BioLiP

>protein
DVSFRLSGADPRSYGMFIKDLRNALPFREKVYNIPLLLPSVSGAGRYLLMHLFNRDGKTITVAVDVTNIYIMGYLADTTS
YFFNEPAAELASQYVFRDARRKITLPYSGDYERLQIAAGKPREKIPIGLPALDSAISTLLHYDSTAAAGALLVLIQTTAE
AARFKYIEQQIQERAYRDEVPSLATISLENSWSGLSKQIQLAQGNNGIFRTPIVLVDNKGNRVQITNVTSKVVTSNIQLL
LNTRNI

The query sequence (length=246) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1aha:A	246	246	0.9878	0.9878	0.9878	0.0	1ahb:A, 5cf9:B, 5cix:A, 5cso:A, 5cst:A, 4emf:A, 4emr:A, 4f9n:A, 4fxa:A, 4fz9:A, 4guw:A, 4h0z:A, 4hoa:A, 4i47:A, 5ilw:A, 5ilx:A, 4jtp:A, 4k2z:A, 4kpv:A, 6loq:A, 6lor:A, 6lov:A, 6low:A, 6loy:A, 6loz:A, 6lp0:A, 4lt4:A, 4lwx:A, 4m5a:A, 1mrg:A, 1mrh:A, 3mry:A, 3my6:A, 3n1d:A, 3n1n:A, 3n2d:A, 3n31:A, 3n3x:A, 3n5d:A, 3nfm:A, 3njs:A, 3nx9:A, 4o0o:A, 4o4q:A, 4o8e:A, 3q4p:A, 4q9f:A, 3qji:A, 3rl9:A, 3sj6:A, 3u6t:A, 3u6z:A, 3u70:A, 3u8f:A, 3v14:A, 3v2k:A, 5wv1:A, 5y48:A, 4yp2:B, 4zt8:A, 4zu0:A, 4zz6:A
2	1gis:A	248	246	0.6341	0.6290	0.6341	6.20e-111	1giu:A, 2jdl:A, 2jdl:B, 1mrj:A, 1mrk:A, 1nli:A, 1qd2:A, 1tcs:A
3	3bwh:A	244	242	0.5691	0.5738	0.5785	7.00e-92
4	1hwp:A	252	219	0.3455	0.3373	0.3881	1.24e-37
5	1br6:A	268	242	0.3537	0.3246	0.3595	6.57e-37	1br5:A, 5ddz:A, 3ej5:X, 4esi:A, 5gu4:A, 5gu4:B, 3hio:A, 4huo:X, 4hup:X, 4hv3:A, 4hv7:X, 8i7p:A, 1ifs:A, 1ifu:A, 1il3:A, 1il4:A, 1il5:A, 1il9:A, 1j1m:A, 7kc9:D, 7kd0:A, 7kdm:D, 7kdu:A, 4lgr:A, 7mln:A, 7mlo:A, 7mlo:B, 7mlp:A, 7mlt:A, 4mx1:A, 4mx5:X, 1obt:A, 6obg:B, 6ocd:A, 6ocd:C, 2p8n:A, 2pjo:A, 3px8:X, 3px9:X, 4q2v:A, 2r2x:A, 3rti:A, 3rtj:A, 1rzo:A, 1rzo:C, 8t9v:A, 8tab:A, 8tad:A, 6urw:A, 6urx:A, 6ury:A, 7xzs:A, 7xzt:A, 7xzu:A, 7xzw:A, 7y02:A, 7y03:A, 7y05:A, 7y06:A, 7y07:A, 7y08:A, 7y4k:A, 7y4m:A, 4z9k:A
6	5z3i:A	247	238	0.3293	0.3279	0.3403	3.86e-30	5z3j:A
7	3ku0:A	251	233	0.3293	0.3227	0.3476	7.40e-30	3ku0:B
8	1onk:A	249	237	0.3293	0.3253	0.3418	2.11e-26	1tfm:A, 1yf8:A
9	3d7w:A	249	237	0.3211	0.3173	0.3333	1.25e-25	6ely:A, 4jkx:A, 1m2t:A, 3o5w:A, 2r9k:A, 2rg9:A, 1sz6:A
10	1d6a:A	262	222	0.2846	0.2672	0.3153	1.94e-23	1d6a:B, 1pag:A, 1pag:B, 1qci:A, 1qci:B, 1qcj:A, 1qcj:B
11	2qes:A	261	228	0.2886	0.2720	0.3114	1.59e-22	2qet:A
12	1j1r:A	261	244	0.2886	0.2720	0.2910	3.25e-20	1j1s:A
13	3le7:A	261	226	0.2927	0.2759	0.3186	1.23e-19	3le7:B
14	3hit:A	257	232	0.2846	0.2724	0.3017	2.99e-15	3hit:B, 3hiv:A, 3hiv:B, 3hiw:A, 3hiw:B
15	1lpc:A	254	225	0.2276	0.2205	0.2489	1.11e-06	1lpd:A
16	7vhc:A	284	160	0.1382	0.1197	0.2125	0.030	8cx8:A, 8cx8:B, 7d6r:A, 2ga4:A, 8gcw:A, 1r4p:A, 8sz2:A, 8sz2:B, 6u3u:A, 7u6v:A, 7vhd:A, 7vhe:A, 7vhf:A, 6x6h:A1
17	3bgd:A	232	62	0.0772	0.0819	0.3065	0.042	3bgd:B, 3bgi:A, 3bgi:B, 2gb4:A, 2gb4:B
18	3a46:A	288	246	0.2398	0.2049	0.2398	0.14	3a46:B, 4nrw:A, 4nrw:B, 3vk7:A, 3vk7:B, 3vk8:A, 3vk8:B
19	5jwa:A	495	52	0.0650	0.0323	0.3077	0.19	5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
20	8asw:A	1255	114	0.1260	0.0247	0.2719	0.80
21	4ege:A	371	34	0.0528	0.0350	0.3824	4.0
22	6xj0:A	508	79	0.0894	0.0433	0.2785	6.1
23	3ue6:E	138	32	0.0610	0.1087	0.4688	9.1	3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
24	5i7i:B	320	47	0.0528	0.0406	0.2766	9.5	5i7i:A, 5izz:A
25	4z87:A	498	98	0.0976	0.0482	0.2449	9.9	5tc3:A, 5tc3:B, 4z87:B, 4z87:C, 4z87:D

[Back]