BioLiP

>protein
DWTSECDVLVVGSGGGALTGAYTAAAQGLTTIVLEKTDRFGGTSAYSGASIWLPGTQVQERAGLPDSTENARTYLRALLG
DAESERQDAYVETAPAVVALLEQNPNIEFEFRAFPDYYKAEGRMDTGRSINPLDLDPADIGDLAGKVRPELDQDRTGQDH
APGPMIGGRALIGRLLAAVQSTGKAELRTESVLTSLIVEDGRVVGAEVESGGETQRIKANRGVLMAAGGIEGNAEMREQA
GTPGKAIWSMGPFGANTGDAISAGIAVGGATALLDQAWFCPGVEQPDGSAAFMVGVRGGLVVDSAGERYLNESLPYDQFG
RAMDAHDDNGSAVPSFMIFDSREGGGLPAICIPNTAPAKHLEAGTWVGADTLEELAAKTGLPADALRSTVEKFNDAAKLG
VDEEFHRGEDPYDAFFCPGANAALTAIENGPFYAARIVLSDLGTKGGLVTDVNGRVLRADGSAIDGLYAAGNTSASLSGR
FYPGPGVPLGTAMVFSYRAAQDMAK

The query sequence (length=505) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8joj:A	523	508	1.0000	0.9656	0.9941	0.0	4c3x:A, 4c3x:B, 4c3x:C, 4c3x:D, 4c3x:E, 4c3x:F, 4c3x:G, 4c3x:H, 4c3y:A, 4c3y:B, 4c3y:C, 4c3y:D, 4c3y:E, 4c3y:F, 4c3y:G, 4c3y:H, 8jbz:AAA, 8ju4:A, 8kcz:A
2	7p18:A	558	561	0.3941	0.3566	0.3547	2.04e-79	7p18:B
3	4at0:A	483	526	0.3010	0.3147	0.2890	6.80e-33	4at2:A
4	8am6:AAA	547	544	0.2733	0.2523	0.2537	2.06e-32	8am3:AAA, 8am3:BBB, 8am6:BaB, 8am8:BBB, 8am8:AAA
5	6t85:A	459	506	0.2515	0.2767	0.2510	1.84e-23	6t86:A, 6t87:A, 6t88:A
6	1qo8:A	564	504	0.2535	0.2270	0.2540	6.64e-14	1qo8:D
7	1d4c:A	570	288	0.1604	0.1421	0.2812	2.18e-13	1d4c:C, 1d4c:B, 1d4c:D, 1d4d:A, 1d4e:A
8	2b7r:A	568	293	0.1525	0.1356	0.2628	1.93e-10	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
9	8p84:B	450	128	0.0772	0.0867	0.3047	0.008	8p84:A
10	7koe:C	438	67	0.0455	0.0525	0.3433	0.055	7koe:G
11	6hg8:B	482	49	0.0376	0.0394	0.3878	0.067	2f5z:A, 2f5z:B, 2f5z:C, 2f5z:D, 2f5z:E, 2f5z:F, 2f5z:G, 2f5z:H, 2f5z:I, 2f5z:J, 6hg8:A, 6i4p:A, 6i4p:B, 6i4q:A, 6i4q:B, 6i4r:A, 6i4r:B, 6i4s:A, 6i4s:B, 6i4t:A, 6i4t:B, 6i4u:A, 6i4u:B, 6i4z:A, 6i4z:B, 6i4z:C, 6i4z:D, 6i4z:E, 6i4z:F, 6i4z:G, 6i4z:H, 5j5z:A, 5j5z:B, 5nhg:A, 5nhg:B, 5nhg:C, 5nhg:D, 5nhg:E, 5nhg:F, 5nhg:G, 5nhg:H, 7psc:A, 7psc:B, 3rnm:A, 3rnm:B, 3rnm:C, 3rnm:D, 1zmc:A, 1zmc:B, 1zmc:C, 1zmc:D, 1zmc:E, 1zmc:F, 1zmc:G, 1zmc:H, 1zmd:A, 1zmd:B, 1zmd:C, 1zmd:D, 1zmd:E, 1zmd:F, 1zmd:G, 1zmd:H, 1zy8:A, 1zy8:B, 1zy8:C, 1zy8:D, 1zy8:E, 1zy8:F, 1zy8:G, 1zy8:H, 1zy8:I, 1zy8:J, 7zyt:A, 7zyt:B
12	6tjr:A	340	47	0.0337	0.0500	0.3617	0.17	6tjr:B
13	7d6v:A	601	379	0.1644	0.1381	0.2190	0.26	7d6x:A
14	5br7:A	386	48	0.0436	0.0570	0.4583	0.30	6d2e:A, 6d2g:A, 6d99:A, 6d9a:A, 6d9b:A, 6d9c:A, 6d9d:A, 6d9e:A, 5eqf:A, 5eqf:B, 4xgk:A, 4xgk:B
15	3rha:A	459	65	0.0495	0.0545	0.3846	0.34	3rha:B
16	8b7s:A	458	44	0.0277	0.0306	0.3182	0.34
17	7u6l:D	436	38	0.0317	0.0367	0.4211	0.34	7e7h:A, 7e7h:B, 7u6l:A, 7u6l:B, 7u6l:C
18	6lum:A	539	30	0.0317	0.0297	0.5333	0.36	6lum:J, 6lum:P
19	6uzi:C	470	46	0.0337	0.0362	0.3696	0.37	6uzi:A, 6uzi:B, 6uzi:D
20	3nlc:A	534	116	0.0574	0.0543	0.2500	0.52
21	3ihg:A	535	60	0.0495	0.0467	0.4167	0.58	3ihg:B, 3ihg:C
22	4mo2:B	365	38	0.0297	0.0411	0.3947	0.71	4mo2:A
23	2vvm:A	481	41	0.0337	0.0353	0.4146	0.75	2vvl:A, 2vvl:B, 2vvl:C, 2vvl:D, 2vvl:E, 2vvl:F, 2vvl:G, 2vvl:H, 2vvm:B, 3zdn:A, 3zdn:B, 3zdn:C, 3zdn:D
24	5z2g:A	477	107	0.0535	0.0566	0.2523	0.82	5z2g:B
25	6fho:A	368	62	0.0455	0.0625	0.3710	0.88	6sw1:A, 6sw2:A, 2x3n:A
26	6y48:B	538	50	0.0337	0.0316	0.3400	0.89	6y48:A, 6y48:C, 6y48:D
27	5c2t:A	616	128	0.0693	0.0568	0.2734	0.93	5c2t:E, 5c3j:A, 5c3j:E, 3vr8:A, 3vr8:E, 3vr9:A, 3vr9:E, 3vra:A, 3vra:E, 3vrb:A, 3vrb:E, 4ysx:A, 4ysx:E, 4ysy:A, 4ysy:E, 4ysz:A, 4ysz:E, 4yt0:A, 4yt0:E, 4ytm:A, 4ytm:E, 4ytn:A, 4ytn:E
28	5kxj:A	481	108	0.0634	0.0665	0.2963	0.98
29	3urh:B	465	43	0.0337	0.0366	0.3953	1.1	3urh:A
30	5ts5:A	483	95	0.0515	0.0538	0.2737	1.3	4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
31	6cr0:A	430	38	0.0277	0.0326	0.3684	1.6
32	5oc2:A	441	248	0.1228	0.1406	0.2500	1.6	5oc2:B, 5oc3:A, 5oc3:B, 4wct:A, 4wct:B, 4xwz:A, 4xwz:B
33	2z5x:A	513	38	0.0297	0.0292	0.3947	1.7	2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
34	8k40:A	448	62	0.0396	0.0446	0.3226	1.8	8k40:B, 8k41:A
35	3kve:A	484	35	0.0317	0.0331	0.4571	1.9	3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
36	3rza:A	373	79	0.0475	0.0643	0.3038	2.4	3rza:B
37	4im0:A	619	52	0.0396	0.0323	0.3846	2.4	6bny:A, 6bod:A, 6boe:A, 6cq0:A, 6cq4:A, 6cq5:A, 4im2:A, 4im3:A, 6nt9:A, 6nt9:B, 5w5v:A
38	2yqu:A	455	43	0.0337	0.0374	0.3953	2.5	2eq7:A, 2eq7:B, 2yqu:B
39	1f8r:A	483	95	0.0535	0.0559	0.2842	2.7	1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
40	4y4m:F	262	36	0.0297	0.0573	0.4167	2.9	4y4m:A, 4y4m:B, 4y4m:C, 4y4m:D, 4y4m:E, 4y4m:G, 4y4m:H
41	8uiu:A	412	66	0.0396	0.0485	0.3030	3.2	8uiu:C, 8uiu:B, 8urc:A, 8urc:C, 8urc:B, 8urd:A, 8urd:B, 8urd:C
42	6qkg:B	664	35	0.0297	0.0226	0.4286	3.2	6qkg:A, 6qkr:A, 6qkr:B, 6qkx:A
43	8x38:A	430	63	0.0416	0.0488	0.3333	4.0
44	2yg3:B	450	69	0.0475	0.0533	0.3478	4.1	2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
45	1reo:A	484	35	0.0297	0.0310	0.4286	4.2	1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
46	3ng7:X	427	92	0.0535	0.0632	0.2935	4.3	3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
47	2bs2:A	655	29	0.0277	0.0214	0.4828	4.5	2bs2:D, 2bs3:A, 2bs3:D, 2bs4:A, 2bs4:D, 1e7p:A, 1e7p:D, 1e7p:G, 1e7p:J, 1qlb:A, 1qlb:D
48	1zov:A	381	36	0.0238	0.0315	0.3333	5.1	1zov:B
49	2gb0:B	389	36	0.0238	0.0308	0.3333	5.6	2a89:A, 2a89:B, 3bhf:A, 3bhf:B, 3bhk:A, 3bhk:B, 1el5:A, 1el5:B, 1el7:A, 1el7:B, 1el8:A, 1el8:B, 1el9:A, 1el9:B, 1eli:A, 1eli:B, 2gb0:A, 2gf3:A, 2gf3:B, 1l9c:A, 1l9c:B, 1l9d:A, 1l9d:B, 1l9e:A, 1l9e:B, 3m0o:A, 3m0o:B, 3m12:A, 3m12:B, 3m13:A, 3m13:B, 3m13:C, 3m13:D, 3qse:A, 3qse:B, 3qsm:A, 3qsm:B, 3qss:A, 3qss:B
50	5o3n:A	488	70	0.0436	0.0451	0.3143	6.9	5o3n:B
51	1jeh:A	478	43	0.0297	0.0314	0.3488	7.5	1jeh:B, 1v59:A, 1v59:B
52	4i58:A	451	40	0.0257	0.0288	0.3250	7.9	4i58:B, 4i58:C, 4i58:D, 4i59:A, 4i59:B, 4i59:C, 4i59:D
53	1knp:A	529	46	0.0356	0.0340	0.3913	8.4	1knr:A
54	6sek:A	504	35	0.0238	0.0238	0.3429	9.0	6sek:B
55	7qf8:A	494	49	0.0337	0.0344	0.3469	9.1
56	7qfd:A	458	49	0.0337	0.0371	0.3469	9.3	7qva:A
57	7eme:A	413	35	0.0257	0.0315	0.3714	9.3	7eme:B
58	4jdr:A	471	45	0.0257	0.0276	0.2889	9.7	4jdr:B, 4jq9:A, 4jq9:B, 4jq9:C, 4jq9:D, 4jq9:E, 4jq9:F
59	3om2:A	448	82	0.0475	0.0536	0.2927	9.9	3om4:A, 3om4:B, 3om4:C, 3om4:D, 3om5:A, 3om5:B, 3om5:C, 3om5:D, 3om6:A, 3om6:B, 3om6:C, 3om6:D, 3om7:C, 3om7:A, 3om7:B, 3om7:D
60	6hk1:A	261	36	0.0277	0.0536	0.3889	10.0	6hk1:B, 6hk1:F, 6hk1:C, 6hk1:D, 6hk1:E

[Back]