BioLiP

>protein
DSSASVVFMRFAPPGEETALPPRRATPGSVAYDLFPSEEMDIEPMGLAKISTGYGIDKFPDGCYGQIVSRSGMTWKNNTS
VPTGTIDVDYRGELKVILRNHSAEKSVPIRKGTSIAQLIFLRYCDVEEEQIVYINETTGERTIIDSSSKKDNKNQARSVR
GTGGFGSTDN

The query sequence (length=170) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5y5p:D	171	170	1.0000	0.9942	1.0000	4.39e-126	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
2	5f9k:B	130	121	0.2765	0.3615	0.3884	1.10e-20	5f9k:A, 5f9k:C
3	3f4f:A	138	149	0.3059	0.3768	0.3490	1.16e-20	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
4	4oop:B	142	152	0.3176	0.3803	0.3553	5.81e-20	4oop:A, 4oop:C
5	6ljj:A	150	126	0.2824	0.3200	0.3810	6.73e-19	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
6	2ol1:C	125	114	0.2529	0.3440	0.3772	8.43e-14	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
7	8hrv:B	145	154	0.3059	0.3586	0.3377	1.18e-13	8hrv:A, 8hrv:C
8	6mjk:A	144	152	0.2647	0.3125	0.2961	2.26e-13
9	7n6s:C	147	151	0.3118	0.3605	0.3510	2.28e-13	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
10	4gcy:A	163	138	0.2588	0.2699	0.3188	1.61e-12	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
11	3tp1:A	114	108	0.2353	0.3509	0.3704	1.20e-11	2d4n:A, 3tpn:A, 3tps:A, 3tpw:A, 3tpy:A, 3tq3:A, 3tq4:A, 3tq5:A, 3trl:A, 3trn:A, 3ts6:A, 3tsl:A, 3tta:A
12	5cct:A	169	113	0.2176	0.2189	0.3274	2.20e-10	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
13	4wrk:A	158	86	0.1706	0.1835	0.3372	1.50e-09	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
14	6mao:A	137	104	0.2235	0.2774	0.3654	3.84e-08
15	1f7r:A	133	91	0.2000	0.2556	0.3736	4.82e-08	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
16	6hde:B	152	117	0.2059	0.2303	0.2991	2.43e-05	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
17	3t64:A	153	155	0.2118	0.2353	0.2323	0.77	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
18	2bt1:A	254	73	0.1294	0.0866	0.3014	1.4	2bsy:A, 2we0:A, 2we1:A, 2we2:A, 2we3:A
19	2y8c:C	136	84	0.1353	0.1691	0.2738	2.2	2y8c:B
20	8xld:A	213	49	0.0941	0.0751	0.3265	2.9	8ill:B
21	7vpb:A	270	88	0.1412	0.0889	0.2727	3.2	7vpb:B
22	8rpr:A	338	35	0.0882	0.0444	0.4286	3.5	8ftr:A, 8fts:A, 8ftv:A, 8rww:A, 8rxf:A, 8rxg:A
23	3he3:A	366	60	0.1118	0.0519	0.3167	4.1	3hdq:A, 3hdq:B, 3hdq:C, 3hdq:D, 3hdq:E, 3hdq:F, 3hdq:G, 3hdq:H, 3hdq:I, 3hdq:J, 3hdy:A, 3hdy:B, 3hdy:C, 3hdy:D, 3hdy:E, 3hdy:F, 3hdy:G, 3hdy:H, 3hdy:I, 3hdy:J, 3he3:B, 3he3:C, 3he3:D, 3he3:E, 3he3:F, 3he3:G, 3he3:H, 3he3:I, 3he3:J, 3mj4:A, 3mj4:B, 3mj4:C, 3mj4:D, 3mj4:E, 3mj4:F, 3mj4:G, 3mj4:H, 3mj4:I, 3mj4:J
24	7k5b:B	4524	64	0.1176	0.0044	0.3125	5.5	8bx8:B, 7k58:B, 7kek:B
25	7k5b:B	4524	26	0.0647	0.0024	0.4231	8.3	8bx8:B, 7k58:B, 7kek:B
26	8gxv:A	353	49	0.1000	0.0482	0.3469	5.6

[Back]