Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DPEVIIVGAGVLGSALAAVLSRDGRKVTVIERDLKEPDRIVGEFLQPGGYHVLKDLGLGDTVEGLDAQVVNGYMIHDQES
KSEVQIPYPLSENNQVQSGRAFHHGRFIMSLRKAAMAEPNAKFIEGVVLQLLEEDDVVMGVQYKDKETGDIKELHAPLTV
VADGLFSKFRKSLVSNKVSVSSHFVGFLMKNAPQFKANHAELILANPSPVLIYQISSSETRVLVDIRGEMPRNLREYMVE
KIYPQIPDHLKEPFLEATDNSHLRSMPASFLPPSSVKKRGVLLLGDAYNMRHPLTGGGMTVAFKDIKLWRKLLKGIPDLY
DDAAIFEAKKSFYWARKTSHSFVVNILAQALYELFSATDDSLHQLRKACFLYFKLGGECVAGPVGLLSVLSPNPLVLIGH
FFAVAIYAVYFCFKSEPWITKPRALLSSGAVLYKACSVIFPLIYSEMKY

The query sequence (length=449) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6c6r:A 451 449 1.0000 0.9956 1.0000 0.0 6c6n:A, 6c6n:B, 6c6p:A, 6c6p:B, 6c6r:B
2 6fho:A 368 320 0.1648 0.2011 0.2313 1.09e-08 6sw1:A, 6sw2:A, 2x3n:A
3 5tue:A 388 330 0.1759 0.2036 0.2394 4.73e-07 5tue:B, 5tuf:A, 5tuf:B, 5tui:A, 5tui:B
4 5bva:A 398 319 0.1559 0.1759 0.2194 2.27e-05 5bul:A
5 5dbj:E 437 349 0.1782 0.1831 0.2292 1.23e-04 5dbj:A, 5dbj:B, 5dbj:C, 5dbj:D
6 8er0:A 371 383 0.1893 0.2291 0.2219 2.88e-04 8er0:B, 8er1:A, 6wg9:A, 6wg9:B
7 7epw:A 373 234 0.1292 0.1555 0.2479 4.07e-04 4a6n:A, 4a6n:B, 4a6n:C, 4a6n:D, 4a99:A, 4a99:C, 4a99:B, 4a99:D, 7epv:A, 4guv:A, 4guv:B, 4guv:C, 4guv:D, 3p9u:A, 3p9u:B, 3p9u:C, 3p9u:D, 3v3n:A, 3v3n:B, 3v3n:C, 3v3n:D, 3v3o:A, 3v3o:B, 3v3o:C, 3v3o:D, 2xdo:A, 2xdo:B, 2xdo:C, 2xdo:D, 2xyo:A, 2xyo:B, 2xyo:C, 2xyo:D, 2y6q:A, 2y6q:B, 2y6q:C, 2y6q:D, 2y6r:A, 2y6r:B, 2y6r:C, 2y6r:D
8 3c96:A 381 338 0.1849 0.2178 0.2456 6.46e-04 2rgj:A
9 3nix:A 407 396 0.1938 0.2138 0.2197 0.002 3nix:B, 3nix:C, 3nix:D, 3nix:E, 3nix:F, 3nix:G, 3nix:H
10 8twf:C 385 325 0.1559 0.1818 0.2154 0.002 8twf:D, 8twf:A, 8twf:B
11 8wvb:A 469 180 0.1047 0.1002 0.2611 0.003 8wvb:B, 8wvf:A, 8wvf:B
12 4j34:B 390 361 0.1715 0.1974 0.2133 0.003 4j2w:A, 4j2w:B, 4j31:A, 4j31:B, 4j33:A, 4j33:B, 4j34:A, 4j36:A, 4j36:B, 5x6r:A, 5x6r:B
13 5x68:B 354 334 0.1759 0.2232 0.2365 0.004 5x68:A
14 4hb9:A 376 112 0.0668 0.0798 0.2679 0.008
15 5fn0:A 455 182 0.1069 0.1055 0.2637 0.010 5fn0:B, 5fn0:C, 5fn0:D, 6fox:A, 6fox:B, 6foy:A, 6foy:B, 6foz:A, 6foz:B, 6fp0:A, 6fp0:B, 6fp1:A, 6fp1:B, 6fph:A, 6fph:B, 5mzc:A, 5mzc:B, 5mzi:A, 5mzi:B, 5mzk:A, 5mzk:B, 5n7t:A, 5n7t:B, 5na5:A, 5na5:B, 5nab:A, 5nab:B, 5nae:A, 5nae:B, 5nag:A, 5nag:B, 5nah:A, 5nah:B, 5nak:A, 5nak:B, 5x6p:A, 5x6p:B, 5x6q:A, 5y66:A, 5y77:A, 5y77:B, 5y7a:A
16 7yj0:D 622 187 0.1047 0.0756 0.2513 0.022 7yj0:A, 7yj0:B, 7yj0:C
17 1d7l:A 394 367 0.1849 0.2107 0.2262 0.028 1bf3:A, 1bgj:A, 1bgn:A, 1bkw:A, 1cc4:A, 1cc6:A, 1cj2:A, 1cj3:A, 1cj4:A, 1dob:A, 1doc:A, 1dod:A, 1doe:A, 1ius:A, 1iut:A, 1iuu:A, 1iuv:A, 1iuw:A, 1iux:A, 6ju1:A, 1k0i:A, 1k0j:A, 1k0l:A, 1pbb:A, 1pbc:A, 1pbd:A, 1pbe:A, 1pbf:A, 1pdh:A, 1phh:A, 2phh:A, 1pxa:A, 1pxb:A, 1pxc:A, 8y2s:A, 1ykj:A, 1ykj:B
18 7fco:A 433 334 0.1715 0.1778 0.2305 0.041 7fco:B
19 3i3l:A 550 66 0.0601 0.0491 0.4091 0.041
20 8gu0:B 450 61 0.0490 0.0489 0.3607 0.044 8gu0:A
21 8jqo:A 391 69 0.0512 0.0588 0.3333 0.057 8jqo:B, 8jqo:C, 8jqp:A, 8jqp:B, 8jqq:A, 8jqq:B
22 7osn:B 291 42 0.0356 0.0550 0.3810 0.096 7osn:A, 7osn:C, 7osn:D, 7osn:E, 7osn:F
23 7fgp:A 379 33 0.0356 0.0422 0.4848 0.12 7fgp:B
24 6pvg:A 445 178 0.1002 0.1011 0.2528 0.14 6pvf:A, 6pvh:A, 6pvi:A, 6pvj:A
25 3e1t:A 437 168 0.0958 0.0984 0.2560 0.17
26 4i58:A 451 42 0.0445 0.0443 0.4762 0.22 4i58:B, 4i58:C, 4i58:D, 4i59:A, 4i59:B, 4i59:C, 4i59:D
27 7qf8:A 494 72 0.0512 0.0466 0.3194 0.23
28 8uiu:A 412 61 0.0490 0.0534 0.3607 0.26 8uiu:C, 8uiu:B, 8urc:A, 8urc:C, 8urc:B, 8urd:A, 8urd:B, 8urd:C
29 8gs8:A 614 138 0.0780 0.0570 0.2536 0.28 3abv:A, 3ae1:A, 3ae2:A, 3ae3:A, 3ae4:A, 3ae5:A, 3ae6:A, 3ae7:A, 3ae8:A, 3ae9:A, 3aea:A, 3aeb:A, 3aec:A, 3aed:A, 3aee:A, 3aef:A, 3aeg:A, 8dyd:A, 8dye:A, 2fbw:A, 2fbw:N, 2h88:A, 2h88:N, 2h89:A, 6myo:A, 6myp:A, 6myq:A, 6myr:A, 6mys:A, 6myt:A, 6myu:A, 3sfd:A, 3sfe:A, 6vax:A, 6vax:C, 2wqy:A, 2wqy:N, 1yq3:A, 1yq4:A, 4ytp:A, 4yxd:A, 1zoy:A, 1zp0:A
30 8x38:A 430 60 0.0445 0.0465 0.3333 0.30
31 5jla:D 259 74 0.0512 0.0888 0.3108 0.31 5jla:A, 5jla:B, 5jla:C
32 8j43:A 285 40 0.0379 0.0596 0.4250 0.41 8j43:B
33 1c0i:A 363 33 0.0312 0.0386 0.4242 0.42 1c0k:A, 1c0l:A, 1c0p:A
34 7cyx:A 363 31 0.0290 0.0358 0.4194 0.52 7cyx:B
35 6k1r:A 305 50 0.0468 0.0689 0.4200 0.56 6k1r:B, 6k1r:C, 5zix:A, 5zix:B
36 5z2g:A 477 49 0.0379 0.0356 0.3469 0.66 5z2g:B
37 6awa:A 475 90 0.0579 0.0547 0.2889 0.72 6awa:B, 5tr3:A, 5tr3:B
38 6bza:C 501 55 0.0401 0.0359 0.3273 0.75 6bza:A, 6bza:B, 6bzn:D, 6bzq:A, 6bzq:B, 6bzq:C, 6bzq:D, 6bzt:A, 6bzt:B, 6bzt:C, 6bzt:D, 6bzz:A, 6bzz:B, 6bzz:C, 6bzz:D
39 8j44:A 293 40 0.0334 0.0512 0.3750 0.80 8j44:B, 8whg:B, 8whg:E, 8whg:F
40 3kve:A 484 37 0.0356 0.0331 0.4324 1.1 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
41 1f8w:A 447 74 0.0535 0.0537 0.3243 1.2 1joa:A, 1nhp:A, 1nhq:A, 1nhr:A, 1nhs:A, 1npx:A, 2npx:A
42 5ts5:A 483 37 0.0356 0.0331 0.4324 1.2 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
43 8i4q:A 479 48 0.0312 0.0292 0.2917 1.3 8i4q:B
44 7koe:C 438 30 0.0312 0.0320 0.4667 1.3 7koe:G
45 2q7v:A 313 52 0.0379 0.0543 0.3269 1.3 2q7v:B
46 3urh:B 465 28 0.0334 0.0323 0.5357 1.3 3urh:A
47 1reo:A 484 37 0.0356 0.0331 0.4324 1.4 1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
48 8jat:A 204 40 0.0356 0.0784 0.4000 1.5
49 4y4m:F 262 34 0.0356 0.0611 0.4706 1.5 4y4m:A, 4y4m:B, 4y4m:C, 4y4m:D, 4y4m:E, 4y4m:G, 4y4m:H
50 4x9m:A 384 30 0.0334 0.0391 0.5000 1.7 4x9n:A
51 1f8r:A 483 49 0.0379 0.0352 0.3469 1.7 1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
52 8w14:A 158 72 0.0512 0.1456 0.3194 1.9 8w14:B
53 5tum:A 369 93 0.0512 0.0623 0.2473 1.9 5tum:B
54 5tuk:B 373 324 0.1537 0.1850 0.2130 2.0 5tuk:A, 5tuk:C, 5tuk:D
55 5ocm:A 290 32 0.0290 0.0448 0.4062 2.1 5ocm:F, 5ocm:B, 5ocm:C, 5ocm:D, 5ocm:E
56 7qfd:A 458 44 0.0379 0.0371 0.3864 2.1 7qva:A
57 2vg8:A 465 64 0.0490 0.0473 0.3438 2.3 2vce:A, 2vch:A
58 6gg2:A 494 47 0.0423 0.0385 0.4043 2.3
59 1rsg:A 481 56 0.0423 0.0395 0.3393 2.4
60 4gdp:B 502 56 0.0423 0.0378 0.3393 2.6 3bi2:A, 3bi2:B, 3bi4:A, 3bi4:B, 3bi5:A, 3bi5:B, 3bnm:B, 3bnm:A, 3bnu:B, 3bnu:A, 3cn8:B, 3cn8:A, 3cnd:B, 3cnd:A, 3cnp:B, 3cnp:A, 3cns:A, 3cns:B, 3cnt:B, 3cnt:A, 4ech:A, 4ech:B, 4gdp:A, 4gdp:C, 4gdp:D, 1rsg:B, 1xpq:A, 1xpq:B, 1xpq:C, 1xpq:D, 1yy5:A, 1yy5:B, 1z6l:A, 1z6l:B
61 7exs:A 372 29 0.0312 0.0376 0.4828 2.7
62 2bcg:G 442 32 0.0290 0.0294 0.4062 2.9 1ukv:G
63 1kdg:B 546 45 0.0379 0.0311 0.3778 3.5 1kdg:A, 1naa:A, 1naa:B
64 7ouj:AAA 540 342 0.1670 0.1389 0.2193 3.6
65 2gqf:A 401 54 0.0423 0.0474 0.3519 3.7
66 6b9u:A 244 41 0.0312 0.0574 0.3415 4.0 6b9u:B
67 8jej:A 540 29 0.0290 0.0241 0.4483 4.2 8jek:A, 8k6j:A, 8k6k:A, 7w2j:A, 7w2j:D, 7wsq:A, 7wsq:D, 8xcm:A, 8xcn:A
68 3ihg:A 535 30 0.0312 0.0262 0.4667 4.3 3ihg:B, 3ihg:C
69 1n1e:A 349 41 0.0356 0.0458 0.3902 4.6 1evz:A, 1jdj:A, 1m66:A, 1m67:A, 1n1e:B, 1n1g:A
70 1i8t:A 367 30 0.0290 0.0354 0.4333 4.8 1i8t:B
71 2yg3:B 450 58 0.0557 0.0556 0.4310 5.0 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
72 5ayv:B 303 29 0.0290 0.0429 0.4483 5.0 5ayv:A, 5hws:A, 5hws:B, 5hws:C, 5hws:D
73 2qae:A 465 28 0.0267 0.0258 0.4286 5.6 2qae:B
74 7e0d:A 604 28 0.0267 0.0199 0.4286 5.8 7e0c:A, 2e1m:A, 2e1m:B, 2e1m:C, 8jpw:A
75 4ntd:A 318 69 0.0445 0.0629 0.2899 5.9
76 3rha:A 459 60 0.0535 0.0523 0.4000 6.2 3rha:B
77 3dme:A 366 31 0.0312 0.0383 0.4516 6.3 3dme:B
78 7a3w:B 293 42 0.0356 0.0546 0.3810 6.7 7a3w:A
79 6pxs:A 370 31 0.0290 0.0351 0.4194 7.1 6pxs:B, 6pxs:C, 6pxs:D
80 3f8p:D 310 38 0.0312 0.0452 0.3684 7.4 3f8d:A, 3f8d:B, 3f8d:C, 3f8d:D, 3f8p:A, 3f8p:B, 3f8p:C, 3f8r:A, 3f8r:B, 3f8r:C, 3f8r:D
81 4wuv:A 280 47 0.0356 0.0571 0.3404 7.5 4wuv:B
82 1vg0:A 481 27 0.0267 0.0249 0.4444 7.7
83 6wpu:A 439 29 0.0290 0.0296 0.4483 8.1
84 4dsg:A 473 102 0.0601 0.0571 0.2647 8.4 4dsg:B, 4dsh:A, 4dsh:B
85 8weq:C 394 62 0.0490 0.0558 0.3548 9.3 8weq:A, 8weq:B
86 3oz2:A 397 24 0.0245 0.0277 0.4583 9.7
87 6aon:A 473 84 0.0535 0.0507 0.2857 9.8 6aon:B
88 8uub:A 442 30 0.0267 0.0271 0.4000 9.8
89 6hg8:B 482 31 0.0312 0.0290 0.4516 9.8 2f5z:A, 2f5z:B, 2f5z:C, 2f5z:D, 2f5z:E, 2f5z:F, 2f5z:G, 2f5z:H, 2f5z:I, 2f5z:J, 6hg8:A, 6i4p:A, 6i4p:B, 6i4q:A, 6i4q:B, 6i4r:A, 6i4r:B, 6i4s:A, 6i4s:B, 6i4t:A, 6i4t:B, 6i4u:A, 6i4u:B, 6i4z:A, 6i4z:B, 6i4z:C, 6i4z:D, 6i4z:E, 6i4z:F, 6i4z:G, 6i4z:H, 5j5z:A, 5j5z:B, 5nhg:A, 5nhg:B, 5nhg:C, 5nhg:D, 5nhg:E, 5nhg:F, 5nhg:G, 5nhg:H, 7psc:A, 7psc:B, 3rnm:A, 3rnm:B, 3rnm:C, 3rnm:D, 1zmc:A, 1zmc:B, 1zmc:C, 1zmc:D, 1zmc:E, 1zmc:F, 1zmc:G, 1zmc:H, 1zmd:A, 1zmd:B, 1zmd:C, 1zmd:D, 1zmd:E, 1zmd:F, 1zmd:G, 1zmd:H, 1zy8:A, 1zy8:B, 1zy8:C, 1zy8:D, 1zy8:E, 1zy8:F, 1zy8:G, 1zy8:H, 1zy8:I, 1zy8:J, 7zyt:A, 7zyt:B
90 5u8u:D 477 26 0.0290 0.0273 0.5000 10.0 1lpf:A, 1lpf:B, 5u8u:A, 5u8u:B, 5u8u:C, 5u8v:A, 5u8v:B, 5u8v:C, 5u8v:D, 5u8w:A, 5u8w:B, 5u8w:C, 5u8w:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218