BioLiP

>protein
DRINTVRGPITISEAGFTLTHEHICGSSAGFLHAWPEFFGSRKALVEKAVRGLRRARAAGVRTIVDVSTFDCGRDVSLLA
EVSRAADVHIVAATGLWIDPPLSMRLRSVEELTQFFLREIQYGIEDTGIRAGIIKVATTGKATPFQELVLRAAARASLAT
GVPVTTHTAASQRDGEQQAAIFESEGLSPSRVCIGHSDDTDDLSYLTALAARGYLIGLDGIPWSAIASASAILGNRSWQT
RALLIKALIDQGYMKQILVSNDWTFGFSSYVTNIMDVLDRVNPDGMAFIPLRVIPFLREKGVPQETLAGITVTNPARFLS
PT

The query sequence (length=322) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6fqe:B	340	327	0.9658	0.9147	0.9511	0.0	6aml:A, 6aml:G, 6b2f:A, 6b2f:G, 6bh7:G, 6bhk:A, 6bhk:G, 6bhk:B, 6bhk:E, 6bhl:A, 6bhl:G, 3cak:A, 3cak:B, 3cs2:A, 3cs2:B, 3cs2:K, 3cs2:P, 1dpm:A, 1dpm:B, 3e3h:A, 3e3h:B, 4e3t:A, 4e3t:B, 1eyw:A, 1ez2:A, 1ez2:B, 6fef:A, 6fei:A, 6fei:B, 6ffw:A, 6ffw:B, 6for:A, 6fqe:A, 6frz:A, 6frz:B, 6fs3:A, 6fs3:B, 6fu0:A, 6fu0:B, 6fu0:C, 6fu0:D, 6fu6:A, 6fu6:B, 6fvk:A, 6fvp:A, 6fw1:A, 6fwe:A, 6g0m:A, 6g1j:A, 6g23:A, 6g3l:A, 6g3m:A, 6gbj:A, 6gbk:A, 6gbk:B, 6gbl:A, 6gbl:B, 4gy0:A, 4gy0:B, 4gy1:A, 4gy1:B, 1hzy:A, 1hzy:B, 1i0b:A, 1i0b:B, 1i0d:A, 1i0d:B, 1jgm:A, 1jgm:B, 2o4m:A, 2o4m:B, 2o4m:C, 2o4m:P, 2o4q:A, 2o4q:B, 2o4q:K, 2o4q:P, 2ob3:A, 2ob3:B, 2oql:A, 2oql:B, 1p6b:A, 1p6b:B, 1p6c:A, 1p6c:B, 8p7h:A, 8p7i:A, 8p7i:B, 8p7k:A, 8p7k:B, 8p7m:A, 8p7n:A, 8p7n:B, 8p7n:C, 8p7n:D, 8p7q:A, 8p7r:A, 8p7s:A, 8p7t:A, 8p7u:A, 8p7v:A, 7p85:A, 4pbe:A, 4pbe:G, 4pbf:A, 4pbf:B, 4pcn:A, 4pcn:B, 4pcp:A, 4pcp:G, 1psc:A, 1psc:B, 1qw7:A, 1qw7:B, 3upm:A, 3upm:B, 8uqy:A, 8uqz:A, 3ur2:A, 3ur2:B, 3ur5:A, 3ur5:B, 3ura:A, 3ura:B, 3urb:A, 3urb:B, 3urn:A, 3urn:B, 3urq:A, 3urq:B, 5w6b:A, 5w6b:G, 5wcp:A, 5wcp:G, 5wcq:A, 5wcq:G, 5wcr:A, 5wcr:G, 5wcw:A, 5wcw:G, 5wiz:A, 5wiz:G, 5wj0:A, 5wj0:G, 5wms:A, 5wms:G, 5wms:Q, 5wms:S, 4xaf:A, 4xaf:G, 4xag:A, 4xag:G, 4xay:A, 4xay:G, 4xaz:A, 4xaz:G, 4xd3:A, 4xd3:G, 4xd4:A, 4xd4:G, 4xd5:A, 4xd5:G, 4xd6:A, 4xd6:G, 4zst:A, 4zst:B, 4zsu:A, 4zsu:B
2	3a3w:A	329	327	0.8789	0.8602	0.8654	0.0	3a3x:A, 3a4j:A, 3c86:A, 2d2g:A, 2d2h:A, 2d2j:A, 4np7:A, 3ood:A, 3oqe:A, 2r1k:A, 2r1l:A, 2r1m:A, 2r1n:A, 2r1p:A, 3so7:A, 5vej:A, 5w7h:A, 5w7h:B, 3wml:A
3	6bh7:A	308	321	0.8820	0.9221	0.8847	0.0	6fee:A, 8p7f:A
4	4if2:A	324	330	0.3602	0.3580	0.3515	3.76e-52
5	8sfb:D	314	318	0.3230	0.3312	0.3270	2.43e-50	8sfc:D, 8sfd:D, 8sfk:D, 8sfm:D, 3uf9:A, 3uf9:B, 3uf9:C, 3uf9:D, 2vc5:A, 2vc5:B, 2vc5:C, 2vc5:D, 2vc7:A, 2vc7:B, 2vc7:C, 2vc7:D, 5vri:A, 5vri:B, 5vri:C, 5vri:D, 5vrk:A, 5vrk:B, 5vsa:A, 5vsa:B, 5vsa:C, 5vsa:D, 5w3u:B, 5w3w:A, 5w3w:B, 5w3w:C, 5w3w:D, 5w3z:B, 5w3z:C, 5w3z:D
6	5w3u:D	294	317	0.3168	0.3469	0.3218	8.53e-50	8sf9:D, 5w3u:A, 5w3u:C, 5w3z:A
7	4g2d:A	314	318	0.3168	0.3248	0.3208	8.18e-48	4ker:A, 4ker:B, 4ker:C, 4ker:D, 4kes:A, 4kes:B, 4kes:C, 4kes:D, 4ket:A, 4ket:B, 4ket:C, 4ket:D, 4keu:A, 4keu:B, 4keu:C, 4keu:D, 4kev:A, 4kev:B, 4kev:C, 4kev:D, 4kez:A, 4kez:B, 4kez:C, 4kez:D, 4kf1:A, 4kf1:B, 4kf1:C, 4kf1:D, 8sf2:D, 8sfa:D, 8sfa:S, 8sfa:b, 8sfa:t
8	3gtx:A	333	333	0.3168	0.3063	0.3063	8.69e-39	3fdk:A, 3gtf:A, 3gth:A, 3gti:A, 3gu1:A, 3gu2:A, 3gu9:A, 3htw:A, 4j2m:A, 4j35:A, 4j5n:A, 2zc1:A
9	5ch9:A	328	343	0.3199	0.3140	0.3003	1.25e-38	5ch9:B, 3f4c:A, 3f4c:B, 3f4d:A, 3f4d:B, 4h9t:A, 4h9t:B, 4h9u:A, 4h9u:B, 4h9v:A, 4h9v:B, 4h9x:A, 4h9x:B, 4h9y:A, 4h9y:B, 4h9z:A, 4h9z:B, 4ha0:A, 4ha0:B, 6jss:A, 6jss:B, 6jss:C, 6jss:D, 6jst:A, 6jst:B, 6jst:C, 6jst:D, 6jsu:A, 6jsu:B, 3ojg:A, 3orw:A, 3orw:B, 3tn3:A, 3tn3:B, 3tn4:A, 3tn4:B, 3tn5:A, 3tn5:B, 3tn6:A, 3tn6:B, 3tnb:A, 3tnb:B, 4wvx:A, 4wvx:B
10	4rdz:B	316	309	0.2795	0.2848	0.2913	1.57e-38	4rdy:A, 4rdy:B, 4rdz:A, 4re0:A
11	1bf6:A	291	317	0.2826	0.3127	0.2871	5.99e-32	1bf6:B, 4lef:C, 4lef:D, 4lef:A, 4lef:B, 4lef:E, 4lef:F, 4lef:G, 4lef:H
12	3pnz:A	329	343	0.3137	0.3070	0.2945	1.52e-25	3pnz:B, 3pnz:C, 3pnz:D, 3pnz:E, 3pnz:F
13	3rhg:A	363	357	0.2826	0.2507	0.2549	2.52e-23	4qsf:A
14	3k2g:B	358	351	0.2950	0.2654	0.2707	7.85e-21	3k2g:A, 3k2g:C, 3k2g:D
15	3ovg:A	351	336	0.2671	0.2450	0.2560	2.10e-15	3ovg:B, 3ovg:C, 3ovg:D, 3ovg:E, 3ovg:F
16	5y2f:A	297	70	0.0870	0.0943	0.4000	0.15	8ak5:A, 8ak5:B, 8ak6:A, 8ak6:B, 8ak7:A, 8ak7:B, 8ak8:A, 8ak8:B, 8ak9:A, 8ak9:B, 8aka:A, 8aka:B, 8akb:A, 8akb:B, 8akc:A, 8akc:B, 8akd:A, 8akd:B, 8ake:A, 8ake:B, 8akf:A, 8akf:B, 8akg:A, 8akg:B, 8bl0:A, 8bl0:B, 8bl1:A, 8bl1:B, 7cl0:A, 7cl1:A, 8cnm:A, 8cnm:B, 8cno:A, 8cno:B, 8f86:K, 8g57:K, 9g7h:A, 9g7h:B, 6hoy:A, 6hoy:B, 8i2b:A, 8i2b:B, 3k35:A, 3k35:B, 3k35:C, 3k35:D, 3k35:E, 3k35:F, 5mf6:A, 5mf6:B, 5mfp:A, 5mfp:B, 5mfz:A, 5mfz:B, 5mgn:A, 5mgn:B, 3pki:A, 3pki:B, 3pki:C, 3pki:D, 3pki:E, 3pki:F, 3pkj:A, 3pkj:B, 3pkj:C, 3pkj:D, 3pkj:E, 3pkj:F, 6qcd:A, 6qcd:B, 6qce:A, 6qce:B, 6qch:A, 6qch:B, 6qcj:A, 6qcj:B, 5x16:A, 6xuy:A, 6xuy:B, 6xv1:A, 6xv1:B, 6xv6:A, 6xv6:B, 6xv6:C, 6xv6:D, 6xv6:E, 6xv6:F, 6xvg:A, 6xvg:B, 6xvg:C, 6xvg:D, 6xvg:E, 6xvg:F, 3zg6:A, 6zu4:A, 6zu4:B
17	8of4:L	237	70	0.0870	0.1181	0.4000	0.20
18	1f3t:B	381	83	0.0807	0.0682	0.3133	0.39	1f3t:A, 1f3t:C, 1f3t:D, 1njj:A, 1njj:B, 1njj:C, 1njj:D, 1qu4:A, 1qu4:B, 1qu4:C, 1qu4:D, 1szr:C, 1szr:D, 1szr:A, 1szr:B, 2tod:A, 2tod:B, 2tod:C, 2tod:D
19	3e5z:A	290	41	0.0404	0.0448	0.3171	0.42	3e5z:B
20	2fdr:A	222	36	0.0528	0.0766	0.4722	1.7
21	3d3l:A	451	41	0.0559	0.0399	0.4390	1.9	3d3l:B
22	8ghc:A	662	41	0.0559	0.0272	0.4390	2.8	8ghb:A, 8ghc:B, 8ghd:A, 8ghd:B, 8ghd:C, 8ghd:D, 8ghd:E, 8ghd:F, 8ghe:B, 8ghe:C, 8ghe:D, 8ghe:A
23	4rl6:A	414	64	0.0559	0.0435	0.2812	3.3	4rl6:B
24	6yxy:EE	433	78	0.0745	0.0554	0.3077	3.7	7aoi:XO, 6yxx:EE
25	1jg8:D	344	103	0.0807	0.0756	0.2524	4.0	2fm1:A, 1jg8:A, 1jg8:B, 1jg8:C, 1lw4:D, 1lw4:B, 1lw4:C, 1lw4:A, 1lw5:A, 1lw5:D, 1lw5:C, 1lw5:B, 1m6s:A, 1m6s:D, 1m6s:C, 1m6s:B
26	4v8m:BJ	214	37	0.0373	0.0561	0.3243	4.5
27	3t2d:A	390	63	0.0559	0.0462	0.2857	4.7	3t2b:A, 3t2c:A, 3t2e:A, 3t2f:A, 3t2g:A
28	3d42:A	289	65	0.0652	0.0727	0.3231	5.5	3d44:A, 1zc0:A
29	6rrn:A	989	51	0.0435	0.0142	0.2745	6.4
30	4tsd:B	181	51	0.0528	0.0939	0.3333	6.8	4tsd:A

[Back]