Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DYVNQEELNYLNQLKDIIDHGVRKNDRTGIGTLSTFGTQSRYCLRDDIFPLLTTKRVFWRGVVEELLWFISGSTNAKQLS
EKNVNIWDGNSSREFLDSRGLYNYEEGDLGPVYGFQWRHFGCPYSSMTADYKGKGYDQLQQCIKMIREEPESRRIIMTAW
NPCDLEKVALPPCHCFVQFYVADGELSCQMYQRSADMGLGVPFNIASYSLLTRMIAHITSLKPGFFIHTIGDAHVYLTHV
DALKVQMERKPRPFPKLKILRNVENIDDFRAEDFELINYKPYPK

The query sequence (length=284) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5by6:B 288 284 1.0000 0.9861 1.0000 0.0 5by6:A, 5by6:C, 5by6:D, 5m4z:A, 5m4z:B
2 6k7s:B 286 282 0.6725 0.6678 0.6773 2.30e-147 6k7r:A, 6k7r:B, 6k7s:A
3 4eb4:B 301 277 0.6585 0.6213 0.6751 1.11e-144 4e5o:A, 4e5o:B, 4e5o:C, 4e5o:D, 4e5o:E, 4e5o:F, 4eb4:A, 4eb4:C, 4eb4:D, 4ein:A, 4ein:B, 3ejl:C, 3ejl:D, 4ez8:A, 6f6z:A, 6f6z:B, 5fct:A, 5fct:B, 4fgt:A, 4g2o:X, 4g6w:X, 4gd7:A, 6gko:A, 6gko:B, 6gyj:A, 3h9k:A, 3h9k:B, 3h9k:D, 3h9k:E, 3hb8:A, 3hb8:B, 3hb8:C, 3hb8:D, 3hb8:E, 5hs3:A, 5hs3:B, 5hs3:C, 5hs3:D, 5hs3:E, 5hs3:F, 1hvy:A, 1hvy:B, 1hvy:C, 1hvy:D, 1i00:A, 1i00:B, 1ju6:A, 1ju6:B, 1ju6:C, 1ju6:D, 1juj:A, 1juj:B, 1juj:C, 1juj:D, 3ob7:A, 3ob7:B, 3ob7:D, 3ob7:E, 6oju:B, 6oju:A, 6oju:C, 6oju:D, 6ojv:B, 6ojv:A, 6ojv:D, 6ojv:C, 6pf3:A, 6pf3:B, 6pf3:C, 6pf3:D, 6pf4:B, 6pf4:D, 6pf4:A, 6pf4:C, 6pf5:A, 6pf5:B, 6pf5:C, 6pf5:D, 6pf6:B, 6pf6:A, 6pf6:C, 6pf6:D, 6qxg:A, 6qxg:B, 6qxg:C, 6qxh:A, 6qxh:B, 6qxh:C, 6qyq:B, 6qyq:D, 6r2e:A, 6r2e:C, 6r2e:D, 6r2e:B, 6r2e:F, 6r2e:H, 6r2e:E, 6r2e:G, 2rd8:B, 2rda:C, 2rda:D, 2rda:E, 1rts:A, 1rts:B, 2tsr:A, 2tsr:B, 2tsr:C, 2tsr:D, 4up1:A, 4up1:B, 4up1:D, 4up1:C, 5wrn:B, 5wrn:A, 5wrn:C, 5wrn:D, 5wrn:E, 5wrn:F, 5x5d:A, 5x5d:D, 5x5d:B, 5x5d:E, 5x5d:C, 5x5d:F, 5x5q:A, 5x5q:D, 5x5q:B, 5x5q:E, 5x5q:C, 5x5q:F, 5x66:A, 5x66:D, 5x66:B, 5x66:E, 5x66:C, 5x66:F, 5x67:A, 5x67:B, 5x69:A, 5x69:D, 5x69:B, 5x69:E, 5x69:C, 5x69:F, 6y08:A, 6y08:B, 6zxo:A, 6zxo:B, 6zxo:C, 6zxo:D, 6zxo:E, 6zxo:F
4 5h39:A 285 279 0.6303 0.6281 0.6416 1.26e-138 5h38:B, 5h39:B, 5h3a:A, 5h3a:B
5 7xyk:A 290 276 0.6162 0.6034 0.6341 1.66e-135 7cca:A, 7cca:B, 7xyj:A, 7xyj:B, 7xyj:C, 7xyj:D, 7xyk:B, 7xyk:C, 7xyk:D
6 4irr:A 290 283 0.6092 0.5966 0.6113 2.04e-135 4irr:B, 4isw:A, 4isw:B, 5noo:A, 5noo:B, 5noo:C, 5noo:D, 4psg:A, 4psg:B
7 2onb:A 264 277 0.6268 0.6742 0.6426 1.64e-131 4e28:A, 3n5e:A, 3n5e:B
8 4xsc:B 284 277 0.6021 0.6021 0.6173 3.90e-131 4xsc:A, 4xsc:C, 4xsc:D, 4xsd:A, 4xsd:B, 4xsd:C, 4xsd:D
9 7dp4:A 287 280 0.5810 0.5749 0.5893 9.68e-128 7dp5:A, 7dp6:A
10 6aog:A 511 284 0.6021 0.3346 0.6021 1.19e-122 6aog:B, 6aoh:A, 6aoh:B, 6aoi:A, 6aoi:B, 4eck:A, 4eck:B, 4eil:A, 4eil:B, 4eil:C, 4eil:D, 4eil:E, 4eil:F, 4eil:G, 4eil:H, 4ky4:A, 4ky4:B, 4ky4:C, 4ky4:D, 4ky4:E, 4ky4:F, 4ky4:G, 4ky4:H, 4kya:A, 4kya:B, 4kya:C, 4kya:D, 4kya:E, 4kya:F, 4kya:G, 4kya:H, 6n1s:A, 6n1s:B, 6n1t:A, 6n1t:B, 5t0l:A, 5t0l:B
11 1f28:A 295 286 0.5880 0.5661 0.5839 3.70e-122 1ci7:A, 1ci7:B, 1f28:B, 1f28:C, 1f28:D
12 7fgx:D 563 284 0.6021 0.3037 0.6021 8.31e-122 7fgw:A, 7fgw:B, 7fgw:C, 7fgw:D, 7fgx:A, 7fgx:B, 7fgx:C, 7fgy:A, 7fgy:B, 7fgy:C, 7fgy:D
13 3irm:A 520 280 0.5775 0.3154 0.5857 2.87e-121 3cl9:A, 3clb:A, 3clb:B, 3clb:C, 3clb:D, 2h2q:A, 2h2q:B, 3hbb:A, 3hbb:B, 3hbb:C, 3hbb:D, 3inv:A, 3inv:B, 3irm:B, 3irm:C, 3irm:D, 3irn:A, 3irn:B, 3irn:C, 3irn:D, 3iro:A, 3iro:B, 3iro:C, 3iro:D, 3kjs:A, 3kjs:B, 3kjs:C, 3kjs:D, 5t7o:A, 5t7o:B, 5t7o:C, 5t7o:D
14 2aaz:A 305 294 0.5951 0.5541 0.5748 4.33e-114 2aaz:B, 2aaz:C, 2aaz:D, 2aaz:E, 2aaz:F, 2aaz:G, 2aaz:H, 2aaz:I, 2aaz:J, 2aaz:K, 2aaz:L, 2aaz:M, 2aaz:N, 2aaz:O, 2aaz:P
15 6a2l:B 521 278 0.5387 0.2937 0.5504 1.02e-112 6kp2:A, 8yq8:B
16 6a2p:B 551 278 0.5387 0.2777 0.5504 1.65e-112 6a2k:A, 6a2k:B, 6a2l:A, 6a2m:A, 6a2m:B, 6a2n:A, 6a2n:B, 6a2o:A, 6a2o:B, 6a2p:A, 7ctw:A, 7ctw:B, 7cty:A, 7cty:B, 7ctz:A, 7ctz:B, 3dg8:A, 3dg8:B, 3dg8:C, 3dg8:D, 3dga:A, 3dga:B, 3dga:C, 3dga:D, 4dp3:A, 4dp3:B, 4dpd:A, 4dpd:B, 4dph:A, 4dph:B, 7f3y:A, 7f3y:B, 7f3z:A, 7f3z:B, 1j3i:A, 1j3i:B, 1j3i:C, 1j3i:D, 1j3j:A, 1j3j:B, 1j3j:C, 1j3j:D, 1j3k:A, 1j3k:B, 1j3k:C, 1j3k:D, 8jfb:A, 8jfb:B, 8jfc:A, 8jfc:B, 8jfd:A, 8jfd:B, 3jsu:A, 3jsu:B, 6kot:A, 6kot:B, 6kp2:B, 6kp7:A, 6kp7:B, 6kpr:A, 6kpr:B, 6leu:A, 6leu:B, 6lev:A, 6lev:B, 6lez:A, 6lez:B, 6lh9:A, 6lh9:B, 6lhi:A, 6lhi:B, 6lhj:A, 6lhj:B, 3qg2:A, 3qg2:B, 3qgt:A, 3qgt:B, 3um5:A, 3um5:B, 3um6:A, 3um6:B, 3um8:A, 3um8:B, 8wgm:A, 8wgm:B, 8yq8:A, 8yq9:A, 8yq9:B
17 3k2h:A 503 280 0.5352 0.3022 0.5429 2.91e-110 3k2h:B, 3kjr:A, 3kjr:B, 3nrr:A, 3nrr:B
18 1qzf:A 519 278 0.5176 0.2832 0.5288 2.81e-103 3dl5:A, 3dl5:B, 3dl5:C, 3dl5:D, 3dl5:E, 3dl6:A, 3dl6:B, 3dl6:C, 3dl6:D, 3dl6:E, 3hj3:A, 3hj3:B, 3hj3:C, 3hj3:D, 4ky8:A, 4ky8:B, 4ky8:C, 4ky8:D, 4ky8:E, 2oip:A, 2oip:B, 2oip:C, 2oip:D, 2oip:E, 6ojs:A, 6ojs:C, 6ojs:B, 6ojs:E, 6ojs:D, 6pf7:A, 6pf7:B, 6pf7:C, 6pf7:D, 6pf7:E, 6pf8:A, 6pf8:B, 6pf8:C, 6pf8:D, 6pf8:E, 6pf9:A, 6pf9:B, 6pf9:C, 6pf9:D, 6pf9:E, 6pfa:A, 6pfa:B, 6pfa:C, 6pfa:D, 6pfa:E, 6pfb:A, 6pfb:B, 6pfb:C, 6pfb:D, 6pfb:E, 6pfc:A, 6pfc:B, 6pfc:D, 6pfc:C, 6pfc:E, 6pfd:A, 6pfd:B, 6pfd:C, 6pfd:D, 6pfd:E, 6pfe:A, 6pfe:B, 6pfe:C, 6pfe:E, 6pfe:D, 6pff:A, 6pff:B, 6pff:C, 6pff:D, 6pff:E, 6pfg:A, 6pfg:B, 6pfg:C, 6pfg:D, 6pfg:E, 6pfh:A, 6pfh:B, 6pfh:C, 6pfh:D, 6pfh:E, 6pfi:A, 6pfi:B, 6pfi:C, 6pfi:D, 6pfi:E, 4q0d:E, 4q0d:A, 4q0d:B, 4q0d:C, 4q0d:D, 4q0e:A, 4q0e:C, 4q0e:B, 4q0e:D, 4q0e:E, 1qzf:B, 1qzf:C, 1qzf:D, 1qzf:E, 1sej:A, 1sej:B, 1sej:C, 1sej:D, 1sej:E, 6wep:A, 6wep:B
19 2a9w:A 264 274 0.4859 0.5227 0.5036 9.39e-92 2a9w:B, 2a9w:C, 2a9w:D, 1aiq:A, 1aiq:B, 1aob:A, 1axw:A, 1axw:B, 3b5b:A, 3b5b:B, 3b9h:A, 2bbq:A, 2bbq:B, 1bdu:A, 3bfi:A, 3bgx:A, 3bhl:A, 3bhl:B, 3bhr:A, 1bid:A, 1bjg:A, 1bq1:A, 1bq1:B, 6cdz:A, 6cdz:B, 1ddu:A, 1ddu:B, 1dna:A, 1dna:B, 1f4c:A, 1f4c:B, 1f4d:A, 1f4d:B, 1f4e:A, 1f4f:A, 1f4f:B, 1f4g:A, 1f4g:B, 2fto:X, 1fwm:A, 1fwm:B, 2g8x:A, 2g8x:B, 4gev:A, 4gev:B, 4isk:A, 4isk:B, 4isk:C, 4isk:F, 4isk:D, 4isk:E, 4isk:G, 4isk:H, 1jg0:A, 1jg0:B, 1jtq:A, 1jtq:B, 1jtu:A, 1jtu:B, 1jut:A, 1jut:B, 7jx1:A, 7jx1:B, 7jxf:A, 7jxf:B, 1kce:A, 1kce:B, 2kce:A, 2kce:B, 1kzi:A, 1kzi:B, 1kzj:A, 1kzj:B, 1kzj:C, 1kzj:D, 1kzj:E, 1kzj:F, 4lrr:A, 1nce:A, 1nce:B, 6nnr:A, 6nnr:B, 1syn:A, 1syn:B, 1tdu:A, 1tdu:B, 1tlc:A, 1tlc:B, 1tls:A, 1tls:B, 1trg:A, 1tsd:A, 1tsd:B, 1tsn:A, 2tsc:A, 2tsc:B, 1tys:A, 2vet:A, 2vf0:A, 2vf0:B, 1zpr:A, 1zpr:B
20 4fog:D 263 274 0.4577 0.4943 0.4745 5.21e-85 4foa:A, 4foa:B, 4foa:C, 4foa:D, 4fog:A, 4fog:B, 4fog:C, 4fox:A, 4fox:B, 4fox:C, 4fox:D, 4fox:E, 4fox:F, 4fox:G, 4fox:H, 4fqs:A, 4fqs:B, 3qj7:A, 3qj7:C, 3qj7:B, 3qj7:D
21 6qxs:A 292 294 0.4789 0.4658 0.4626 1.95e-82 6qxs:C, 6qya:A, 6qya:C
22 5j7w:C 315 315 0.4859 0.4381 0.4381 3.75e-78 5j7w:D, 4o7u:B, 4o7u:D, 6qxs:B, 6qxs:D, 6qya:B, 6qya:D, 3uwl:B, 3uwl:D
23 3c0a:A 289 295 0.4648 0.4567 0.4475 1.04e-77
24 1bo7:A 316 315 0.4859 0.4367 0.4381 2.40e-77 3bnz:A, 1bo8:A, 1bp0:A, 1bp6:A, 1bpj:A, 3byx:A, 3bz0:A, 3c06:A, 2g86:A, 2g89:A, 2g8a:A, 2g8d:A, 3ijz:A, 3ik0:A, 3ik1:A, 1jmf:A, 1jmg:A, 1jmh:A, 1jmi:A, 1lca:A, 1lcb:A, 1lce:A, 1nja:A, 1njb:A, 1njc:A, 1njd:A, 1nje:A, 1tdb:A, 1tdc:A, 2tdd:A, 2tdm:A, 1thy:A, 1tsl:A, 1tsm:A, 1tsv:A, 1tsx:A, 1tsy:A, 1tsz:A, 1tvu:A, 1tvv:A, 1tvw:A, 1vza:A, 1vzb:A, 1vzc:A, 1vzd:A, 1vze:A
25 4dq1:A 312 318 0.4648 0.4231 0.4151 5.15e-76 4dq1:B
26 4h0u:A 260 274 0.4296 0.4692 0.4453 4.74e-74 4h0u:B, 4h0u:C, 4h0u:D
27 1b02:A 279 289 0.3732 0.3799 0.3668 4.98e-53
28 5b6e:A 319 121 0.1092 0.0972 0.2562 3.27e-08 5b6d:A, 5b6d:B, 5b6e:B, 5jp9:A, 5jp9:B
29 6a9a:A 246 226 0.1761 0.2033 0.2212 1.36e-04 1b49:A, 1b49:C, 1b5d:A, 1b5d:B, 1b5e:A, 1b5e:B, 6l18:A
30 7sic:A 2773 66 0.0563 0.0058 0.2424 2.8 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
31 8oxm:A 2748 66 0.0563 0.0058 0.2424 2.9 8oxm:B
32 7ni5:A 2791 66 0.0563 0.0057 0.2424 2.9 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
33 6ysw:A 707 107 0.0951 0.0382 0.2523 4.3
34 4wxw:A 165 33 0.0528 0.0909 0.4545 6.6
35 3a8g:B 212 53 0.0563 0.0755 0.3019 6.7 3a8h:B, 3a8m:B, 3a8o:B, 2cz1:B, 2cz6:B, 2d0q:B, 2qdy:B, 3x26:B
36 6h8s:A 291 38 0.0458 0.0447 0.3421 7.3 2cjz:A, 6h8r:A, 5ovr:A, 5ovx:A, 5ow1:A
37 8uss:A 107 66 0.0528 0.1402 0.2273 8.4
38 3o1h:B 296 57 0.0669 0.0642 0.3333 8.9
39 5vb9:A 108 83 0.0669 0.1759 0.2289 9.3 7ama:A, 7ama:B, 7amg:A, 7amg:B, 7amg:C, 7amg:D, 8cdg:A, 8cdg:B, 8dyf:A, 8dyf:B, 8dyg:A, 8dyg:B, 8dyh:A, 8dyh:B, 8dyi:A, 8dyi:B, 5hhv:A, 5hhx:A, 5hi3:A, 5hi3:B, 5hi4:A, 5hi4:B, 5hi5:A, 5hi5:B, 8usr:A, 8usr:B, 8usr:D, 5vb9:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218