BioLiP

>protein
DQPFAWQVASLSERYQEQFDIGAAVEPYQLEGRQAQILKHHYNSLVAENAMKPESLQPREGEWNWEGADKIVEFARKHNM
ELRFHTLVWHSQVPEWFFIDEDGNRMVDETDPDKREANKQLLLERMENHIKTVVERYKDDVTSWDVVNEVIDDGGGLRES
EWYQITGTDYIKVAFETARKYGGEEAKLYINDYNTEVPSKRDDLYNLVKDLLEQGVPIDGVGHQSHIQIGWPSIEDTRAS
FEKFTSLGLDNQVTELDMSLYGWPPTGAYTSYDDIPAELLQAQADRYDQLFELYEELAADISSVTFWGIADNHTWLDGRA
REYNNGVGIDAPFVFDHNYRVKPAYWRIIDLEHHHHHH

The query sequence (length=358) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cpl:A	358	358	0.9972	0.9972	0.9972	0.0	7cpk:A, 6lps:A, 2uwf:A, 8xy0:A, 8y1m:A, 8y1m:B
2	5eb8:A	354	353	0.7570	0.7655	0.7677	0.0	5eb8:B, 5eba:A, 5efd:A, 5efd:B, 5eff:A, 5eff:B, 2f8q:A, 2f8q:B, 2fgl:A, 2fgl:B, 4qce:A, 4qce:B, 4qcf:A, 4qdm:A, 4qdm:B, 5xc0:A, 5xc0:B, 5xc1:A, 5xc1:B
3	1hiz:A	375	365	0.6313	0.6027	0.6192	2.51e-165	3mmd:A, 4prw:A, 4pud:A, 4pue:A, 1r85:A, 1r86:A, 1r87:A
4	4pmd:A	329	352	0.4413	0.4802	0.4489	6.85e-93	4l4p:A
5	3w25:A	324	351	0.4274	0.4722	0.4359	4.64e-91	3w26:A, 3w27:A, 3w28:A, 3w29:A
6	3msd:A	330	346	0.4050	0.4394	0.4191	4.05e-88	3msd:B, 3msg:A, 3msg:B, 3mua:A, 3mua:B, 3mui:A, 3mui:B
7	5ofk:A	339	353	0.4050	0.4277	0.4108	1.42e-86	5ofl:A
8	3emq:A	331	348	0.4022	0.4350	0.4138	1.15e-85	3emz:A
9	8bbi:A	335	357	0.4078	0.4358	0.4090	5.17e-83	8bbi:B, 7nl2:A, 7nl2:B
10	4w8l:A	352	360	0.4078	0.4148	0.4056	3.11e-81	4w8l:B, 4w8l:C
11	6wqw:A	305	343	0.4022	0.4721	0.4198	2.36e-76
12	3rdk:B	334	362	0.3743	0.4012	0.3702	1.90e-68	4e4p:A, 4e4p:B, 3rdk:A, 3ro8:A, 3ro8:B, 3ro8:C, 3ro8:D, 3ro8:E, 3ro8:F, 3ro8:G, 3ro8:H
13	1ur2:A	351	367	0.3520	0.3590	0.3433	1.20e-66	2cnc:A, 1uqy:A, 1uqz:A, 1ur1:A
14	5d4y:A	314	342	0.3324	0.3790	0.3480	4.13e-63	5d4y:B
15	3nj3:A	327	319	0.3101	0.3394	0.3480	3.28e-57	3nj3:B, 1vbr:A, 1vbr:B
16	3cuf:A	314	334	0.3240	0.3694	0.3473	2.44e-53	3cug:A, 3cuh:A, 3cui:A, 3cuj:A, 1exp:A, 1fh7:A, 1fh8:A, 1fh9:A, 1fhd:A, 2his:A, 1j01:A, 2xyl:A
17	1us2:A	507	363	0.3492	0.2465	0.3444	4.73e-50	1gny:A
18	1b30:A	302	321	0.2849	0.3377	0.3178	1.02e-47	1b3v:A, 1b3w:A, 1b3x:A, 1b3y:A, 1b3z:A, 1bg4:A
19	2wys:B	516	370	0.3212	0.2229	0.3108	1.52e-46	2w5f:A, 2w5f:B, 2wys:A, 2wze:A, 2wze:B
20	1isv:A	436	348	0.3045	0.2500	0.3132	7.66e-46	2d20:A, 2d20:B, 2d22:A, 2d22:B, 2d23:A, 2d23:B, 2d24:A, 2d24:B, 1e0v:A, 1e0x:A, 1e0x:B, 2g3j:A, 5gqd:A, 5gqd:B, 5gqe:A, 5gqe:B, 1isv:B, 1isw:A, 1isw:B, 1isx:A, 1isx:B, 1isy:A, 1isy:B, 1isz:A, 1isz:B, 1it0:A, 1it0:B, 1od8:A, 1v0k:A, 1v0l:A, 1v0m:A, 1v0n:A, 1v6u:A, 1v6u:B, 1v6v:A, 1v6v:B, 1v6w:A, 1v6w:B, 1v6x:A, 1v6x:B
21	3u7b:B	326	323	0.2793	0.3067	0.3096	2.85e-42
22	7k4u:A	305	324	0.2821	0.3311	0.3117	1.92e-41	2bnj:A, 4bs0:A, 4bs0:B, 8fos:A, 1goq:A, 1gor:A, 7k4q:A, 7k4q:B, 7k4w:A, 7k4x:A, 7k4x:B, 7k4z:A, 8kh3:A, 3nyd:A, 3nyd:B, 8rd5:A, 8rd5:B, 5rga:A, 5rga:B, 5rgb:A, 5rgb:B, 5rgc:A, 5rgc:B, 5rgd:A, 5rgd:B, 5rge:A, 5rgf:A, 5rgf:B, 6srw:A, 6srw:B, 6sry:A, 6sry:B, 6srz:A, 6srz:B, 6ss1:A, 6ss1:B, 6ss3:A, 6ss3:B, 6tu6:A, 6tu6:B, 6tu6:C, 6tu6:D, 6tu6:E, 6tu6:F, 6tu6:G, 6tu6:H, 6tu6:I, 6tu6:J, 6tu6:K, 6tu6:L, 6tu6:M, 6tu6:N, 6tu6:O, 6tu6:P, 8usf:A, 8usf:B, 8ush:A, 8ush:B, 8usj:A, 8usj:B, 8usj:C, 8usl:A, 8usl:B
23	1w3h:A	348	373	0.3408	0.3506	0.3271	4.61e-41	1clx:A, 1clx:B, 1clx:C, 1clx:D, 1e5n:A, 1e5n:B, 1w2p:A, 1w2p:B, 1w2v:A, 1w2v:B, 1w32:A, 1w32:B, 1w3h:B
24	6jdy:A	319	312	0.2877	0.3229	0.3301	2.08e-39	6jdy:B, 6jdz:A, 6jdz:B, 6je0:A, 6je0:B, 6je1:A, 6je1:B, 6je2:A, 6je2:B, 7wh7:A, 7wh7:B, 7whe:B
25	4xx6:B	321	311	0.2765	0.3084	0.3183	4.27e-37	4xx6:A
26	3wub:A	313	329	0.2877	0.3291	0.3131	3.10e-35	3wue:A, 3wuf:A, 3wug:A
27	5xzu:A	334	289	0.2514	0.2695	0.3114	1.12e-33
28	6q8n:A	321	306	0.2402	0.2679	0.2810	8.94e-28	6q8n:B
29	4pmx:A	306	312	0.2179	0.2549	0.2500	1.68e-13	4pmy:A, 4pmy:B, 4pmz:A, 4pmz:B, 4pn2:A, 4pn2:B
30	7d88:A	364	243	0.1732	0.1703	0.2551	6.83e-10	7d89:A
31	8ibt:A	694	134	0.0866	0.0447	0.2313	0.10	8ibs:A, 8ibs:B, 8ibs:C, 8ibs:D, 8ibs:E, 8ibs:F, 8ibt:B
32	4dem:F	346	37	0.0391	0.0405	0.3784	0.98	3b7l:A, 5cg5:A, 5cg6:A, 3cp6:A, 5dgm:F, 5dgn:F, 5dgs:F, 5diq:F, 5djp:F, 5djr:F, 5djv:F, 2f7m:F, 2f89:F, 2f8c:F, 2f8z:F, 2f92:F, 2f94:F, 2f9k:F, 4ga3:A, 4h5c:F, 4h5d:F, 4h5e:F, 5ja0:F, 5juz:F, 4jvj:F, 5jv0:F, 5jv1:F, 5jv2:F, 4kfa:A, 4kpd:A, 4kpj:A, 4kq5:A, 4kqs:A, 4kqu:A, 5ksx:F, 4l2x:F, 4lfv:F, 4lpg:F, 4lph:F, 3n1v:F, 3n1w:F, 4n1z:F, 3n3l:F, 3n45:F, 3n46:F, 3n49:F, 3n5h:F, 3n5j:F, 3n6k:F, 6n7y:F, 6n7z:F, 6n82:F, 6n83:F, 4n9u:A, 4nfi:F, 4nfj:F, 4nfk:F, 4ng6:A, 4nke:A, 4nkf:A, 4nua:A, 6oag:F, 6oah:F, 4ogu:A, 2opm:A, 2opn:A, 4p0v:A, 4p0w:A, 4p0x:A, 4pvx:F, 4pvy:F, 4q23:A, 2qis:A, 4qpf:A, 4qxs:F, 2rah:A, 4rxa:A, 3rye:A, 3s4j:A, 2vf6:A, 5ygi:A, 1yq7:A, 1yv5:A, 1zw5:A
33	3zmr:A	469	87	0.0782	0.0597	0.3218	1.1	3zmr:B
34	8etg:E	145	31	0.0391	0.0966	0.4516	2.1
35	8dmf:A	718	52	0.0447	0.0223	0.3077	3.0	7uvp:A
36	4a0g:D	709	56	0.0531	0.0268	0.3393	3.0
37	8eui:E	183	31	0.0391	0.0765	0.4516	3.1	8esq:E, 8esr:E, 8etc:E, 8eth:E, 8eti:E, 8etj:E, 8eug:E, 8eup:E, 8euy:E, 8ev3:E
38	4a0g:C	681	56	0.0531	0.0279	0.3393	3.1
39	6lvw:A	668	104	0.0726	0.0389	0.2500	3.2
40	7awt:B	141	84	0.0615	0.1560	0.2619	3.6
41	7alp:U	1935	48	0.0475	0.0088	0.3542	4.4
42	8asd:A	1826	48	0.0475	0.0093	0.3542	4.7
43	8r6y:A	1991	48	0.0475	0.0085	0.3542	4.8	8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
44	8asb:A	1715	48	0.0475	0.0099	0.3542	4.9	8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
45	3qom:A	479	29	0.0335	0.0251	0.4138	4.9
46	4ipn:E	463	29	0.0363	0.0281	0.4483	5.0	4ipn:B
47	4uzs:A	687	125	0.0810	0.0422	0.2320	5.9	4ucf:A, 4ucf:B, 4ucf:C, 4uzs:B
48	4a0g:A	769	27	0.0363	0.0169	0.4815	7.1	4a0f:B, 4a0g:B, 4a0h:A, 4a0h:B, 4a0r:A, 4a0r:B
49	4a0f:A	746	27	0.0363	0.0174	0.4815	7.2

[Back]