Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EEEPKELLEKDSKGNIIKLNEPSTISEDSKVSVTGLPLNKGPSEKIKRESLWNNRNDLKTFLTENMTEESNIRSTIGWNG
DENEDFCSACNQSGSFLCCDTCPKSFHFLCLDPPIDPNNLPKGDWHCNECKFKIFINNSMATLKKIESNFIKQNNNVKIF
AKLLFNIDSHNPKQFQLPNYIKETFPAVKTGSRGQYSDENDKIPLTDRQLFNTSYGQSITKLDSYNPDTHIDSNSGKFLI
CYKCNQTRLGSWSHPENSRLIMTCDYCQTPWHLDCVPRASFKNLGSKWKCPLHSPTKVYKKIVNYKVWKKQRLINKNQLY
YEPLQKIGYQNNGNIQIIPDFKITQIDENSIKYDFFDKIYKSKMVQKRK

The query sequence (length=369) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8hxx:N 375 368 0.9539 0.9387 0.9565 0.0 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
2 8ihn:M 357 368 0.8889 0.9188 0.8913 0.0 8kd4:E
3 7yi2:D 321 352 0.8618 0.9907 0.9034 0.0 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
4 8kd6:E 301 286 0.7236 0.8870 0.9336 0.0 8kd2:E
5 8w9c:F 156 120 0.3198 0.7564 0.9833 3.98e-83 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
6 8w9c:F 156 152 0.1328 0.3141 0.3224 5.19e-07 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
7 7yi0:F 120 99 0.2629 0.8083 0.9798 5.34e-66
8 7yi0:F 120 139 0.1247 0.3833 0.3309 8.79e-07
9 8i02:G 284 276 0.2547 0.3310 0.3406 1.16e-36 8ifg:P
10 8i02:F 235 122 0.1138 0.1787 0.3443 5.63e-20
11 8bpa:C 213 282 0.1762 0.3052 0.2305 1.73e-17 8c60:C
12 2ke1:A 66 54 0.0623 0.3485 0.4259 1.60e-13 2kft:A, 1xwh:A
13 2puy:B 60 49 0.0678 0.4167 0.5102 1.04e-12 2puy:A
14 2yql:A 56 49 0.0678 0.4464 0.5102 1.11e-12
15 2l5u:A 61 50 0.0569 0.3443 0.4200 4.81e-12
16 2l5u:A 61 31 0.0298 0.1803 0.3548 2.4
17 1mm3:A 61 50 0.0596 0.3607 0.4400 2.12e-11
18 1mm3:A 61 49 0.0407 0.2459 0.3061 0.062
19 6ryr:W 708 50 0.0623 0.0325 0.4600 1.33e-10 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
20 6q3m:C 219 50 0.0623 0.1050 0.4600 4.01e-10 6q3m:A, 6q3m:B
21 6ieu:A 170 50 0.0650 0.1412 0.4800 6.84e-10 6iet:A
22 6guu:B 204 50 0.0596 0.1078 0.4400 7.16e-10 6guu:A
23 3u5o:C 195 51 0.0623 0.1179 0.4510 3.40e-09 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
24 3u5m:E 173 49 0.0596 0.1272 0.4490 7.65e-09
25 3o36:A 184 49 0.0596 0.1196 0.4490 1.36e-08 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
26 7ebk:A 183 49 0.0596 0.1202 0.4490 2.48e-08 7ebj:A
27 2mny:A 55 45 0.0515 0.3455 0.4222 6.12e-08 2mnz:A
28 7klo:A 59 45 0.0542 0.3390 0.4444 9.22e-08 7klr:A
29 9atn:A 98 62 0.0623 0.2347 0.3710 2.95e-07
30 4ptb:A 178 51 0.0596 0.1236 0.4314 3.53e-07 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
31 2miq:A 94 47 0.0542 0.2128 0.4255 2.44e-06
32 5b73:A 313 80 0.0732 0.0863 0.3375 4.17e-06 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
33 6g8r:B 164 51 0.0542 0.1220 0.3922 1.42e-05 2md7:B, 2md8:C
34 4gnd:C 107 51 0.0542 0.1869 0.3922 2.39e-05 4gnd:A, 4gne:A, 4gnf:A, 4gng:A, 4gng:D
35 1f62:A 51 48 0.0461 0.3333 0.3542 2.89e-05
36 1f62:A 51 40 0.0379 0.2745 0.3500 0.10
37 5vab:A 54 44 0.0407 0.2778 0.3409 1.10e-04
38 6oie:B 111 51 0.0596 0.1982 0.4314 1.37e-04 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
39 4lk9:A 126 49 0.0542 0.1587 0.4082 3.56e-04 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
40 5hh7:A 192 49 0.0515 0.0990 0.3878 0.001
41 4gy5:A 215 47 0.0488 0.0837 0.3830 0.001 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
42 8bpb:C 126 61 0.0569 0.1667 0.3443 0.002 8bpc:C
43 8bpb:C 126 124 0.0786 0.2302 0.2339 0.017 8bpc:C
44 2ysm:A 111 61 0.0623 0.2072 0.3770 0.002
45 2ysm:A 111 49 0.0488 0.1622 0.3673 0.036
46 6fhq:A 58 48 0.0461 0.2931 0.3542 0.003 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
47 2naa:A 94 81 0.0596 0.2340 0.2716 0.006
48 4q6f:A 56 51 0.0434 0.2857 0.3137 0.007 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
49 2e6r:A 92 44 0.0434 0.1739 0.3636 0.012
50 7duf:A 62 54 0.0542 0.3226 0.3704 0.035 7duf:B
51 7duf:A 62 35 0.0379 0.2258 0.4000 1.6 7duf:B
52 2yt5:A 66 52 0.0434 0.2424 0.3077 0.043
53 5wlf:A 60 43 0.0407 0.2500 0.3488 0.044 5wle:A
54 5szb:A 115 71 0.0623 0.2000 0.3239 0.044 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
55 7xga:A 126 35 0.0379 0.1111 0.4000 0.052 6vfo:A
56 5yc3:A 60 35 0.0379 0.2333 0.4000 0.11 5yc4:A
57 4tvr:A 222 46 0.0407 0.0676 0.3261 0.18
58 5b79:A 118 50 0.0461 0.1441 0.3400 0.25 5vdc:A
59 1x4i:A 70 46 0.0461 0.2429 0.3696 0.55 7zmx:A, 7zmx:B
60 2e6s:A 77 34 0.0379 0.1818 0.4118 0.59
61 2l43:A 80 54 0.0434 0.2000 0.2963 0.74 2ku3:A
62 1wem:A 76 23 0.0271 0.1316 0.4348 0.78 4l7x:A, 2m3h:A
63 1gv4:A 490 95 0.0623 0.0469 0.2421 1.0 4bv6:A, 5fmh:A, 5fs8:A, 3gd3:B, 3gd3:C, 3gd3:D, 1gv4:B, 5kvi:A, 4lii:A
64 5xfr:A 309 71 0.0515 0.0615 0.2676 2.1 5xfr:B
65 2qic:A 51 33 0.0379 0.2745 0.4242 3.0
66 8fl2:SI 234 66 0.0515 0.0812 0.2879 4.6 8fkp:SI, 8fkq:SI, 8fkr:SI, 8fks:SI, 8fkt:SI, 8fku:SI, 8fkv:SI, 8fkw:SI, 8fkx:SI, 8fky:SI, 8fkz:SI, 8fl3:SI, 8fl6:SI, 8fl7:SI, 8fla:SI, 8flb:SI, 8fld:SI, 8fle:SI, 8ine:3, 8inf:3, 8ipx:1, 8ipy:1, 8ir3:3
67 1wes:A 71 56 0.0569 0.2958 0.3750 5.2 2g6q:A
68 7bbd:B 160 30 0.0325 0.0750 0.4000 7.1 8a58:C, 8a58:D, 8c07:I, 8f1f:C, 8f1f:c, 6fga:A, 6fga:B, 6fga:C, 6fga:D, 6fga:E, 6fga:F, 6fga:G, 6fga:H, 5m93:B, 5m93:C, 7nbb:C, 5o44:E, 6s53:B, 6s53:A, 6s53:H, 6s53:G, 3zlz:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218