Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EHQAIAKMRTMIEGFDDISHGGLPIGRSTLVSGTSGTGKTLFSIQFLYNGIIEFDEPGVFVTFEETPQDIIKNARSFGWD
LAKLVDEGKLFILDASPDPEGQEVVGGFDLSALIERINYAIQKYRARRVSIDSVTSVFQQYDASSVVRRELFRLVARLKQ
IGATTVMTTERIEEYGPIARYGVEEFVSDNVVILRNVLEGERRRRTLEILKLRGTSHMKGEYPFTITDHGINIFPLGAMR
LTQRSSNVRVSSGVVRLDEMCGGGFFKDSIILATGATGTGKTLLVSRFVENACANKERAILFAYEESRAQLLRNAYSWGM
DFEEMERQNLLKIVCAYPESAGLEDHLQIIKSEINDFKPARIAIDSLSALARGVSNNAFRQFVIGVTGYAKQEEITGLFT
NTSDQFMGAHSITDSHIDTITDTIILLQYVEIRGEMSRAINVFKMRGSWHDKAIREFMISDKGPDIKDSFRNFERIISGS
PTRIT

The query sequence (length=485) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4dug:A 506 485 0.9959 0.9545 0.9959 0.0 4dug:B, 4dug:C, 4dug:D, 4dug:E, 4dug:F, 3dvl:A, 3dvl:B, 3dvl:C, 3dvl:D, 3dvl:E, 3dvl:F, 7dxq:A, 7dxq:B, 7dxq:C, 7dxq:E, 7dxq:F, 7dxq:D, 7dy2:A, 7dy2:B, 7dy2:C, 7dy2:E, 7dy2:F, 7dy2:I, 7dy2:K, 7dy2:J, 2gbl:A, 2gbl:B, 2gbl:C, 2gbl:D, 2gbl:E, 2gbl:F, 4ijm:A, 4ijm:B, 4ijm:F, 4ijm:C, 4ijm:D, 4ijm:E, 8jon:A, 8jon:B, 8jon:C, 8jon:D, 8jon:E, 8jon:F, 3jzm:A, 3jzm:B, 3jzm:C, 3jzm:D, 3jzm:E, 3jzm:F, 3k09:A, 3k09:B, 3k09:C, 3k09:D, 3k09:E, 3k09:F, 3k0a:A, 3k0a:B, 3k0a:F, 3k0a:C, 3k0a:D, 3k0a:E, 3k0c:A, 3k0c:B, 3k0c:C, 3k0c:D, 3k0c:E, 3k0c:F, 3k0e:A, 3k0e:B, 3k0e:C, 3k0e:D, 3k0e:E, 3k0e:F, 3k0f:A, 3k0f:B, 3k0f:C, 3k0f:D, 3k0f:E, 3k0f:F, 3s1a:A, 3s1a:B, 3s1a:C, 3s1a:D, 3s1a:E, 3s1a:F, 7s65:A, 7s65:B, 7s65:C, 7s65:D, 7s65:E, 7s65:F, 7s66:A, 7s66:B, 7s66:C, 7s66:D, 7s66:E, 7s66:F, 7s67:A, 7s67:B, 7s67:F, 7s67:C, 7s67:D, 7s67:E, 1tf7:A, 1tf7:B, 1tf7:C, 1tf7:D, 1tf7:E, 1tf7:F, 4tl6:A, 4tl6:B, 4tl6:C, 4tl7:A, 4tl7:B, 4tl7:C, 4tl7:D, 4tl7:E, 4tl7:F, 4tl8:A, 4tl8:B, 4tl8:C, 4tl8:D, 4tl8:E, 4tl8:F, 4tl9:A, 4tl9:B, 4tl9:C, 4tl9:D, 4tl9:E, 4tl9:F, 4tla:A, 4tla:B, 4tla:C, 4tla:D, 4tla:E, 4tla:F, 4tlb:A, 4tlb:B, 4tlb:C, 4tlb:D, 4tlb:E, 4tlb:F, 4tlc:A, 4tlc:B, 4tlc:C, 4tlc:D, 4tlc:E, 4tlc:F, 4tld:A, 4tld:B, 4tld:C, 4tld:D, 4tld:E, 4tld:F, 4tle:A, 4tle:B, 4tle:C, 4tle:D, 4tle:E, 4tle:F, 1u9i:A, 1u9i:B, 1u9i:C, 1u9i:D, 1u9i:E, 1u9i:F, 7v3x:A, 7v3x:B, 7v3x:C, 7v3x:E, 7v3x:F, 7v3x:D, 7v3x:G, 7v3x:H, 7v3x:I, 7v3x:K, 7v3x:L, 7v3x:J, 7v3x:R, 7v3x:M, 7v3x:Q, 7v3x:W, 7x1y:A, 7x1y:B, 7x1y:C, 7x1y:D, 7x1y:E, 7x1y:F, 7x1z:A, 7x1z:B, 7x1z:C, 7x1z:D, 7x1z:E, 7x1z:F, 5yz8:A, 5yz8:B, 5yz8:C, 5yz8:D, 5yz8:E, 5yz8:F
2 7v3x:O 461 482 0.9485 0.9978 0.9544 0.0 7dy2:D, 7dy2:G, 7dy2:H, 7dy2:L, 7dye:A, 7dye:B, 7dyi:A, 7dyi:B, 7dyj:A, 7dyj:B, 7dyk:A, 7dyk:B, 7v3x:N, 7v3x:P, 7v3x:X, 7v3x:S, 7wdc:A, 7wdc:B, 8wv8:A, 8wv8:B, 8wve:A, 8wve:B
3 4o0m:A 494 481 0.8206 0.8057 0.8274 0.0 5jwo:A, 4o0m:B, 4o0m:C
4 7v3x:V 437 480 0.8969 0.9954 0.9062 0.0 7v3x:U
5 7dy1:D 458 480 0.7814 0.8275 0.7896 0.0 7dy1:A, 7dy1:B, 7dy1:C, 7dy1:E, 7dy1:F
6 7v3x:T 415 480 0.8536 0.9976 0.8625 0.0
7 5jwq:A 413 452 0.7113 0.8354 0.7633 0.0 5jwq:C
8 8fwj:A 552 461 0.3711 0.3261 0.3905 2.18e-103 8db3:A, 8db3:B, 8db3:C, 8dba:A, 8dba:E, 8dba:D, 8dba:G, 8dba:H, 8dba:K, 8fwi:A, 8fwi:D, 8fwi:B, 8fwi:K, 8fwi:C, 8fwi:F, 8fwi:E, 8fwi:H, 8fwi:G, 8fwi:J, 8fwi:I, 8fwi:L, 8fwj:B, 8fwj:C, 8fwj:D, 8fwj:E, 8fwj:F, 8fwj:G, 8fwj:H, 8fwj:I, 8fwj:J, 8fwj:K, 8fwj:L
9 8fwj:A 552 218 0.1237 0.1087 0.2752 3.19e-11 8db3:A, 8db3:B, 8db3:C, 8dba:A, 8dba:E, 8dba:D, 8dba:G, 8dba:H, 8dba:K, 8fwi:A, 8fwi:D, 8fwi:B, 8fwi:K, 8fwi:C, 8fwi:F, 8fwi:E, 8fwi:H, 8fwi:G, 8fwi:J, 8fwi:I, 8fwi:L, 8fwj:B, 8fwj:C, 8fwj:D, 8fwj:E, 8fwj:F, 8fwj:G, 8fwj:H, 8fwj:I, 8fwj:J, 8fwj:K, 8fwj:L
10 8dba:J 510 461 0.3546 0.3373 0.3731 1.28e-94 8dba:C, 8dba:B, 8dba:F, 8dba:I, 8dba:L
11 8dba:J 510 218 0.1175 0.1118 0.2615 2.61e-09 8dba:C, 8dba:B, 8dba:F, 8dba:I, 8dba:L
12 2zts:C 226 234 0.1753 0.3761 0.3632 2.10e-35 2zts:A, 2zts:B
13 2zts:C 226 222 0.1237 0.2655 0.2703 1.48e-07 2zts:A, 2zts:B
14 2dr3:D 242 237 0.1711 0.3430 0.3502 3.68e-34 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
15 2dr3:D 242 231 0.1258 0.2521 0.2641 8.41e-20 2dr3:A, 2dr3:B, 2dr3:C, 2dr3:E, 2dr3:F
16 2w0m:A 220 226 0.1381 0.3045 0.2965 8.43e-21
17 2w0m:A 220 229 0.1258 0.2773 0.2664 5.33e-12
18 4yds:A 226 81 0.0577 0.1239 0.3457 8.09e-05
19 4yds:A 226 203 0.1031 0.2212 0.2463 0.57
20 3fyh:A 296 73 0.0454 0.0743 0.3014 0.047 2gdj:A
21 3fyh:A 296 260 0.1216 0.1993 0.2269 5.8 2gdj:A
22 1xu4:A 318 73 0.0454 0.0692 0.3014 0.060 2b21:A, 2f1h:A, 2f1i:A, 2f1j:A, 2fpk:A, 2fpl:A, 2fpm:A, 2i1q:A, 3ntu:A, 1t4g:A
23 8gbj:C 317 37 0.0289 0.0442 0.3784 0.068 8faz:C, 8ouy:B, 8ouz:B
24 3ew9:A 314 71 0.0495 0.0764 0.3380 0.15 3etl:A, 3ewa:A
25 8gja:C 274 37 0.0309 0.0547 0.4054 0.58 8gj8:A, 8gja:A, 8gja:E
26 5lkm:A 390 160 0.0784 0.0974 0.2375 1.7 5lkm:C
27 6hqu:G 194 36 0.0309 0.0773 0.4167 2.2 6hqu:H
28 7ej6:B 316 120 0.0619 0.0949 0.2500 2.5 7ej6:C, 7ej6:A, 7ej7:B, 7ej7:A, 7ej7:C
29 4d6p:B 229 36 0.0309 0.0655 0.4167 2.7 4a6x:A, 4a6x:B, 4b2i:A, 4b2l:A, 4b2p:A, 4b32:A, 4b33:A, 4b34:A, 4b35:A, 4b3b:A, 4b3d:A, 4b3d:C, 4d6p:A, 5fos:A, 5fot:A, 5fou:A, 5fov:A, 5fov:C, 5fow:A, 5fow:C, 5fox:A, 5fpk:A, 5j4h:A, 5j4k:A, 5jee:A, 5jfg:A, 5lbi:A, 5qub:A, 5quc:A, 5qud:A, 5que:A, 5quf:A, 5qug:A, 5quh:A, 5qui:A, 5quj:A, 5qur:A, 5qus:A, 5qut:A, 6tuu:A, 6tuu:B, 6tuu:C, 6tuu:D, 6tv3:A, 6tw3:A, 6tw4:A, 6tw9:A, 4uqo:A, 4uqo:B, 6xtw:A, 6xuf:A, 6xuj:A
30 5xc3:A 168 60 0.0412 0.1190 0.3333 3.1 5xc5:A
31 6hqu:B 219 37 0.0309 0.0685 0.4054 3.3 8br9:A, 8c3n:A, 6hqu:C, 6hqu:F, 6hqu:A, 6hqu:D, 6hqu:E
32 4zc0:B 434 82 0.0515 0.0576 0.3049 3.4 3gxv:A
33 2bov:A 173 28 0.0206 0.0578 0.3571 4.3 2a78:A, 2a9k:A, 8fjh:B, 8fji:B, 6p0i:B, 6p0j:B, 6p0k:B, 6p0l:B, 6p0m:B, 6p0n:B, 6p0o:B, 1u8y:A, 1u8y:B, 1u8z:A, 1u8z:B, 1u90:A, 1u90:B, 1uad:A, 1uad:B, 1zc3:A, 1zc3:C, 1zc4:A, 1zc4:C
34 2kwi:A 178 28 0.0206 0.0562 0.3571 5.0 2ke5:A, 6zqt:A, 6zqt:B, 6zrn:A, 6zrn:B
35 6pd2:C 616 45 0.0309 0.0244 0.3333 5.1 6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
36 8bsc:D 313 79 0.0454 0.0703 0.2785 5.3 8bq2:A, 8bq2:B, 8bq2:C, 8bq2:D, 8bq2:E, 8bq2:F, 8bq2:G, 8bq2:H, 8bq2:I, 8br2:A, 8br2:B, 8br2:C, 8br2:D, 8br2:E, 8br2:F, 8bsc:A, 8bsc:B, 8bsc:C, 8bsc:E, 8bsc:F, 8bsc:G, 7c9a:A, 7c9a:B, 7c9a:C, 7ejc:A, 7ejc:C, 7ejc:B, 7eje:A, 7eje:B, 7eje:C, 8gyk:A, 8gyk:B, 8gyk:C, 8gyk:D, 8gyk:E, 8gyk:F, 8gyk:G, 8gyk:H, 5h1b:A, 5h1b:B, 5h1b:C, 5h1c:A, 5h1c:B, 5h1c:C, 5np7:A, 5np7:B, 5np7:C, 5np7:D, 5np7:E, 5np7:F, 5np7:G, 5nwl:A, 5nwl:B, 5nwl:C, 5nwl:D, 5nwl:E, 5nwl:F, 5nwl:G, 5nwl:H, 5nwl:I, 5nwl:J, 5nwl:K, 5nwl:L, 5nwl:M, 5nwl:N, 8pbc:J, 8pbc:K, 8pbc:I, 8pbc:H, 8pbc:G, 8pbc:F, 8pbc:E, 8pbc:D, 8pbc:C, 8pbc:B, 8pbc:A, 8pbd:I, 8pbd:J, 8pbd:H, 8pbd:G, 8pbd:F, 8pbd:E, 8pbd:D, 8pbd:C, 8pbd:B, 8pbd:A, 8rcd:A, 8rcd:B, 8rcd:C, 8rcd:D, 8rcd:E, 8rcd:F, 8rcd:G, 8rcd:H, 8rcf:A, 8rcf:B, 8rcf:C, 8rcf:D, 8rcf:E, 8rcf:F, 8rcf:G, 8rcf:H
37 4j2o:C 316 52 0.0371 0.0570 0.3462 5.5 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
38 7uqj:A 585 32 0.0289 0.0239 0.4375 5.7 7uqi:A, 7uqi:B, 7uqi:C, 7uqi:D, 7uqj:C, 7uqj:D, 7uqj:E, 7uqj:F, 7uqj:B, 7uqk:A, 7uqk:B, 7uqk:C, 7uqk:D
39 6o75:A 710 55 0.0392 0.0268 0.3455 5.9 6o74:A, 6o78:A, 6o79:A, 6o7b:A, 6o7d:A
40 7uqi:E 558 32 0.0289 0.0251 0.4375 6.0 7uqk:E
41 8gbj:D 308 71 0.0330 0.0519 0.2254 6.0 8faz:D, 8ouy:C, 8ouz:C
42 6muu:A 780 55 0.0392 0.0244 0.3455 6.1 6iqw:A, 6mur:A, 6mus:A, 6mut:A, 6o7e:A, 6o7h:A
43 1xmv:A 293 30 0.0227 0.0375 0.3667 6.8
44 8a3v:A 450 60 0.0330 0.0356 0.2667 8.2 8a3v:B, 6t66:A, 6t66:B, 6t66:C, 6t66:D, 6t66:E, 6t66:F
45 8szq:A 861 33 0.0268 0.0151 0.3939 8.5 3llm:A, 3llm:B, 8szp:A, 8szp:B, 8szr:A, 8szs:A
46 2hf8:A 211 52 0.0330 0.0758 0.3077 9.3 2hf8:B, 2hf9:A, 2hf9:B
47 6bbm:A 405 60 0.0309 0.0370 0.2500 9.3
48 1gl6:B 420 89 0.0495 0.0571 0.2697 9.4 1gki:A, 1gki:B, 1gki:D, 1gki:E, 1gki:F, 1gki:G, 1gl6:A, 1gl6:D, 1gl6:E, 1gl6:F, 1gl6:G, 1gl7:A, 1gl7:B, 1gl7:D, 1gl7:E, 1gl7:F, 1gl7:G
49 4esv:C 434 64 0.0371 0.0415 0.2812 9.7 4esv:A, 4esv:B, 4esv:D, 4esv:E, 4esv:F, 4esv:G, 4esv:H, 4esv:I, 4esv:J, 4esv:K, 4esv:L, 2vye:A, 2vye:B
50 6bbm:D 455 60 0.0309 0.0330 0.2500 9.8 6bbm:F, 6bbm:B, 6bbm:C, 6bbm:E, 6qel:A, 6qel:B, 6qel:C, 6qel:D, 6qel:E, 6qel:F, 6qem:A, 6qem:B, 6qem:C, 6qem:D, 6qem:E, 6qem:F, 7t20:B, 7t20:C, 7t20:E, 7t20:F, 7t20:D, 7t21:A, 7t21:B, 7t21:C, 7t21:D, 7t21:E, 7t21:F, 7t22:A, 7t22:B, 7t22:C, 7t22:D, 7t22:E, 7t22:F, 7t23:A, 7t23:B, 7t23:C, 7t23:D, 7t23:E, 7t23:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218