BioLiP

>protein
DPILTGVAHDRSEAKVTIVGLPDIPGYAAKVFRAVADADVNIDMVLQNVSKVEDGKTDITFTCSRDVGPAAVEKLDSLRN
EIGFSQLLYDDHIGKVSLIGAGMRSHPGVTATFCEALAAVGVNIELISTSEIRISVLCRDTELDKAVVALHEAFGL

The query sequence (length=156) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4go7:X	165	156	0.9872	0.9333	0.9872	8.34e-109	3s1t:A, 3s1t:B
2	3aaw:C	392	156	0.6667	0.2653	0.6667	1.27e-66	3aaw:A, 3aaw:B, 3aaw:D, 3ab2:A, 3ab2:B, 3ab2:C, 3ab2:D, 3ab2:E, 3ab2:F, 3ab2:G, 3ab2:H, 3ab2:I, 3ab2:J, 3ab2:K, 3ab2:L, 3ab2:M, 3ab2:N, 3ab2:O, 3ab2:P, 3ab4:B, 3ab4:D, 3ab4:F, 3ab4:H, 3ab4:J, 3ab4:K, 3ab4:L, 3ab4:M, 3ab4:N, 3ab4:P, 2dtj:A, 2dtj:B
3	3ab4:A	370	156	0.6474	0.2730	0.6474	1.08e-62	3ab4:C, 3ab4:E, 3ab4:G, 3ab4:I, 3ab4:O
4	5yei:C	397	156	0.4679	0.1839	0.4679	6.66e-40	5yei:D, 5yei:B, 5yei:A, 5yei:F, 5yei:E, 5yei:H, 5yei:G
5	2re1:A	148	153	0.4103	0.4324	0.4183	7.04e-37
6	2dt9:A	153	151	0.3974	0.4052	0.4106	2.82e-35	2dt9:B
7	3l76:A	585	159	0.3846	0.1026	0.3774	1.06e-26	3l76:B
8	3l76:A	585	159	0.3974	0.1060	0.3899	3.65e-25	3l76:B
9	3c1m:C	468	170	0.3141	0.1047	0.2882	2.98e-11	3c1m:A, 3c1m:B, 3c1m:D, 3c1n:A, 3c1n:B, 3c1n:C, 3c1n:D, 3c20:A, 3c20:B, 2hmf:A, 2hmf:B, 2hmf:C, 2hmf:D
10	3c1m:C	468	66	0.1538	0.0513	0.3636	3.53e-04	3c1m:A, 3c1m:B, 3c1m:D, 3c1n:A, 3c1n:B, 3c1n:C, 3c1n:D, 3c20:A, 3c20:B, 2hmf:A, 2hmf:B, 2hmf:C, 2hmf:D
11	2cdq:A	470	132	0.2436	0.0809	0.2879	0.011	2cdq:B
12	3tvi:E	439	61	0.1282	0.0456	0.3279	0.012	3tvi:A, 3tvi:B, 3tvi:C, 3tvi:D, 3tvi:G, 3tvi:H, 3tvi:I, 3tvi:L
13	3tvi:E	439	33	0.0769	0.0273	0.3636	5.1	3tvi:A, 3tvi:B, 3tvi:C, 3tvi:D, 3tvi:G, 3tvi:H, 3tvi:I, 3tvi:L
14	5gt9:B	263	30	0.0769	0.0456	0.4000	0.75	5gt9:A
15	5fii:B	78	66	0.1090	0.2179	0.2576	1.3	5fii:A, 5fii:C, 5fii:D
16	5fgj:A	428	66	0.1090	0.0397	0.2576	1.3	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
17	7xtj:B	743	31	0.0769	0.0162	0.3871	6.0	7xtj:A
18	6mve:A	680	25	0.0641	0.0147	0.4000	8.4	6cgl:A, 6cgl:B, 6cgn:A, 6mt9:A, 6mv9:A, 6mv9:B, 6mw3:D, 6mw3:C, 6myx:C, 6myx:D, 6myx:I, 6myx:J

[Back]