Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DSFINIFVSIDKDGTNVISYPELEQYVAENNLDPSMVEKWKQLFDPDNTGSITLETFCSKLGLKPAEIIDFREQKGLHAA

The query sequence (length=80) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5x2e:A 80 80 1.0000 1.0000 1.0000 3.94e-56
2 1y1x:A 182 53 0.2125 0.0934 0.3208 0.001 1y1x:B
3 1s6i:A 182 61 0.2000 0.0879 0.2623 0.015
4 1hqv:A 178 58 0.2125 0.0955 0.2931 0.038 3aaj:A, 3aaj:B, 3aak:A, 5gqq:C, 5gqq:D, 5jjg:A, 3wxa:A, 3wxa:B, 2zn8:A, 2zn9:A, 2zn9:B, 2zne:A, 2zne:B, 2zrs:A, 2zrs:B, 2zrs:C, 2zrs:D, 2zrs:E, 2zrs:F, 2zrs:G, 2zrs:H, 2zrt:A, 2zrt:B, 2zrt:C, 2zrt:D, 2zrt:E, 2zrt:F, 2zrt:G, 2zrt:H
5 2pmy:A 73 53 0.1625 0.1781 0.2453 0.042 2pmy:B
6 3qrx:A 145 48 0.2500 0.1379 0.4167 0.043 1oqp:A
7 3kf9:A 149 64 0.2750 0.1477 0.3438 0.095 3kf9:C
8 1iq3:A 110 62 0.2250 0.1636 0.2903 0.12
9 1ggz:A 144 66 0.2125 0.1181 0.2576 0.36
10 8pw0:A 137 41 0.1250 0.0730 0.2439 0.61
11 1osa:A 148 62 0.2250 0.1216 0.2903 0.64 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
12 1osa:A 148 67 0.2375 0.1284 0.2836 2.1 1clm:A, 5e1k:A, 5e1n:A, 5e1p:A, 1exr:A, 2kxw:A, 2m5e:A
13 6yxx:EM 308 45 0.2000 0.0519 0.3556 0.71
14 1rfj:A 148 61 0.2375 0.1284 0.3115 0.89 5a2h:A, 4aqr:A, 4aqr:B, 2ro9:A
15 1jf0:A 192 52 0.2125 0.0885 0.3269 1.0
16 8aht:A 140 58 0.2375 0.1357 0.3276 1.0 8aht:B
17 2aao:A 147 61 0.2250 0.1224 0.2951 1.2 2aao:B
18 1nfg:A 457 46 0.1625 0.0284 0.2826 1.2 1nfg:B, 1nfg:C, 1nfg:D
19 1fi6:A 92 61 0.1875 0.1630 0.2459 1.4
20 2f2p:A 169 61 0.2250 0.1065 0.2951 1.5 2f2o:B, 2f2p:B
21 5cy4:C 184 27 0.1500 0.0652 0.4444 1.5 5cy4:A, 5cy4:B, 5cy4:D, 5cy4:E, 5cy4:F
22 4qox:A 462 60 0.2375 0.0411 0.3167 1.6
23 4qox:A 462 54 0.2250 0.0390 0.3333 8.5
24 2n6a:A 162 61 0.2250 0.1111 0.2951 1.8
25 2n6a:A 162 64 0.2125 0.1049 0.2656 9.8
26 2lmt:A 148 67 0.2125 0.1149 0.2537 2.2 2lmu:A, 2lmv:A
27 6hr1:A 406 61 0.2250 0.0443 0.2951 2.6 6hr1:B
28 3o78:A 402 61 0.2250 0.0448 0.2951 2.6 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
29 4jwq:C 73 32 0.1500 0.1644 0.3750 2.7 4jwq:A
30 6xyr:A 348 47 0.1750 0.0402 0.2979 2.7
31 6u2m:A 464 47 0.1750 0.0302 0.2979 2.8 8aht:C, 1ak8:A, 3b32:A, 7cqv:E, 5dsu:A, 2i08:A, 1j7o:A, 6jiu:C, 6jiu:F, 6jiu:I, 6jiu:L, 2kug:A, 6pjx:B, 2pq3:A, 4q57:A, 6u2m:C, 3uct:B, 3ucw:C, 3ucy:A
32 2doq:B 149 57 0.1875 0.1007 0.2632 3.3 2doq:A, 2doq:C, 4mbe:D, 4mbe:A
33 3khe:B 191 60 0.2000 0.0838 0.2667 3.6 3khe:A
34 8b6q:A 466 47 0.1750 0.0300 0.2979 3.8 1a29:A, 1ahr:A, 8ahs:A, 8aht:D, 6ale:R, 4anj:B, 6b8m:B, 6b8m:D, 6b8m:F, 6b8m:H, 6b8n:B, 6b8n:D, 6b8n:F, 6b8n:H, 6b8p:B, 6b8p:D, 6b8p:F, 6b8p:H, 6b8q:B, 6b8q:D, 6b8q:H, 6b8q:F, 2bbm:A, 2bbn:A, 2bcx:A, 8bd2:A, 2be6:A, 2be6:B, 2be6:C, 7bf1:AAA, 7bf2:AAA, 2bkh:B, 2bki:B, 4bw8:A, 4bw8:B, 3bxk:A, 3bxk:C, 3bxl:A, 3bya:A, 4bya:A, 4byf:D, 1cdl:A, 1cdl:B, 1cdl:C, 1cdl:D, 1cdm:A, 1cff:A, 1ckk:A, 1cll:A, 3cln:A, 4cln:A, 1cm1:A, 1cm4:A, 6cnn:E, 6cnn:F, 6cnn:G, 6cnn:H, 6cno:E, 6cno:F, 6cno:G, 6cno:H, 2col:B, 7cqh:B, 7cqp:B, 7cqv:A, 1ctr:A, 6ctb:A, 6czq:R, 6dad:A, 6dad:B, 6dae:B, 6dae:A, 6daf:A, 6daf:B, 6dah:A, 6dah:B, 6dah:C, 6dah:D, 4dbp:C, 4dbq:B, 5dbr:A, 4dck:B, 8dgh:A, 8dgk:A, 4djc:A, 5dow:A, 5dow:C, 5dow:E, 5dow:G, 3dve:A, 3dvj:A, 3dvk:A, 3dvm:A, 6e2f:E, 6e2g:E, 6eeb:A, 4ehq:A, 3ewt:A, 3ewv:A, 2f2o:A, 2f3y:A, 2f3z:A, 6feg:B, 6feh:B, 8fny:B, 8fny:D, 2fot:A, 8fo6:B, 1fw4:A, 4g27:R, 4g28:R, 1g4y:R, 3g43:A, 3g43:B, 3g43:C, 3g43:D, 6gdk:A, 5ggm:A, 8gm4:B, 8gm5:B, 3gn4:B, 3gn4:D, 3gn4:F, 3gn4:H, 3gof:A, 3gof:B, 4gow:D, 3gp2:A, 6hcs:A, 6hcs:C, 6hcs:E, 6hcs:G, 4hex:A, 4hex:B, 2hf5:A, 5hit:A, 2hqw:A, 3hr4:B, 3hr4:D, 3hr4:F, 3hr4:H, 3if7:A, 3ifk:A, 3ifk:B, 1iq5:A, 1iwq:A, 5j03:B, 3j41:E, 3j41:F, 1j7p:A, 5j7j:A, 5j8h:A, 4j9y:R, 4j9z:R, 6jiy:C, 6jiy:F, 6jiy:I, 6jiy:L, 4jpz:C, 4jpz:I, 4jq0:C, 5jqa:A, 5jth:A, 6jv2:B, 6jv2:D, 6jv2:F, 6jv2:H, 2jzi:A, 2k0e:A, 2k0f:A, 2k0j:A, 6k4k:C, 6k4l:C, 6k4l:D, 6k4r:C, 6k4r:D, 2k61:A, 5k8q:A, 1k90:D, 1k90:E, 1k90:F, 1k93:D, 1k93:E, 1k93:F, 8k9z:B, 8k9z:D, 8ka0:B, 8ka0:D, 8ka0:F, 8ka0:H, 8ka1:F, 2kdu:A, 7kl5:A, 2kne:A, 2kuh:A, 1l7z:A, 2l7l:A, 7l8v:A, 3l9i:C, 2lgf:A, 1lin:A, 2ll6:A, 2ll7:A, 2llo:A, 2llq:A, 2lqc:A, 2lqp:A, 1lvc:D, 1lvc:E, 1lvc:F, 2lv6:A, 2m0j:A, 2m0k:A, 4m1l:A, 2m3s:A, 2m55:A, 6m7h:A, 6mba:B, 6mc9:B, 2mes:A, 2mg5:A, 2mgu:A, 7mir:B, 7mis:B, 1mux:A, 6mud:A, 6mue:A, 1mxe:A, 1mxe:B, 2n27:A, 6n5w:C, 2n8j:A, 1niw:A, 1niw:C, 1niw:E, 1niw:G, 5nin:A, 5nin:B, 7nqc:A, 1nwd:A, 6o20:F, 2o5g:A, 6o5g:A, 2o60:A, 5oeo:A, 1ooj:A, 6os4:A, 4ovn:A, 4ovn:B, 4ovn:C, 4ovn:D, 4ovn:E, 3oxq:A, 3oxq:B, 3oxq:C, 3oxq:D, 6paw:D, 6paw:G, 6paw:H, 6paw:C, 4pjj:B, 1pk0:D, 1pk0:E, 1pk0:F, 6plm:C, 6plm:D, 7ppo:B, 7pqe:B, 1prw:A, 7psz:A, 7pu9:A, 4q5u:A, 1qiv:A, 1qiw:A, 1qiw:B, 4qnh:R, 1qs7:A, 1qs7:C, 1qtx:A, 2r28:A, 2r28:B, 4rjd:A, 4rjd:B, 2ro8:A, 1s26:D, 1s26:E, 1s26:F, 7shq:B, 8sik:B, 8sik:F, 8sik:H, 8sim:B, 8sim:D, 8sim:F, 8sim:H, 3sjq:A, 3sjq:B, 1sk6:D, 1sk6:E, 1sk6:F, 3sui:A, 1sw8:A, 1sy9:A, 5sy1:C, 5sy1:D, 6sz5:A, 5t0x:A, 7t2q:A, 7tci:B, 7tci:F, 7tci:D, 7tci:H, 7tcp:B, 7tcp:F, 7tcp:H, 7tcp:D, 5tp6:A, 7tzc:K, 7tzc:D, 7tzc:E, 7tzc:C, 6u39:A, 6u39:C, 6u39:E, 6u39:G, 6u39:I, 6u39:K, 6u39:M, 6u39:O, 6u39:Q, 6u39:S, 6u3a:A, 6u3a:B, 6u3b:A, 6u3d:A, 6u3d:B, 3uct:A, 3ucw:A, 3ucw:B, 3ucw:D, 4umo:C, 4umo:D, 1up5:A, 1up5:B, 4upu:A, 8uxl:I, 8uxl:J, 8uxl:L, 8uxl:K, 8uxm:I, 8uxm:J, 8uxm:L, 8uxm:K, 6uzz:B, 6uzz:D, 6uzz:F, 6uzz:H, 2v01:A, 2v02:A, 4v0c:C, 4v0c:D, 5v02:R, 5v03:R, 6v00:B, 6v00:E, 6v00:H, 6v00:K, 6v01:B, 6v01:E, 6v01:H, 6v01:K, 2vas:B, 2vay:A, 2vb6:B, 5vms:B, 1vrk:A, 7vuo:C, 7vvd:C, 7vvd:E, 7vvh:C, 8w41:B, 2w73:A, 2w73:B, 2w73:E, 2w73:F, 5wbx:R, 5wc5:R, 2wel:D, 1wrz:A, 5wsv:A, 5wsv:C, 1x02:A, 2x0g:B, 2x51:B, 1xa5:A, 1xfu:O, 1xfu:P, 1xfu:Q, 1xfu:R, 1xfu:S, 1xfu:T, 1xfv:O, 1xfv:P, 1xfv:Q, 1xfv:R, 1xfv:S, 1xfv:T, 1xfw:O, 1xfw:P, 1xfw:Q, 1xfw:R, 1xfw:S, 1xfw:T, 1xfx:O, 1xfx:P, 1xfx:Q, 1xfx:R, 1xfx:S, 1xfx:T, 1xfy:O, 1xfy:P, 1xfy:Q, 1xfy:R, 1xfy:S, 1xfy:T, 1xfz:O, 1xfz:P, 1xfz:Q, 1xfz:R, 1xfz:S, 1xfz:T, 6xxf:AAA, 6xxx:AAA, 6xy3:AAA, 1y0v:H, 1y0v:I, 1y0v:J, 1y0v:K, 1y0v:L, 1y0v:M, 2y4v:A, 6y4o:A, 6y4p:A, 1y6w:A, 6y94:A, 2ygg:B, 6yns:A, 6yns:C, 6yns:B, 6yns:K, 6yns:D, 6yns:E, 6yns:F, 6yns:G, 6yns:H, 6yns:I, 6yns:J, 6yns:L, 6ynu:A, 6ynu:C, 1yr5:A, 1yrt:B, 1yru:B, 6zbi:A, 4zlk:B, 1zot:B, 7zrp:A, 7zrp:C, 7zrq:A, 1zuz:A
35 4q04:A 212 55 0.1750 0.0660 0.2545 3.9 3sia:A, 3sib:A, 3sjs:A
36 2l1w:A 149 64 0.2250 0.1208 0.2812 4.1 2ksz:A, 2roa:A, 2rob:A
37 6f70:A 242 23 0.1000 0.0331 0.3478 4.2 6f71:A, 6f71:B, 6f71:C, 6f71:D
38 6xu4:A 389 60 0.2250 0.0463 0.3000 4.8 6xu4:B, 6xu4:E
39 6k4k:D 95 62 0.2125 0.1789 0.2742 5.0
40 6yet:A 104 78 0.2250 0.1731 0.2308 5.2
41 3kpx:A 189 52 0.2125 0.0899 0.3269 5.4
42 3u0k:A 397 68 0.2375 0.0479 0.2794 6.0
43 8u87:A 621 26 0.1375 0.0177 0.4231 6.2 8u7y:A, 8u7y:B, 8u85:A, 8u85:C, 8u86:A, 8u86:C, 8u87:C
44 4ysm:A 475 58 0.2125 0.0358 0.2931 7.0 3ma6:A, 3ma6:B, 4ysj:A, 4ysj:B, 4ysm:B, 4yuq:A, 4yuq:B, 4yzb:A, 4yzb:B
45 7u0t:A 190 60 0.2750 0.1158 0.3667 7.0
46 6o1e:A 431 71 0.2750 0.0510 0.3099 7.6 5ix1:B, 5ix2:A, 5ix2:B, 4qq4:A, 4qq4:B, 5svi:A, 5svi:B, 5svx:A, 5svy:A
47 4ieb:A 472 61 0.1750 0.0297 0.2295 7.7 6bfa:A, 3hx4:A, 3i7b:A, 3i7c:A, 4ifg:A, 4ihp:A, 4jbv:A, 5jms:A, 5jn2:A, 3ku2:A, 4m84:A, 4mx9:A, 4mxa:A, 3n51:A, 3nyv:A, 4ona:A, 3sx9:A, 3sxf:A, 3t3u:A, 3t3v:A, 4tzr:A, 3upx:A, 3upz:A, 3v51:A, 3v5p:A, 3v5t:A, 5w80:A, 5w8r:A, 5w91:A, 5w9e:A, 5w9r:A, 4wg3:A, 4wg4:A, 4wg5:A, 4yga:A, 4yga:C, 4yga:E, 4yga:G, 4yjn:A
48 6k67:B 83 64 0.2125 0.2048 0.2656 8.2 6k67:D
49 8c6o:A 195 52 0.1875 0.0769 0.2885 8.8 8a9s:A, 8a9s:B, 8c6o:B, 1el4:A, 2f8p:A, 1jf2:A, 4mrx:A, 4mry:A, 4n1f:A, 4n1g:A, 4n1g:B, 7o3u:A, 1qv0:A, 1qv1:A, 1s36:A, 1sl7:A, 1sl9:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218