BioLiP

>protein
DQPFAWQVASLSERYQEQFDIGAAVEPYQLEGRQAQILKHHYNSLVAENAMKPESLQPREGEWNWEGADKIVEFARKHNM
ELRFHTLVWHEQVPEWFFIDEDGNRMVDETDPDKREANKQLLLERMENHIKTVVERYKDDVTSWDVVNEVIDDGGGLRES
EWYQITGTDYIKVAFETARKYGGEEAKLYINDYNTEVPSKRDDLYNLVKDLLEQGVPIDGVGHQSHIQIGWPSIEDTRAS
FEKFTSLGLDNQVTELDMSLYGWPPTGAYTSYDDIPAELLQAQADRYDQLFELYEELAADISSVTFWGIADNHTWLDGRA
REYNNGVGIDAPFVFDHNYRVKPAYWRIIDLEHHHHHH

The query sequence (length=358) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cpl:A	358	358	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7cpk:A, 6lps:A, 2uwf:A, 8xy0:A, 8y1m:A, 8y1m:B
2	5eb8:A	354	353	0.7570	0.7655	0.7677	0.0	5eb8:B, 5eba:A, 5efd:A, 5efd:B, 5eff:A, 5eff:B, 2f8q:A, 2f8q:B, 2fgl:A, 2fgl:B, 4qce:A, 4qce:B, 4qcf:A, 4qdm:A, 4qdm:B, 5xc0:A, 5xc0:B, 5xc1:A, 5xc1:B
3	1hiz:A	375	365	0.6285	0.6000	0.6164	1.16e-164	3mmd:A, 4prw:A, 4pud:A, 4pue:A, 1r85:A, 1r86:A, 1r87:A
4	4pmd:A	329	352	0.4413	0.4802	0.4489	1.19e-92	4l4p:A
5	3w25:A	324	351	0.4274	0.4722	0.4359	6.15e-91	3w26:A, 3w27:A, 3w28:A, 3w29:A
6	3msd:A	330	346	0.4050	0.4394	0.4191	6.25e-88	3msd:B, 3msg:A, 3msg:B, 3mua:A, 3mua:B, 3mui:A, 3mui:B
7	5ofk:A	339	353	0.4022	0.4248	0.4079	5.60e-86	5ofl:A
8	3emq:A	331	348	0.4022	0.4350	0.4138	2.10e-85	3emz:A
9	8bbi:A	335	357	0.4050	0.4328	0.4062	2.07e-82	8bbi:B, 7nl2:A, 7nl2:B
10	4w8l:A	352	360	0.4050	0.4119	0.4028	1.35e-80	4w8l:B, 4w8l:C
11	6wqw:A	305	343	0.4022	0.4721	0.4198	3.03e-76
12	3rdk:B	334	362	0.3743	0.4012	0.3702	1.05e-68	4e4p:A, 4e4p:B, 3rdk:A, 3ro8:A, 3ro8:B, 3ro8:C, 3ro8:D, 3ro8:E, 3ro8:F, 3ro8:G, 3ro8:H
13	1ur2:A	351	367	0.3492	0.3561	0.3406	5.52e-66	2cnc:A, 1uqy:A, 1uqz:A, 1ur1:A
14	5d4y:A	314	342	0.3296	0.3758	0.3450	1.74e-62	5d4y:B
15	3nj3:A	327	319	0.3101	0.3394	0.3480	6.09e-57	3nj3:B, 1vbr:A, 1vbr:B
16	3cuf:A	314	334	0.3212	0.3662	0.3443	9.03e-53	3cug:A, 3cuh:A, 3cui:A, 3cuj:A, 1exp:A, 1fh7:A, 1fh8:A, 1fh9:A, 1fhd:A, 2his:A, 1j01:A, 2xyl:A
17	1us2:A	507	363	0.3464	0.2446	0.3416	1.75e-49	1gny:A
18	1b30:A	302	321	0.2821	0.3344	0.3146	2.71e-47	1b3v:A, 1b3w:A, 1b3x:A, 1b3y:A, 1b3z:A, 1bg4:A
19	2wys:B	516	370	0.3184	0.2209	0.3081	5.29e-46	2w5f:A, 2w5f:B, 2wys:A, 2wze:A, 2wze:B
20	1isv:A	436	348	0.3017	0.2477	0.3103	2.43e-45	2d20:A, 2d20:B, 2d22:A, 2d22:B, 2d23:A, 2d23:B, 2d24:A, 2d24:B, 1e0v:A, 1e0x:A, 1e0x:B, 2g3j:A, 5gqd:A, 5gqd:B, 5gqe:A, 5gqe:B, 1isv:B, 1isw:A, 1isw:B, 1isx:A, 1isx:B, 1isy:A, 1isy:B, 1isz:A, 1isz:B, 1it0:A, 1it0:B, 1od8:A, 1v0k:A, 1v0l:A, 1v0m:A, 1v0n:A, 1v6u:A, 1v6u:B, 1v6v:A, 1v6v:B, 1v6w:A, 1v6w:B, 1v6x:A, 1v6x:B
21	3u7b:B	326	323	0.2765	0.3037	0.3065	9.84e-42
22	1w3h:A	348	373	0.3408	0.3506	0.3271	3.94e-41	1clx:A, 1clx:B, 1clx:C, 1clx:D, 1e5n:A, 1e5n:B, 1w2p:A, 1w2p:B, 1w2v:A, 1w2v:B, 1w32:A, 1w32:B, 1w3h:B
23	7k4u:A	305	324	0.2793	0.3279	0.3086	5.92e-41	2bnj:A, 4bs0:A, 4bs0:B, 8fos:A, 1goq:A, 1gor:A, 7k4q:A, 7k4q:B, 7k4w:A, 7k4x:A, 7k4x:B, 7k4z:A, 8kh3:A, 3nyd:A, 3nyd:B, 8rd5:A, 8rd5:B, 5rga:A, 5rga:B, 5rgb:A, 5rgb:B, 5rgc:A, 5rgc:B, 5rgd:A, 5rgd:B, 5rge:A, 5rgf:A, 5rgf:B, 6srw:A, 6srw:B, 6sry:A, 6sry:B, 6srz:A, 6srz:B, 6ss1:A, 6ss1:B, 6ss3:A, 6ss3:B, 6tu6:A, 6tu6:B, 6tu6:C, 6tu6:D, 6tu6:E, 6tu6:F, 6tu6:G, 6tu6:H, 6tu6:I, 6tu6:J, 6tu6:K, 6tu6:L, 6tu6:M, 6tu6:N, 6tu6:O, 6tu6:P, 8usf:A, 8usf:B, 8ush:A, 8ush:B, 8usj:A, 8usj:B, 8usj:C, 8usl:A, 8usl:B
24	6jdy:A	319	312	0.2849	0.3197	0.3269	7.20e-39	6jdy:B, 6jdz:A, 6jdz:B, 6je0:A, 6je0:B, 6je1:A, 6je1:B, 6je2:A, 6je2:B, 7wh7:A, 7wh7:B, 7whe:B
25	4xx6:B	321	311	0.2765	0.3084	0.3183	2.24e-37	4xx6:A
26	3wub:A	313	329	0.2877	0.3291	0.3131	3.94e-35	3wue:A, 3wuf:A, 3wug:A
27	5xzu:A	334	289	0.2486	0.2665	0.3080	4.28e-33
28	6q8n:A	321	306	0.2402	0.2679	0.2810	9.80e-28	6q8n:B
29	4pmx:A	306	289	0.2039	0.2386	0.2526	2.27e-13	4pmy:A, 4pmy:B, 4pmz:A, 4pmz:B, 4pn2:A, 4pn2:B
30	7d88:A	364	243	0.1732	0.1703	0.2551	9.89e-10	7d89:A
31	8ibt:A	694	134	0.0866	0.0447	0.2313	0.18	8ibs:A, 8ibs:B, 8ibs:C, 8ibs:D, 8ibs:E, 8ibs:F, 8ibt:B
32	4dem:F	346	37	0.0391	0.0405	0.3784	0.96	3b7l:A, 5cg5:A, 5cg6:A, 3cp6:A, 5dgm:F, 5dgn:F, 5dgs:F, 5diq:F, 5djp:F, 5djr:F, 5djv:F, 2f7m:F, 2f89:F, 2f8c:F, 2f8z:F, 2f92:F, 2f94:F, 2f9k:F, 4ga3:A, 4h5c:F, 4h5d:F, 4h5e:F, 5ja0:F, 5juz:F, 4jvj:F, 5jv0:F, 5jv1:F, 5jv2:F, 4kfa:A, 4kpd:A, 4kpj:A, 4kq5:A, 4kqs:A, 4kqu:A, 5ksx:F, 4l2x:F, 4lfv:F, 4lpg:F, 4lph:F, 3n1v:F, 3n1w:F, 4n1z:F, 3n3l:F, 3n45:F, 3n46:F, 3n49:F, 3n5h:F, 3n5j:F, 3n6k:F, 6n7y:F, 6n7z:F, 6n82:F, 6n83:F, 4n9u:A, 4nfi:F, 4nfj:F, 4nfk:F, 4ng6:A, 4nke:A, 4nkf:A, 4nua:A, 6oag:F, 6oah:F, 4ogu:A, 2opm:A, 2opn:A, 4p0v:A, 4p0w:A, 4p0x:A, 4pvx:F, 4pvy:F, 4q23:A, 2qis:A, 4qpf:A, 4qxs:F, 2rah:A, 4rxa:A, 3rye:A, 3s4j:A, 2vf6:A, 5ygi:A, 1yq7:A, 1yv5:A, 1zw5:A
33	3zmr:A	469	87	0.0782	0.0597	0.3218	1.2	3zmr:B
34	3v76:A	390	73	0.0475	0.0436	0.2329	1.8
35	8etg:E	145	31	0.0391	0.0966	0.4516	2.1
36	4a0g:D	709	56	0.0531	0.0268	0.3393	2.9
37	4a0g:C	681	56	0.0531	0.0279	0.3393	2.9
38	8eui:E	183	31	0.0391	0.0765	0.4516	3.0	8esq:E, 8esr:E, 8etc:E, 8eth:E, 8eti:E, 8etj:E, 8eug:E, 8eup:E, 8euy:E, 8ev3:E
39	8dmf:A	718	52	0.0447	0.0223	0.3077	3.1	7uvp:A
40	7awt:B	141	84	0.0615	0.1560	0.2619	3.6
41	7alp:U	1935	48	0.0475	0.0088	0.3542	4.4
42	8asd:A	1826	48	0.0475	0.0093	0.3542	4.7
43	8r6y:A	1991	48	0.0475	0.0085	0.3542	4.8	8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
44	8asb:A	1715	48	0.0475	0.0099	0.3542	5.0	8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
45	4ipn:E	463	29	0.0363	0.0281	0.4483	5.0	4ipn:B
46	3qom:A	479	29	0.0335	0.0251	0.4138	5.0
47	6lvw:A	668	104	0.0754	0.0404	0.2596	6.1
48	5bxp:A	636	87	0.0615	0.0346	0.2529	6.3	5bxp:B, 5bxr:A, 5bxr:B, 5bxs:A, 5bxs:B, 5bxt:A, 5bxt:B, 4h04:A, 4h04:B, 4jaw:A, 4jaw:B
49	4a0f:A	746	27	0.0363	0.0174	0.4815	7.0
50	4a0g:A	769	27	0.0363	0.0169	0.4815	7.2	4a0f:B, 4a0g:B, 4a0h:A, 4a0h:B, 4a0r:A, 4a0r:B

[Back]