BioLiP

>protein
DQKLSDFHAEGGCESCHKDGTPSADGAFEFAQCQSCHGKLSEMDAVHKPHDGNLVCADCHAVHDMNVGQKPTCESCHDDG
RTSASVLKK

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ee7:A	91	90	1.0000	0.9780	0.9889	9.20e-60	1m1p:A, 1m1p:B, 1m1p:C, 1m1p:D, 1m1p:E, 1m1p:F, 1m1q:A, 1m1r:A
2	6hr0:A	90	89	0.8539	0.8444	0.8539	1.00e-50
3	2k3v:A	86	84	0.6517	0.6744	0.6905	1.11e-38
4	1d4c:A	570	90	0.4045	0.0632	0.4000	1.89e-08	1d4c:C, 1d4c:B, 1d4c:D, 1d4d:A, 1d4e:A
5	2b7r:A	568	88	0.3596	0.0563	0.3636	1.99e-05	2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
6	2r6f:B	879	37	0.1685	0.0171	0.4054	0.015
7	2r6f:A	899	37	0.1685	0.0167	0.4054	0.015
8	3uwx:A	945	37	0.1685	0.0159	0.4054	0.015
9	3ux8:A	564	34	0.1573	0.0248	0.4118	0.065
10	1gws:A	503	80	0.2697	0.0477	0.3000	0.13	2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
11	1qn0:A	112	84	0.3034	0.2411	0.3214	0.19	1qn1:A, 1wad:A
12	8b9d:4	677	39	0.1798	0.0236	0.4103	0.45	7pfo:4, 7plo:4
13	7w1y:4	653	39	0.1798	0.0245	0.4103	0.48	7w1y:C, 6xtx:4, 6xty:4
14	8eik:E	378	67	0.1798	0.0423	0.2388	0.52
15	8eii:B	439	67	0.1798	0.0364	0.2388	0.64	8eih:A, 8eih:B, 8eih:C, 8eii:A, 8eii:C, 8eij:A, 8eij:B, 8eik:A, 8eik:B, 6kda:A, 6kda:D, 6kdb:A, 6kdb:D, 6kdl:A, 6kdl:D, 6kdp:A, 6kdp:D, 6kdt:A, 6kdt:D, 7o45:A, 7o45:B, 7o45:C, 6u8p:A, 6u8p:D, 6u8v:A, 6u8v:D, 6u8w:A, 6u8w:D, 6u8x:A, 6u8x:D, 6u90:A, 6u90:D, 6u91:A, 6u91:D, 7v0e:A, 7v0e:B, 7v0e:C, 7v0e:D, 7v0e:E, 7v0e:F, 7v0e:G, 7v0e:H, 7x9d:A, 7x9d:D
16	8eik:C	407	67	0.1798	0.0393	0.2388	0.66
17	6lod:A	218	29	0.1236	0.0505	0.3793	0.84	6loe:A
18	2ozy:A	142	63	0.2135	0.1338	0.3016	1.0	2p0b:A
19	6btm:A	221	50	0.1461	0.0588	0.2600	1.8
20	3zqj:C	890	53	0.1685	0.0169	0.2830	2.3
21	3zqj:D	921	53	0.1685	0.0163	0.2830	2.3	3zqj:B, 3zqj:E
22	3zqj:A	944	53	0.1685	0.0159	0.2830	2.3
23	7dxg:A	698	64	0.2360	0.0301	0.3281	2.8	7dxf:A, 7dxf:D, 7dxf:B, 7dxf:C, 7dxg:D, 7dxg:C, 7dxg:B
24	6f0k:A	207	29	0.1124	0.0483	0.3448	3.1
25	1duw:A	289	75	0.2584	0.0796	0.3067	3.5
26	4ltu:A	106	29	0.1348	0.1132	0.4138	4.5	4ltu:B
27	1gks:A	78	20	0.1236	0.1410	0.5500	4.8
28	1z9n:A	155	28	0.1011	0.0581	0.3214	5.1	1z9n:B, 1z9n:C, 1z9n:D, 1z9p:A, 1z9p:B
29	1pft:A	50	24	0.0899	0.1600	0.3333	6.2
30	3ov0:A	318	97	0.3483	0.0975	0.3196	7.4	3oue:A, 3ouq:A, 1rwj:A
31	8eih:D	256	32	0.1236	0.0430	0.3438	9.0
32	6v59:A	419	16	0.1011	0.0215	0.5625	9.6	6nx0:A, 6v59:B

[Back]