BioLiP

>protein
DSMDRQLLDIIQTGFPLSPRPYAELGQRLGLDEQEVLDRVRGLKARKIIRRLGANFQSAKLGFVSTLCAAKVPQDKMDAF
VAEVNAKPGVTHNYLREHDYNIWFTLISPSREETQAILDGITQATGVPILNLPATKLFK

The query sequence (length=139) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4un1:A	145	139	1.0000	0.9586	1.0000	4.92e-102	4un1:C
2	4czc:A	305	104	0.3022	0.1377	0.4038	1.38e-21
3	4czc:A	305	128	0.2374	0.1082	0.2578	7.34e-12
4	4un1:B	159	130	0.2662	0.2327	0.2846	3.58e-11	4un1:D
5	2cyy:A	151	128	0.2158	0.1987	0.2344	8.51e-06	2e1c:A, 2zny:A, 2zny:C, 2zny:E, 2zny:B, 2zny:D, 2zny:F, 2zny:H, 2zny:G, 2znz:A, 2znz:B, 2znz:C, 2znz:D, 2znz:E, 2znz:F, 2znz:G, 2znz:H
6	7fby:A	153	91	0.1799	0.1634	0.2747	0.048
7	2cg4:A	149	120	0.1871	0.1745	0.2167	0.21	2cg4:B
8	5t8s:A	388	50	0.1367	0.0490	0.3800	0.27	5t8s:B, 5t8t:A, 5t8t:B
9	2dq3:A	425	61	0.1439	0.0471	0.3279	0.39	2dq3:B
10	5zgc:F	212	99	0.1942	0.1274	0.2727	0.52	6iso:K
11	1dk4:A	252	57	0.1151	0.0635	0.2807	0.98	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
12	2c1w:B	276	47	0.1223	0.0616	0.3617	1.1	2c1w:A, 2c1w:C
13	2vd3:A	289	25	0.0791	0.0381	0.4400	1.5	2vd3:B
14	2vbw:A	147	53	0.1151	0.1088	0.3019	1.8	2vbx:A, 2vby:A, 2vbz:A, 2vc0:A, 2vc1:A, 2w24:A
15	8bbk:A	274	45	0.1295	0.0657	0.4000	2.6	8bbk:B, 8bbk:C, 8bbk:D, 8bbk:E, 8bbk:F, 4bn4:A, 4bn5:A, 4bn5:B, 4bn5:C, 4bn5:D, 4bn5:E, 4bn5:F, 4bn5:G, 4bn5:H, 4bn5:I, 4bn5:J, 4bn5:K, 4bn5:L, 4bv3:A, 4bvb:A, 4bve:A, 4bvf:A, 4bvg:A, 4bvh:A, 4bvh:B, 4bvh:C, 5bwn:A, 5bwo:A, 4c78:A, 4c7b:A, 9cbt:A, 9cbt:B, 8ccw:A, 8ccz:A, 8ccz:B, 5d7n:A, 5d7n:B, 5d7n:C, 5d7n:D, 5d7n:E, 5d7n:F, 4fvt:A, 4fz3:A, 3glr:A, 3gls:A, 3gls:B, 3gls:C, 3gls:D, 3gls:E, 3gls:F, 3glt:A, 3glu:A, 5h4d:H, 5h4d:A, 4hd8:A, 8hlw:A, 8hly:A, 8hn9:A, 8hn9:B, 6iso:A, 6iso:B, 6iso:E, 6iso:G, 4jsr:A, 4jt8:A, 4jt9:A, 4o8z:A, 8v15:A, 8v15:C, 8v2n:A, 5y4h:A, 5ytk:A, 5ytk:D, 5ytk:E, 5ytk:F, 5ytk:B, 5ytk:C, 5z93:A, 5z94:A, 5z94:B, 5zgc:A, 5zgc:B, 5zgc:C, 5zgc:E, 5zgc:D
16	8u41:B	451	33	0.1007	0.0310	0.4242	3.9	8u41:A, 8u42:A, 8u42:B, 8ux5:A, 8ux5:B
17	7u2a:B	442	90	0.1799	0.0566	0.2778	4.9	8ffy:A, 7u2a:A, 7u2b:A
18	2wef:A	303	36	0.0647	0.0297	0.2500	5.3	1jp4:A
19	6x94:A	413	50	0.0863	0.0291	0.2400	7.3
20	5dqr:C	421	89	0.1439	0.0475	0.2247	7.4	5dqr:A, 5dqr:B, 5dqr:D, 5dqr:E, 5dqr:F
21	3d23:B	301	50	0.1007	0.0465	0.2800	9.4	3d23:A, 3d23:C, 3d23:D

[Back]