Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EEECCICMDGRADLILPCAHSFCQKCIDKWSDRHRNCPICRL

The query sequence (length=42) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2ecn:A 70 42 1.0000 0.6000 1.0000 4.82e-27 5xek:A
2 5d0m:C 60 44 0.4524 0.3167 0.4318 4.88e-07 5ulh:C, 5ulk:C
3 4v3k:C 75 42 0.5000 0.2800 0.5000 7.30e-07 7ojx:A, 4v3k:F, 4v3l:C
4 1x4j:A 75 42 0.5000 0.2800 0.5000 7.71e-07
5 1iym:A 55 45 0.4524 0.3455 0.4222 1.42e-06
6 7r70:A 150 46 0.4762 0.1333 0.4348 2.85e-06 5d0i:A, 5d0i:B, 5d0k:C, 5d0k:F, 5d0k:I, 5d0k:L, 7r70:B, 7r71:A
7 1chc:A 68 43 0.3810 0.2353 0.3721 4.04e-06
8 4orh:H 142 42 0.4762 0.1408 0.4762 4.82e-06 4ayc:A, 4ayc:B, 4orh:C, 4orh:G, 4orh:K, 4orh:L, 4whv:C, 4whv:D, 4whv:I, 4whv:J
9 2kiz:A 69 44 0.4286 0.2609 0.4091 2.79e-05 5lg0:A, 5lg7:A, 7p2k:A
10 7t92:C 317 42 0.3333 0.0442 0.3333 4.98e-05
11 6w7z:B 71 44 0.3810 0.2254 0.3636 1.22e-04 6w9a:B, 6w9a:D, 6w9d:B, 6w9d:E, 6w9d:H
12 2lxh:C 58 43 0.3810 0.2759 0.3721 1.32e-04 2lxp:C
13 2ect:A 78 43 0.4048 0.2179 0.3953 1.48e-04
14 5j3x:B 389 40 0.3571 0.0386 0.3750 2.21e-04 4a4b:A, 4a4c:A, 1b47:A, 1b47:B, 1b47:C, 3bum:B, 3bun:B, 3buo:B, 3buo:D, 3buw:B, 3buw:D, 3bux:B, 3bux:D, 2cbl:A, 1fbv:A, 4gpl:B, 5hkx:A, 5hky:A, 5hkz:A, 5hl0:A, 5j3x:A, 5j3x:C, 5j3x:D, 5j3x:E, 5j3x:F, 2k4d:A, 5o76:A, 5o76:C, 3ob1:B, 3ob2:B, 3plf:B, 3plf:D, 7siy:A, 6xar:A, 6xar:B, 2y1m:A, 2y1m:B, 2y1m:C, 2y1m:D, 2y1m:E, 2y1m:F, 2y1n:A, 2y1n:C, 1yvh:A
15 4lad:B 69 42 0.3810 0.2319 0.3810 2.39e-04
16 5zbu:A 74 43 0.4048 0.2297 0.3953 2.73e-04 5zbu:D, 5zc4:A, 5zc4:D
17 7bvw:A 79 45 0.4048 0.2152 0.3778 3.36e-04 7bvw:B
18 7zj3:A 86 42 0.3571 0.1744 0.3571 3.43e-04 8a38:A, 8a38:B, 8a38:C, 8ams:C, 8ams:D, 7zj3:D, 7zj3:G, 7zj3:J
19 5jw7:B 61 40 0.4286 0.2951 0.4500 6.58e-04
20 6f98:A 78 27 0.3095 0.1667 0.4815 8.30e-04
21 6a3z:A 56 27 0.2857 0.2143 0.4444 0.001
22 3t6p:A 330 43 0.4048 0.0515 0.3953 0.001 3d9t:A, 3d9t:B, 3d9u:A, 8dsf:A, 8dsf:B, 8dsf:C, 8dsf:D, 8dso:D, 4eb9:A, 4eb9:B, 4eb9:C, 4eb9:D, 6exw:A, 6exw:C, 6hpr:A, 4hy4:A, 4hy4:B, 4hy5:A, 4hy5:B, 4lge:A, 4lge:B, 4lgu:A, 4lgu:B, 5m6n:A, 5m6n:B, 4mti:A, 4mti:B, 3mup:A, 3mup:B, 3mup:C, 3mup:D, 4mu7:A, 4mu7:B, 3oz1:A, 3oz1:B, 3oz1:C, 3oz1:D, 1qbh:A, 7trm:A, 3uw4:A, 6w74:A, 6w7o:C, 6w7o:D, 6w8i:F, 6w8i:D, 6w8i:E
23 7oik:A 4426 41 0.3571 0.0034 0.3659 0.002 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
24 2ecj:A 58 44 0.3571 0.2586 0.3409 0.002
25 2ep4:A 74 45 0.4048 0.2297 0.3778 0.002
26 6l8n:A 810 51 0.3810 0.0198 0.3137 0.002
27 6wi7:A 206 29 0.3095 0.0631 0.4483 0.003 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
28 6wi7:A 206 44 0.3571 0.0728 0.3409 9.0 2ckl:A, 8grm:M, 2h0d:A, 7nd1:H, 8pp7:K, 8pp7:M, 4r8p:K, 4r8p:M, 3rpg:B, 6wi8:A, 6wi8:B
29 2l0b:A 91 34 0.2857 0.1319 0.3529 0.004
30 2ea6:A 69 47 0.3571 0.2174 0.3191 0.009
31 7bbd:B 160 43 0.4048 0.1062 0.3953 0.010 8a58:C, 8a58:D, 8c07:I, 8f1f:C, 8f1f:c, 6fga:A, 6fga:B, 6fga:C, 6fga:D, 6fga:E, 6fga:F, 6fga:G, 6fga:H, 5m93:B, 5m93:C, 7nbb:C, 5o44:E, 6s53:B, 6s53:A, 6s53:H, 6s53:G, 3zlz:B
32 5olm:B 132 43 0.4048 0.1288 0.3953 0.014 5jpx:A, 5olm:A
33 5ait:A 129 47 0.3571 0.1163 0.3191 0.019 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
34 5ait:A 129 47 0.3571 0.1163 0.3191 0.019 5aiu:A, 4ap4:A, 3ng2:A, 3ng2:B, 4ppe:A, 4ppe:B, 2xeu:A
35 5vo0:D 159 39 0.4048 0.1069 0.4359 0.019 5vnz:A, 5vnz:D, 5vo0:A
36 4tkp:B 63 43 0.4286 0.2857 0.4186 0.026
37 2ecw:A 85 49 0.4048 0.2000 0.3469 0.044
38 3zni:A 390 40 0.3571 0.0385 0.3750 0.061 4a49:A, 5axi:B, 5axi:A, 5axi:C, 9fqh:A, 9fqi:A, 9fqj:A, 9fqj:B, 8gcy:A, 2ldr:A, 3pfv:A, 3pfv:B, 8qng:A, 8qnh:A, 8qni:A, 8qtg:A, 8qth:A, 8qtj:A, 8qtk:A, 8vw4:A, 8vw4:B, 8vw5:A, 8vw5:B, 3zni:E, 3zni:I, 3zni:M
39 5ywr:B 87 40 0.3810 0.1839 0.4000 0.088
40 7z36:B 446 44 0.3333 0.0314 0.3182 0.090 6h3a:A, 6h3a:F, 6qaj:A, 6qaj:B, 6qu1:A, 2yvr:A, 2yvr:B, 7z36:A
41 2ecv:A 85 49 0.4048 0.2000 0.3469 0.098
42 2d8t:A 71 40 0.3571 0.2113 0.3750 0.14
43 2eci:A 86 39 0.4048 0.1977 0.4359 0.23
44 6yxe:A 89 46 0.4286 0.2022 0.3913 0.25 6yxe:B
45 5eya:G 86 45 0.3571 0.1744 0.3333 0.26 5eya:F, 5fer:A, 5fer:D
46 3eb5:A 65 43 0.3810 0.2462 0.3721 0.29 3eb6:A
47 2y43:A 88 39 0.3333 0.1591 0.3590 0.35 2y43:B
48 4qpl:A 153 40 0.3571 0.0980 0.3750 0.43 4qpl:C, 3v3l:A, 3v3l:B
49 2ysl:A 73 45 0.3571 0.2055 0.3333 0.51 2ysj:A
50 3hcs:A 157 39 0.4048 0.1083 0.4359 0.57 3hcs:B, 3hct:A, 3hcu:A, 3hcu:C, 8hz2:A, 8hz2:B, 2jmd:A, 7l3l:B, 7l3l:D
51 5din:B 124 25 0.2381 0.0806 0.4000 0.60 5din:A
52 7enc:0 306 24 0.2381 0.0327 0.4167 0.74 1g25:A, 8gxq:HD, 8gxs:HD, 6nmi:H, 7nvw:3, 7nvx:3, 7nvy:3, 7nvz:3, 8wak:0, 8wal:0, 8wan:0, 8wao:0, 8wap:0, 8waq:0, 8war:0, 8was:0
53 8gui:K 72 34 0.2619 0.1528 0.3235 0.80 8guj:K, 8iej:M, 5trb:A
54 8adl:A 633 27 0.2381 0.0158 0.3704 0.93 8adl:I
55 2djb:A 72 31 0.2619 0.1528 0.3548 0.97
56 7lbm:d 275 24 0.2381 0.0364 0.4167 1.1 8byq:7
57 2ct2:A 88 46 0.3571 0.1705 0.3261 1.2 5fey:A, 5fey:B
58 7xyz:B 456 47 0.3333 0.0307 0.2979 1.3 7xv2:A, 7xyy:A, 7xyy:B, 7xyz:A, 7xyz:C, 7xyz:D, 7xz0:A, 7xz0:B, 7xz1:A, 7xz1:B, 7xz2:A, 7xz2:B, 7xz2:C, 7xz2:D
59 8ras:F 568 19 0.1905 0.0141 0.4211 1.4
60 8rdj:F 660 19 0.1905 0.0121 0.4211 1.4
61 7egb:0 236 24 0.2381 0.0424 0.4167 1.5 7egc:0
62 8gui:L 73 36 0.3095 0.1781 0.3611 1.5 8guj:L, 8iej:A
63 7dco:M 176 39 0.2857 0.0682 0.3077 1.7 5gm6:a
64 7nvr:3 214 24 0.2381 0.0467 0.4167 1.9
65 4r7e:A 69 27 0.2619 0.1594 0.4074 1.9 8ieg:A, 8ieg:B, 8t3t:K, 8t3t:L, 8t3w:K, 8t3w:L, 8t3y:K, 8t3y:L
66 5h7r:D 124 39 0.3095 0.1048 0.3333 2.0 5h7s:D, 5h7s:B
67 1bor:A 56 27 0.2381 0.1786 0.3704 2.0 2mwx:A, 5yuf:A, 5yuf:B, 5yuf:C, 5yuf:D
68 7a6q:A 489 17 0.1905 0.0164 0.4706 2.1 7a6q:B, 5fhz:A, 5fhz:B, 5fhz:C, 5fhz:D, 5fhz:E, 5fhz:G, 5fhz:H, 7qk8:A, 7qk8:B, 7qk9:A, 7qk9:B, 6s6w:A, 6s6w:B, 6te5:A, 6te5:B, 6tgw:A, 6tgw:B, 6tgw:C, 6tgw:D, 6try:A, 6try:B
69 8f5o:B 1134 21 0.2143 0.0079 0.4286 2.2 8f5p:B
70 5fog:D 284 43 0.3095 0.0458 0.3023 2.3 5fog:A, 5fog:B, 5fog:C, 5fol:A, 5fom:A
71 5fhz:F 449 17 0.1905 0.0178 0.4706 2.3
72 8adl:B 801 23 0.2143 0.0112 0.3913 2.5 8adl:G, 8adl:O, 8adl:J
73 4z4k:A 282 12 0.1667 0.0248 0.5833 3.1 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
74 7xe1:A 751 21 0.1667 0.0093 0.3333 3.5 4fwe:A, 4fwf:A, 4fwj:A, 4fwj:B, 4gu0:A, 4gu0:C, 4gu0:B, 4gu0:D, 4gu1:A, 4gu1:B, 4gur:A, 4gus:A, 4gut:A, 4guu:A, 4hsu:A, 6r1u:K, 6r25:K, 7xe1:B, 7xe2:A, 7xe2:B, 7xe3:A, 7xe3:B
75 4s3o:C 95 30 0.2143 0.0947 0.3000 3.6 4s3o:F
76 3nvt:A 345 12 0.1905 0.0232 0.6667 4.2 3nvt:B, 3tfc:A, 3tfc:B
77 2ma6:A 61 42 0.2857 0.1967 0.2857 4.6
78 7r5j:D4 1312 33 0.2143 0.0069 0.2727 4.8 7r5j:D0, 7r5j:D1, 7r5j:D2, 7r5j:D3, 7r5j:D5, 7r5k:D4, 7r5k:D0, 7r5k:D1, 7r5k:D2, 7r5k:D3, 7r5k:D5
79 5g5l:A 1480 23 0.2143 0.0061 0.3913 5.0 6h67:A, 6h68:A, 5m3m:A, 5m5y:A, 5m64:A, 5n5y:A, 5n5z:A, 5n60:A, 6rqt:A, 6rrd:A, 6rui:A, 6ruo:A, 6rwe:A, 6tps:A
80 8iqi:C 916 15 0.1905 0.0087 0.5333 5.1 8iqc:A, 8iqc:B, 8iqd:A, 8iqd:B, 8iqd:C, 8iqd:D, 8iqi:A, 8iqi:B, 8iqi:D, 8iqi:E, 8iqi:F
81 2ecm:A 55 26 0.1905 0.1455 0.3077 5.3
82 7oni:R 86 24 0.2143 0.1047 0.3750 5.4 2ecl:A, 6v9i:R
83 7ah2:AAA 58 19 0.1905 0.1379 0.4211 5.7 7ah2:BBB
84 3ztg:A 92 42 0.4048 0.1848 0.4048 5.9 3ztg:B
85 7ahz:GGG 60 19 0.1905 0.1333 0.4211 6.2 7ahy:AAA, 7ahy:BBB, 7ahz:AAA, 7ahz:DDD, 7ahz:JJJ
86 2yur:A 74 43 0.4048 0.2297 0.3953 6.4
87 6bxn:A 294 17 0.1905 0.0272 0.4706 6.5
88 4txa:A 367 40 0.2857 0.0327 0.3000 6.6 5f5f:A, 5f5f:G, 5f5f:C, 5f5f:E, 5f5h:A, 5f5h:B, 4qi2:A, 4qi2:B, 4qi2:C, 4qi2:D, 4qik:A, 4qik:B, 4qil:B, 4qil:A, 6tqa:A, 6tqa:B, 6tqa:C, 6tqa:D, 6tqb:A, 4ywq:A, 4zld:A
89 7obb:A 1510 23 0.2143 0.0060 0.3913 7.5
90 6sc6:A 365 19 0.1667 0.0192 0.3684 8.6 5edv:A, 5edv:B, 6gzy:A, 6gzy:B, 6kc5:B, 6kc6:A, 6kc6:C, 6kc6:E, 6kc6:G, 6kc6:I, 6kc6:K, 4ljo:A, 4ljp:A, 4ljq:B, 4ljq:C, 4ljq:A, 4ljq:D, 6sc5:A, 6sc7:A, 6sc8:A, 6sc9:A, 7v8f:B, 7v8g:D, 7v8g:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218