BioLiP

>protein
DQKLSDFHAESGGCESCHKDGTPSADGAFEFAQCQSCHGKLSEMDAVHKPHDGNLVCADCHAVHDMNVGQKPTCESCHDD
GRTSASVL

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ee7:A	91	88	1.0000	0.9670	1.0000	9.19e-61	1m1p:A, 1m1p:B, 1m1p:C, 1m1p:D, 1m1p:E, 1m1p:F, 1m1q:A, 1m1r:A
2	6hr0:A	90	88	0.8523	0.8333	0.8523	1.68e-51
3	2k3v:A	86	84	0.6591	0.6744	0.6905	2.64e-40
4	1d4c:A	570	90	0.4091	0.0632	0.4000	6.93e-13	1d4c:C, 1d4c:B, 1d4c:D, 1d4d:A, 1d4e:A
5	2b7r:A	568	88	0.3636	0.0563	0.3636	1.18e-06	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
6	1qo8:A	564	82	0.3409	0.0532	0.3659	1.32e-06	1qo8:D
7	2r6f:B	879	37	0.1591	0.0159	0.3784	0.005
8	2r6f:A	899	37	0.1591	0.0156	0.3784	0.005
9	3uwx:A	945	37	0.1591	0.0148	0.3784	0.005
10	3ux8:A	564	34	0.1477	0.0230	0.3824	0.024
11	1gws:A	503	80	0.2727	0.0477	0.3000	0.11	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
12	4g6f:B	235	72	0.2045	0.0766	0.2500	0.13	4g6f:H, 5ghw:H, 5iq7:H, 5iq9:A, 5iq9:H, 4u6g:H, 4u6g:A, 6vpx:H, 6vpx:K, 6vpx:M
13	7w1y:4	653	39	0.1818	0.0245	0.4103	0.43	7w1y:C, 6xtx:4, 6xty:4
14	8b9d:4	677	39	0.1818	0.0236	0.4103	0.43	7pfo:4, 7plo:4
15	6lod:A	218	29	0.1250	0.0505	0.3793	0.81	6loe:A
16	3zqj:C	890	53	0.1591	0.0157	0.2642	0.86
17	3zqj:D	921	53	0.1591	0.0152	0.2642	0.86	3zqj:B, 3zqj:E
18	3zqj:A	944	53	0.1591	0.0148	0.2642	0.86
19	1qn0:A	112	56	0.2273	0.1786	0.3571	0.98	1qn1:A, 1wad:A
20	2ozy:A	142	63	0.2159	0.1338	0.3016	1.0	2p0b:A
21	6btm:A	221	50	0.1477	0.0588	0.2600	1.5
22	8eik:E	378	65	0.1705	0.0397	0.2308	1.6
23	8eik:C	407	65	0.1705	0.0369	0.2308	2.0
24	8eii:B	439	65	0.1705	0.0342	0.2308	2.0	8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
25	6f0k:A	207	29	0.1136	0.0483	0.3448	3.2
26	1z9n:A	155	28	0.1023	0.0581	0.3214	4.3	1z9n:B, 1z9n:C, 1z9n:D, 1z9p:A, 1z9p:B
27	4ltu:A	106	29	0.1364	0.1132	0.4138	4.4	4ltu:B
28	1duw:A	289	75	0.2614	0.0796	0.3067	4.5
29	1gks:A	78	20	0.1250	0.1410	0.5500	5.3
30	1pft:A	50	24	0.0909	0.1600	0.3333	5.8
31	7dxg:A	698	64	0.2273	0.0287	0.3125	6.6	7dxf:A, 7dxf:D, 7dxf:B, 7dxf:C, 7dxg:D, 7dxg:C, 7dxg:B
32	8pj1:s	159	38	0.1250	0.0692	0.2895	7.0	7a09:4, 8oz0:U, 8ppl:Is, 7qp6:s, 6ybv:s, 6zmw:s, 6zp4:4
33	8hmc:B	1195	67	0.2159	0.0159	0.2836	7.6	8hmd:B
34	8k5o:C	346	77	0.2273	0.0578	0.2597	7.7
35	8eih:D	256	32	0.1250	0.0430	0.3438	9.0

[Back]