Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DTKEQRILRYVQQNAKPGDPQSVLEAIDTYCTQKEWAMNVGDAKGQIMDAVIREYSPSLVLELGAYCGYSAVRMARLLQP
GARLLTMEINPDCAAITQQMLNFAGLQDKVTILNGASQDLIPQLKKKYDVDTLDMVFLDHWKDRYLPDTLLLEECGLLRK
GTVLLADNVIVPGTPDFLAYVRGSSSFECTHYSSYLEYMKVVDGLEKAIYQGPS

The query sequence (length=214) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5k0g:B 220 214 1.0000 0.9727 1.0000 6.35e-161 6aw7:A, 6aw7:B, 6aw8:A, 6aw8:B, 6aw8:C, 6aw9:A, 6aw9:B, 6aw9:C, 5k0j:A, 5k0j:B, 4p7k:A
2 7ud6:A 265 212 0.9206 0.7434 0.9292 3.10e-143 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
3 6i3d:B 218 212 0.8178 0.8028 0.8255 5.45e-134 3a7e:A, 3bwm:A, 3bwy:A, 6i3c:A, 6i3d:A, 5lsa:A, 4pyj:A, 4pyk:A, 4xuc:A, 4xud:A, 4xue:B, 4xue:A
4 5zy6:B 245 197 0.3551 0.3102 0.3858 2.22e-39 5zy6:A
5 7cvx:B 220 152 0.2336 0.2273 0.3289 3.57e-17 7cvv:A, 7cvv:B, 7cvv:C, 7cvw:A, 7cvw:B, 7cvx:A
6 4pca:A 221 156 0.2056 0.1991 0.2821 5.35e-12 4oa5:A, 4oa5:B, 4oa5:C, 4oa5:D, 4oa5:E, 4oa5:F, 4pca:B, 4pca:C, 4pca:D, 4pcl:A, 4pcl:B
7 3duw:A 220 138 0.1869 0.1818 0.2899 6.39e-12 3duw:B
8 4ymg:B 239 170 0.2056 0.1841 0.2588 2.12e-11 4ymg:A, 4ymh:A, 4ymh:B, 4ymh:C, 4ymh:D
9 3cbg:A 218 138 0.1869 0.1835 0.2899 3.24e-11
10 6jcl:G 219 114 0.1729 0.1689 0.3246 5.83e-11 6jcl:A, 6jcl:C, 6jcl:B, 6jcl:E, 6jcl:D, 6jcl:H, 6jcl:F
11 3tr6:A 222 138 0.1589 0.1532 0.2464 7.50e-10
12 5n5d:A 224 102 0.1449 0.1384 0.3039 5.10e-08 5n5d:B
13 5log:A 222 136 0.1495 0.1441 0.2353 7.83e-08 5lhm:A, 5log:B
14 8xdo:A 242 178 0.1822 0.1612 0.2191 2.22e-07 8uke:A, 8uke:C, 8uke:B, 8uke:D, 8uke:E, 8uke:F, 8xdo:B, 8xdp:A, 8xdp:B, 8xdq:A, 8xdq:B, 8xdr:A, 8xdr:B, 8xds:A, 8xds:B, 8xdt:A, 8xdt:B, 8xdu:A, 8xdu:B, 8xdv:A, 8xdv:B, 8xdy:A, 8xdy:B, 8xe0:A, 8xe0:B, 8xe2:A, 8xe2:B, 8xe2:C, 8xe2:D, 8xe3:A, 8xe3:B, 8xe4:A, 8xe4:B, 8xe4:C, 8xe4:D, 8xe5:A, 8xe5:B, 8xe5:C, 8xe5:D, 8z8o:A, 8z8o:B, 8z8o:C, 8z8o:D, 8z8p:A, 8z8p:B, 8z8p:C, 8z8p:D, 8z8r:A, 8z8r:B, 8z8r:C, 8z8r:D, 8z8s:A, 8z8s:B, 8zfw:A, 8zfw:B
15 8c9s:A 223 136 0.1589 0.1525 0.2500 3.47e-07 8c9s:B
16 5kva:B 228 134 0.1682 0.1579 0.2687 4.61e-07 5kva:A
17 2gpy:B 192 116 0.1589 0.1771 0.2931 1.13e-06 2gpy:A
18 1sui:A 227 157 0.1776 0.1674 0.2420 1.27e-06 1sui:B, 1sui:C, 1sui:D, 1sus:A, 1sus:B, 1sus:C, 1sus:D
19 5zw4:A 216 117 0.1589 0.1574 0.2906 3.19e-05 5zw3:A
20 5zw3:B 193 116 0.1636 0.1813 0.3017 1.35e-04
21 4kif:B 339 126 0.1449 0.0914 0.2460 4.47e-04 4kib:A, 4kib:B, 4kic:A, 4kic:B, 4kif:A, 4kig:A, 4kig:B, 4m6x:A, 4m6x:B, 4m6y:A, 4m6y:B, 4m71:A, 4m71:B, 4m72:A, 4m72:B, 4m73:A, 4m73:B, 4m74:A, 4m74:B
22 2hnk:B 232 119 0.1028 0.0948 0.1849 0.001 2hnk:A, 2hnk:C
23 3mb5:A 255 58 0.0841 0.0706 0.3103 0.005 3lga:A, 3lga:B, 3lga:C, 3lga:D, 3lhd:C, 3lhd:A, 3lhd:B, 3lhd:D
24 3c3y:A 225 154 0.1495 0.1422 0.2078 0.009 3c3y:B
25 8c9v:A 187 140 0.1495 0.1711 0.2286 0.016
26 6kms:C 210 74 0.1028 0.1048 0.2973 0.091 8cnc:A, 6h1d:A, 6h1e:A, 6k0x:A, 6khs:A, 6kmr:B, 6kms:D, 6ped:A, 8qdg:A, 8qdi:A
27 8gxn:B 225 137 0.1402 0.1333 0.2190 0.40 8gxo:A, 8gxo:B
28 5kqa:A 110 106 0.1355 0.2636 0.2736 0.62
29 3ndr:A 247 58 0.0935 0.0810 0.3448 0.67 3ndr:B, 3ndr:C, 3ndr:D, 3nug:A, 3nug:B, 3nug:C, 3nug:D, 3rwb:A, 3rwb:B, 3rwb:C, 3rwb:D
30 5x7f:A 198 107 0.1215 0.1313 0.2430 0.72
31 4o29:A 207 56 0.0794 0.0821 0.3036 0.87
32 2avd:A 219 176 0.1822 0.1781 0.2216 1.2 2avd:B
33 5bxy:A 155 54 0.0841 0.1161 0.3333 1.4 5bxy:B
34 3ond:B 488 77 0.1028 0.0451 0.2857 2.5 3ond:A, 3one:A, 3one:B, 3onf:A, 3onf:B
35 5w8q:A 379 54 0.0888 0.0501 0.3519 3.8 5w8q:B, 5wc4:A, 5wc4:B
36 2vug:A 373 63 0.0841 0.0483 0.2857 3.9 2vug:B
37 1dl5:A 317 71 0.0841 0.0568 0.2535 4.3 1dl5:B
38 4pmx:A 306 45 0.0654 0.0458 0.3111 4.4 4pmy:A, 4pmy:B, 4pmz:A, 4pmz:B, 4pn2:A, 4pn2:B
39 1p91:A 268 63 0.0841 0.0672 0.2857 4.7 1p91:B
40 6gbn:B 435 54 0.0748 0.0368 0.2963 6.1 6gbn:A, 6gbn:C, 6gbn:D
41 2xma:E 141 53 0.0841 0.1277 0.3396 6.8 2xm3:A, 2xm3:B, 2xm3:C, 2xm3:D, 2xm3:F, 2xm3:E, 2xma:A, 2xma:B, 2xma:F, 2xo6:A, 2xo6:D, 2xqc:A, 2xqc:D
42 4ec0:B 200 47 0.0514 0.0550 0.2340 7.8 5ais:A, 5ais:B, 5ais:C, 5ais:D, 5aiv:A, 5aiv:B, 5aiv:C, 5aiv:D, 5aix:B, 5aix:C, 2cvd:A, 2cvd:B, 2cvd:C, 2cvd:D, 4ec0:A, 4edy:A, 4edy:B, 4edz:A, 4edz:B, 4edz:C, 4edz:D, 3ee2:A, 4ee0:A, 4ee0:B, 1iyh:A, 1iyh:B, 1iyh:C, 1iyh:D, 1iyi:A, 1iyi:B, 1iyi:C, 1iyi:D, 7jr6:A, 7jr6:B, 7jr8:A, 7jr8:B, 3kxo:A, 3kxo:B, 6n4e:A, 1v40:A, 1v40:B, 1v40:C, 1v40:D, 2vcq:A, 2vcq:B, 2vcq:C, 2vcq:D, 2vcw:A, 2vcw:B, 2vcw:D, 2vcx:A, 2vcx:B, 2vcx:C, 2vcx:D, 2vcz:A, 2vcz:B, 2vcz:D, 2vd0:A, 2vd0:B, 2vd0:D, 2vd1:A, 2vd1:B, 2vd1:C, 2vd1:D, 3vi5:A, 3vi5:B, 3vi5:C, 3vi5:D, 3vi7:A, 3vi7:B, 3vi7:C, 3vi7:D, 6w58:A, 6w58:B, 6w8h:A, 6w8h:C, 5ywe:A, 5ywe:B, 5ywe:C, 5ywe:D, 5ywx:A, 5ywx:B, 5ywx:C, 5ywx:D, 5yx1:A, 5yx1:B, 5yx1:C, 5yx1:D, 6ztc:A, 6ztc:B
43 6uk3:A 475 59 0.0794 0.0358 0.2881 8.3 6uk3:C, 6uk3:B, 6uk3:D
44 4y2h:B 352 139 0.1729 0.1051 0.2662 8.7 4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218