Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DQKQFEKIRAVFDRSGVALTLVDMSLPEQPLVLANPPFLRMTGYTEGQILGFNCRFLQRGDENAQARADIRDALKLGREL
QVVLRNYRANDEPFDNLLFLHPVGGRPDAPDYFLGSQFELGRSGNSEEAAAAGHAGYLTGELARIGTVAARLEMDSRRHL
AQAAAALVRAWERRG

The query sequence (length=175) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4hj6:B 178 175 0.9943 0.9775 0.9943 6.31e-126 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
2 6hmj:A 359 112 0.2514 0.1226 0.3929 4.32e-20 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
3 4wuj:C 145 111 0.2343 0.2828 0.3694 5.23e-20 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
4 8c05:A 305 99 0.2343 0.1344 0.4141 9.91e-19
5 7yx0:A 166 146 0.2743 0.2892 0.3288 1.98e-18 7yx0:C
6 8qi8:A 110 103 0.2286 0.3636 0.3883 2.35e-18 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
7 2z6d:A 118 105 0.2171 0.3220 0.3619 4.14e-18 2z6d:B
8 4r3a:A 318 111 0.2171 0.1195 0.3423 4.27e-17 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
9 4eeu:A 109 102 0.2400 0.3853 0.4118 1.10e-16 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
10 7r5n:B 151 91 0.2114 0.2450 0.4066 1.60e-16 7r5n:A
11 6ph4:B 460 113 0.2343 0.0891 0.3628 2.26e-16 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
12 6t74:B 141 82 0.2000 0.2482 0.4268 2.86e-16 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
13 3ue6:E 138 82 0.2057 0.2609 0.4390 3.16e-16 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
14 7a6p:A 149 121 0.2343 0.2752 0.3388 4.28e-16 7a6p:B
15 7r56:A 137 115 0.2229 0.2847 0.3391 8.55e-16 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
16 4gcz:B 378 153 0.2686 0.1243 0.3072 8.95e-16 4gcz:A
17 8a6x:B 368 149 0.2686 0.1277 0.3154 1.45e-15 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
18 4hhd:A 152 110 0.2000 0.2303 0.3182 1.66e-15 4hhd:B
19 2z6c:A 121 105 0.1943 0.2810 0.3238 1.73e-15 2z6c:B
20 7qf2:AAA 117 103 0.2343 0.3504 0.3981 1.82e-15 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
21 6i21:A 135 82 0.1886 0.2444 0.4024 2.91e-15 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
22 1g28:A 104 103 0.2114 0.3558 0.3592 3.27e-15 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
23 4r3a:B 278 106 0.2114 0.1331 0.3491 5.01e-15
24 2mwg:A 261 125 0.2286 0.1533 0.3200 8.10e-15 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
25 2wkp:A 320 101 0.2057 0.1125 0.3564 1.57e-14 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
26 7tbq:A 375 110 0.2114 0.0987 0.3364 6.61e-14 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
27 3hjk:A 150 116 0.2171 0.2533 0.3276 7.75e-14 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
28 8a5r:AAA 206 110 0.2000 0.1699 0.3182 1.17e-13 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
29 6gb3:A 120 112 0.2229 0.3250 0.3482 2.79e-13 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
30 5hzh:A 320 101 0.2000 0.1094 0.3465 4.17e-13
31 5hzi:A 476 110 0.2057 0.0756 0.3273 4.53e-13 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
32 7tcd:A 436 101 0.1943 0.0780 0.3366 5.01e-13 4wf0:A, 4wf0:B
33 8pm1:A 109 93 0.1886 0.3028 0.3548 1.34e-12 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
34 5svu:B 135 111 0.2114 0.2741 0.3333 7.59e-12 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
35 8j68:A 129 90 0.1829 0.2481 0.3556 1.60e-10 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
36 7wa4:B 107 91 0.1771 0.2897 0.3407 3.34e-08
37 7oo9:A 106 94 0.1886 0.3113 0.3511 3.50e-07 7oo9:B
38 2gj3:A 119 110 0.1486 0.2185 0.2364 0.15 2gj3:B
39 3ewk:A 227 87 0.1200 0.0925 0.2414 0.30
40 3zhf:A 123 45 0.0914 0.1301 0.3556 0.62 2ymt:A
41 8dik:A 127 64 0.0914 0.1260 0.2500 1.3 8dik:B
42 4pxl:A 486 57 0.1257 0.0453 0.3860 2.6 4pxl:B
43 3was:A 389 41 0.0800 0.0360 0.3415 4.9 4kmi:A, 4kmi:B, 3was:B, 3wat:A, 3wat:B, 3wau:A, 3wau:B
44 2wvz:B 742 38 0.0629 0.0148 0.2895 9.3 2wvx:A, 2wvx:B, 2wvx:C, 2wvx:D, 2wvz:A, 2wvz:C, 2wvz:D, 2ww0:A, 2ww0:B, 2ww0:C, 2ww0:D, 2ww0:E, 2ww0:F, 2ww0:G, 2ww0:H, 2ww1:A, 2ww1:B, 2ww1:C, 2ww1:D, 2ww3:A, 2ww3:B, 2ww3:C, 2ww3:D, 2ww3:E, 2ww3:F, 2wzs:A, 2wzs:B, 2wzs:C, 2wzs:D, 2wzs:E, 2wzs:F, 2wzs:G, 2wzs:H

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218