BioLiP

>protein
DTKHYEEAKKCVEELALYLKVLSRPMQRKLVTLVHCQLVEEEGRIRAMRAARSLGERTVTELILQHQNPQQLSSNLWAAV
RARGCQFLGPAMQEEALKLVLLALEDGSALSRKVLVLFVVQRLEPRFPQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVTKRDEDSSLM
QLKEEFRTYEALRREHDSQIVQIAMEAGLRIAPDQWSSLLYGDQSHKSHMQSIIDKLQTPASFAQSVQELTIALQRTGDP
ANLNRLRPHLELLANIDPSPDAPPPTWEQLENGLVAVRTVVHGLVDYIQNHS

The query sequence (length=292) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4txa:A	367	293	0.9897	0.7875	0.9863	0.0	5f5f:A, 5f5f:G, 5f5f:C, 5f5f:E, 5f5h:A, 5f5h:B, 4qi2:A, 4qi2:B, 4qi2:C, 4qi2:D, 4qik:A, 4qik:B, 4qil:B, 4qil:A, 6tqa:A, 6tqa:B, 6tqa:C, 6tqa:D, 6tqb:A, 4ywq:A, 4zld:A
2	4z31:B	295	292	0.9075	0.8983	0.9075	0.0	4z31:A
3	5s5a:E	123	76	0.0582	0.1382	0.2237	0.78
4	1puj:A	261	98	0.0856	0.0958	0.2551	2.0	6ppk:W
5	6fuv:A	427	43	0.0479	0.0328	0.3256	4.0
6	3wgx:B	112	42	0.0548	0.1429	0.3810	4.3	3wgx:A
7	4ojq:B	420	22	0.0308	0.0214	0.4091	4.3	1hei:B, 4ok6:B
8	4b6f:A	645	22	0.0308	0.0140	0.4091	5.6	1a1v:A, 4a1t:A, 4a1t:B, 4a1v:A, 4a1v:B, 4a1x:A, 4a1x:B, 4a92:A, 4a92:B, 4b6e:B, 4b6f:B, 4b71:A, 4b71:B, 4b73:A, 4b73:B, 4b74:A, 4b74:B, 4b75:A, 4b75:B, 4b76:A, 4b76:B, 1bt7:A, 1cu1:A, 1cu1:B, 1dxp:A, 1dxp:B, 1dxw:A, 1dy8:A, 1dy8:B, 1dy9:A, 1dy9:B, 5e4f:A, 5e4f:B, 2f55:A, 2f55:B, 2f55:C, 6fe6:A, 5fps:A, 5fps:B, 5fpt:A, 5fpt:B, 5fpy:A, 5fpy:B, 1hei:A, 4i31:A, 4i31:B, 4i32:A, 4i32:B, 4i33:A, 4i33:B, 4jmy:A, 4jmy:B, 1jxp:A, 1jxp:B, 2k1q:A, 4k8b:A, 4k8b:B, 3kee:A, 3kee:B, 3kee:C, 3kee:D, 3kqh:B, 3kqh:A, 3kqk:B, 3kqk:A, 3kql:A, 3kql:B, 3kqn:A, 3kqu:A, 3kqu:B, 3kqu:C, 3kqu:D, 3kqu:E, 3kqu:F, 4ktc:A, 4ktc:C, 1ns3:A, 1ns3:B, 3o8b:A, 3o8b:B, 3o8c:A, 3o8c:B, 3o8d:A, 3o8d:B, 3o8r:A, 3o8r:B, 4ojq:A, 4ok3:A, 4ok5:A, 4ok6:A, 4oks:A, 4oks:B, 3oyp:A, 3oyp:B, 3p8n:A, 3p8n:B, 3p8o:A, 3p8o:B, 3rvb:A, 4tyd:A, 4tyd:D, 4tyd:B, 4tyd:E, 4tyd:C, 4tyd:F, 4tyd:G, 4tyd:M, 4tyd:H, 4tyd:J, 4tyd:L, 4tyd:K, 4u01:A, 4u01:B, 4u01:C, 4u01:D, 4u01:E, 4u01:F, 4u01:G, 4u01:H, 4u01:J, 1w3c:A, 1w3c:B, 4wxp:A, 4wxr:A, 4wxr:B, 2zjo:A
9	7ase:U	68	30	0.0445	0.1912	0.4333	6.0	8a3w:Sd, 8a98:Sd, 6az1:d, 5opt:U, 8ovj:Sd, 8rxh:Sd, 8rxx:Sd, 5t2a:AZ, 4v8m:AZ
10	8vsi:B	579	39	0.0445	0.0225	0.3333	7.2
11	5wbj:A	1058	45	0.0514	0.0142	0.3333	7.2	5wbk:A, 5wbl:A
12	4irm:C	236	45	0.0514	0.0636	0.3333	7.5	1xvl:C
13	6afn:A	268	118	0.0856	0.0933	0.2119	7.5	6afp:A, 6afp:B, 5glb:A, 5gld:A

[Back]