Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EELQTELYEIKHQILQTMGVLSLQGSMLSVGDKVFSTNGQSVNFDTIKEMCTRAGGNIAVPRTPEENEAIASIAKKYNNY
VYLGMIDDQTEGDFHYLDGASVSYTNWYPGEPRGQGKEDCVEMYTDGTWNDRGCLQYRLAVCEF

The query sequence (length=144) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3pak:A 145 144 0.9792 0.9724 0.9792 8.42e-106 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
2 2ric:C 158 117 0.3889 0.3544 0.4786 2.97e-36 1b08:A, 1b08:B, 1b08:C, 3dbz:A, 3dbz:B, 3dbz:C, 4e52:B, 4e52:C, 4e52:A, 3g81:A, 3g81:B, 3g81:C, 3g83:A, 3g83:B, 3g83:C, 3g84:A, 3g84:B, 3g84:C, 2ggu:A, 2ggu:B, 2ggu:C, 2ggx:A, 2ggx:B, 2ggx:C, 3ikn:A, 3ikn:B, 3ikn:C, 3ikp:A, 3ikp:B, 3ikp:C, 3ikq:A, 3ikq:B, 3ikq:C, 3ikr:A, 3ikr:B, 3ikr:C, 4m17:A, 4m17:B, 4m17:C, 4m17:D, 4m17:E, 4m17:F, 4m17:G, 4m17:H, 4m17:I, 4m17:J, 4m17:K, 4m17:L, 4m18:A, 4m18:E, 4m18:B, 4m18:C, 4m18:D, 4m18:L, 4m18:F, 4m18:G, 4m18:H, 4m18:I, 4m18:J, 4m18:K, 2orj:A, 2orj:B, 2orj:C, 2ork:A, 2ork:B, 2ork:C, 2os9:A, 2os9:B, 2os9:C, 5oxr:B, 5oxr:C, 5oxr:A, 5oxs:A, 5oxs:B, 5oxs:C, 1pw9:A, 1pw9:B, 1pw9:C, 1pwb:A, 1pwb:B, 1pwb:C, 2ria:A, 2ria:B, 2ria:C, 2rib:A, 2rib:B, 2rib:C, 2ric:B, 2ric:A, 2rid:A, 2rid:B, 2rid:C, 2rie:A, 2rie:B, 2rie:C
3 6bbe:A 155 119 0.3542 0.3290 0.4286 2.19e-34 6bbd:A, 4dn8:A
4 1hup:A 141 143 0.3958 0.4043 0.3986 8.72e-31
5 6ryj:A 122 119 0.3194 0.3770 0.3866 4.15e-27 6ryg:A, 6rym:A, 6ryn:A
6 1afa:1 154 120 0.3264 0.3052 0.3917 3.40e-26 1afa:2, 1afa:3, 1afb:1, 1afb:2, 1afb:3, 1afd:1, 1afd:2, 1afd:3, 1bch:1, 1bch:2, 1bch:3, 1bcj:1, 1bcj:2, 1bcj:3, 1fif:A, 1fif:B, 1fif:C, 1fih:A, 1fih:B, 1fih:C, 1kmb:1, 1kmb:2, 1kmb:3, 2kmb:1, 2kmb:2, 2kmb:3, 3kmb:1, 3kmb:3, 3kmb:2, 4kmb:1, 4kmb:2, 4kmb:3, 1kwt:A, 1kwt:B, 1kwt:C, 1kwu:A, 1kwu:B, 1kwu:C, 1kwv:A, 1kwv:B, 1kwv:C, 1kww:A, 1kww:B, 1kww:C, 1kwx:A, 1kwx:B, 1kwx:C, 1kwy:A, 1kwy:B, 1kwy:C, 1kwz:A, 1kwz:B, 1kwz:C, 1kx0:A, 1kx0:B, 1kx0:C, 1kx1:C, 1kx1:F, 1kx1:A, 1kx1:B, 1kx1:D, 1kx1:E, 2msb:B, 2msb:A, 1rtm:1, 1rtm:2, 1rtm:3
7 1kza:1 115 117 0.3333 0.4174 0.4103 3.94e-25 1kza:2, 1kzb:1, 1kzb:2, 1kzc:1, 1kzc:2, 1kzd:1, 1kzd:2, 1kze:1, 1kze:2, 1rdi:1, 1rdi:2, 1rdj:1, 1rdj:2, 1rdk:1, 1rdk:2, 1rdl:1, 1rdl:2, 1rdm:1, 1rdm:2, 1rdn:1, 1rdn:2, 1rdo:1, 1rdo:2
8 4gko:L 136 101 0.2569 0.2721 0.3663 4.20e-12 4g9a:A, 4g9a:B, 4g9a:C, 4g9a:D, 4gko:G, 4gko:H, 4gko:I, 4gko:J, 4gko:K, 2h2t:B
9 6ghv:D 133 116 0.2361 0.2556 0.2931 5.54e-12 6ghv:A, 6ghv:B, 6ghv:C, 6ghv:E, 6ghv:F, 2it5:A, 2it6:A, 1k9i:A, 1k9i:C, 1k9i:D, 1k9i:E, 1k9i:H, 1k9i:B, 1k9i:F, 1k9i:G, 1k9i:I, 1k9i:J, 7nl6:A, 7nl7:A, 1sl4:A, 1sl5:A, 2xr5:A, 2xr6:A
10 1htn:A 156 150 0.2778 0.2564 0.2667 1.26e-11 1tn3:A
11 4yli:D 155 97 0.2292 0.2129 0.3402 1.27e-11 4yli:A, 4yli:B, 4yli:C, 4yli:E, 4yli:F, 4ymd:A, 4ymd:B, 4ymd:D, 4ymd:F, 4ymd:C, 4ymd:E
12 5e4k:A 424 99 0.2222 0.0755 0.3232 1.43e-11
13 5e4k:A 424 117 0.1806 0.0613 0.2222 2.03e-05
14 6pwr:A 129 100 0.2292 0.2558 0.3300 4.91e-11 6pws:A, 6pwt:A
15 5e4l:A 428 99 0.2222 0.0748 0.3232 1.51e-10
16 5e4l:A 428 115 0.1806 0.0607 0.2261 2.44e-05
17 1sl6:A 168 148 0.2847 0.2440 0.2770 1.67e-10 1k9j:A, 1sl6:B, 1sl6:C, 1sl6:D, 1sl6:E, 1sl6:F, 1xph:A
18 2ox9:C 131 117 0.2153 0.2366 0.2650 7.57e-10 2ox9:A, 2ox9:B, 2ox9:D
19 5xts:A 460 88 0.2222 0.0696 0.3636 1.32e-09 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
20 5xts:A 460 105 0.1111 0.0348 0.1524 0.055 5xtw:A, 5xtw:C, 5xtw:D, 5xtw:E, 5xtw:F, 5xtw:H
21 8urf:A 128 117 0.2431 0.2734 0.2991 1.92e-09
22 2ox8:A 129 117 0.2222 0.2481 0.2735 2.46e-09 2ox8:B, 2ox8:C, 2ox8:D
23 1tdq:B 126 88 0.2083 0.2381 0.3409 2.90e-09
24 1egg:B 144 102 0.2222 0.2222 0.3137 3.09e-08 1egg:A, 1egi:A, 1egi:B, 7jub:A, 7juc:A, 7jud:A, 7jud:B, 7jue:A, 7juf:A, 7juf:B, 7jug:A, 7juh:A, 7l61:A, 7l62:A, 7l63:A, 7l64:A, 7l65:A, 7l66:A, 7l67:A, 7l68:A, 7l68:B
25 4c9f:D 134 117 0.2153 0.2313 0.2650 3.77e-08 4c9f:A, 4c9f:B, 4c9f:C, 4caj:A, 4caj:B, 4caj:C, 4caj:D, 3zhg:A, 3zhg:B, 3zhg:C, 3zhg:D
26 5e4l:B 386 77 0.1806 0.0674 0.3377 6.32e-08
27 5e4l:B 386 115 0.1806 0.0674 0.2261 3.03e-05
28 6py1:A 130 119 0.2500 0.2769 0.3025 6.85e-08 6puv:A, 6w12:A, 6xiy:A
29 2py2:A 127 112 0.1736 0.1969 0.2232 7.36e-08 2py2:B, 2py2:C, 2py2:D, 2py2:E, 2py2:F
30 4c16:A 280 118 0.2292 0.1179 0.2797 1.21e-06 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
31 3wh2:A 132 116 0.2292 0.2500 0.2845 2.19e-06 3wh3:A
32 8h4v:A 148 100 0.2083 0.2027 0.3000 2.48e-06 8h4v:B, 8hb5:A, 5kth:A, 5kti:A, 4kzv:A, 4kzv:B, 4kzw:A, 4kzw:B, 4zrv:A, 4zrv:C, 4zrv:B, 4zrw:A
33 6jk4:A 126 107 0.1597 0.1825 0.2150 5.51e-06
34 4wqq:A 141 67 0.1389 0.1418 0.2985 7.56e-05 1wmy:A, 1wmy:B, 1wmz:A, 1wmz:B, 1wmz:C, 1wmz:D, 4wqq:B, 4wqq:C, 4wqq:D
35 5b1w:A 130 123 0.2292 0.2538 0.2683 1.15e-04 5b1w:B, 5b1w:C, 5b1w:D, 5b1x:A, 5b1x:B, 5b1x:C, 5b1x:D
36 2vuv:A 129 97 0.1944 0.2171 0.2887 1.63e-04 2vuz:A
37 1qdd:A 144 97 0.1875 0.1875 0.2784 6.29e-04
38 5jq1:A 130 117 0.2083 0.2308 0.2564 0.001 1dv8:A, 5jpv:A, 5jpv:B, 5jq1:B, 8ts0:A, 6yau:A
39 1g1q:A 160 115 0.1944 0.1750 0.2435 0.001 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
40 3cfw:A 156 43 0.1319 0.1218 0.4419 0.002 5vc1:A
41 5k8y:A 136 69 0.1458 0.1544 0.3043 0.002 5k8y:B, 5m62:A, 5m62:B
42 3alu:A 157 122 0.2153 0.1975 0.2541 0.002 3als:A, 3als:B, 3als:C, 3als:D, 3alt:A, 3alt:B, 3alt:C, 3alt:D, 3alu:B, 3alu:C, 3alu:D
43 6jjj:A 151 105 0.1806 0.1722 0.2476 0.003 6jjj:B, 6jjj:C, 6jjj:D, 6jjj:E, 6jjj:F
44 6a7t:A 137 71 0.1111 0.1168 0.2254 0.004 6m5m:A
45 6a7s:B 138 99 0.1389 0.1449 0.2020 0.005 6a7t:B, 6m5m:B
46 3kqg:A 169 69 0.1389 0.1183 0.2899 0.015 4ak8:A, 4ak8:B, 4ak8:C, 4ak8:D, 3c22:A, 3c22:B, 3c22:C, 3c22:D, 5g6u:A, 5g6u:B, 5g6u:D, 5g6u:C, 3kqg:B, 3kqg:C, 3kqg:D, 3kqg:E, 3kqg:F, 4n32:A, 4n32:B, 4n32:C, 4n32:D, 4n33:A, 4n33:B, 4n33:C, 4n33:D, 4n34:A, 4n34:B, 4n34:C, 4n34:D, 4n35:A, 4n35:B, 4n35:C, 4n35:D, 4n36:A, 4n36:B, 4n36:C, 4n36:D, 4n37:A, 4n37:B, 4n37:C, 4n37:D, 4n38:A, 4n38:B, 4n38:C, 4n38:D, 3p5d:A, 3p5d:B, 3p5d:C, 3p5d:D, 3p5e:A, 3p5e:B, 3p5e:C, 3p5e:D, 3p5f:B, 3p5f:C, 3p5f:A, 3p5f:D, 3p5g:A, 3p5g:B, 3p5g:C, 3p5g:D, 3p5h:B, 3p5h:D, 3p5h:A, 3p5h:C, 3p5i:A, 3p5i:B, 3p5i:C, 3p5i:D, 3p7f:A, 3p7f:B, 3p7f:C, 3p7f:D, 3p7g:A, 3p7g:B, 3p7g:C, 3p7g:D, 3p7h:A, 3p7h:B, 3p7h:C, 3p7h:D, 7ytq:A, 7ytq:B, 7ytq:C, 7ytq:D
47 1bj3:B 123 107 0.1597 0.1870 0.2150 0.18 1ixx:B, 1ixx:D, 1ixx:F, 1j34:B, 1j35:B, 1x2t:B, 1x2t:D
48 1iod:A 129 122 0.2083 0.2326 0.2459 0.19 1wt9:A, 1y17:A
49 1bj3:A 129 78 0.1319 0.1473 0.2436 0.36 1j34:A, 1j35:A, 1x2t:A, 1x2t:C
50 8qcq:W 85 40 0.1042 0.1765 0.3750 1.1 7aqc:V, 7aqd:V, 7as8:a, 7as9:a, 7asm:U, 7asn:a, 7aso:b, 7asp:U, 8buu:W, 6ddd:I, 6ddg:I, 6fxc:AU, 6fxc:BU, 6ha1:W, 6ha8:W, 5hkv:T, 5hl7:T, 6hma:U, 6htq:V, 3j9w:BZ, 5li0:Z, 5nd8:Z, 5nd9:Z, 5ngm:AU, 7nhl:Z, 7nhm:Z, 5njt:o, 5nrg:T, 7o5b:u, 7ope:a, 8p2f:Z, 8p2g:Z, 8p2h:Z, 7p48:U, 6ppf:V, 6ppk:V, 7qgu:V, 7qh4:V, 8qpp:u, 7qv1:W, 7qv2:W, 7qv3:W, 8r55:u, 6s0x:U, 6s0z:U, 6s12:U, 6s13:U, 8s1p:W, 8s1u:W, 7s9u:V, 7sae:V, 6sj6:Z, 5t7v:L9, 5tcu:L9, 6tnn:o, 6tpq:o, 7ttu:I, 7ttw:I, 4wce:T, 4wf9:T, 4wfa:T, 4wfb:T, 6wqn:I, 6wqq:I, 6wrs:I, 6wru:I, 8y36:U, 8y37:U, 8y38:U, 8y39:U, 6yef:Z
51 4c3h:A 1523 52 0.1250 0.0118 0.3462 1.1 4c2m:A, 4c2m:P, 4c3j:A
52 6hls:A 1431 52 0.1250 0.0126 0.3462 1.2 5lmx:A
53 5m3f:A 1459 52 0.1250 0.0123 0.3462 1.2 5n61:A
54 4ym7:BA 1462 52 0.1250 0.0123 0.3462 1.2 6hko:A, 6hlq:A, 6hlr:A, 5m5x:A, 5oa1:A, 5w5y:A, 5w64:A, 5w65:A, 5w66:A
55 5g5l:A 1480 52 0.1250 0.0122 0.3462 1.2 6h67:A, 6h68:A, 5m3m:A, 5m5y:A, 5m64:A, 5n5y:A, 5n5z:A, 5n60:A, 6rqt:A, 6rrd:A, 6rui:A, 6ruo:A, 6rwe:A, 6tps:A
56 5m5w:A 1493 52 0.1250 0.0121 0.3462 1.3 4c3i:A, 4ym7:AA, 4ym7:CA, 4ym7:DA, 4ym7:EA, 4ym7:FA
57 2bpe:A 128 70 0.1250 0.1406 0.2571 1.5 2bpe:B, 2bph:A, 2bph:B, 2cl8:A, 2cl8:B
58 6o75:A 710 56 0.1250 0.0254 0.3214 2.0 6o74:A, 6o78:A, 6o79:A, 6o7b:A, 6o7d:A
59 6o7i:A 741 56 0.1250 0.0243 0.3214 2.0
60 6muu:A 780 56 0.1250 0.0231 0.3214 2.1 6iqw:A, 6mur:A, 6mus:A, 6mut:A, 6o7e:A, 6o7h:A
61 5xbt:A 271 102 0.2014 0.1070 0.2843 2.1 5xbi:A, 5xbi:B, 5xbt:B, 5xql:A
62 1qn0:A 112 56 0.1111 0.1429 0.2857 2.2 1qn1:A, 1wad:A
63 1ixx:A 129 78 0.1181 0.1318 0.2179 2.3 1ixx:C, 1ixx:E
64 2brs:B 115 52 0.0972 0.1217 0.2692 2.5
65 6m13:b 688 80 0.1458 0.0305 0.2625 2.8 7dsy:a, 7dsy:b, 7dts:a, 7dts:b, 7elw:a, 7elw:b, 6m11:a, 6m11:b, 6m12:a, 6m12:b, 6m13:a, 4o1o:A, 4o1o:B, 4o1o:C, 4o1o:D, 4o1p:A, 4o1p:B, 4o1p:C, 4o1p:D
66 2g5g:X 255 49 0.1111 0.0627 0.3265 3.4
67 5xgd:A 548 31 0.0833 0.0219 0.3871 4.7 8pps:A, 8pps:B, 5xge:A
68 5u92:A 347 35 0.0833 0.0346 0.3429 5.4
69 7f0r:D 1339 57 0.1111 0.0119 0.2807 5.9 7vf9:D, 7xl3:D, 7xl4:D, 7xya:D, 7xyb:D
70 8uu4:Y 76 39 0.0972 0.1842 0.3590 6.1 8a57:Z, 8a5i:Z, 8a63:Z, 7nhn:Z, 8uu5:Y, 8uu6:Y, 8uu7:Y, 8uu8:Y, 8uu9:Y, 8uua:Y
71 7l7x:AAA 395 49 0.1111 0.0405 0.3265 6.8 7l7x:BBB
72 8aic:A 330 75 0.1250 0.0545 0.2400 7.6 8aez:A, 8aic:B
73 7xoi:B 436 66 0.1250 0.0413 0.2727 7.7 7xoi:D, 7xoi:F, 7xoi:H, 7xoi:J, 7xoi:L, 7xoi:N, 7xoi:P
74 2ch4:A 320 66 0.1181 0.0531 0.2576 9.1 2ch4:B, 1i58:A, 1i58:B, 1i59:A, 1i59:B, 1i5a:A, 1i5a:B, 1i5b:A, 1i5b:B, 1i5c:A, 1i5c:B, 1i5d:A, 6mi6:A, 6mi6:B, 6mi6:C, 6mi6:D, 8oyq:B, 8oyq:A, 8oyz:B, 8oyz:A, 8oz9:B, 8oz9:A, 8p3n:B, 8p3n:A, 8p3r:A, 8p3r:B, 8p59:A, 8p59:B, 8pf2:B, 8pf2:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218