Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
DQCETSPCQNQGKCKDGLGEYTCTCLEGFEGKNCELFTRKLCSLDNGDCDQFCHEEQNSVVCSCARGYTLADNGKACIPT
GPYPCGKQTLE

The query sequence (length=91) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1xkb:A 91 91 1.0000 1.0000 1.0000 1.81e-62 3k9x:A
2 1p0s:L 99 53 0.5714 0.5253 0.9811 7.78e-34 2y80:B
3 8eph:A 91 91 0.5275 0.5275 0.5275 1.17e-26 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
4 2vwn:L 44 51 0.4835 1.0000 0.8627 9.56e-23 2vwo:L
5 6r2w:L 143 90 0.4725 0.3007 0.4778 2.45e-21 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
6 3h5c:B 312 90 0.4286 0.1250 0.4333 5.28e-15
7 7alj:A 115 71 0.3187 0.2522 0.4085 2.88e-10
8 7alj:A 115 36 0.1538 0.1217 0.3889 3.38e-04
9 5vyg:B 43 37 0.2527 0.5349 0.6216 7.20e-10 5vyg:A, 5vyg:C
10 5ky2:B 40 35 0.2308 0.5250 0.6000 1.13e-08 5ky3:B
11 4xlw:C 118 72 0.2857 0.2203 0.3611 1.75e-08 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
12 4xlw:C 118 64 0.2308 0.1780 0.3281 1.25e-04 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
13 4xlw:C 118 35 0.1648 0.1271 0.4286 2.41e-04 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
14 4d0f:A 125 72 0.2967 0.2160 0.3750 2.43e-08 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
15 4d0f:A 125 64 0.2308 0.1680 0.3281 9.69e-05 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
16 4d0f:A 125 41 0.1648 0.1200 0.3659 2.40e-04 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
17 5l0t:B 40 35 0.2088 0.4750 0.5429 1.17e-07 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
18 5mwb:A 118 72 0.2857 0.2203 0.3611 1.89e-07
19 5mwb:A 118 64 0.2198 0.1695 0.3125 4.75e-04
20 5mwb:A 118 36 0.1429 0.1102 0.3611 0.002
21 4bxw:B 287 48 0.2198 0.0697 0.4167 2.86e-06 4bxw:A
22 4xbm:B 401 36 0.2198 0.0499 0.5556 8.47e-06
23 4xbm:B 401 65 0.2527 0.0574 0.3538 0.016
24 4xbm:B 401 34 0.1758 0.0399 0.4706 0.10
25 4xbm:B 401 25 0.1319 0.0299 0.4800 6.3
26 5uk5:A 194 35 0.1758 0.0825 0.4571 6.14e-05 2rqz:A, 2rr2:A
27 5uk5:A 194 64 0.2308 0.1082 0.3281 3.12e-04 2rqz:A, 2rr2:A
28 5uk5:A 194 83 0.2967 0.1392 0.3253 0.008 2rqz:A, 2rr2:A
29 5uk5:A 194 77 0.2198 0.1031 0.2597 5.0 2rqz:A, 2rr2:A
30 5fm9:A 154 87 0.2967 0.1753 0.3103 9.62e-05 5fma:A, 5fma:B
31 5fm9:A 154 34 0.1978 0.1169 0.5294 0.004 5fma:A, 5fma:B
32 5fm9:A 154 34 0.1429 0.0844 0.3824 0.66 5fma:A, 5fma:B
33 5f1a:A 553 42 0.2088 0.0344 0.4524 1.65e-04 5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
34 4d90:A 127 36 0.1648 0.1181 0.4167 0.001 4d90:B
35 4d90:A 127 32 0.1429 0.1024 0.4062 2.2 4d90:B
36 4d90:A 127 40 0.1538 0.1102 0.3500 6.0 4d90:B
37 1g1q:A 160 34 0.1648 0.0938 0.4412 0.002 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
38 1lmj:A 86 87 0.2967 0.3140 0.3103 0.002
39 3poy:A 1005 34 0.1648 0.0149 0.4412 0.003 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
40 6l6r:A 610 38 0.1538 0.0230 0.3684 0.010 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
41 6l6r:A 610 37 0.1319 0.0197 0.3243 0.012 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
42 4c16:A 280 65 0.2198 0.0714 0.3077 0.037 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
43 5uk5:B 308 30 0.1648 0.0487 0.5000 0.056 4cbz:A, 4cc0:A, 4cc0:B, 4cc1:A, 4cc1:B
44 8em7:A 4378 71 0.2308 0.0048 0.2958 0.081 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
45 8em7:A 4378 74 0.2527 0.0053 0.3108 4.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
46 8em7:A 4378 30 0.1209 0.0025 0.3667 5.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
47 8em7:A 4378 39 0.1429 0.0030 0.3333 5.4 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
48 4rs0:A 557 40 0.1978 0.0323 0.4500 0.083 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
49 8em4:A 3818 71 0.2308 0.0055 0.2958 0.090 8em4:B
50 8em4:A 3818 39 0.1429 0.0034 0.3333 5.0 8em4:B
51 8em4:A 3818 74 0.2527 0.0060 0.3108 5.5 8em4:B
52 8em4:A 3818 30 0.1209 0.0029 0.3667 5.5 8em4:B
53 5ckn:A 278 33 0.1429 0.0468 0.3939 0.13 5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G
54 7nxd:B 690 65 0.2198 0.0290 0.3077 0.15 7ceb:B, 7cec:B, 9ckv:B, 7nwl:B, 3vi3:B, 3vi3:D, 3vi4:D, 3vi4:B, 4wjk:B, 4wk0:B, 4wk2:B, 4wk4:B
55 1szb:A 167 29 0.1319 0.0719 0.4138 0.23 1szb:B
56 3v64:C 338 36 0.1538 0.0414 0.3889 0.32 3v64:D
57 3v64:C 338 69 0.1978 0.0533 0.2609 2.9 3v64:D
58 7lyu:B 371 36 0.1429 0.0350 0.3611 0.33 7lyu:A
59 1emn:A 82 31 0.1758 0.1951 0.5161 0.42 1emo:A
60 4aqb:A 345 29 0.1209 0.0319 0.3793 0.91 5ckq:A, 3dem:A, 3dem:B
61 2w86:A 147 25 0.1429 0.0884 0.5200 1.3
62 7ajt:JA 812 67 0.2088 0.0234 0.2836 1.4 7d63:RL, 6ke6:RL, 6lqp:RL, 6lqq:RL, 6lqr:RL, 6lqu:RL, 6lqv:RL, 7suk:LX, 6zqb:JA, 6zqc:JA
63 3cfw:A 156 34 0.1209 0.0705 0.3235 1.5 5vc1:A
64 7nx4:A 348 28 0.1319 0.0345 0.4286 2.2
65 1ktg:A 137 32 0.1319 0.0876 0.3750 2.4 1ktg:B
66 7pfp:A 563 69 0.2088 0.0337 0.2754 4.0 7pfp:C, 7q3n:U
67 1n7d:A 639 73 0.2308 0.0329 0.2877 5.2 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
68 6vv5:A 1097 23 0.0989 0.0082 0.3913 5.8 6vv5:B, 6vv5:C
69 6u7k:A 1064 23 0.0989 0.0085 0.3913 5.9
70 7y6t:A 1124 23 0.0989 0.0080 0.3913 6.5
71 7y6t:C 1098 23 0.0989 0.0082 0.3913 6.5
72 6zwm:B 2185 19 0.0879 0.0037 0.4211 6.7 6zwm:A
73 7w6m:A 1224 23 0.0989 0.0074 0.3913 6.8 7w6m:C, 7w6m:B, 7w73:C, 7w73:A, 7y6t:B, 7y6u:A
74 3t5o:A 871 35 0.1538 0.0161 0.4000 7.2
75 4a5w:B 871 35 0.1538 0.0161 0.4000 7.2
76 8fr7:A 1275 23 0.0989 0.0071 0.3913 7.3 8fr7:C, 8fr7:B
77 8wai:A 277 23 0.1209 0.0397 0.4783 7.8 8kce:A, 8wai:B
78 4e0s:B 898 35 0.1538 0.0156 0.4000 7.8 7nyc:B, 7nyd:B
79 6a48:A 651 32 0.1099 0.0154 0.3125 9.9

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218