Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ECIENYAKVNGIYIYYKLCKAPEEKAKLMTMHGGPGMSHDYLLSLRDMTKEGITVLFYDQFGCGRSEEPDQSKFTIDYGV
EEAEALRSKLFGNEKVFLMGSSYGGALALAYAVKYQDHLKGLIVSGGLSSVPLTVKEMNRLIDELPAKYRDAIKKYGSSG
SYENPEYQEAVNYFYHQHLLRSEDWPPEVLKSLEYAERRNVYRIMNGPNQFTITGTIKDWDITDKISAIKIPTLITVGEY
DEVTPNVARVIHEKIAGSELHVFRDCSHLTMWEDREGYNKLLSDFILKHL

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1mu0:A 293 290 0.9966 0.9863 0.9966 0.0 1xqw:A, 1xqx:A, 1xqy:A, 1xrl:A, 1xrm:A, 1xrn:A, 1xro:A, 1xrp:A, 1xrq:A, 1xrr:A
2 6eb3:B 268 289 0.2552 0.2761 0.2561 1.90e-14 6eb3:A, 6eb3:C, 6eb3:D
3 2og1:A 285 200 0.1966 0.2000 0.2850 4.24e-13 2puh:A, 2puj:A, 2rht:A, 2rhw:A, 3v1m:A, 3v1n:A
4 5h3h:B 269 289 0.2414 0.2602 0.2422 6.16e-13 5h3h:A
5 2ocg:A 254 282 0.2379 0.2717 0.2447 5.44e-11 2oci:A, 2ock:A, 2ocl:A
6 1iun:B 276 267 0.2138 0.2246 0.2322 9.18e-10 2d0d:A, 1iuo:A, 1iup:A, 1uk7:A, 1uk8:A, 1uk9:A, 1uka:A
7 1wm1:A 313 123 0.1448 0.1342 0.3415 3.22e-08 1x2b:A, 1x2e:A
8 4uhf:A 278 223 0.1862 0.1942 0.2422 1.65e-07 4uhd:A, 4uhe:A
9 4lxh:A 276 261 0.2034 0.2138 0.2261 4.26e-06 4lxi:A, 4lye:A
10 5jz9:A 284 303 0.2379 0.2430 0.2277 4.82e-06 5jz9:B, 5jzb:A, 5jzb:B, 5jzs:B, 2wue:B, 2wuf:B, 2wug:A, 2wug:B, 7zm1:A, 7zm1:B, 7zm2:A, 7zm2:B, 7zm3:A, 7zm3:B, 7zm4:A, 7zm4:B
11 2xua:H 261 289 0.2241 0.2490 0.2249 7.54e-06
12 5frd:A 256 61 0.0828 0.0938 0.3934 7.94e-05 5frd:B
13 8hgw:A 288 295 0.2103 0.2118 0.2068 3.48e-04 8hgw:B, 8hgw:C, 8hgw:D
14 6i8w:B 310 274 0.1897 0.1774 0.2007 7.04e-04
15 8b6q:A 466 175 0.1414 0.0880 0.2343 0.001 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
16 2cjp:B 319 306 0.2379 0.2163 0.2255 0.001
17 5esr:A 308 119 0.0931 0.0877 0.2269 0.002
18 7prm:A 295 158 0.1448 0.1424 0.2658 0.004 8aqf:A, 6ax1:A, 6ax1:B, 6bq0:A, 6bq0:B, 3hju:A, 3hju:B, 3jwe:A, 3jwe:B, 7l4t:A, 7l4u:A, 7l4u:B, 7l4w:A, 7l4w:B, 7l50:A, 7l50:B, 7l50:C, 7l50:D, 3pe6:A, 8ptc:A, 8ptq:A, 8ptr:A, 4uuq:A, 4uuq:B, 7zpg:A, 5zun:A
19 6u2m:A 464 161 0.1310 0.0819 0.2360 0.004 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
20 8pi1:B 276 50 0.0586 0.0616 0.3400 0.008 3hea:A, 3hea:B, 3hea:C, 3hea:D, 3hea:E, 3hea:F, 3hi4:A, 3hi4:B, 3hi4:C, 3hi4:D, 3hi4:E, 3hi4:F, 3ia2:A, 3ia2:B, 3ia2:C, 3ia2:D, 3ia2:E, 3ia2:F, 8pi1:A, 8pi1:C, 8pi1:D, 8pi1:E, 8pi1:F, 8pi1:G, 8pi1:H, 8pi1:I, 8pi1:J, 8pi1:K, 8pi1:M, 8pi1:N, 8pi1:O
21 1b6g:A 310 119 0.1000 0.0935 0.2437 0.008 1be0:A, 1bez:A, 1cij:A, 2dhc:A, 2dhd:A, 2dhe:A, 1edb:A, 1edd:A, 2eda:A, 2edc:A
22 2rau:A 350 112 0.1138 0.0943 0.2946 0.008
23 8b9s:A 259 140 0.1276 0.1429 0.2643 0.008 8b9s:B, 8b9s:C, 8b9s:E, 8b9s:F, 7q4h:A, 7q4h:B, 7q4j:A, 7q4j:B
24 7c4d:A 261 130 0.1241 0.1379 0.2769 0.014
25 8b6s:A 517 155 0.1207 0.0677 0.2258 0.015 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
26 4cib:A 413 147 0.1655 0.1162 0.3265 0.020 4az0:A, 4az0:B, 4az3:A, 4az3:B, 4cia:A
27 2zjf:A 346 120 0.0931 0.0780 0.2250 0.023
28 2zjf:A 346 75 0.0828 0.0694 0.3200 7.8
29 7p0y:A 278 130 0.1034 0.1079 0.2308 0.28 7p0y:B
30 3a2m:B 300 118 0.1103 0.1067 0.2712 0.30 3a2l:A, 3a2l:B, 3a2m:A
31 1q0r:A 297 86 0.0793 0.0774 0.2674 0.40 1q0z:A
32 7omd:B 310 30 0.0379 0.0355 0.3667 0.47 7omd:A, 7omo:A, 7omr:A, 2psj:A, 2psj:B, 6yn2:A, 6yn2:B
33 8ags:AAA 298 299 0.2103 0.2047 0.2040 0.52 8agm:AAA, 8agm:BBB, 8agm:CCC, 8agm:DDD, 8agn:AAA, 8agn:BBB, 8agn:CCC, 8agn:DDD, 8agp:AAA, 8agp:BBB, 8ags:BBB, 5ng7:B
34 8iyb:A 275 168 0.1379 0.1455 0.2381 0.54 8iyb:B, 8iyc:A, 8iyc:B
35 2wtn:B 250 284 0.2241 0.2600 0.2289 0.75 2wtn:A
36 1odt:C 317 77 0.0724 0.0662 0.2727 1.2 1odt:H
37 1hl7:A 279 275 0.2069 0.2151 0.2182 1.3 1hl7:B
38 5olu:A 310 134 0.1138 0.1065 0.2463 1.3
39 3e0x:A 245 204 0.1414 0.1673 0.2010 1.3 3e0x:B
40 8a2c:A 268 35 0.0345 0.0373 0.2857 2.6 8a2c:B
41 4p92:A 233 53 0.0759 0.0944 0.4151 3.1
42 4it1:D 427 76 0.0759 0.0515 0.2895 3.2 4it1:A
43 3ij6:A 303 124 0.1241 0.1188 0.2903 4.3 3ij6:B, 3ij6:C, 3ij6:D
44 1q1w:A 422 40 0.0414 0.0284 0.3000 4.7 3lb8:A, 3lb8:B, 1q1r:A, 1q1r:B, 1q1w:B
45 3s6h:A 436 88 0.0931 0.0619 0.3068 5.9 4kzt:A, 4kzt:B, 4kzt:X, 4kzt:Y, 3s6g:B, 3s6g:Y, 3s6h:X, 3s6h:B, 3s6h:Y
46 7ne7:A 677 87 0.0828 0.0355 0.2759 6.8 7ne4:A, 7ne5:A, 7ob1:A, 7ywp:A
47 4kys:A 366 52 0.0724 0.0574 0.4038 7.5 4kys:B
48 4v4s:AY 365 43 0.0586 0.0466 0.3953 7.6 6c5l:AY, 6c5l:CY, 4v5e:AY, 4v5e:CY, 4v5j:AY, 4v5j:CY, 4v67:AX, 4v67:CX, 4v9n:AY, 4v9n:CY
49 7ryt:B 368 67 0.0759 0.0598 0.3284 8.1 8f2l:B, 8f2l:A, 8f2l:C, 8f2l:D, 8f2l:F, 8f2l:G, 8f2l:H, 8f2l:I, 8f2l:J, 8f2l:K, 8f2l:L, 6pux:A, 6pux:B, 7ryt:A, 7ryt:C, 7ryt:D, 7ryt:E, 7ryt:F
50 3t2z:A 427 121 0.1069 0.0726 0.2562 8.6 3kpk:A, 3sx6:A, 3sxi:A, 3sy4:A, 3syi:A, 3sz0:A, 3szc:A, 3szf:A, 3szw:A, 3t0k:A, 3t14:A, 3t2k:A, 3t2y:A, 3t2z:B, 3t31:A
51 5mdy:7 324 43 0.0586 0.0525 0.3953 9.1

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218