BioLiP

>protein
DYLLSANGSKAIDFVWSNFLKHPYNPKLKQPDANVKAAWEKHADWEHWSNMGQDWSLNTPSGLVPRPNHGIAHTLRVAQL
VPVIAEFLKAYSGDPKFQKLTQKEIQKAQYMMLFSVIGRENDMSWTDANHYQQAFKEAYNGQYSKHIYATFKENAQKGFL
NHVVTNKSSLIPSLFSDESELQYWAEALDTISSASGILMALAHDLDLMRCYDKGKFNSLKMKDLVARLGGNEDAAKKLAD
YAHDLIVATGDRCMGYGVTQDYNYSLFGKCSLDPNECLKQLQSIPKPETT

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5bu2:B	290	290	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5bu2:A, 5bu2:C, 5bu2:D
2	5zq6:A	828	169	0.1483	0.0519	0.2544	3.73e-11	5zq4:B, 5zq4:A, 5zq6:C, 5zq7:A, 5zq7:C
3	6g0c:A	624	163	0.1448	0.0673	0.2577	9.73e-10
4	5yij:A	959	201	0.1724	0.0521	0.2488	1.72e-09	5ysi:A
5	6b7o:A	313	253	0.2103	0.1949	0.2411	4.07e-05
6	4z17:A	424	114	0.0862	0.0590	0.2193	2.6	4yws:A, 4z17:B, 4z1y:A, 4z1y:B
7	7krw:A	608	80	0.0621	0.0296	0.2250	3.2	4b9q:A, 4b9q:B, 4b9q:C, 4b9q:D, 1dkx:A, 1dky:A, 1dky:B, 1dkz:A, 3dpo:B, 3dpo:A, 3dpp:A, 3dpp:B, 3dpq:B, 3dpq:A, 3dpq:F, 3dpq:E, 4e81:A, 4e81:B, 4ezn:A, 4ezn:B, 4ezo:A, 4ezo:B, 4ezp:A, 4ezp:B, 4ezq:A, 4ezr:A, 4ezs:A, 4ezt:A, 4ezu:A, 4ezv:A, 4ezv:B, 4ezw:A, 4ezw:B, 4ezw:C, 4ezw:D, 4ezx:A, 4ezx:B, 4ezy:A, 4ezz:A, 4f00:A, 4hy9:A, 4hy9:B, 4hyb:A, 4hyb:B, 7jmm:A, 4jn4:A, 4jn4:B, 4jne:A, 4jne:B, 7jn8:A, 7jn9:A, 7jne:A, 4jwc:A, 4jwc:B, 4jwd:B, 4jwd:A, 4jwe:A, 4jwe:B, 4jwi:A, 4jwi:B, 7ko2:A, 7ko2:B, 7ko2:C, 7ko2:D, 7krt:A, 7krt:B, 7krt:C, 7krt:D, 7kru:B, 7kru:A, 7krv:B, 7krv:A, 7krw:C, 7krw:B, 7krw:D, 7kzi:A, 7kzi:B, 7kzu:A, 7n46:A, 7n6j:A, 7n6k:A, 7n6l:A, 7n6m:A, 5nro:A, 5oow:A, 5oow:B, 1q5l:A, 3qnj:A, 3qnj:B, 4r5g:B, 4r5i:A, 4r5j:A, 4r5j:C, 4r5j:B, 4r5j:D, 4r5k:A, 4r5k:B, 7rax:A
8	8hil:A	860	63	0.0552	0.0186	0.2540	5.1	8him:A
9	4c1p:A	703	66	0.0586	0.0242	0.2576	7.2
10	2nli:B	326	51	0.0517	0.0460	0.2941	7.3
11	2j6x:H	348	51	0.0517	0.0431	0.2941	8.0	8ufy:B, 2zfa:B
12	2du2:A	374	51	0.0517	0.0401	0.2941	8.2	2du2:B, 2du2:C, 2du2:D, 2e77:A, 2e77:B, 2e77:C, 2e77:D, 5ebu:A, 5ebu:B, 5ebu:C, 5ebu:D, 5ebu:E, 5ebu:F, 5ebu:G, 5ebu:H, 7f1y:A, 7f1y:B, 7f20:A, 7f20:B, 7f21:A, 7f21:B, 7f22:A, 7f22:B, 2j6x:A, 2j6x:B, 2j6x:C, 2j6x:D, 2j6x:E, 2j6x:F, 2j6x:G, 2nli:A, 4rje:A, 4rje:B, 4rje:C, 4rje:D, 8ufy:A, 4yl2:A, 4yl2:B, 4yl2:C, 4yl2:D, 2zfa:A

[Back]