BioLiP

>protein
DQNKDIQDLLDKIVFDAQHGQIWFDENRMLLMHTSILGFLRKDLYQMLGLERTKRFFIRCGYQAGMRDAEVTSKLRPNNE
AEAFMAGPQMHGIRGMVQVEVNELHLSHDLKQFYADFNWLNSFEAEVHLSEFPASDQPACWMLLGYACGYSSFVMGQTII
YQETHCVAQGDEHCRIIGKPLSEWENADELI

The query sequence (length=191) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5kbe:B	206	188	0.9686	0.8981	0.9840	1.16e-139	5kbe:A, 5kbg:A, 5kbg:B, 5kbh:A, 5kbh:B, 5kbi:A, 5kbi:B, 7vqf:A
2	6iy8:A	469	175	0.4084	0.1663	0.4457	4.48e-56	6iy8:B, 6iy8:C, 6iy8:D
3	5frw:A	201	184	0.3874	0.3682	0.4022	5.55e-52	5fru:A, 5fru:B, 5frv:A, 5frv:B, 5frw:B, 5frx:A, 5frx:B, 5fry:A, 5fry:B, 5frz:A, 5frz:B, 5fs0:A, 5fs0:B
4	3my0:K	261	41	0.0838	0.0613	0.3902	0.50	3my0:J, 3my0:X
5	3my0:N	300	35	0.0733	0.0467	0.4000	1.4	3my0:A, 3my0:B, 3my0:C, 3my0:D, 3my0:E, 3my0:F, 3my0:G, 3my0:H, 3my0:I, 3my0:L, 3my0:M, 3my0:O, 3my0:P, 3my0:Q, 3my0:R, 3my0:S, 3my0:T, 3my0:U, 3my0:V, 3my0:W
6	6z1p:Ad	374	42	0.0785	0.0401	0.3571	1.7
7	5ktk:A	452	81	0.1152	0.0487	0.2716	3.4
8	5mtv:A	379	55	0.0890	0.0449	0.3091	6.7	5mvf:A
9	3jyg:A	180	84	0.1099	0.1167	0.2500	7.2	3jyg:B, 3jyg:C, 3jyg:D, 3jyg:E, 3jyg:F
10	6i1s:A	322	35	0.0628	0.0373	0.3429	7.8	7a21:A, 7a21:B, 6acr:A, 6acr:B, 4bgg:A, 4bgg:B, 4bgg:C, 4bgg:D, 4c02:A, 7c3g:A, 7c3g:B, 8c7w:A, 8c7z:A, 4dym:A, 6eix:A, 6gi6:A, 6gin:A, 6gin:B, 6gip:A, 3h9r:A, 6jux:A, 3mtf:A, 3mtf:B, 7nns:B, 3oom:A, 5oxg:A, 5oxg:B, 5oxg:C, 5oxg:D, 5oy6:A, 5oy6:B, 5oy6:C, 5oy6:D, 8pod:A, 3q4u:A, 3q4u:B, 3q4u:C, 3q4u:D, 8r7g:A, 8r7g:B, 8r7g:C, 8r7g:D, 5s75:A, 5s75:B, 5s76:A, 5s76:B, 5s77:A, 5s77:B, 5s78:A, 5s78:B, 5s79:A, 5s79:B, 5s7a:A, 5s7a:B, 5s7b:A, 5s7b:B, 5s7c:A, 5s7c:B, 5s7d:A, 5s7d:B, 5s7e:A, 5s7e:B, 5s7f:A, 5s7f:B, 5s7g:A, 5s7g:B, 5s7h:A, 5s7h:B, 5s7i:A, 5s7i:B, 5s7j:A, 5s7j:B, 5s7k:A, 5s7k:B, 5s7l:A, 5s7l:B, 5s7m:A, 5s7m:B, 5s7n:A, 5s7n:B, 5s7o:A, 5s7o:B, 5s7p:A, 5s7p:B, 5s7q:A, 5s7q:B, 5s7r:A, 5s7r:B, 5s7s:A, 5s7s:B, 5s7t:A, 5s7t:B, 5s7u:A, 5s7u:B, 5s7v:A, 5s7v:B, 5s7w:A, 5s7w:B, 5s7x:A, 5s7x:B, 5s7y:A, 5s7y:B, 5s7z:A, 5s7z:B, 5s80:A, 5s80:B, 5s81:A, 5s81:B, 5s82:A, 5s82:B, 5s83:A, 5s83:B, 5s84:A, 5s84:B, 5s85:A, 5s85:B, 5s86:A, 5s86:B, 5s87:A, 5s87:B, 5s88:A, 5s88:B, 5s89:A, 5s89:B, 5s8a:A, 5s8a:B, 5s8b:A, 5s8b:B, 5s9k:A, 5s9k:B, 6srh:A, 6srh:B, 6szm:A, 6szm:B, 6t6d:A, 6t6d:B, 6t6d:C, 6t6d:D, 6t8n:A, 6t8n:B, 6tn8:A, 6unq:A, 6unr:A, 6uns:A, 6uns:B, 6z36:A, 6z36:B, 6zgc:A, 6zgc:B, 6zgc:C, 6zgc:D
11	6l8n:A	810	88	0.1047	0.0247	0.2273	9.4

[Back]