BioLiP

>protein
EASRLGPVFDSCRANNRAALIGYLPTGYPDVPASVAAMTALVESGCDIIEVGVPYSDPGMDGPTIARATEAALRGGVRVR
DTLAAVEAISIAGGRAVVMTYWNPVLRYGVDAFARDLAAAGGLGLITPDLIPDEAQQWLAASEEHRLDRIFLVAPSSTPE
RLAATVEASRGFVYAASSQAAPELVGRVKAVSDIPVGVGLGVRSRAQAAQIAQYADGVIVGSALVTALTEGLPRLRALTG
ELAAGVRLG

The query sequence (length=249) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6uap:C	250	250	0.9960	0.9920	0.9920	2.24e-173	6dwe:A, 6dwe:G, 6dwe:E, 6dwe:C, 6e9p:A, 6e9p:G, 5tci:A, 5tci:G, 5tci:C, 5tcj:A, 5tcj:G, 5tcj:E, 5tcj:C, 6u6c:A, 6u6c:C, 6u6c:E, 6u6c:G, 6uap:A, 6uap:E, 6uap:G, 6ub9:A, 6ub9:E, 6ub9:G, 6usa:A, 6usa:C, 6usa:G
2	5ey5:A	261	257	0.4056	0.3870	0.3930	1.51e-54	5ey5:C
3	8b08:A	269	261	0.2811	0.2602	0.2682	1.68e-16	1a50:A, 1a5b:A, 1a5s:A, 5bw6:A, 1c29:A, 6c73:A, 1c8v:A, 1c9d:A, 3cep:A, 5cgq:A, 2cle:A, 2clf:A, 2clh:A, 2cli:A, 2clk:A, 2cll:A, 2clm:A, 2clo:A, 1cw2:A, 1cx9:A, 6d0v:A, 6duc:A, 6dzo:A, 1fuy:A, 4hn4:A, 4hpj:A, 4hpx:A, 4ht3:A, 2j9x:A, 7jhw:A, 7jll:A, 7jmq:A, 7jqw:A, 7jtt:A, 1k3u:A, 7k5a:A, 1k7e:A, 1k7f:A, 1k8z:A, 7ka1:A, 7kbn:A, 1kfb:A, 7kh6:A, 7ki7:A, 4kkx:A, 7kqf:A, 7ku9:A, 7kwv:A, 7kxc:A, 7kyt:A, 7l03:A, 7l1h:A, 7lgx:A, 7lkl:A, 7lpf:A, 7lt4:A, 7ltp:A, 7lv5:A, 7lvx:A, 7ly8:A, 7m2l:A, 7m3s:A, 7mt4:A, 7mt5:A, 7mt6:A, 6o1h:A, 3pr2:A, 1qoq:A, 2rh9:A, 2rhg:A, 1tjp:A, 2trs:A, 2tsy:A, 6vfd:A, 6vnt:A, 1wbj:A, 4wx2:A, 6wx3:A, 6x0c:A, 6xe3:A, 6xin:A, 6xnc:A, 6xoy:A, 6xrh:A, 6xsy:A, 6xt0:A, 4xug:A, 4y6g:A, 4zqc:A
4	6hul:A	241	228	0.2169	0.2241	0.2368	7.05e-08
5	1xc4:A	240	209	0.1807	0.1875	0.2153	8.86e-08	1xc4:B
6	4nae:A	219	213	0.2329	0.2648	0.2723	0.001	4nae:B
7	2f6x:A	231	67	0.0924	0.0996	0.3433	0.002	2f6x:B
8	3vzx:B	228	60	0.0763	0.0833	0.3167	0.52	3vzx:A, 3vzy:A, 3vzy:B, 3vzz:A, 3vzz:B, 3w00:B
9	3noy:B	351	32	0.0482	0.0342	0.3750	0.78	3noy:A, 3noy:C, 3noy:D
10	2xma:E	141	34	0.0522	0.0922	0.3824	0.90	2xm3:A, 2xm3:B, 2xm3:C, 2xm3:D, 2xm3:F, 2xm3:E, 2xma:A, 2xma:B, 2xma:F, 2xo6:A, 2xo6:D, 2xqc:A, 2xqc:D
11	6clv:C	257	46	0.0522	0.0506	0.2826	3.3	1ad4:A, 6clv:A, 6clv:B
12	2ynm:C	417	23	0.0482	0.0288	0.5217	3.7
13	4jdy:A	264	69	0.1044	0.0985	0.3768	4.5	4jdy:B, 4jdy:C
14	1pii:A	452	65	0.0723	0.0398	0.2769	4.6	1jcm:P
15	7pnt:4	589	62	0.0763	0.0323	0.3065	5.4	7pnu:4, 7pnv:4, 7pnw:4
16	1peu:A	692	37	0.0643	0.0231	0.4324	9.8	2bq1:E, 2bq1:F, 1peo:A, 1peq:A

[Back]