BioLiP

>protein
DSLSKSPENWMSKLDDGKHLTEINIPGSHDSGSFTLKDPVKSVWAKTQDKDYLTQMKSGVRFFDIRGRASADNMISVHHG
MVYLHHELGKFLDDAKYYLSAYPNETIVMSMKKDYDSDSKVTKTFEEIFREYYYNNPQYQNLFYTGSNANPTLKETKGKI
VLFNRMGGTYIKSGYGADTSGIQWADNATFETKINNGSLNLKVQDEYKDYYDKKVEAVKNLLAKAKTDSNKDNVYVNFLS
VASGGSAFNSTYNYASHINPEIAKTIKANGKARTGWLIVDYAGYTWPGYDDIVSEIIDSNKLEH

The query sequence (length=304) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3v1h:A	306	303	0.9934	0.9869	0.9967	0.0	4f2b:A, 4f2b:B, 4i90:A, 4i9j:A, 4i9t:A, 4rv3:A, 4s3g:A, 3v16:A
2	3ea1:A	296	293	0.3980	0.4088	0.4130	3.81e-74	3ea1:B, 3ea2:A, 3ea2:B, 3ea3:A, 3ea3:B, 1gym:A, 1ptg:A, 6s2a:A, 6s2a:B, 6s2a:C, 1t6m:A, 1t6m:B
3	1aod:A	274	286	0.2632	0.2920	0.2797	1.68e-22
4	6srg:A	455	36	0.0428	0.0286	0.3611	1.5
5	5mc1:B	485	36	0.0428	0.0268	0.3611	1.6	6h2p:A, 6h2p:B, 6h2q:A, 6h2q:B, 5m4g:A, 5m4g:B, 5m4j:A, 5m4j:B, 5m4l:A, 5m4l:B, 5m4q:A, 5m4q:B, 5mby:A, 5mby:B, 5mbz:A, 5mbz:B, 5mc0:A, 5mc0:B, 5mc1:A, 5mc2:A, 5mc2:B, 5mc3:A, 5mc3:B, 5mc4:A, 5mc4:B, 5mc5:A, 5mc5:B, 2okn:A, 2okn:B, 6qsb:A, 6qsb:B, 6qsc:A, 6qsc:B, 6sre:A, 6sre:B, 6srf:A, 6srf:B, 6srg:B
6	6ubn:B	791	62	0.0493	0.0190	0.2419	2.1	6byw:B, 6byw:A, 6byw:C, 6byw:D, 6eer:A, 6eer:B, 6eer:C, 6eer:D, 6ubn:A, 6ubn:C, 6ubn:D, 6ubr:B, 6ubr:A, 6ubr:C, 6ubr:D, 6ubz:B, 6ubz:A, 6ubz:C, 6ubz:D, 6uc1:B, 6uc1:A, 6uc1:D, 6uc1:C, 6ufq:A, 6ufq:B, 6ufq:C, 6ufq:D, 6vl7:A, 6vl7:B, 6vl7:C, 6vl7:D, 6vmf:A, 6vmf:B, 6vmf:C, 6vmf:D, 6vmv:A, 6vmv:B, 6vmv:C, 6vmv:D, 6vmw:B, 6vmw:A, 6vmw:C, 6vmw:D
7	2pyy:B	217	72	0.0691	0.0968	0.2917	3.4	2pyy:A, 2pyy:C
8	7ec3:A	500	80	0.0757	0.0460	0.2875	3.9	7ec3:C, 7ec6:A, 7ec7:A, 7ec7:B, 7vfl:A, 7vfl:C, 7vfm:A, 7vfm:C, 7vfn:A, 7vfo:A, 7vfo:B
9	3cog:D	392	100	0.0757	0.0587	0.2300	4.0	3cog:A, 3cog:B, 3cog:C, 5eig:C, 5eig:D, 5eig:E, 5eig:F, 5eig:G, 6nba:A, 6nba:B, 6nba:C, 6nba:D, 2nmp:A, 2nmp:B, 2nmp:C, 2nmp:D, 5tsu:A, 5tsu:C, 5tsu:D, 5tsu:E, 5tsu:F, 5tsu:G, 5tsu:H
10	7aju:UL	779	34	0.0428	0.0167	0.3824	5.1	5wyj:BB, 5wyk:BB, 6zqd:UL, 6zqe:UL, 6zqf:UL
11	7d5s:B2	851	34	0.0428	0.0153	0.3824	5.7	7ajt:UL, 7d4i:B2, 7d5t:B2, 7d63:B2, 6ke6:B2, 6lqp:B2, 6lqq:B2, 6lqr:B2, 6lqs:B2, 6lqt:B2, 6lqu:B2, 6lqv:B2, 7suk:LQ, 5wlc:LQ, 6zqa:UL, 6zqb:UL, 6zqc:UL
12	8fru:F	221	44	0.0493	0.0679	0.3409	6.0	8br8:LH, 8brm:LH, 8bsi:LH, 8bsj:LH, 8btd:LH, 8btr:LH, 7pwg:F, 7pwo:F2
13	3s3t:A	145	67	0.0625	0.1310	0.2836	7.0	3s3t:B, 3s3t:C, 3s3t:D, 3s3t:E, 3s3t:F, 3s3t:G, 3s3t:H
14	7nup:D	884	55	0.0461	0.0158	0.2545	9.0	5ab0:C, 5ab2:B, 4e36:A, 4e36:B, 6ea4:A, 6ea4:B, 5j6s:B, 4jbs:A, 4jbs:B, 7nsk:B, 7nup:C, 7p7p:B, 7pfs:B, 3se6:A, 3se6:B
15	2hji:A	156	30	0.0395	0.0769	0.4000	9.2
16	6ax9:A	340	78	0.0625	0.0559	0.2436	9.7	6axm:A, 6axn:A, 6axu:A, 3kb9:A, 7kj8:A, 7kj9:A, 7kjd:A, 7kje:A, 7kjf:A, 7kjg:A, 3lg5:A, 4ltz:A, 4luu:A, 4lxw:A, 4lz0:A, 4lz3:A, 4lzc:A, 6ofv:A, 8su1:A, 8su2:A, 8su3:A, 8su4:A, 8su5:A, 8v3k:A

[Back]