Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DWEGRWNHVKKFLERSGPFTHPDFEPSTESLQFLLDTCKVLVIGAGGLGCELLKNLALSGFRQIHVIDMDTIDVSNLNRQ
FLFRPKDIGRPKAEVAAEFLNDRVPNCNVVPHFNKIQDFNDTFYRQFHIIVCGLDSIIARRWINGMLISLLNYEDGVLDP
SSIVPLIDGGTEGFKGNARVILPGMTACIECTLELYPPQVNFPMATIASMPRLPEHCIEYVRMLQWPKEQPFGEGVPLDG
DDPEHIQWIFQKSLERASQYNIRGVTYRLTQGVVKRIIPAVASTNAVIAAVCATEVFKIATSAYIPLNNYLVFNDVDGLY
TYTFEAERKENCPACSQLPQNIQFSPSAKLQEVLDYLTNSASLQMKSPAITATNRTLYLQSVTSIEERTRKELGLVDGQE
AVADVTTPQTVLFKLHFT

The query sequence (length=418) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2nvu:B 789 430 0.9976 0.5285 0.9698 0.0 3dbh:B, 3dbh:D, 3dbh:F, 3dbh:H, 3dbl:B, 3dbl:D, 3dbl:F, 3dbl:H, 3dbr:B, 3dbr:D, 3dbr:F, 3dbr:H, 3gzn:B, 3gzn:D, 1r4m:F, 1r4m:H, 1r4n:B, 1r4n:D, 1r4n:F, 1r4n:H, 1tt5:B, 1tt5:D, 1yov:B, 1yov:D
2 3kyc:B 548 229 0.2297 0.1752 0.4192 1.02e-44 6cwz:D, 6xog:B, 6xoh:B, 1y8q:B, 1y8q:D, 1y8r:B, 1y8r:E
3 3kyc:B 548 95 0.0694 0.0529 0.3053 0.005 6cwz:D, 6xog:B, 6xoh:B, 1y8q:B, 1y8q:D, 1y8r:B, 1y8r:E
4 3kyd:B 477 333 0.2727 0.2390 0.3423 1.57e-44
5 6xoi:B 403 332 0.2679 0.2779 0.3373 5.81e-44
6 6cwy:D 487 210 0.1938 0.1663 0.3857 1.34e-32
7 6cwy:D 487 94 0.0646 0.0554 0.2872 0.044
8 6dc6:C 996 202 0.1627 0.0683 0.3366 8.04e-29 6dc6:A, 1z7l:A, 1z7l:B, 1z7l:C
9 6dc6:C 996 75 0.0766 0.0321 0.4267 2.35e-07 6dc6:A, 1z7l:A, 1z7l:B, 1z7l:C
10 6dc6:C 996 61 0.0431 0.0181 0.2951 0.007 6dc6:A, 1z7l:A, 1z7l:B, 1z7l:C
11 7pvn:B 990 199 0.1675 0.0707 0.3518 9.65e-29 7sol:C
12 7pvn:B 990 72 0.0598 0.0253 0.3472 0.001 7sol:C
13 7pvn:B 990 98 0.0670 0.0283 0.2857 0.001 7sol:C
14 7sol:A 1011 199 0.1675 0.0692 0.3518 9.83e-29 7pvn:A
15 7sol:A 1011 72 0.0598 0.0247 0.3472 0.001 7pvn:A
16 7sol:A 1011 98 0.0670 0.0277 0.2857 0.001 7pvn:A
17 5l6i:A 1007 201 0.1699 0.0705 0.3532 1.32e-28 3cmm:A, 3cmm:C, 5l6h:A, 5l6h:C, 5l6i:C, 5l6j:A, 5l6j:C, 4nnj:A, 4nnj:C, 6nya:A, 6nya:D, 6zhu:A, 6zhu:E, 6zhu:C, 6zhu:G, 7zh9:A
18 5l6i:A 1007 102 0.0813 0.0338 0.3333 6.98e-08 3cmm:A, 3cmm:C, 5l6h:A, 5l6h:C, 5l6i:C, 5l6j:A, 5l6j:C, 4nnj:A, 4nnj:C, 6nya:A, 6nya:D, 6zhu:A, 6zhu:E, 6zhu:C, 6zhu:G, 7zh9:A
19 5l6i:A 1007 61 0.0478 0.0199 0.3279 0.003 3cmm:A, 3cmm:C, 5l6h:A, 5l6h:C, 5l6i:C, 5l6j:A, 5l6j:C, 4nnj:A, 4nnj:C, 6nya:A, 6nya:D, 6zhu:A, 6zhu:E, 6zhu:C, 6zhu:G, 7zh9:A
20 4ii3:A 986 208 0.1603 0.0680 0.3221 1.04e-26 9b5c:A, 9b5d:A, 9b5e:A, 9b5f:A, 9b5g:A, 9b5h:A, 9b5i:A, 9b5j:A, 9b5k:A, 9b5l:A, 9b5m:A, 9b5n:A, 9b5o:A, 9b5p:A, 9b5q:A, 9b5r:A, 9b5s:A, 9b5t:A, 9b5u:A, 9b5v:A, 9b5w:A, 9b5x:A, 4ii2:A, 4ii3:C, 6o82:A, 6o82:C, 6o83:A, 6o83:C, 5um6:A
21 4ii3:A 986 114 0.0766 0.0325 0.2807 2.49e-06 9b5c:A, 9b5d:A, 9b5e:A, 9b5f:A, 9b5g:A, 9b5h:A, 9b5i:A, 9b5j:A, 9b5k:A, 9b5l:A, 9b5m:A, 9b5n:A, 9b5o:A, 9b5p:A, 9b5q:A, 9b5r:A, 9b5s:A, 9b5t:A, 9b5u:A, 9b5v:A, 9b5w:A, 9b5x:A, 4ii2:A, 4ii3:C, 6o82:A, 6o82:C, 6o83:A, 6o83:C, 5um6:A
22 4ii3:A 986 131 0.0813 0.0345 0.2595 6.43e-04 9b5c:A, 9b5d:A, 9b5e:A, 9b5f:A, 9b5g:A, 9b5h:A, 9b5i:A, 9b5j:A, 9b5k:A, 9b5l:A, 9b5m:A, 9b5n:A, 9b5o:A, 9b5p:A, 9b5q:A, 9b5r:A, 9b5s:A, 9b5t:A, 9b5u:A, 9b5v:A, 9b5w:A, 9b5x:A, 4ii2:A, 4ii3:C, 6o82:A, 6o82:C, 6o83:A, 6o83:C, 5um6:A
23 7k5j:I 979 191 0.1627 0.0695 0.3560 1.60e-25 7k5j:D, 7k5j:A, 7k5j:C, 7k5j:G, 7k5j:K, 7k5j:S, 5tr4:A, 5tr4:C
24 7k5j:I 979 102 0.0813 0.0347 0.3333 7.76e-08 7k5j:D, 7k5j:A, 7k5j:C, 7k5j:G, 7k5j:K, 7k5j:S, 5tr4:A, 5tr4:C
25 7k5j:I 979 61 0.0478 0.0204 0.3279 0.003 7k5j:D, 7k5j:A, 7k5j:C, 7k5j:G, 7k5j:K, 7k5j:S, 5tr4:A, 5tr4:C
26 8oif:A 704 195 0.1579 0.0938 0.3385 1.27e-23
27 8oif:A 704 94 0.0742 0.0440 0.3298 1.59e-05
28 8sea:A 992 193 0.1579 0.0665 0.3420 2.34e-23 8se9:A, 8seb:A, 8sv8:A
29 8sea:A 992 94 0.0742 0.0312 0.3298 1.52e-05 8se9:A, 8seb:A, 8sv8:A
30 1zfn:A 244 237 0.1651 0.2828 0.2911 3.48e-12 1zfn:B, 1zfn:C, 1zfn:D, 1zkm:A, 1zkm:B, 1zkm:C, 1zkm:D, 1zud:1, 1zud:3
31 1jw9:B 240 80 0.0718 0.1250 0.3750 7.88e-10 1jwa:B, 1jwb:B
32 3h5a:C 358 119 0.0933 0.1089 0.3277 8.64e-09 3h5a:A, 3h5a:B, 3h5a:D, 3h5n:A, 3h5n:B, 3h5n:C, 3h5n:D, 3h5r:A, 3h5r:B, 3h5r:C, 3h5r:D, 3h9g:A, 3h9g:B, 3h9g:C, 3h9g:D, 3h9j:A, 3h9j:B, 3h9j:C, 3h9j:D, 3h9q:A, 3h9q:B, 3h9q:C, 3h9q:D, 6om4:A, 6om4:B
33 4gsk:B 572 72 0.0718 0.0524 0.4167 1.23e-08 4gsk:A
34 4gsl:A 598 72 0.0718 0.0502 0.4167 1.28e-08 4gsl:B, 3rui:A, 3t7e:A, 3t7g:B, 3t7g:A, 3vh1:A, 3vh2:A, 3vh3:A, 3vh4:A, 5yec:A, 5yec:C
35 4yed:D 255 81 0.0742 0.1216 0.3827 2.43e-08 4d79:A, 4d79:B, 4d79:C, 4d79:D, 4d7a:A, 4d7a:B, 4d7a:D, 4rdh:A, 4rdh:B, 4rdh:C, 4rdh:D, 4rdi:A, 4rdi:B, 4rdi:C, 4rdi:D, 4yed:A, 4yed:B, 4yed:C
36 6yub:A 423 63 0.0646 0.0638 0.4286 5.07e-08 6yub:B, 6yuc:D, 6z6s:DDD
37 7tsq:B 208 120 0.0837 0.1683 0.2917 1.03e-04
38 7to3:A 568 120 0.0837 0.0616 0.2917 1.11e-04 7to3:B, 7tqd:A, 7tsq:A, 7tsx:B, 7tsx:A
39 8ide:A 929 100 0.0742 0.0334 0.3100 5.03e-04
40 8tz0:A 505 71 0.0550 0.0455 0.3239 0.31 8tyz:A, 8tz0:B
41 5iy6:M 260 75 0.0574 0.0923 0.3200 0.34 8bvw:M, 8byq:M, 8bz1:M, 7edx:R, 7eg7:R, 7eg8:R, 7eg9:R, 7ega:R, 7egb:R, 7egc:R, 7ena:BA, 7enc:BA, 8gxq:BA, 8gxs:BA, 5iya:M, 7lbm:O, 7nvr:M, 7nvs:M, 7nvt:M, 7nvy:M, 7nvz:M, 7zwd:M, 7zx7:M
42 5iy7:M 310 75 0.0574 0.0774 0.3200 0.41 1c9b:A, 1c9b:E, 1c9b:I, 1c9b:M, 1c9b:Q, 1dl6:A, 5iy8:M, 5iy9:M, 5iyb:M, 5iyc:M, 5iyd:M, 7nvu:M, 7nw0:M, 6o9l:M, 2phg:A, 1rly:A, 8s51:M, 8s52:M, 8s5n:M, 1vol:A, 8wak:R, 8wal:R, 8wan:R, 8wao:R, 8wap:R, 8waq:R, 8war:R, 8was:R, 7zwc:M, 7zx8:M, 7zxe:M
43 6h77:B 302 181 0.1077 0.1490 0.2486 0.88 3guc:A, 6h77:A, 6h77:C, 6h77:D, 6h78:A, 6h78:B, 6h78:C, 6h78:D, 6h78:E, 6h78:F, 6h78:G, 6h78:H, 6h78:I, 6h78:J, 6h78:K, 6h78:L, 6h78:M, 6h78:N, 6h78:O, 6h78:P, 3h8v:A, 5iaa:A, 5l95:A
44 2q1s:A 336 35 0.0359 0.0446 0.4286 1.3 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
45 5oc2:A 441 29 0.0287 0.0272 0.4138 1.5 5oc2:B, 5oc3:A, 5oc3:B, 4wct:A, 4wct:B, 4xwz:A, 4xwz:B
46 4zrn:A 309 45 0.0383 0.0518 0.3556 1.9 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
47 2bcg:G 442 81 0.0526 0.0498 0.2716 2.6 1ukv:G
48 3pvz:B 300 66 0.0407 0.0567 0.2576 3.2
49 2yjz:A 174 73 0.0574 0.1379 0.3288 3.5 2yjz:B, 2yjz:C, 2yjz:D
50 4k28:A 266 97 0.0550 0.0865 0.2371 3.6 4k28:B
51 3pvz:A 372 66 0.0407 0.0457 0.2576 3.8 3pvz:C, 3pvz:D
52 2bi7:A 383 30 0.0311 0.0339 0.4333 5.1 2bi8:A, 3gf4:A, 3gf4:B, 3inr:A, 3inr:B, 3int:A, 3int:B, 3kyb:A, 3kyb:B, 1wam:A
53 1rr8:C 494 26 0.0287 0.0243 0.4615 6.6 1a35:A, 1k4s:A
54 1sc7:A 567 26 0.0287 0.0212 0.4615 7.5 1a31:A, 1a36:A, 1ej9:A, 1k4t:A, 1lpq:A, 1nh3:A, 1r49:A, 1rrj:A, 1seu:A, 1t8i:A, 1tl8:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218