Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DSIQAEEWYFGKITRRESERLLLNAENPRGTFLVRESETTKGAYSLSVSDFDNAKGLNVKHYKIRKLDSGGFYITSRTQF
NSLQQLVAYYSKHADGLCHRLTTVCP

The query sequence (length=106) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1y57:A 452 106 0.9906 0.2323 0.9906 1.53e-72 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
2 7t1u:B 107 103 0.8774 0.8692 0.9029 2.49e-63 7t1u:A
3 1aot:F 106 105 0.6792 0.6792 0.6857 8.20e-49 1aou:F, 2mrk:A, 4u1p:A
4 7uy0:A 448 105 0.6509 0.1540 0.6571 7.76e-46 7uy0:B, 7uy3:A
5 1qcf:A 450 105 0.5472 0.1289 0.5524 8.79e-38 1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
6 1lck:A 164 105 0.5094 0.3293 0.5143 1.68e-36 1bhf:A, 1cwd:L, 1cwe:A, 1cwe:C, 1fbz:A, 1fbz:B, 2iim:A, 1ijr:A, 1lcj:A, 1lkk:A, 1lkl:A, 1x27:A, 1x27:B, 1x27:C, 1x27:D, 1x27:E, 1x27:F
7 3vs7:B 427 105 0.5094 0.1265 0.5143 2.24e-32 4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
8 8ssn:B 386 106 0.3774 0.1036 0.3774 1.05e-14
9 2fo0:A 466 106 0.3774 0.0858 0.3774 1.31e-14 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
10 5mo4:A 429 106 0.3774 0.0932 0.3774 1.41e-14 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
11 1a81:E 220 98 0.3585 0.1727 0.3878 1.22e-13 1a81:G, 1a81:K
12 1a81:E 220 90 0.2830 0.1364 0.3333 2.32e-08 1a81:G, 1a81:K
13 4fl2:A 555 98 0.3585 0.0685 0.3878 2.08e-13 1a81:A, 1a81:C, 1a81:I, 8bi2:A, 5c26:A, 5c27:A, 1csy:A, 1csz:A, 5cxh:A, 5cxz:A, 5cy3:A, 4dfl:A, 4dfn:A, 3emg:A, 4f4p:A, 4fl1:A, 4fl3:A, 3fqe:A, 3fqh:A, 3fqh:B, 3fqs:A, 4fyn:A, 4fyo:A, 4fz6:A, 4fz7:A, 4gfg:A, 5ghv:A, 5ghv:B, 6hm6:A, 6hm7:A, 4i0r:A, 4i0s:A, 4i0t:A, 5lma:A, 5lmb:A, 5lmb:B, 4puz:A, 4puz:B, 4pv0:A, 4px6:A, 7q5t:EEE, 7q5t:CCC, 7q5t:DDD, 7q5t:AAA, 7q5t:BBB, 7q5t:FFF, 7q5u:FFF, 7q5u:DDD, 7q5u:BBB, 7q5u:CCC, 7q5u:EEE, 7q5u:AAA, 7q5w:BBB, 7q5w:DDD, 7q5w:FFF, 7q5w:EEE, 7q5w:AAA, 7q5w:CCC, 8rrq:A, 8rrz:A, 4rss:A, 4rx7:A, 4rx8:A, 4rx9:A, 3srv:A, 3srv:B, 6ssb:A, 5t68:A, 5t68:B, 5tiu:A, 5tr6:A, 5tt7:A, 3tub:A, 3tuc:A, 3tud:A, 3vf8:A, 3vf9:A, 6vov:A, 6vov:B, 4wnm:A, 8x5k:A, 1xbb:A, 1xbc:A, 4xg3:A, 4xg3:B, 4xg4:A, 4xg6:A, 4xg7:A, 4xg8:A, 4xg8:C, 4xg9:A, 4xg9:B, 5y5t:A, 5y5u:A, 5y5u:B, 4yjo:A, 4yjp:A, 4yjq:A, 4yjr:A, 4yjs:A, 4yjt:A, 4yju:A, 4yjv:A, 6zc0:A, 6zcp:A, 6zcq:A, 6zcr:A, 6zcs:A, 6zcu:A, 6zcx:A, 6zcy:A
14 4fl2:A 555 91 0.2830 0.0541 0.3297 4.77e-08 1a81:A, 1a81:C, 1a81:I, 8bi2:A, 5c26:A, 5c27:A, 1csy:A, 1csz:A, 5cxh:A, 5cxz:A, 5cy3:A, 4dfl:A, 4dfn:A, 3emg:A, 4f4p:A, 4fl1:A, 4fl3:A, 3fqe:A, 3fqh:A, 3fqh:B, 3fqs:A, 4fyn:A, 4fyo:A, 4fz6:A, 4fz7:A, 4gfg:A, 5ghv:A, 5ghv:B, 6hm6:A, 6hm7:A, 4i0r:A, 4i0s:A, 4i0t:A, 5lma:A, 5lmb:A, 5lmb:B, 4puz:A, 4puz:B, 4pv0:A, 4px6:A, 7q5t:EEE, 7q5t:CCC, 7q5t:DDD, 7q5t:AAA, 7q5t:BBB, 7q5t:FFF, 7q5u:FFF, 7q5u:DDD, 7q5u:BBB, 7q5u:CCC, 7q5u:EEE, 7q5u:AAA, 7q5w:BBB, 7q5w:DDD, 7q5w:FFF, 7q5w:EEE, 7q5w:AAA, 7q5w:CCC, 8rrq:A, 8rrz:A, 4rss:A, 4rx7:A, 4rx8:A, 4rx9:A, 3srv:A, 3srv:B, 6ssb:A, 5t68:A, 5t68:B, 5tiu:A, 5tr6:A, 5tt7:A, 3tub:A, 3tuc:A, 3tud:A, 3vf8:A, 3vf9:A, 6vov:A, 6vov:B, 4wnm:A, 8x5k:A, 1xbb:A, 1xbc:A, 4xg3:A, 4xg3:B, 4xg4:A, 4xg6:A, 4xg7:A, 4xg8:A, 4xg8:C, 4xg9:A, 4xg9:B, 5y5t:A, 5y5u:A, 5y5u:B, 4yjo:A, 4yjp:A, 4yjq:A, 4yjr:A, 4yjs:A, 4yjt:A, 4yju:A, 4yjv:A, 6zc0:A, 6zcp:A, 6zcq:A, 6zcr:A, 6zcs:A, 6zcu:A, 6zcx:A, 6zcy:A
15 4k2r:A 551 99 0.3491 0.0672 0.3737 3.69e-13 2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
16 4k2r:A 551 98 0.2547 0.0490 0.2755 8.02e-05 2oq1:A, 2ozo:A, 1u59:A, 4xz0:A, 4xz1:A
17 8dgo:B 218 102 0.3585 0.1743 0.3725 5.69e-13 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
18 4xey:B 359 104 0.3585 0.1058 0.3654 2.06e-11 7n9g:C, 4wa9:A
19 2cia:A 98 86 0.2830 0.3061 0.3488 4.24e-11
20 2ci9:A 102 85 0.2736 0.2843 0.3412 6.14e-11 2ci9:B
21 1tce:A 107 91 0.3208 0.3178 0.3736 1.39e-10
22 2etz:A 108 106 0.3208 0.3148 0.3208 2.52e-10 2eu0:A
23 1i3z:A 103 100 0.3679 0.3786 0.3900 5.28e-10
24 8gmb:A 438 101 0.2925 0.0708 0.3069 6.64e-09 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
25 6crg:B 462 94 0.3208 0.0736 0.3617 2.13e-08 6bn5:A
26 6crg:B 462 99 0.3113 0.0714 0.3333 1.64e-06 6bn5:A
27 7z3j:A 1119 100 0.3396 0.0322 0.3600 2.75e-08 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
28 7z3j:A 1119 92 0.2736 0.0259 0.3152 4.52e-07 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
29 7t8t:A 1086 111 0.3585 0.0350 0.3423 6.39e-08
30 7t8t:A 1086 92 0.2736 0.0267 0.3152 4.30e-07
31 6pbc:A 1070 111 0.3585 0.0355 0.3423 6.45e-08
32 6pbc:A 1070 92 0.2736 0.0271 0.3152 4.92e-07
33 7r7l:A 490 94 0.3208 0.0694 0.3617 6.75e-08 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
34 7r7l:A 490 95 0.3019 0.0653 0.3368 1.18e-05 6bmr:B, 6bmu:A, 6bmu:B, 6bmv:A, 6bmv:B, 6bmw:A, 6bmw:B, 6bmx:A, 6bmx:B, 6bmy:A, 6bmy:B, 8cbh:A, 8cbh:B, 6crg:A, 5ehp:B, 5ehr:A, 5ehr:B, 8gww:A, 8gww:B, 7jvm:A, 7jvm:B, 7jvn:A, 7jvn:B, 6md9:A, 6md9:B, 6mda:A, 6mda:B, 6mdb:A, 6mdb:B, 6mdc:A, 6mdc:B, 6mdd:A, 6mdd:B, 7r7i:B, 7r7l:B, 8s0s:B, 8t7q:B, 7vxg:A, 7vxg:B, 7vxg:C, 7vxg:D, 8wx7:A, 7xhq:A, 7xhq:B
35 8dgq:A 272 85 0.3019 0.1176 0.3765 8.13e-08 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
36 8dgq:A 272 92 0.2547 0.0993 0.2935 1.06e-05 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
37 5xzr:A 519 99 0.3302 0.0674 0.3535 8.75e-08 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
38 5xzr:A 519 87 0.2830 0.0578 0.3448 3.05e-05 1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
39 1fu5:A 111 91 0.3302 0.3153 0.3846 9.95e-08 1oo4:A
40 2l4k:A 120 87 0.2830 0.2500 0.3448 1.21e-07 5d0j:A, 5d0j:D, 5eel:C, 5eel:F, 5eel:A, 5eel:B, 5eel:E, 5eel:D, 5eeq:A, 5eeq:B, 7mp3:A, 7mp3:C, 1mw4:A, 3pqz:A, 3pqz:B, 3pqz:D, 3pqz:C, 5tyi:A, 5tyi:B, 5tyi:C, 5tyi:D, 5u06:A, 5u06:B, 5u06:C, 5u06:D, 5u1q:A, 5u1q:B, 5u1q:C, 5u1q:D, 4x6s:A, 4x6s:B
41 4jmh:A 200 70 0.2453 0.1300 0.3714 1.76e-07 4jmg:A
42 8t7c:A 1001 92 0.2925 0.0310 0.3370 2.37e-07
43 2lnw:A 113 90 0.2642 0.2478 0.3111 9.36e-07 7rnv:A, 4roj:A, 4roj:B, 4roj:C, 7wfy:C
44 7rnu:C 110 90 0.2830 0.2727 0.3333 1.35e-06 7rnu:A, 7rnu:E, 7rnu:G
45 1ju5:A 109 57 0.2358 0.2294 0.4386 1.93e-06
46 6kc4:A 101 85 0.2736 0.2871 0.3412 3.46e-06 6kc4:C, 6kc4:E, 6kc4:G, 6kc4:I, 6kc4:K
47 2rmx:A 118 89 0.3019 0.2712 0.3596 5.91e-06 2yu7:A
48 3ps5:A 529 92 0.3113 0.0624 0.3587 6.45e-06 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
49 3ps5:A 529 99 0.2925 0.0586 0.3131 8.98e-05 1fpr:A, 4gry:A, 4grz:A, 4gs0:B, 4hjq:A, 4hjq:B
50 6i5j:D 169 84 0.2453 0.1538 0.3095 2.41e-05 6i4x:A, 6i5j:A, 6i5n:A, 7m6t:A, 7zlm:A, 7zlm:D, 7zlm:G, 7zlm:J, 7zln:A, 7zlo:A, 7zlp:A, 7zlr:A, 7zls:A, 7zls:G, 7zls:J
51 7r8w:A 113 53 0.1792 0.1681 0.3585 1.06e-04 8cz9:A, 7r8x:A
52 1ka6:A 107 46 0.1887 0.1869 0.4348 2.64e-04 1d4t:A, 1d4w:A, 1d4w:B, 1ka7:A, 1m27:A
53 2vif:A 131 53 0.2170 0.1756 0.4340 2.98e-04
54 6i5n:D 151 84 0.2358 0.1656 0.2976 3.52e-04 7zls:D
55 2hdx:A 108 91 0.2358 0.2315 0.2747 0.001 2hdx:B, 2hdx:C, 2hdx:D, 2hdx:E, 2hdx:F
56 4gl9:F 126 58 0.1981 0.1667 0.3621 0.002 4gl9:G, 4gl9:E, 4gl9:H, 2hmh:A
57 2bbu:A 156 58 0.1981 0.1346 0.3621 0.004
58 4ykn:A 1205 57 0.2075 0.0183 0.3860 0.007 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
59 3cxl:A 402 40 0.1415 0.0373 0.3750 0.011
60 1wwr:C 160 45 0.1415 0.0938 0.3333 0.22 1wwr:A, 1wwr:B, 1wwr:D
61 1xa6:A 399 79 0.2170 0.0576 0.2911 0.33
62 6c5x:A 151 63 0.1604 0.1126 0.2698 0.37
63 4y5w:C 465 62 0.1887 0.0430 0.3226 0.59
64 1bg1:A 559 35 0.1415 0.0268 0.4286 0.62 4e68:A, 6njs:A, 6nuq:A, 6qhd:A
65 6qhd:B 532 35 0.1415 0.0282 0.4286 0.63
66 7tvb:A 558 65 0.1792 0.0341 0.2923 1.2 7tva:A, 7tva:B, 7ubt:A, 7uc6:A, 7uc7:A
67 2nx8:A 168 33 0.1226 0.0774 0.3939 1.8
68 1o8b:B 212 47 0.1132 0.0566 0.2553 4.1 1o8b:A
69 5d39:A 489 66 0.1792 0.0389 0.2879 5.0 5d39:C, 5d39:B, 5d39:D, 4y5w:B, 4y5w:D, 4y5w:A
70 6ip5:2z 150 49 0.1509 0.1067 0.3265 5.6 7a01:G5, 7a09:k, 5a2q:S, 5aj0:BS, 9bdl:AS18, 9bdn:AS18, 9bdp:AS18, 8bhf:T3, 9bkd:f, 9bln:f, 8btk:Ar, 7cpu:SS, 7cpv:SS, 4d5l:S, 4d61:S, 6d90:TT, 6d9j:TT, 9f1b:Ar, 9f1c:Ar, 9f1d:Ar, 6fec:L, 5flx:S, 6g18:S, 6g4s:S, 6g4w:S, 6g51:S, 6g53:S, 6g5h:S, 6g5i:S, 8g5y:SS, 8g5z:SS, 8g60:SS, 8g61:SS, 8g6j:SS, 8glp:SS, 6gz3:BS, 6gz4:BS, 6gz5:BS, 6hcf:T1, 6hcj:T2, 6hcm:T1, 6hcq:T2, 8ifd:2z, 8ife:2z, 6ip6:2z, 6ip8:2z, 3j7p:SS, 3j7r:SS, 3jag:SS, 3jah:SS, 3jai:SS, 3jaj:SS, 3jan:SS, 8jdj:AE, 8jdk:AE, 8jdl:AE, 8jdm:AE, 7jqb:T, 7jqc:T, 5k0y:L, 8k2c:SS, 7k5i:S, 4kzx:S, 4kzy:S, 4kzz:S, 5lks:SS, 7ls1:A3, 7ls2:A3, 5lzs:SS, 5lzt:SS, 5lzu:SS, 5lzv:SS, 5lzw:SS, 5lzx:SS, 5lzy:SS, 5lzz:SS, 7mdz:SS, 6mtb:SS, 6mtc:SS, 6mtd:SS, 6mte:SS, 7nwg:T2, 7nwh:SS, 7nwi:SS, 7o7y:Ar, 7o7z:Ar, 7o80:Ar, 7o81:Ar, 5oa3:S, 6ole:SS, 6olf:SS, 6olg:BS, 6oli:SS, 6olz:BS, 6om0:SS, 6om7:SS, 7oya:S2, 7oyb:S2, 7oyc:S2, 7oyd:SS, 8oz0:n, 8p03:U, 8p09:U, 8p2k:Ar, 6p4g:T, 6p4h:T, 6p5i:T, 6p5j:T, 6p5k:T, 6p5n:T, 8pj1:f, 8pj2:f, 8pj3:f, 8pj4:f, 8pj5:f, 8pj6:f, 8ppk:S, 8ppl:AS, 8q7z:Ar, 8q87:Ar, 7qgg:SS, 8qoi:SS, 7qp6:f, 7qp7:f, 7qvp:SS, 7qvp:RS, 6qzp:SS, 7r4x:S, 6r5q:II, 6r6g:II, 6r6p:II, 6r7q:II, 8scb:SS, 6sgc:T1, 7syg:T, 7syh:T, 7syi:T, 7syj:T, 7syk:T, 7syl:T, 7sym:T, 7syn:T, 7syo:T, 7syp:T, 7syq:T, 7syr:T, 7sys:T, 7syt:T, 7syu:T, 7syv:T, 7syw:T, 7syx:T, 5t2c:A0, 8t4s:S, 7toq:AS18, 7tor:AS18, 7tql:T, 7ucj:SS, 7uck:SS, 4ug0:SS, 4ujc:CS, 4ujd:CS, 4uje:BS, 4v5z:Am, 4v6x:AS, 5vyc:S1, 5vyc:S6, 5vyc:S2, 5vyc:S5, 5vyc:S3, 5vyc:S4, 6w2s:T, 6w2t:T, 7wtt:S, 7wtu:S, 7wtv:S, 7wtw:S, 7wtx:S, 7wtz:S, 7wu0:S, 6xa1:SS, 7xnx:SS, 7xny:SS, 8xsx:SS, 8xsy:SS, 8xsz:SS, 8xxl:SS, 8xxm:SS, 8xxn:SS, 6y0g:SS, 8y0w:SS, 8y0x:SS, 6y2l:SS, 6y57:SS, 6yal:U, 6yam:U, 6yan:U, 6ybs:f, 8yoo:SS, 8yop:SS, 6z6l:SS, 6z6m:SS, 6z6n:SS, 7zjw:Sd, 7zjx:Sd, 6zlw:T, 6zm7:SS, 6zme:SS, 6zmi:SS, 6zmo:SS, 6zmt:T, 6zmw:f, 6zn5:T, 6zoj:S, 6zol:S, 6zon:k, 6zp4:k, 6zuo:S, 6zv6:S, 6zvh:S, 6zvj:k, 6zvk:G5, 6zxd:S, 6zxe:S, 6zxf:S, 6zxg:S, 6zxh:S
71 7aor:ag 548 78 0.2075 0.0401 0.2821 5.9
72 4qko:D 133 44 0.1321 0.1053 0.3182 7.3 4qko:B, 4qko:F, 4qko:H
73 4jal:A 156 48 0.1509 0.1026 0.3333 8.1 4jal:B
74 1v0w:A 496 30 0.1038 0.0222 0.3667 8.9 1v0r:A, 1v0t:A, 1v0u:A, 1v0v:A, 1v0y:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218