Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DRAEVRNIPFKLGMYLTVGGVVNSNATRFSINVGESTDSIAMHMDHRFSYGADQNVLVLNSLVHNVGWQQEERSKKFPFT
KGDHFQTTITFDTHTFYIQLSNGETVEFPNRNKDAAFNLIYLAGDARLTFVRLE

The query sequence (length=134) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1is3:A 134 134 1.0000 1.0000 1.0000 4.91e-99 1is4:A, 1wld:A, 1wlw:A
2 3ajz:A 132 132 0.7836 0.7955 0.7955 1.57e-74 3ak0:A, 3ak0:B
3 3ajy:A 133 131 0.6269 0.6316 0.6412 1.53e-60 3ajy:C
4 1c1l:A 135 132 0.4776 0.4741 0.4848 2.33e-44
5 6e20:B 133 130 0.3507 0.3534 0.3615 5.27e-29 6e20:A
6 2ymz:B 130 131 0.3134 0.3231 0.3206 1.13e-19 2ymz:D
7 4ga9:A 134 128 0.3134 0.3134 0.3281 4.08e-19 4ga9:B, 3m2m:A, 3m2m:C, 3m2m:D, 3m2m:E, 3m2m:H, 4no4:A, 4no4:B, 4no4:C, 4no4:D, 4no4:E, 4no4:F
8 1w6m:A 134 128 0.3060 0.3060 0.3203 8.59e-19 1w6m:B, 1w6o:A, 1w6o:B, 1w6p:A, 1w6p:B, 2zkn:A
9 1sla:A 134 129 0.3134 0.3134 0.3256 2.22e-18 1slb:A, 1slb:C, 1slc:A, 1slc:B, 1slt:A, 1slt:B
10 5dg2:B 131 131 0.2910 0.2977 0.2977 2.79e-17 5dg1:C, 5dg1:H, 5dg1:D, 5dg1:I, 5ews:C, 5ews:D, 5ews:A, 5ews:G, 5ews:H, 5ews:I, 5ews:J, 5ews:K, 5ews:M, 5ews:N, 1hlc:A, 1hlc:B
11 6m5y:A 270 128 0.3060 0.1519 0.3203 1.54e-16 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
12 6m5y:A 270 128 0.3060 0.1519 0.3203 1.54e-16 8b0w:A, 8b0w:B, 8b0z:A, 8b0z:B, 6b94:A, 6b94:B, 6f83:A, 6f83:B, 1gzw:A, 1gzw:B, 7lta:A, 5mwt:A, 5mwt:B, 5mwx:A, 5mwx:B, 7nml:B, 8ojp:A, 8ojp:B, 3oy8:A, 3oy8:B, 3oyw:A, 3oyw:B, 4q1p:A, 4q1p:B, 4q1r:A, 4q1r:B, 4q26:A, 4q26:B, 4q26:G, 4q26:H, 4q27:A, 4q27:B, 4q2f:A, 4q2f:B, 8r74:A, 8r74:B, 3t2t:A, 4xbl:A, 4xbl:B, 4y1u:B, 4y1u:A, 4y1v:A, 4y1v:B, 4y1x:A, 4y1x:B, 4y1y:A, 4y1y:B, 4y1z:A, 4y1z:B, 4y20:A, 4y20:B, 4y22:B, 4y24:A, 4y24:B
13 1a78:A 134 122 0.2537 0.2537 0.2787 3.65e-14 1a78:B, 1gan:A, 1gan:B
14 5jpg:A 144 126 0.3209 0.2986 0.3413 1.46e-13 5jpg:B
15 3wud:A 132 107 0.2313 0.2348 0.2897 1.87e-13
16 3wuc:B 137 120 0.2612 0.2555 0.2917 2.18e-11 3wuc:A
17 4han:A 293 130 0.3060 0.1399 0.3154 5.65e-11 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
18 4han:A 293 114 0.2313 0.1058 0.2719 0.001 7aen:A, 7aen:B, 7als:A, 7als:B, 3ap4:A, 3ap4:B, 3ap4:C, 3ap4:D, 3ap6:A, 3ap6:B, 3ap6:C, 3ap6:D, 3ap7:A, 3ap9:A, 4bmb:A, 4bme:A, 4bme:B, 8cm8:A, 8cm8:B, 4fqz:A, 4gxl:A, 5gzc:A, 5gzd:A, 5gze:A, 5gzf:A, 5gzg:A, 4han:B, 7p11:A, 7p11:B, 7p1m:A, 7p1m:B, 5t7i:A, 5t7s:A, 5t7t:A, 5t7u:A, 3vkl:A, 3vkl:B, 3vkm:A, 3vkm:B, 3vko:A, 3vko:B, 5vwg:A, 6w4z:A, 6w4z:B, 2yxs:A, 6z6y:A
19 7xbl:B 136 127 0.2836 0.2794 0.2992 4.76e-10 2gal:A, 2gal:B, 3gal:A, 3gal:B, 4gal:B, 5gal:B, 5h9q:B, 5h9s:B, 7n57:A, 7n57:B, 7n8d:A, 7n8d:B, 7rdg:C, 7rdg:B, 7rdg:A, 7rdg:D, 7tkx:A, 7tkx:B, 7tkz:B, 7tkz:A, 7tro:B, 4uw3:A, 4uw4:B, 4uw5:A, 4uw5:D, 4uw5:F, 4uw6:B, 6vto:A, 6vto:B, 6vtq:A, 6vtq:B, 6vts:A, 6vts:B, 7xac:A, 7xac:B, 4xbq:A, 4xbq:B, 7xbl:A, 4y26:A, 4y26:B, 3zxe:A, 3zxe:B
20 6fof:A 153 128 0.2612 0.2288 0.2734 2.15e-09 1a3k:A, 3aya:A, 3aya:B, 3ayc:B, 3ayd:A, 3aye:A, 3aye:B, 6b8k:A, 4bli:A, 4blj:A, 4bm8:A, 8bz3:A, 7cxa:A, 7cxa:B, 7df5:A, 5e88:A, 5e89:A, 5e8a:A, 6eog:A, 6eol:A, 5exo:A, 6exy:A, 6eym:A, 6f6y:A, 6fk2:A, 6fof:C, 6fof:D, 6fof:E, 6fof:G, 6fof:B, 6fof:F, 6fof:H, 6fof:I, 6fof:J, 6fof:K, 6fof:L, 6g0v:A, 6h64:A, 6h64:F, 6h64:B, 6h64:E, 6h64:C, 6h64:D, 5h9p:A, 5h9r:A, 6i74:A, 6i75:A, 6i76:A, 6i77:A, 6i78:A, 8itx:A, 8itx:B, 8itz:A, 5iuq:A, 4jc1:A, 4jck:A, 1kjl:A, 1kjr:A, 6kxa:A, 6kxb:A, 4lbj:A, 4lbk:A, 4lbl:A, 4lbm:A, 4lbn:A, 4lbo:A, 5nf7:A, 5nf9:A, 5nfa:A, 5nfb:A, 2nmn:A, 2nmo:A, 2nn8:A, 5oax:A, 5ody:A, 8oji:A, 8ojk:A, 8ojm:A, 8ojo:A, 8pbf:A, 8pf9:A, 8pff:A, 8ppn:A, 6q0q:A, 6q17:A, 6qge:A, 6qgf:A, 6qln:A, 6qlo:A, 6qlp:A, 6qlq:B, 6qlr:A, 6qls:A, 6qlt:A, 6qlu:A, 4r9a:A, 4r9b:A, 4r9c:A, 4r9d:A, 7rdo:A, 7rdp:A, 7rgx:A, 7rgy:A, 7rgz:A, 6rhl:A, 6rhm:A, 7rh0:A, 7rh1:A, 7rh3:A, 7rh4:A, 4rl7:A, 6rzf:A, 6rzg:A, 6rzh:A, 6rzi:A, 6rzj:A, 6rzk:A, 6rzl:A, 6rzm:A, 3t1l:A, 3t1m:A, 6tf6:A, 6tf7:A, 4xbn:A, 7xfa:A, 2xg3:A, 6y4c:A, 6y78:A, 7zqx:A, 3zsj:A, 3zsk:A
21 5nld:B 138 105 0.2463 0.2391 0.3143 2.71e-09 5nle:A, 5nle:B, 5nle:C, 5nle:D, 5nlh:A, 5nm1:A, 5nm1:B, 5nm1:C, 5nm1:D, 5nmj:A, 7p8h:C, 7p8h:A
22 7df6:A 139 117 0.2388 0.2302 0.2735 4.14e-09 7cxb:A, 7cxc:A, 7cxc:B, 7cxd:A, 7cxd:B, 7cxd:D, 7cxd:E, 7df6:B, 8ilu:A, 8ilu:B, 8iu1:A
23 2wt0:A 300 134 0.2687 0.1200 0.2687 1.34e-08 2wsv:A, 2wt1:A, 2wt2:A, 2wt2:B
24 2d6n:B 153 124 0.2463 0.2157 0.2661 4.06e-08 2d6m:A, 2d6m:B, 2d6n:A, 2d6o:X, 2d6p:A, 2d6p:B
25 3wv6:A 284 125 0.2687 0.1268 0.2880 1.04e-07 2eak:A, 2eak:C, 2eal:A, 2eal:B, 3lse:A, 3nv2:A, 3nv3:A, 3nv4:A, 3wlu:A, 3wlu:B, 3wlu:C, 3wlu:D, 3wv6:B, 2yy1:A, 2zhk:A, 2zhk:B, 2zhl:A, 2zhl:B, 2zhl:C, 2zhl:D, 2zhm:A, 2zhm:B, 2zhm:C, 2zhm:D, 2zhn:A
26 3i8t:A 140 128 0.2537 0.2429 0.2656 2.27e-07
27 5glt:A 278 128 0.2537 0.1223 0.2656 2.73e-07 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
28 5glt:A 278 121 0.2313 0.1115 0.2562 1.83e-06 5glt:B, 5glu:A, 5glu:B, 5glw:A, 5glz:A, 5glz:B, 5glz:C, 5gm0:A, 5gm0:B
29 4xzp:A 148 120 0.2463 0.2230 0.2750 1.67e-05 5duu:A, 5duu:B, 5duu:C, 5duu:D, 5duv:A, 5duv:B, 5duv:C, 5duv:D, 5duw:A, 5duw:B, 5duw:C, 5duw:D, 5dux:B, 5dux:D, 5dux:A, 5dux:C
30 7cya:A 139 137 0.2910 0.2806 0.2847 6.15e-04
31 6k2z:A 138 140 0.2687 0.2609 0.2571 8.47e-04 6k2z:B
32 4ylz:C 140 123 0.2463 0.2357 0.2683 0.001 5cbl:A, 5cbl:B, 5cbl:C, 5cbl:D, 6wab:A, 6wab:B, 4ylz:A, 4ylz:B, 4ylz:D, 4ym0:D, 4ym0:A, 4ym0:B, 4ym0:C, 4ym1:A, 4ym1:B, 4ym1:C, 4ym2:A, 4ym2:B, 4ym2:C, 4ym2:D, 4ym3:A, 4ym3:B, 4ym3:C, 4ym3:D
33 6l6a:A 142 73 0.1418 0.1338 0.2603 0.002 6a1t:A, 1g86:A, 6gku:A, 1hdk:A, 6l64:A, 6l67:A, 6l68:A, 6l6b:A, 6l6c:A, 1qkq:A, 6qrn:A, 5xrg:A, 5xri:A, 5xrk:A, 5xrl:A, 5xrm:A, 5xrn:A, 5xro:A, 5xrp:A, 5yt4:A
34 6ryx:A 626 116 0.2388 0.0511 0.2759 0.14 6ryv:A, 6ryw:A
35 7xxy:A 137 101 0.1866 0.1825 0.2475 0.17 7xxv:A
36 1ulc:A 150 71 0.1642 0.1467 0.3099 0.18 1ulc:B, 1uld:A, 1uld:B, 1uld:C, 1uld:D, 1ule:A, 1ule:B, 1ulf:A, 1ulf:B, 1ulg:A, 1ulg:B, 1ulg:C, 1ulg:D, 2wkk:A, 2wkk:B, 2wkk:C, 2wkk:D
37 6ljq:A 140 129 0.2239 0.2143 0.2326 0.19 6ljr:A
38 2bwr:A 401 76 0.1567 0.0524 0.2763 0.78 2bwm:A, 2bwr:B, 2c25:A, 2c25:B, 2c4d:A, 4up4:A, 4up4:B
39 6mp4:E 137 47 0.0970 0.0949 0.2766 3.3 6drg:A, 7fy8:A, 7fy8:B, 7fy8:C, 7fy8:D, 7fy8:E, 7fy8:F, 7fy8:G, 7fy8:H, 7g00:A, 7g00:B, 7g00:C, 7g00:D, 7g00:E, 7g00:F, 7g00:G, 7g00:H, 7g00:I, 7g00:J, 7g00:K, 7g00:L, 7g00:M, 7g00:N, 7g00:O, 7g00:P, 2lkk:A, 6mp4:A, 6mp4:H, 3stk:A, 3stm:X
40 7n7v:A 321 74 0.1418 0.0592 0.2568 3.8 7n7v:B
41 3w5m:A 1030 38 0.1045 0.0136 0.3684 5.4 3w5n:A
42 6cin:B 1169 33 0.0970 0.0111 0.3939 7.3 6cin:A, 6cin:C, 6cin:D, 6cin:E, 6cin:F, 6cio:A, 6cio:B, 6cio:C, 6cio:D, 6cio:E, 6cio:F, 6cip:A, 6cip:B, 6cip:C, 6cip:D, 6cip:E, 6cip:F, 6ciq:A, 6ciq:B, 6ciq:C
43 2f8s:A 704 30 0.0896 0.0170 0.4000 7.3 2f8t:A
44 1yvu:A 682 30 0.0896 0.0176 0.4000 7.3
45 7b04:B 1120 55 0.1119 0.0134 0.2727 8.1 7b04:E, 7b04:H, 7b04:K, 7b04:N, 7b04:Q, 7b04:T, 7b04:W
46 2ofd:A 141 68 0.1418 0.1348 0.2794 9.7 2ofd:B
47 4tqm:A 402 51 0.0970 0.0323 0.2549 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218