BioLiP

>protein
EDNNRIISRLWRSFRTVKEMAADRGYFISQEEMDQSLEEFRSKICDSMGNPQRKLMSFLANPTPEALEKYSDLGTLWVEF
CDEPSVGIKTMRNFCLRIQEKNFSTGIFIYQNNITPSANKMIPTVSPAIIETFQESDLVVNITHHELVPKHIRLSDGEKS
QLLQRYKLKESQLPRIQREDPVARYLGLKRGQVVKIIRRSETSGRYASYRICL

The query sequence (length=213) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6a5p:E	213	213	1.0000	1.0000	1.0000	2.24e-161	8h0v:E, 8h0w:E, 8he5:E, 6inq:E, 6j4w:E, 6j4x:E, 6j4y:E, 6j4z:E, 6j50:E, 8jh4:E, 7wbv:E, 7wbw:E, 7wbx:E, 7xn7:E, 5xog:E, 7xsx:E, 7xsz:E, 7xt7:E, 7xtd:E, 7xti:E, 8yfq:E
2	8bws:E	215	213	0.7371	0.7302	0.7371	4.07e-123	5c44:E, 5c4a:E, 5c4x:E, 6cnb:E, 2e2i:E, 6eu1:E, 3gtj:E, 3gtk:E, 3gtl:E, 3gtm:E, 6i84:E, 7kef:E, 3m4o:E, 7nky:E, 2nvq:E, 2nvx:E, 5oqm:E, 1r9t:E, 7rim:E, 7rip:E, 7riq:E, 7riw:E, 7rix:E, 7riy:E, 8tug:E, 8tvp:E, 8tvw:E, 8tvx:E, 8tvy:E, 6upx:E, 6upy:E, 6uq0:E, 6uq1:E, 6uq2:E, 6uq3:E, 4y52:E, 4y7n:E, 7z1m:E, 7z1o:E
3	7d58:E	210	214	0.4460	0.4524	0.4439	7.40e-64	8a3y:E, 8a40:E, 7ae1:E, 7ae3:E, 7aea:E, 7b0y:E, 8b3d:E, 8b3f:E, 7dn3:E, 6exv:E, 7fji:E, 7fjj:E, 6gmh:E, 6gml:E, 8gxq:PE, 8iue:E, 8iuh:E, 5iy7:E, 5iy8:E, 5iy9:E, 5iyc:E, 5iyd:E, 8oeu:E, 8oev:E, 8oew:E, 8of0:E, 5oik:E, 7okx:E, 7oky:E, 7ol0:E, 7oo3:E, 7oob:E, 7oop:E, 7opc:E, 7opd:E, 8p4a:E, 8p4b:E, 8p4f:E, 7pks:E, 8rbx:E, 8s51:E, 8s52:E, 8s54:E, 8s5n:E, 6ted:E, 8uhd:E, 7und:E, 8w8e:E, 8w8f:E, 8wak:s, 8wal:s, 8wan:s, 8wao:s, 8wap:s, 8waq:s, 8war:s, 8was:s, 8wat:s, 8wau:s, 8wav:s, 8waw:s, 8wax:s, 8way:s, 8waz:s, 8wb0:s
4	8xmc:E	198	208	0.3991	0.4293	0.4087	9.18e-47	8xmd:E, 8xme:E
5	8hyj:E	209	203	0.3239	0.3301	0.3399	5.84e-30
6	6oz1:A	643	24	0.0563	0.0187	0.5000	0.63
7	6zu5:LG0	202	31	0.0563	0.0594	0.3871	1.4
8	6kzd:A	282	86	0.1127	0.0851	0.2791	2.8	6kzc:A, 3v5q:A, 3v5q:B, 4ymj:A, 4ymj:B
9	5mss:A	717	24	0.0563	0.0167	0.5000	4.0	5mst:A, 5mst:B, 5msw:A
10	1q20:A	294	50	0.0798	0.0578	0.3400	4.4	1q1q:A, 1q1z:A, 1q22:A
11	1lml:A	465	69	0.0657	0.0301	0.2029	4.9
12	8uvx:A	222	39	0.0563	0.0541	0.3077	5.8	8uvk:A, 8uvk:B, 8uvx:B
13	8euh:A	418	61	0.0798	0.0407	0.2787	6.8	1cpt:A, 8euk:A, 8eul:A

[Back]