BioLiP

>protein
EDGKVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPS
ETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLA
QCINGKVLIMHGGLFSEDGVTLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLD
YIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYA

The query sequence (length=309) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1wao:1	471	309	1.0000	0.6561	1.0000	0.0	2bug:A, 8gae:E, 8gft:E, 3h60:A, 3h60:B, 3h61:A, 3h61:D, 3h62:C, 3h62:B, 3h63:A, 3h63:C, 3h64:A, 3h64:D, 3h66:A, 3h66:B, 3h67:A, 3h67:D, 3h68:A, 3h68:D, 3h69:A, 3h69:D, 5hpe:A, 4ja7:A, 4ja9:A, 1s95:A, 1s95:B, 5ui1:A, 5ui1:B, 5ui1:C, 5ui1:D, 1wao:2, 1wao:3, 1wao:4, 5wg8:A, 4zvz:A, 4zvz:B, 4zvz:C, 4zvz:D, 4zx2:A
2	7obe:A	480	309	0.6214	0.4000	0.6214	8.34e-147	7obe:B
3	3icf:A	316	301	0.4498	0.4399	0.4618	2.03e-89	3icf:B
4	8uwb:C	309	295	0.3916	0.3916	0.4102	4.74e-74	7cun:Q, 3dw8:C, 3dw8:F, 3fga:C, 4i5l:F, 4i5l:C, 4i5n:F, 4i5n:C, 2iae:C, 2iae:F, 2ie3:C, 2ie4:C, 7k36:C, 3k7v:C, 3k7w:C, 4lac:C, 2npp:C, 2npp:F, 6nts:C, 2nyl:C, 2nyl:F, 2nym:C, 2nym:F, 3p71:C, 7pks:q, 8rbx:q, 8rbz:q, 8rc4:q, 8so0:C, 8ttb:C, 8twi:C, 8u1x:C, 8u89:C, 8uwb:F, 5w0w:F, 7ycx:Q
5	8pq7:C	289	248	0.3657	0.3910	0.4556	2.94e-71	8pq7:A
6	7qwj:A	298	259	0.3625	0.3758	0.4324	7.83e-70	8a8f:A
7	4or9:A	399	300	0.3883	0.3008	0.4000	2.08e-68	4ora:A, 4orc:A
8	6zej:I	351	241	0.3463	0.3048	0.4440	8.98e-67	6alz:A, 6alz:B, 2bcd:A, 2bdx:A, 6czo:A, 6czo:C, 6dno:A, 8dwk:A, 8dwk:B, 8dwl:C, 8dwl:A, 3e7a:A, 3e7a:B, 3e7b:A, 3e7b:B, 3egg:A, 3egg:B, 3egh:A, 3egh:B, 1fjm:A, 1fjm:B, 6g0i:A, 6g0j:A, 4g9j:A, 4g9j:B, 6ghm:A, 6ghm:B, 3hvq:A, 3hvq:B, 1it6:A, 1it6:B, 1jk7:A, 4mov:A, 4mov:B, 4moy:A, 4mp0:C, 4mp0:A, 3n5u:A, 3n5u:B, 7nzm:B, 2o8g:A, 2o8g:B, 6obn:A, 6obn:B, 6obp:A, 6obq:A, 6obq:B, 6obr:A, 6obr:B, 6obs:A, 6obs:B, 6obu:A, 6obu:B, 7qfb:A, 7sd0:C, 8sw5:A, 8sw5:B, 8sw6:A, 8sw6:B, 7t0y:A, 7t0y:C, 7tvf:F, 7tvf:C, 7txh:C, 7txh:F, 1u32:A, 8u5g:A, 7upi:B, 4ut2:A, 4ut2:B, 4ut3:A, 4ut3:B, 4v0u:D, 4v0u:F, 4v0u:H, 4v0u:J, 4v0u:N, 4v0v:A, 4v0v:C, 4v0w:A, 4v0w:C, 4v0x:A, 3v4y:A, 3v4y:C, 3v4y:E, 3v4y:G, 4xpn:A, 4xpn:C, 6zee:P, 6zee:Q, 6zee:B, 6zee:A, 6zee:I, 6zee:K, 6zef:A, 6zef:B, 6zeg:A, 6zeg:B, 6zeh:A, 6zeh:B, 6zei:A, 6zei:B, 6zej:D, 6zej:A, 6zej:F, 6zej:L, 6zej:O, 6zk6:A, 5zqv:A, 5zqv:B, 5zqv:D, 5zqv:C, 5zt0:A, 5zt0:C, 5zt0:B, 5zt0:D, 5zt0:E, 5zt0:F
9	1s70:A	309	268	0.3625	0.3625	0.4179	3.84e-66
10	5b8i:A	359	319	0.4045	0.3482	0.3918	7.62e-66	6tz7:A
11	4il1:A	529	319	0.3916	0.2287	0.3793	1.32e-65	1aui:A, 1aui:B, 9b9g:H, 9b9g:J, 5c1v:A, 5c1v:B, 4f0z:B, 4il1:B, 4il1:C, 4il1:D, 2jog:A, 3ll8:A, 3ll8:B, 3ll8:C, 3ll8:D, 1m63:A, 1m63:B, 1m63:E, 1m63:F, 1mf8:A, 1mf8:B, 6nuc:A, 6nuc:B, 6nuf:A, 6nuf:B, 6nuu:A, 6nuu:B, 4or9:B, 4ora:B, 4orb:A, 4orb:B, 4orc:B, 2p6b:A, 2p6b:C, 2p6b:B, 2p6b:D, 5sve:A, 5sve:B, 1tco:A, 1tco:B, 6uuq:A
12	6tz6:A	361	318	0.3981	0.3407	0.3868	2.21e-65	6tz6:D
13	6tz8:D	373	316	0.4045	0.3351	0.3956	3.30e-65	6tz8:A
14	5jpf:A	290	246	0.3333	0.3552	0.4187	8.27e-58
15	2z72:A	338	161	0.1359	0.1243	0.2609	3.68e-05	1v73:A, 2zbm:A
16	1g5b:B	221	69	0.0809	0.1131	0.3623	1.15e-04	1g5b:A, 1g5b:C
17	5vjv:A	298	79	0.0939	0.0973	0.3671	0.013	5vjw:A
18	6t2b:B	439	89	0.0906	0.0638	0.3146	0.21	6t2b:A, 6t2b:C, 6t2b:D
19	6uqq:C	280	62	0.0550	0.0607	0.2742	3.9	3sop:A, 3sop:B, 6uqq:D, 4z51:A, 4z54:A, 4z54:B
20	6can:A	616	44	0.0485	0.0244	0.3409	4.1	6can:B, 5t88:A, 5t88:B
21	4j6o:A	261	148	0.1036	0.1226	0.2162	5.2	4j6o:B
22	2y9z:B	595	35	0.0421	0.0218	0.3714	6.4
23	3ki9:A	467	72	0.0680	0.0450	0.2917	7.4
24	4rck:A	204	58	0.0583	0.0882	0.3103	9.4	4rck:B
25	2qjc:A	222	72	0.0583	0.0811	0.2500	9.7

[Back]