BioLiP

>protein
DSVTLRLMTEHDLAMLYEWLNRSHIVEWWGGEEARPTLADVQEQYLPSVLAQESVTPYIAMLNGEPIGYAQSYVALGSGD
GWWEEETDPGVRGIDQLLANASQLGKGLGTKLVRALVELLFNDPEVTKIQTDPSPSNLRAIRCYEKAGFERQGTVTTPDG
PAVYMVQTRQAFERTRSDA

The query sequence (length=179) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2bue:A	179	179	1.0000	1.0000	1.0000	7.19e-133	2prb:A, 2qir:A, 1v0c:A, 2vqy:A
2	4qc6:A	179	150	0.2346	0.2346	0.2800	2.08e-19	4qc6:B
3	6bff:A	178	149	0.2402	0.2416	0.2886	1.04e-18	6bff:B, 6bfh:A
4	3f5b:A	172	154	0.2402	0.2500	0.2792	9.97e-11
5	3wr7:A	170	156	0.1955	0.2059	0.2244	0.001	4r9m:A, 3wr7:C, 3wr7:B, 3wr7:D
6	6vfn:A	167	156	0.1955	0.2096	0.2244	0.002	6vfn:F, 6vfn:B, 6vfn:C, 6vfn:D, 6vfn:E, 6vfn:H, 6vfn:I, 6vfn:J, 6vfn:G, 6vfn:L, 6vfn:K
7	1s5k:A	153	138	0.1788	0.2092	0.2319	0.002	1s3z:A, 1s3z:B, 1s5k:B, 1s60:A, 2vbq:A, 2vbq:B
8	6d72:B	176	154	0.2067	0.2102	0.2403	0.002	6d72:A
9	7ovu:A	196	86	0.1229	0.1122	0.2558	0.003
10	8q6u:B	166	152	0.1788	0.1928	0.2105	0.006	8q6u:A
11	2ge3:A	164	143	0.1955	0.2134	0.2448	0.009	2ge3:B, 2ge3:C
12	8gxk:B	188	54	0.0950	0.0904	0.3148	0.021	8gxk:A, 8gxk:C, 8gxk:D
13	1wwz:A	157	116	0.1453	0.1656	0.2241	0.025	1wwz:B
14	8gxf:B	187	51	0.0950	0.0909	0.3333	0.033	8gxf:A, 8gxf:C, 8gxf:D
15	1yre:B	187	56	0.0838	0.0802	0.2679	0.11	1yre:A, 1yre:C, 1yre:D
16	6e1x:C	176	183	0.1844	0.1875	0.1803	0.14	5cnp:B, 5cnp:D, 5cnp:F, 6cx8:A, 6cx8:B, 6cx8:C, 6cx8:D, 6cx8:E, 6cx8:F, 6e1x:A, 6e1x:B, 6e1x:D, 4mhd:A, 4mhd:B, 4mhd:C, 4mi4:A, 4mi4:B, 4mi4:C, 4ncz:A, 4ncz:C, 4ncz:B, 4r57:A, 4r57:B, 4r57:C, 4r57:D, 4r57:E, 4r57:F, 4r57:G, 4r57:H, 4r57:I, 4r57:J, 4r57:K, 4r57:L, 4r87:A, 4r87:B, 4r87:C, 4r87:D, 4r87:E, 4r87:F, 4r87:G, 4r87:H, 4r87:I, 4r87:J, 4r87:K, 4r87:L, 5ug4:A, 5ug4:B, 5ug4:C, 4ygo:A, 4ygo:C, 4ygo:D, 4ygo:E
17	2vi7:C	165	87	0.1564	0.1697	0.3218	0.24
18	4urs:A	162	35	0.0726	0.0802	0.3714	0.34	4urg:A, 4urs:B
19	5c88:A	158	63	0.1061	0.1203	0.3016	0.38	6ag4:A, 6ag5:A, 5c88:B, 4lx9:A, 4r3k:A, 4r3l:A, 2x7b:A
20	6hif:G	531	46	0.0894	0.0301	0.3478	0.66	6hif:I, 6hif:H, 6hif:A, 6hif:C, 6hif:B, 6hif:D, 6hif:F, 6hif:E, 6hif:J, 6hif:L, 6hif:K, 6hif:M, 6hif:O, 6hif:N, 6hif:P, 6hif:R, 6hif:Q, 6hif:S, 6hif:U, 6hif:T, 6hif:V, 6hif:X, 6hif:W
21	3fbu:A	166	56	0.0782	0.0843	0.2500	1.1
22	3ld2:B	162	53	0.0950	0.1049	0.3208	1.6	3ld2:A, 3ld2:C, 3ld2:D
23	8iyo:D	163	50	0.0950	0.1043	0.3400	2.2	8iyo:A, 8iyo:B, 8iyo:C
24	2ob0:C	166	44	0.0838	0.0904	0.3409	3.1	2ob0:A, 2ob0:B, 6ppl:A, 2psw:A, 2psw:B, 2psw:C, 3tfy:A, 3tfy:B, 3tfy:C, 6wf3:A, 6wf3:B, 6wf3:C, 6wf3:D, 6wf3:E, 6wf3:F, 6wf5:A, 6wf5:B, 6wfg:A, 6wfg:C, 6wfg:E, 6wfk:A, 6wfk:B, 6wfk:C, 6wfn:A, 6wfo:A, 6wfo:B, 6wfo:C, 4x5k:A
25	5veu:C	469	57	0.0782	0.0299	0.2456	3.8	6mjm:A, 8sg5:A, 8sg5:B, 8sg5:C, 8sg5:D, 8sg5:E, 8sg5:F, 8sg5:G, 7sv2:A, 7sv2:B, 7sv2:C, 5veu:A, 5veu:B, 5veu:D, 5veu:F, 5veu:G, 5veu:H, 5veu:I, 5veu:J, 5veu:K
26	4neu:A	286	40	0.0838	0.0524	0.3750	4.0	6c3e:A, 6c3e:B, 6c4d:A, 6c4d:B, 6c4d:C, 6c4d:D, 7fcz:A, 7fcz:B, 7fd0:A, 7fd0:B, 6hho:A, 6hho:B, 5hx6:A, 5hx6:B, 8i2n:A, 8i2n:B, 4ith:A, 4ith:B, 4iti:A, 4iti:B, 4itj:A, 4itj:B, 4neu:B, 6nw2:A, 6nw2:B, 6nyh:A, 6nyh:B, 6ocq:A, 6ocq:B, 6r5f:A, 6r5f:B, 6r5f:C, 6r5f:D, 6rln:A, 6rln:B, 5tx5:A, 5tx5:B, 7xmk:A, 7xmk:B, 7ydx:A, 7ydx:B
27	7n29:B	350	76	0.1117	0.0571	0.2632	4.5	7n29:A, 7n29:C, 7n29:D, 7r4j:A, 7r4k:A, 7r4l:A, 7r4m:A
28	5veu:L	448	57	0.0782	0.0312	0.2456	4.8	7lad:A, 8sg5:H, 7sv2:D, 5veu:E
29	6j9f:C	1296	41	0.0782	0.0108	0.3415	4.9
30	6j9e:C	1288	41	0.0782	0.0109	0.3415	4.9
31	1y57:A	452	71	0.1117	0.0442	0.2817	5.3	1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
32	6td7:A	126	36	0.0782	0.1111	0.3889	6.6
33	3n0q:A	402	36	0.0950	0.0423	0.4722	6.8
34	5xgk:A	368	62	0.1006	0.0489	0.2903	6.9	1sp9:A
35	1cli:A	341	57	0.1061	0.0557	0.3333	8.5	1cli:B, 1cli:C, 1cli:D

[Back]