Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EEKILNREIGFAIGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKHIYNKLDKG
QIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMP
NLMLMAKESLYSQLPMDCFTMPSYSTKSLWVINSALRIKILCATYVNIDKIYVRTGIYHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRW
NEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKEEHCPLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNP
NKETPCLELEFDWFSSVVKFPDMSVIEEHANWSVRENDKEQLKAISTRDPLSEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLL
LSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAMELLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLL
VRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILKQEKKDETQK
VQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQ
DMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEI
YDAAIDLFTRSCAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDFLIVISKGAQ
ECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIAYIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAH

The query sequence (length=878) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4ykn:A 1205 902 0.9932 0.7237 0.9667 0.0 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
2 5swp:A 1060 926 0.9954 0.8245 0.9438 0.0 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
3 5itd:A 995 890 0.9818 0.8663 0.9685 0.0 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
4 5ubr:A 887 901 0.9749 0.9651 0.9501 0.0 5dxt:A, 7k6n:A
5 5dxh:D 981 893 0.9624 0.8614 0.9462 0.0 8gua:A, 6oac:A
6 7k71:A 843 875 0.9601 1.0000 0.9634 0.0 8gud:A
7 2y3a:A 976 900 0.4271 0.3842 0.4167 0.0
8 7lq1:A 950 893 0.4328 0.4000 0.4255 0.0 5ae8:A, 5ae9:A, 6eyz:A, 6ez6:A, 6g6w:A, 6hi1:A, 6hi2:A, 6hi9:A, 5l72:A, 7lm2:A, 6oco:A, 7pop:A, 7por:A, 7pos:A, 7pot:A, 6pyr:A, 6q6y:A, 6q73:A, 6q74:A, 6tnr:A, 6tns:A, 5vlr:A, 6zaa:A, 6zac:A, 6zad:A
9 6pyu:A 930 888 0.4282 0.4043 0.4234 0.0 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A
10 2wxl:A 823 883 0.4146 0.4423 0.4122 0.0 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
11 4bfr:A 855 896 0.4146 0.4257 0.4062 0.0 4bfr:B
12 5o83:A 794 882 0.4032 0.4458 0.4014 0.0 4ajw:B, 6dgt:A, 5is5:A, 7r2b:A, 4v0i:B
13 4ajw:A 765 878 0.3929 0.4510 0.3929 0.0 4v0i:A
14 1e7u:A 872 897 0.3781 0.3807 0.3701 2.13e-172 4anv:A, 3ibe:A
15 3zw3:A 831 883 0.3702 0.3911 0.3681 2.41e-171 2a4z:A, 4fhj:A, 4fhk:A, 6fh5:A, 6gq7:A, 4hvb:A, 5jha:A, 5jhb:A, 7jwe:A, 4kzc:A, 3lj3:A, 3mjw:A, 3nzu:A, 3p2b:A, 3qk0:A, 3sd5:A, 5t23:A, 6t3b:A, 6t3c:A, 4wwo:A, 4wwp:A, 6xrm:A, 6xrn:A, 3zvv:A
16 1e8w:A 851 896 0.3736 0.3854 0.3661 2.96e-169 2a5u:A, 4anu:A, 4anw:A, 4anx:A, 4aof:A, 3apc:A, 3apd:A, 3apf:A, 6aud:A, 6c1s:A, 2chw:A, 2chx:A, 2chz:A, 3csf:A, 3cst:A, 3dbs:A, 4dk5:A, 3dpd:A, 1e7v:A, 1e8x:A, 1e8z:A, 1e90:A, 5eds:A, 3ene:A, 4ezj:A, 4ezk:A, 4ezl:A, 4f1s:A, 4fa6:A, 4fad:A, 4fjy:A, 4fjz:A, 4flh:A, 4ful:A, 4g11:A, 5g2n:A, 5g55:A, 4gb9:A, 4hle:A, 4j6i:A, 7jwz:A, 5kae:A, 7kke:A, 4kz0:A, 3l08:A, 3l13:A, 3l16:A, 3l17:A, 3l54:A, 3ml8:A, 3ml9:A, 3nzs:A, 3oaw:A, 5oq4:A, 3pre:A, 3prz:A, 3ps6:A, 4ps3:A, 4ps7:A, 4ps8:A, 3qaq:A, 3qar:A, 3r7q:A, 3r7r:A, 3s2a:A, 8sc8:A, 3t8m:A, 3tjp:A, 3tl5:A, 4urk:A, 2v4l:A, 4wwn:A, 6xrl:A, 4xx5:A, 4xz4:A, 7z61:A
17 8sob:A 1005 924 0.3759 0.3284 0.3571 8.15e-167 8soa:A, 8soc:A
18 7jx0:A 801 884 0.3633 0.3983 0.3609 2.79e-166 3qjz:A
19 8sod:A 941 916 0.3656 0.3411 0.3504 7.25e-152 8soe:A
20 7bi6:A 829 776 0.2870 0.3040 0.3247 1.81e-116 8a9i:A, 7bi9:A, 7z74:A, 7z75:A
21 7bi2:A 1021 710 0.2677 0.2302 0.3310 9.01e-106
22 7bi2:A 1021 29 0.0137 0.0118 0.4138 7.6
23 6ykg:AAA 559 556 0.1720 0.2701 0.2716 5.28e-62 5anl:A, 5enn:A, 5enn:B, 6i3u:A, 3ls8:A, 3ls8:B, 4oys:A, 4ph4:B, 7rsj:A, 7rsp:A, 7rsp:B, 7rsv:A, 7rsv:B, 8rxr:A, 8rxr:B, 4uwf:A, 4uwg:A, 4uwh:A, 4uwk:A, 4uwl:A
24 2x6k:A 550 548 0.1800 0.2873 0.2883 3.32e-58 2x6f:A, 2x6f:B, 2x6i:A, 2x6i:B, 2x6j:A, 2x6j:B, 2x6k:B
25 6bq1:E 1510 493 0.1560 0.0907 0.2779 1.11e-38 6bq1:A
26 4d0l:E 479 251 0.0831 0.1524 0.2908 4.31e-27 5c4g:E, 4d0l:A, 4d0l:C, 4d0m:A, 4d0m:C, 4d0m:G, 4d0m:I, 4d0m:M, 4d0m:O, 4d0m:Q, 4d0m:S, 4d0m:W, 4d0m:Y, 4d0m:c, 4d0m:g, 5euq:E, 5fbl:A, 5fbq:A, 5fbr:A, 5fbv:A, 5fbw:A, 6gl3:A, 8q6f:A, 8q6g:A, 8q6h:A, 8vof:A, 4wae:A, 4wag:A
27 6s8f:F 2571 223 0.0706 0.0241 0.2780 1.27e-12 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
28 6zwm:B 2185 260 0.0729 0.0293 0.2462 1.77e-08 6zwm:A
29 8rch:A 2036 260 0.0729 0.0314 0.2462 1.81e-08 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
30 6bcu:A 2204 260 0.0729 0.0290 0.2462 2.30e-08 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
31 3jbz:A 960 219 0.0638 0.0583 0.2557 2.63e-08
32 7nfe:A 3585 243 0.0695 0.0170 0.2510 9.29e-08
33 7nfc:A 3562 245 0.0706 0.0174 0.2531 1.78e-07 8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
34 8bot:A 3528 241 0.0695 0.0173 0.2531 2.56e-07
35 8oxm:A 2748 90 0.0364 0.0116 0.3556 7.45e-06 8oxm:B
36 7sic:A 2773 90 0.0364 0.0115 0.3556 7.71e-06 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
37 7ni5:A 2791 90 0.0364 0.0115 0.3556 8.19e-06 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
38 7otm:A 3656 75 0.0342 0.0082 0.4000 1.09e-05 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
39 7otm:A 3656 95 0.0296 0.0071 0.2737 0.57 7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
40 6zhe:A 3768 75 0.0342 0.0080 0.4000 1.12e-05
41 6zhe:A 3768 95 0.0296 0.0069 0.2737 0.52
42 7su3:A 3802 75 0.0342 0.0079 0.4000 1.12e-05
43 7su3:A 3802 95 0.0296 0.0068 0.2737 0.53
44 7sgl:A 3852 75 0.0342 0.0078 0.4000 1.12e-05
45 7sgl:A 3852 95 0.0296 0.0067 0.2737 0.51
46 7k17:B 3645 75 0.0342 0.0082 0.4000 1.13e-05 7k17:A
47 7k17:B 3645 95 0.0296 0.0071 0.2737 0.54 7k17:A
48 8ez9:L 3662 75 0.0342 0.0082 0.4000 1.13e-05 8ez9:C
49 8ez9:L 3662 95 0.0296 0.0071 0.2737 0.54 8ez9:C
50 6zhe:F 3731 75 0.0342 0.0080 0.4000 1.13e-05
51 6zhe:F 3731 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.54
52 6zha:A 3707 75 0.0342 0.0081 0.4000 1.14e-05 6zh8:A
53 6zha:A 3707 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.55 6zh8:A
54 7sud:A 3740 75 0.0342 0.0080 0.4000 1.14e-05
55 7sud:A 3740 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.53
56 7k0y:A 3669 75 0.0342 0.0082 0.4000 1.15e-05
57 7k0y:A 3669 95 0.0296 0.0071 0.2737 0.54
58 7z87:A 3689 75 0.0342 0.0081 0.4000 1.15e-05
59 7z87:A 3689 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.55
60 8eza:L 3720 75 0.0342 0.0081 0.4000 1.15e-05 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
61 8eza:L 3720 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.50 8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
62 7k1k:A 3604 75 0.0342 0.0083 0.4000 1.16e-05 7k1b:A
63 7k1k:A 3604 95 0.0296 0.0072 0.2737 0.51 7k1b:A
64 5y3r:C 3636 75 0.0342 0.0083 0.4000 1.16e-05
65 5y3r:C 3636 95 0.0296 0.0072 0.2737 0.53
66 8ezb:C 3724 75 0.0342 0.0081 0.4000 1.17e-05 8ezb:L
67 8ezb:C 3724 95 0.0296 0.0070 0.2737 0.54 8ezb:L
68 7k1n:A 3634 75 0.0342 0.0083 0.4000 1.19e-05 7z88:A
69 7k1n:A 3634 95 0.0296 0.0072 0.2737 0.56 7z88:A
70 7k1j:A 3584 75 0.0342 0.0084 0.4000 1.20e-05 7k19:A
71 7k1j:A 3584 95 0.0296 0.0073 0.2737 0.52 7k19:A
72 6sl1:A 2652 236 0.0638 0.0211 0.2373 3.61e-05 6sky:A, 6sky:B
73 6skz:A 2638 236 0.0638 0.0212 0.2373 3.96e-05 6sl0:A, 6sl0:B
74 6z2w:E 2325 270 0.0786 0.0297 0.2556 9.29e-05 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
75 7pw9:A 1952 65 0.0251 0.0113 0.3385 8.83e-04 7pw4:A, 7pw5:A, 7pw6:A, 7pw7:A, 7pw8:A, 6z3r:A
76 6syt:A 1896 65 0.0239 0.0111 0.3231 0.007
77 1gq6:B 301 71 0.0216 0.0631 0.2676 2.0 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
78 3hxs:A 117 66 0.0239 0.1795 0.3182 5.3 3hyp:A
79 8jd5:2 785 36 0.0148 0.0166 0.3611 6.6 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
80 6pqp:A 615 177 0.0467 0.0667 0.2316 9.3 7or0:A, 7or0:B, 7or0:C, 7or0:D, 7or1:A, 7or1:B, 7or1:C, 7or1:D, 6pqo:D, 6pqo:A, 6pqo:B, 6pqo:C, 6pqp:B, 6pqp:D, 6pqp:C, 6pqq:A, 6pqq:D, 6pqq:B, 6pqq:C, 6v9v:A, 6v9v:B, 6v9v:D, 6v9v:C, 6v9w:A, 6v9w:B, 6v9w:D, 6v9w:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218