Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EDKKQALLEAATQAIAQSGIAASTAVIARNAGVAEGTLFRYFATKDELINTLYLHLKQDLCQSMIMELDRSITDAKMMTR
FIWNSYISWGLNHPARHRAIRQLAVSEKLTKETEQRADDMFPELRDLCHRSVLMVFMSDEYRAFGDGLFLALAETTMDFA
ARDPARAGEYIALGFEAMWRALTRE

The query sequence (length=185) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6ko7:C 186 185 1.0000 0.9946 1.0000 5.30e-138 6ie8:A, 6ie9:A, 6ko7:A, 6ko7:B, 6ko7:D, 6ko9:A, 6ko9:B, 6ko9:C, 6ko9:D, 7n4w:A, 7n4z:A, 7n4z:C, 7n4z:B, 7n4z:D, 7n53:A, 7n53:B, 7n54:A, 7n54:B, 7n54:C, 7n54:D, 3vvy:A, 3vvy:B, 3vvy:C, 3vvy:D, 3vvz:A, 3vvz:B, 3vvz:C, 3vvz:D, 3vw0:B, 3vw0:D, 3vw1:B, 3vw1:D, 3vw2:A, 3vw2:B, 3vw2:C, 3vw2:D
2 4i6z:B 200 97 0.1676 0.1550 0.3196 8.01e-07 4i76:A
3 5gpc:A 190 52 0.1081 0.1053 0.3846 7.14e-05 5gpc:B, 5gpc:C, 5gpc:D
4 3whc:A 190 52 0.1027 0.1000 0.3654 1.03e-04 1vi0:A, 1vi0:B, 3whb:A, 3whb:B, 3whc:B, 3whc:C, 3whc:D, 3whc:E, 3whc:F
5 4w97:A 196 51 0.1027 0.0969 0.3725 0.001
6 7xaq:B 201 129 0.1622 0.1493 0.2326 0.001 8hjb:A, 7xaq:D, 7xaq:H, 7xaq:A, 7xaq:G, 7xaq:C
7 5x3r:A 203 55 0.1081 0.0985 0.3636 0.001 7amn:B, 7amn:A, 7amt:B, 7amt:A, 5x3r:B, 5x3r:C, 5x3r:D
8 5d1r:A 227 78 0.1081 0.0881 0.2564 0.002 5d1r:B
9 7k1c:B 208 62 0.1189 0.1058 0.3548 0.021 7k1a:A, 7k1a:B, 7k1c:A, 7kd8:A, 7kd8:B, 7kd8:D, 7kd8:C, 2uxh:A, 2uxh:B, 2uxi:A, 2uxi:B, 2uxo:B, 2uxp:A, 2uxp:B, 2uxu:A, 2uxu:B
10 7xxn:A 198 51 0.0973 0.0909 0.3529 0.026 7xxt:A
11 6g8g:A 195 63 0.1135 0.1077 0.3333 0.050 6g8g:B, 6g8g:C, 6g8g:D, 6g8h:CCC, 6g8h:BBB
12 4l62:A 190 127 0.1622 0.1579 0.2362 0.082 4l62:B, 4l62:C, 4l62:D, 4l62:E, 4l62:F, 4l62:G, 4l62:H, 4l62:I, 4l62:J, 4l62:K, 4l62:L, 4l62:M, 4l62:N, 4l62:O, 4l62:P
13 6en8:C 191 83 0.1135 0.1099 0.2530 0.12 6el2:A, 6el2:B, 6en8:D, 6en8:F, 6en8:A, 6en8:B, 6en8:E
14 3hth:B 173 49 0.0919 0.0983 0.3469 0.24 3hth:A, 3hti:A, 3htj:A, 3htj:B
15 5fmp:A 184 50 0.1081 0.1087 0.4000 0.40 5aqc:A, 5aqc:B, 5cw8:A, 5cw8:B, 5cxi:A, 5cxi:B, 5fmp:B, 5ua1:B, 5ua1:A, 5ua2:A
16 4gct:C 190 61 0.0811 0.0789 0.2459 0.45 4gct:A, 4gct:B, 4gct:D, 5haw:A, 5haw:B
17 7acm:B 178 48 0.0919 0.0955 0.3542 0.86 7acm:A
18 4za6:A 188 51 0.0811 0.0798 0.2941 0.92
19 6z1b:B 202 47 0.0973 0.0891 0.3830 0.93 4jyk:A, 4jyk:B, 3loc:A, 3loc:B, 3loc:C, 3loc:D, 4xk4:A, 4xk4:B, 4xk4:C, 4xk4:D, 6z1b:A
20 2np5:A 187 34 0.0811 0.0802 0.4412 1.0
21 3aqt:B 196 116 0.1405 0.1327 0.2241 1.1 3aqt:A
22 5yej:C 169 54 0.1027 0.1124 0.3519 1.2 5yej:B, 5yej:A
23 4gcl:B 196 30 0.0595 0.0561 0.3667 1.7 4gck:A, 4gck:B, 4gck:C, 4gck:D, 4gcl:A, 4gcl:C, 4gcl:D, 4gcl:E, 4gcl:G, 4gcl:H, 4gcl:F, 5hbu:A, 5hbu:B, 5hbu:C, 5hbu:D, 5hbu:E, 5hbu:G, 5hbu:H, 5hbu:F, 5hsz:A, 5k58:E, 5k58:F, 5k58:A, 5k58:B
24 3ang:C 201 48 0.0757 0.0697 0.2917 2.0 3ang:D, 3ang:A, 3ang:B, 3anp:C, 3anp:D, 3anp:A, 3anp:B
25 3wd7:A 401 92 0.1351 0.0623 0.2717 2.1 7cct:A, 6l7j:A, 3wd7:B
26 3v78:B 173 47 0.0919 0.0983 0.3617 3.4 3v78:A
27 5u9c:A 288 29 0.0757 0.0486 0.4828 3.7 5u9c:C
28 8aas:B 178 43 0.0865 0.0899 0.3721 4.0 8oej:B, 8oej:H, 8oel:B, 8oel:H
29 5h58:B 204 70 0.0973 0.0882 0.2571 4.7 5h58:A, 5h58:C, 5h58:D, 4pxi:A, 4pxi:B, 4pxi:C, 4pxi:D
30 2qlw:B 108 30 0.0541 0.0926 0.3333 7.1 2qlx:A, 2qlx:B
31 2v57:C 172 90 0.1351 0.1453 0.2778 7.6 2v57:A
32 4uny:C 330 38 0.0541 0.0303 0.2632 8.5 4unx:A, 4unx:C, 4unx:E, 4uny:A, 4uny:E, 4unz:A, 4unz:C, 4unz:E, 4uo1:A, 4uo1:C, 4uo1:E, 4uo2:A, 4uo2:C, 4uo2:E, 4uo5:A, 4uo5:C, 4uo5:E, 4uo6:A, 4uo7:A, 4uo7:C, 4uo7:E, 4uo8:A
33 5mym:C 205 102 0.1405 0.1268 0.2549 8.9 4dw6:A, 5eyr:A, 5ezg:A, 5ezh:A, 5f04:A, 5f08:A, 5f0c:A, 5f0f:A, 5f0h:A, 5f1j:A, 5f27:A, 3g1l:A, 3g1m:A, 3g1o:A, 6hnx:A, 6hnz:A, 6ho0:A, 6ho1:A, 6ho2:A, 6ho3:A, 6ho4:A, 6ho5:A, 6ho6:A, 6ho7:A, 6ho8:A, 6ho9:A, 6hoa:A, 6hob:A, 6hoc:A, 6hod:A, 6hoe:A, 6hof:A, 5ioy:A, 5ioz:A, 5ip6:A, 5ipa:A, 5j1r:A, 5j1u:A, 5j1y:A, 5j3l:A, 4m3b:A, 4m3d:A, 4m3e:A, 4m3f:A, 4m3g:A, 5mwo:A, 5mxk:A, 5mxv:A, 5myl:A, 5mym:B, 5myn:A, 5myr:A, 5mys:A, 5myt:A, 5myw:A, 7ngd:A, 7ngg:C, 7ngi:A, 7ngj:A, 7ngk:A, 7ngm:A, 7ngn:A, 7ngo:A, 7ngr:A, 7ngs:A, 7ngt:A, 7ngu:A, 7ngw:A, 7ngx:A, 7ngy:A, 5nim:A, 5nio:A, 5niz:A, 5nj0:A, 5nz0:A, 5nz1:A, 5nz1:C, 5nz1:D, 3o8g:A, 3o8h:A, 3q0u:A, 3q0v:A, 3q0v:B, 3q0w:A, 3q3s:A, 6r1p:A, 6r1s:A, 3sdg:A, 3sfi:A, 3tp0:A, 1u9n:A, 1u9o:A, 1u9o:B
34 6yl2:B 192 60 0.0973 0.0938 0.3000 9.4 6yl2:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218