Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DRPYSCDHPGCDKAFVRNHDLIRHKKSHQEKA

The query sequence (length=32) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1zfd:A 32 32 1.0000 1.0000 1.0000 9.03e-19
2 6pv0:A 31 27 0.4375 0.4516 0.5185 4.12e-06 6pv1:A, 6pv2:A, 6pv3:A, 1sp2:A, 6uco:A, 6ucp:A, 1va2:A
3 2ent:A 48 29 0.3750 0.2500 0.4138 5.51e-05
4 2emv:A 44 32 0.4062 0.2955 0.4062 9.32e-05
5 2epa:A 72 28 0.3438 0.1528 0.3929 2.61e-04
6 2epa:A 72 27 0.3125 0.1389 0.3704 0.074
7 6b0o:A 119 29 0.4062 0.1092 0.4483 2.79e-04 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
8 6b0o:A 119 28 0.3438 0.0924 0.3929 0.028 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
9 6b0o:A 119 27 0.3125 0.0840 0.3704 0.15 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
10 2rpc:A 155 28 0.3750 0.0774 0.4286 7.15e-04 2ej4:A
11 2rpc:A 155 28 0.2812 0.0581 0.3214 0.53 2ej4:A
12 2ebt:A 100 28 0.3750 0.1200 0.4286 0.003
13 2ebt:A 100 27 0.3125 0.1000 0.3704 0.19
14 2eme:A 46 28 0.3750 0.2609 0.4286 0.004
15 1ncs:A 47 30 0.3438 0.2340 0.3667 0.004
16 6zr5:D 38 29 0.3438 0.2895 0.3793 0.007 6zr5:C
17 1x3c:A 73 26 0.3750 0.1644 0.4615 0.008
18 1p47:A 87 28 0.3750 0.1379 0.4286 0.009 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
19 2em1:A 44 28 0.4062 0.2955 0.4643 0.010
20 1f2i:G 66 27 0.3750 0.1818 0.4444 0.010 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
21 1mey:F 84 29 0.4062 0.1548 0.4483 0.010 1mey:C
22 1mey:F 84 28 0.3438 0.1310 0.3929 0.043 1mey:C
23 1mey:F 84 28 0.3125 0.1190 0.3571 0.16 1mey:C
24 1tf6:D 182 28 0.3438 0.0604 0.3929 0.012 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
25 1tf6:D 182 26 0.4375 0.0769 0.5385 0.021 2hgh:A, 2j7j:A, 1tf3:A, 1tf6:A, 1un6:C, 1un6:B, 1un6:D
26 2gli:A 155 25 0.3438 0.0710 0.4400 0.013 7t91:A, 7t91:B
27 2gli:A 155 28 0.3125 0.0645 0.3571 0.60 7t91:A, 7t91:B
28 2gli:A 155 27 0.3125 0.0645 0.3704 0.70 7t91:A, 7t91:B
29 2epx:A 47 27 0.3750 0.2553 0.4444 0.018
30 8ffz:A 314 26 0.4062 0.0414 0.5000 0.019
31 2emy:A 46 28 0.3750 0.2609 0.4286 0.021 2el5:A
32 5ke9:A 88 28 0.3750 0.1364 0.4286 0.021 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
33 5ke9:A 88 25 0.2500 0.0909 0.3200 2.4 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
34 5ke9:A 88 27 0.3750 0.1364 0.4444 3.9 5ke6:A, 5ke7:A, 5ke8:A, 5kea:A, 5keb:A, 4m9e:A, 6vtx:A, 2wbs:A, 2wbu:A
35 2epv:A 44 28 0.3438 0.2500 0.3929 0.022
36 2enf:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 0.024 2yti:A, 2ytn:A, 2yu8:A
37 2yte:A 42 32 0.3750 0.2857 0.3750 0.030
38 1ubd:C 114 28 0.3750 0.1053 0.4286 0.035
39 1ubd:C 114 28 0.2812 0.0789 0.3214 2.5
40 2emh:A 46 28 0.4062 0.2826 0.4643 0.039
41 2ytj:A 46 31 0.3750 0.2609 0.3871 0.043
42 5wjq:D 281 28 0.4062 0.0463 0.4643 0.043 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
43 5wjq:D 281 28 0.3438 0.0391 0.3929 0.25 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
44 5wjq:D 281 28 0.3750 0.0427 0.4286 0.33 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
45 5wjq:D 281 28 0.3750 0.0427 0.4286 0.47 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
46 5wjq:D 281 28 0.3438 0.0391 0.3929 0.58 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
47 5wjq:D 281 18 0.2812 0.0320 0.5000 4.6 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
48 5wjq:D 281 28 0.2812 0.0320 0.3214 9.3 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
49 2eqw:A 42 32 0.3438 0.2619 0.3438 0.052
50 2i13:B 144 28 0.3750 0.0833 0.4286 0.066
51 2i13:B 144 27 0.3438 0.0764 0.4074 0.43
52 2i13:B 144 28 0.3438 0.0764 0.3929 0.60
53 2i13:B 144 28 0.3125 0.0694 0.3571 2.1
54 2i13:B 144 28 0.3125 0.0694 0.3571 7.8
55 6h0f:C 32 28 0.3125 0.3125 0.3571 0.071 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
56 1x6e:A 72 28 0.3750 0.1667 0.4286 0.073
57 1x6e:A 72 28 0.3438 0.1528 0.3929 0.088
58 7w1m:H 322 25 0.3750 0.0373 0.4800 0.075 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
59 2eq2:A 46 27 0.3438 0.2391 0.4074 0.098 2ytr:A
60 2emk:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 0.12
61 2eoz:A 46 32 0.3750 0.2609 0.3750 0.13
62 2i13:A 151 27 0.3750 0.0795 0.4444 0.14
63 2i13:A 151 28 0.3438 0.0728 0.3929 0.63
64 2i13:A 151 28 0.3125 0.0662 0.3571 2.2
65 2i13:A 151 28 0.3438 0.0728 0.3929 2.4
66 2i13:A 151 28 0.3125 0.0662 0.3571 8.2
67 2eox:A 44 29 0.4062 0.2955 0.4483 0.14
68 2em4:A 46 28 0.4062 0.2826 0.4643 0.15
69 2em3:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 0.17
70 2eoo:A 46 28 0.4062 0.2826 0.4643 0.17
71 2emm:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.18
72 2yrj:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.19
73 2eol:A 42 32 0.3438 0.2619 0.3438 0.22
74 2ytf:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.23 2eof:A
75 2cot:A 77 28 0.3750 0.1558 0.4286 0.25
76 2cot:A 77 27 0.3438 0.1429 0.4074 1.4
77 2emx:A 44 31 0.3125 0.2273 0.3226 0.27
78 2eor:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.27
79 2el4:A 46 27 0.3438 0.2391 0.4074 0.29
80 2yu5:A 44 32 0.2812 0.2045 0.2812 0.29
81 6a57:A 131 25 0.3438 0.0840 0.4400 0.30 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
82 6a57:A 131 24 0.2500 0.0611 0.3333 6.7 6a58:A, 6a59:A, 6jnl:A, 6jnm:A, 6jnm:B, 6jnn:A, 6jnn:B, 6jnn:N, 6jnn:G
83 2eoj:A 44 32 0.3438 0.2500 0.3438 0.30
84 2ytq:A 46 29 0.3438 0.2391 0.3793 0.31 2eog:A
85 1p7a:A 37 28 0.3438 0.2973 0.3929 0.37 1u85:A, 1u86:A
86 2eoe:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.40 2ytk:A
87 2yto:A 46 28 0.3750 0.2609 0.4286 0.47
88 2yts:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 0.53
89 2ma7:A 73 28 0.3125 0.1370 0.3571 0.59
90 2en0:A 42 32 0.3438 0.2619 0.3438 0.62
91 5y0u:A 109 28 0.3125 0.0917 0.3571 0.63
92 6wmi:A 146 28 0.2812 0.0616 0.3214 0.68 6wmi:D
93 6wmi:A 146 28 0.2500 0.0548 0.2857 3.8 6wmi:D
94 6wmi:A 146 28 0.3125 0.0685 0.3571 6.6 6wmi:D
95 2eq0:A 46 28 0.3750 0.2609 0.4286 0.76
96 2ep3:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 0.82
97 2ema:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 0.82
98 8e3e:F 121 25 0.4375 0.1157 0.5600 1.0 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
99 2en7:A 44 31 0.3438 0.2500 0.3548 1.1
100 8dey:C 57 28 0.3125 0.1754 0.3571 1.1 8dey:F
101 2enc:A 46 28 0.2812 0.1957 0.3214 1.1
102 2epu:A 45 28 0.2812 0.2000 0.3214 1.2
103 2enh:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 1.2
104 2ene:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 1.2
105 2adr:A 60 26 0.3438 0.1833 0.4231 1.2 1paa:A
106 2adr:A 60 27 0.3438 0.1833 0.4074 5.5 1paa:A
107 1g2d:C 89 28 0.3125 0.1124 0.3571 1.3 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
108 2ysv:A 42 32 0.3125 0.2381 0.3125 1.7
109 7nng:A 572 10 0.2188 0.0122 0.7000 1.8 5rl6:A, 5rl7:A, 5rl8:A, 5rl9:A, 5rlb:A, 5rlc:A, 5rld:A, 5rle:A, 5rlf:A, 5rlg:A, 5rlh:A, 5rli:A, 5rlj:A, 5rlk:A, 5rll:A, 5rlm:A, 5rln:A, 5rlo:A, 5rlp:A, 5rlq:A, 5rlr:A, 5rls:A, 5rlt:A, 5rlu:A, 5rlv:A, 5rlw:A, 5rly:A, 5rlz:A, 5rm0:A, 5rm1:A, 5rm2:A, 5rm3:A, 5rm4:A, 5rm5:A, 5rm6:A, 5rm7:A, 5rm8:A, 5rm9:A, 5rma:A, 5rmb:A, 5rmc:A, 5rmd:A, 5rme:A, 5rmf:A, 5rmg:A, 5rmh:A, 5rmi:A, 5rmj:A, 5rmk:A, 5rml:A, 5rmm:A, 5rob:A, 6zsl:A
110 6jyt:A 597 10 0.2188 0.0117 0.7000 2.0 7cxm:E, 7cxm:F, 7cxn:E, 7cxn:F, 7cyq:F, 7cyq:E, 7egq:E, 7egq:R, 7egq:F, 7egq:S, 7eiz:E, 7eiz:F, 8gw1:E, 8gw1:F, 8gwb:F, 8gwb:E, 8gwe:F, 8gwe:E, 8gwf:F, 8gwf:E, 8gwg:F, 8gwg:E, 8gwi:F, 8gwi:E, 8gwk:E, 8gwk:F, 8gwm:E, 8gwm:F, 8gwn:F, 8gwn:E, 8gwo:F, 8gwo:E, 6jyt:B, 7krn:E, 7kro:E, 7kro:F, 7nio:A, 7nio:E, 7nn0:A, 7nn0:B, 7nn0:C, 7nn0:D, 7nng:B, 7rdx:E, 7rdx:F, 7rdy:E, 7rdy:F, 7rdz:E, 7rdz:F, 7re0:E, 7re0:F, 7re1:E, 7re1:F, 7re2:E, 7re3:E, 7re3:F, 7re3:K, 7re3:L, 5rl6:B, 5rl7:B, 5rl8:B, 5rl9:B, 5rlb:B, 5rlc:B, 5rld:B, 5rle:B, 5rlf:B, 5rlg:B, 5rlh:B, 5rli:B, 5rlj:B, 5rlk:B, 5rll:B, 5rlm:B, 5rln:B, 5rlo:B, 5rlp:B, 5rlq:B, 5rlr:B, 5rls:B, 5rlt:B, 5rlu:B, 5rlv:B, 5rlw:B, 5rly:B, 5rlz:B, 5rm0:B, 5rm1:B, 5rm2:B, 5rm3:B, 5rm4:B, 5rm5:B, 5rm6:B, 5rm7:B, 5rm8:B, 5rm9:B, 5rma:B, 5rmb:B, 5rmc:B, 5rmd:B, 5rme:B, 5rmf:B, 5rmg:B, 5rmh:B, 5rmi:B, 5rmj:B, 5rmk:B, 5rml:B, 5rmm:B, 5rob:B, 6xez:E, 6xez:F, 6zsl:B
111 8tho:A 100 30 0.3438 0.1100 0.3667 2.2 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
112 7txc:E 84 28 0.3125 0.1190 0.3571 2.2
113 2dlk:A 79 21 0.3125 0.1266 0.4762 2.4
114 2dlk:A 79 29 0.3125 0.1266 0.3448 7.4
115 2emg:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 3.0
116 4m9v:C 60 30 0.4375 0.2333 0.4667 3.2 4gzn:C, 4m9v:F
117 2en1:A 46 28 0.2812 0.1957 0.3214 3.2 2yth:A
118 2nab:A 41 31 0.3438 0.2683 0.3548 3.2
119 2csh:A 110 27 0.3750 0.1091 0.4444 3.4
120 4c9z:A 193 31 0.3438 0.0570 0.3548 3.5 2a25:A, 2an6:A, 2an6:B, 2an6:C, 2an6:D, 4c9z:B, 4ca1:A, 4ca1:B, 8heo:B, 8heo:A, 4i7b:A, 4i7b:C, 4i7c:A, 4i7c:C, 4i7d:A, 4i7d:C, 1k2f:A, 1k2f:B, 5wzz:C, 5wzz:B, 5wzz:A, 5wzz:D, 4x3g:A, 4x3g:B
121 2epw:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 4.0
122 5v3g:D 170 28 0.2812 0.0529 0.3214 4.4 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
123 5v3g:D 170 28 0.2812 0.0529 0.3214 6.1 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
124 5v3g:D 170 28 0.2812 0.0529 0.3214 6.5 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
125 5z06:B 698 22 0.3438 0.0158 0.5000 5.0 5z06:A
126 2ytm:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 5.0
127 2emi:A 46 29 0.3125 0.2174 0.3448 5.2 2ytp:A
128 2eop:A 46 28 0.3125 0.2174 0.3571 5.3
129 2eml:A 46 31 0.3438 0.2391 0.3548 5.8
130 2emf:A 46 18 0.2812 0.1957 0.5000 6.0
131 2kmk:A 82 28 0.3125 0.1220 0.3571 6.6
132 2ytd:A 46 28 0.3438 0.2391 0.3929 6.9
133 6zwm:E 1117 19 0.2500 0.0072 0.4211 7.1 7pe7:F, 7pe7:E, 7pe8:E, 7pe9:E, 6zwm:F, 6zwo:F
134 1jk0:A 334 19 0.2500 0.0240 0.4211 7.6
135 2ep1:A 46 28 0.2812 0.1957 0.3214 7.6 2ep2:A
136 5wwp:B 591 9 0.1875 0.0102 0.6667 9.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218