BioLiP

>protein
EFGNLARIRHVISYSLSPFEQRAFPSYFSKGIPNVLRRTRERILRVAPPFVVVYLIYTWGNQEFEQSKRKNP

The query sequence (length=72) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7o3e:R	72	72	1.0000	1.0000	1.0000	2.13e-48
2	2a06:G	73	72	0.8194	0.8082	0.8194	1.08e-40	1pp9:G, 1ppj:G
3	8e7s:H	93	62	0.2500	0.1935	0.2903	0.016	8e7s:h
4	8cub:C	588	42	0.1806	0.0221	0.3095	0.22	8cub:A, 7r8a:A, 7r8b:A
5	1mo4:A	324	30	0.1667	0.0370	0.4000	0.51	1g18:A, 1mo3:A, 1mo5:A, 1mo6:A
6	5m95:A	395	43	0.2361	0.0430	0.3953	1.6	5m95:C
7	8pv1:CI	152	73	0.2222	0.1053	0.2192	2.5	8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
8	3hmz:A	191	65	0.2917	0.1099	0.3231	2.5
9	7ejx:R	229	15	0.1250	0.0393	0.6000	2.9
10	7vdv:A	809	34	0.1944	0.0173	0.4118	4.6	7vdt:A
11	7y8r:I	732	34	0.1944	0.0191	0.4118	5.0
12	8rfv:A	345	37	0.1806	0.0377	0.3514	6.2	9evm:A, 7qxk:A, 7qy4:A, 7qyc:A, 8r8s:A, 8rfl:A, 8rfo:A, 8rfp:A, 8rfq:A, 8rfr:A, 8rfs:A, 8rft:A, 8rfu:A, 8rfw:A, 8rfx:A, 8rfy:A, 8rg8:A, 8rg9:A, 8rgb:A, 8rgc:A, 8rgd:A, 8ru9:A, 8rur:A, 8ryj:A, 8ryr:A, 8ryu:A, 8ryv:A, 8s0w:A, 8s2q:A, 8s5x:A, 8s5y:A, 8s63:A, 8s64:A, 8s68:A, 8s69:A, 6thf:A, 6zar:A, 6zas:A, 6zat:A, 6zau:A, 6zav:A, 6zaw:A, 6zax:A, 7zcn:A, 7zco:A, 7zcp:A, 7zcq:A, 7zcr:A, 7zcs:A
13	4imp:A	520	17	0.1389	0.0192	0.5882	7.2	4imp:B, 4imp:C, 4imp:D
14	6rm3:LDD	102	30	0.1667	0.1176	0.4000	8.8
15	6idy:A	421	55	0.2083	0.0356	0.2727	9.2	6idy:B, 6idy:C

[Back]