BioLiP

>protein
EHYIKHPLQNRWALWFFKNDWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLI
TLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVI
GYQSHADTAKNRFVV

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5ei3:A	191	186	1.0000	0.9162	0.9409	9.63e-128	3am7:A, 4aza:A, 4aza:C, 4bea:A, 5bxv:A, 5bxv:C, 7d6y:A, 4dt6:A, 4dum:A, 5ehc:A, 5eir:A, 1ej1:A, 1ej1:B, 1ej4:A, 1ejh:A, 1ejh:B, 1ejh:C, 1ejh:D, 5ekv:A, 5ekv:C, 7ezw:A, 6gkj:A, 6gkj:B, 6gkj:C, 6gkj:D, 6gkk:A, 6gkk:B, 6gkk:C, 6gkk:D, 6gkl:A, 6gkl:B, 6gkl:C, 6gkl:D, 1ipb:A, 1ipc:A, 5j5o:A, 5j5o:B, 5j5o:C, 5j5o:D, 5j5y:A, 5j5y:B, 1l8b:A, 1l8b:B, 5m7v:A, 5m7v:B, 5m7v:C, 5m7w:A, 5m7w:B, 5m7w:C, 5m7w:D, 5m7x:A, 5m7x:B, 5m7x:C, 5m7x:D, 5m7z:A, 5m7z:B, 5m7z:C, 5m80:A, 5m80:B, 5m81:A, 5m81:B, 5m81:C, 5m81:D, 5m83:A, 5m83:B, 5m84:A, 5m84:B, 7meu:A, 7meu:B, 5osx:A, 5osx:B, 8sx4:A, 8sx4:B, 5t46:A, 5t46:C, 4tpw:A, 4tpw:B, 4tqb:A, 4tqb:B, 4tqc:A, 4tqc:B, 6u06:A, 6u06:B, 6u06:C, 6u06:D, 6u09:A, 6u09:B, 6u09:C, 6u09:D, 3u7x:A, 3u7x:B, 2v8w:A, 2v8w:E, 2v8x:A, 2v8x:E, 2v8y:A, 2v8y:E, 2w97:A, 2w97:B, 1wkw:A, 7xtp:A, 7xtp:B, 6ylr:A, 6ylr:B, 6ylt:A, 6ylt:B, 6ylt:C, 6ylt:D, 6ylv:A, 6ylv:B, 6ylv:C, 6ylv:D, 5zjy:A, 5zjz:A, 5zk5:A, 5zk7:A, 5zk7:B, 5zk9:A, 5zml:A
2	5abx:A	173	169	0.4857	0.4913	0.5030	2.52e-60
3	5t48:A	181	170	0.5143	0.4972	0.5294	4.81e-60	5abu:A, 4axg:B, 4uec:A, 4uec:C
4	3m93:A	180	177	0.4971	0.4833	0.4915	1.03e-59	3m94:A
5	6fbz:A	191	179	0.4171	0.3822	0.4078	6.34e-43
6	2idv:A	177	183	0.4457	0.4407	0.4262	8.28e-42
7	2wmc:A	174	180	0.4286	0.4310	0.4167	1.75e-38	2wmc:B, 2wmc:C, 2wmc:D, 2wmc:E, 2wmc:F, 2wmc:G, 2wmc:H
8	5me6:A	175	176	0.4286	0.4286	0.4261	2.21e-37	5me6:D
9	2jgb:A	187	175	0.3429	0.3209	0.3429	7.89e-36	2jgc:A, 5xln:A
10	1ap8:A	213	157	0.3371	0.2770	0.3758	1.30e-34	6fc1:A, 6fc1:C, 1rf8:A
11	3hxg:A	183	159	0.3600	0.3443	0.3962	2.71e-34	3hxi:A
12	4b6u:A	207	153	0.2514	0.2126	0.2876	7.60e-19
13	6o7y:A	183	138	0.1829	0.1749	0.2319	0.76	6o7z:A, 6o80:A
14	2a1t:C	388	52	0.0914	0.0412	0.3077	2.0	2a1t:A, 2a1t:B, 2a1t:D, 1egc:A, 1egc:B, 1egc:C, 1egc:D, 1egd:A, 1egd:B, 1egd:C, 1egd:D, 1ege:A, 1ege:B, 1ege:C, 1ege:D, 4p13:A, 4p13:B, 4p13:C, 4p13:D, 8sgp:A, 8sgp:B, 8sgp:C, 8sgp:D, 1t9g:A, 1t9g:B, 1t9g:C, 1t9g:D
15	4j1q:A	417	78	0.1143	0.0480	0.2564	3.4
16	3mdd:A	385	52	0.0914	0.0416	0.3077	4.9	3mdd:B, 3mde:A, 3mde:B, 1udy:A, 1udy:B, 1udy:C, 1udy:D
17	7ouj:AAA	540	51	0.1029	0.0333	0.3529	7.6
18	1x0x:A	350	54	0.0743	0.0371	0.2407	8.0	6e8y:A, 6e8z:A, 6e8z:B, 6e90:A, 6e90:B, 6e90:C, 6e90:D, 6pyp:A, 6pyp:B, 1wpq:A, 1wpq:B, 1x0v:A, 1x0v:B
19	7q4q:A	218	42	0.0686	0.0550	0.2857	9.3	7q4q:C, 7sgm:L, 7sgm:M, 7sgm:Y, 6w9g:L, 6w9g:M, 6w9g:Y

[Back]