BioLiP

>protein
EHVILLNAQGVPTGTLEKYAAHTADTRLHLAFSSWLFNAKGQLLVTRRALSKKAWPGVWTNSVCGHPQLGESNEDAVIRR
CRYELGVEITPPESIYPDFRFRATDPSGIVENEVCPVFAARTTSALQINDDEVMDYQWCDLADVLHGIDATPWAFSPWMV
MQATNREARKRLSAFT

The query sequence (length=176) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2b2k:B	180	176	1.0000	0.9778	1.0000	2.08e-133	2b2k:A, 2g73:A, 2g73:B, 2g74:A, 2g74:B, 1hx3:A, 1hx3:B, 1i9a:A, 1i9a:B, 1nfs:A, 1nfs:B, 1nfz:A, 1nfz:B, 1ow2:A, 1ow2:B, 1ppv:A, 1ppv:B, 1ppw:A, 1ppw:B, 1pvf:A, 1pvf:B, 1q54:A, 1q54:B, 1r67:A, 2vnp:A, 2vnp:B, 2vnq:A, 2vnq:B, 1x83:A, 1x83:B, 1x84:A, 1x84:B
2	2i6k:A	224	153	0.2614	0.2054	0.3007	1.02e-11	2dho:A, 2i6k:B, 2icj:A, 2ick:A
3	2pny:A	233	115	0.2045	0.1545	0.3130	8.81e-08
4	1vc8:A	126	87	0.1705	0.2381	0.3448	6.70e-04	1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
5	5zrk:A	129	63	0.1193	0.1628	0.3333	0.26	5zrg:A, 5zrh:A, 5zri:A, 5zrk:B, 5zrl:A, 5zrl:B, 5zro:A, 5zro:B
6	7ohy:b	375	69	0.1136	0.0533	0.2899	0.32
7	2e50:P	186	84	0.1364	0.1290	0.2857	0.40	2e50:A, 2e50:Q
8	1e1c:A	727	52	0.0966	0.0234	0.3269	0.46	1e1c:C, 1req:A, 1req:C, 2req:A, 2req:C, 3req:A, 4req:A, 4req:C, 5req:A, 5req:C, 6req:A, 6req:C, 7req:A, 7req:C
9	6scx:A	328	107	0.1420	0.0762	0.2336	0.50	6o3p:A, 6scx:B, 6scx:C
10	7mto:A	188	84	0.1364	0.1277	0.2857	0.53	2e50:B
11	1ppx:A	129	74	0.1250	0.1705	0.2973	0.76	3a6t:A, 3a6u:A, 3a6v:A, 3a6v:B, 1pun:A, 1puq:A, 1pus:A, 1tum:A, 7ww5:A, 7ww6:A, 7ww7:A, 7ww8:A, 7ww9:A, 7wwa:A, 7x9h:A, 7x9i:A, 7x9j:A, 7x9k:A, 7x9l:A, 7x9n:A, 7x9o:A
12	6o3p:B	320	88	0.1136	0.0625	0.2273	1.4
13	6ylg:b	613	66	0.1080	0.0310	0.2879	2.4	7nac:b, 7of1:b, 7r7a:b, 6ylh:b
14	8hfr:rA	647	66	0.1080	0.0294	0.2879	2.6	7bt6:b, 7btb:b, 6c0f:W, 6ft6:b, 3jct:b, 5jcs:o, 6m62:b, 6n8j:b, 6n8k:b, 7nad:b, 7oh3:b, 7ohq:b, 7oht:b, 7r72:b, 7u0h:b, 7ug6:b, 7uoo:b, 7uqb:b, 7uqz:b, 7v08:b, 4v7f:o, 8v87:b, 6ylx:b, 6yly:b, 7z34:b
15	8v83:b	423	66	0.1080	0.0449	0.2879	2.6	6elz:b, 6em1:b, 6em5:b, 7ohp:b, 7ohr:b, 7ohs:b, 7ohu:b, 7ohv:b, 8v84:b
16	3hhj:B	131	62	0.1023	0.1374	0.2903	3.2	3hhj:A
17	3i1l:A	362	51	0.0795	0.0387	0.2745	4.2	3i1l:B, 3i1l:C
18	3r03:A	131	59	0.1023	0.1374	0.3051	4.4
19	3kzp:B	232	34	0.0739	0.0560	0.3824	5.4	3kzp:A

[Back]