Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DTLDEAERQWKAEFHRWSSYMVHWKNQFDHYS

The query sequence (length=32) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1vzj:F 34 32 1.0000 0.9412 1.0000 7.54e-19 1vzj:B, 1vzj:D, 1vzj:H, 1vzj:C, 1vzj:G
2 4bdt:A 563 24 0.7500 0.0426 1.0000 3.44e-13 8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
3 6i2t:B 562 30 0.5938 0.0338 0.6333 1.45e-09 7aiy:A, 8ai7:F, 7amz:A, 8am1:A, 8am2:A, 4aqd:A, 4aqd:B, 7awg:A, 7awh:A, 7awi:A, 4axb:A, 4b0o:A, 4b0p:A, 4bbz:A, 4bds:A, 7bgc:A, 7bo3:A, 7bo4:A, 8cgo:A, 3djy:A, 3dkk:A, 5dyt:A, 5dyt:B, 5dyw:A, 5dyw:B, 5dyy:A, 5dyy:B, 6ep4:A, 6eqp:A, 6eqq:A, 6esj:A, 6esj:B, 6esy:B, 6esy:A, 6eyf:A, 6f7q:A, 6f7q:B, 6i0b:A, 6i0c:A, 6i2t:A, 6i2t:C, 6i2t:D, 2j4c:A, 5k5e:A, 5k5e:B, 5lkr:A, 5lkr:B, 5nn0:A, 3o9m:A, 3o9m:B, 1p0i:A, 1p0m:A, 1p0p:A, 1p0q:A, 7q1m:A, 7q1n:A, 7q1o:A, 7q1p:A, 6qaa:A, 6qab:A, 6qac:A, 6qad:A, 6qae:A, 7qbq:A, 7qbr:A, 7qhd:A, 7qhe:A, 6r6v:A, 6r6w:A, 6rua:A, 6rua:B, 6sam:A, 6t9p:A, 6t9s:A, 4tpk:A, 4tpk:B, 2wid:A, 2wif:A, 2wig:A, 2wij:A, 2wik:A, 2wil:B, 2wil:A, 2wsl:A, 4xii:A, 4xii:B, 1xlu:A, 1xlv:A, 1xlw:A, 2xmb:A, 2xmc:A, 2xmd:A, 2xmg:A, 2xqf:A, 2xqg:A, 2xqi:A, 2xqj:A, 2xqk:A, 6xta:A, 2y1k:A, 7zpb:A, 6zwi:A
4 8he5:O 516 10 0.2500 0.0155 0.8000 1.2
5 7qe7:N 682 20 0.2812 0.0132 0.4500 1.5 8s4g:N
6 8pkp:N 652 20 0.2812 0.0138 0.4500 1.7 9gaw:N
7 6tm5:N 676 20 0.2812 0.0133 0.4500 2.1
8 7y4i:A 822 29 0.3438 0.0134 0.3793 3.7 8dti:A, 8dti:B
9 8r3q:D 676 29 0.2812 0.0133 0.3103 3.9 8r3q:B, 8r3q:A, 8r3q:C
10 7ksf:A 742 27 0.2500 0.0108 0.2963 4.3
11 4rpg:A 393 23 0.2500 0.0204 0.3478 5.2 4rpg:B, 4rpg:C, 4rph:B, 4rph:A, 4rph:C, 4rpj:A, 4rpj:B, 4rpj:C, 4rpk:B, 4rpk:A, 4rpk:C, 4rpl:B, 4rpl:A, 4rpl:C, 1v0j:A, 1v0j:B, 1v0j:C, 1v0j:D
12 8rsn:A 538 14 0.1875 0.0112 0.4286 9.3 8rsn:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218