Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESATMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHL
LTLKVRVSSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPEMAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVVDEAHCVSQWGHDFR
PDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIFKTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKAL
GQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLAIELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRF
VAHWNIAKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATIMAFDALVTFCEELG
CRHAAIAKYFGDALPACAKGCDHCQNPTAVRRRLEALERSSSW

The query sequence (length=443) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7zmq:A 443 441 0.9955 0.9955 1.0000 0.0 5lb3:B, 5lb3:E, 5lb5:A, 5lb5:B, 5lb5:C, 5lb5:D, 5lb8:A, 5lb8:D, 5lba:B, 5lba:A, 5lba:C, 5lba:D, 7zml:A, 7zml:B, 7zml:C, 7zml:D, 7zmm:B, 7zmm:A, 7zmm:C, 7zmm:D, 7zmn:A, 7zmn:B, 7zmo:A, 7zmo:B, 7zmp:A, 7zmp:B, 7zmq:B, 7zmr:A, 7zmr:B, 7zms:A, 7zmt:A, 7zmt:B, 7zmv:A, 7zmv:B, 7zmv:C, 7zmv:D
2 7aud:A 522 412 0.3815 0.3238 0.4102 1.05e-95 7aud:E, 7aud:B, 7aud:C, 7aud:D, 7aud:F
3 4cgz:A 629 431 0.3928 0.2766 0.4037 1.39e-94 4cdg:A, 4cdg:B, 4o3m:A
4 6crm:A 512 438 0.3905 0.3379 0.3950 2.27e-91 4tmu:A
5 7a8r:A 531 433 0.3612 0.3013 0.3695 3.92e-88 7a8r:B, 6jtz:A, 6jtz:B, 4u7d:A, 4u7d:B, 4u7d:D, 4u7d:C, 2v1x:A, 2v1x:B, 2wwy:B, 2wwy:A, 8yrs:B, 8yrs:A
6 4q47:A 513 427 0.3860 0.3333 0.4005 6.04e-88 4q47:B, 4q48:A, 4q48:B
7 1oyw:A 516 436 0.3702 0.3178 0.3761 4.94e-87 1oyy:A
8 7auc:A 493 441 0.3657 0.3286 0.3673 3.92e-78
9 6yhr:A 541 437 0.3251 0.2662 0.3295 1.44e-66 3aaf:A, 3aaf:B, 7gqs:A, 7gqt:A, 7gqu:A, 8pfl:A, 8pfo:A, 8pfp:A, 8yle:A
10 5lst:A 617 408 0.3205 0.2301 0.3480 4.12e-55
11 5v9x:A 772 358 0.2099 0.1205 0.2598 7.06e-11
12 4ljy:A 451 343 0.1806 0.1774 0.2332 2.69e-10 7oqb:p, 7oqe:p
13 8y6o:I 597 390 0.1964 0.1457 0.2231 1.26e-09 8qp8:G, 6qw6:5X, 6qx9:5X, 8r08:G
14 4bru:A 375 373 0.2054 0.2427 0.2440 2.75e-09
15 6znp:A 748 426 0.2257 0.1337 0.2347 2.05e-08 6znq:A
16 6uv1:A 438 360 0.1919 0.1941 0.2361 6.13e-08 6uv1:B, 6uv2:A, 6uv3:A, 6uv4:A
17 2zja:A 700 397 0.2099 0.1329 0.2343 8.92e-08 2zj5:A
18 6znq:B 711 423 0.2212 0.1378 0.2317 2.85e-07 6znp:B
19 8arp:C 445 353 0.1828 0.1820 0.2295 1.15e-06 8arp:A, 8arp:B, 8arp:D, 8arp:E, 8arp:F
20 5gan:B 1781 404 0.2099 0.0522 0.2302 1.54e-06 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
21 6l5n:A 377 115 0.0655 0.0769 0.2522 3.82e-06 6l5m:A, 6l5m:B, 6l5m:C, 6l5m:D, 6l5m:E, 6l5n:B, 6l5o:A
22 5dtu:A 404 378 0.1964 0.2153 0.2302 7.74e-06
23 2db3:A 420 382 0.1716 0.1810 0.1990 1.80e-05 2db3:B, 2db3:C, 2db3:D
24 2p6r:A 683 374 0.1941 0.1259 0.2299 2.01e-05
25 5yzg:D 1908 414 0.2054 0.0477 0.2198 8.54e-05 6ahd:D, 8bc8:B, 8bc9:B, 8bca:B, 8bcb:B, 8bcc:B, 8bcd:B, 8bce:B, 8bcf:B, 8bcg:B, 8bch:B, 7bdi:B, 7bdj:B, 7bdk:B, 7bdl:B, 4f92:B, 4f93:B, 6ff7:r, 8h6k:5D, 8h6l:5D, 4kit:B, 5o9z:C, 7os1:B, 8qo9:B, 8qzs:B, 5urj:A, 5urk:A, 5urm:A, 5urm:B, 5xjc:D
26 5yzg:D 1908 59 0.0406 0.0094 0.3051 0.058 6ahd:D, 8bc8:B, 8bc9:B, 8bca:B, 8bcb:B, 8bcc:B, 8bcd:B, 8bce:B, 8bcf:B, 8bcg:B, 8bch:B, 7bdi:B, 7bdj:B, 7bdk:B, 7bdl:B, 4f92:B, 4f93:B, 6ff7:r, 8h6k:5D, 8h6l:5D, 4kit:B, 5o9z:C, 7os1:B, 8qo9:B, 8qzs:B, 5urj:A, 5urk:A, 5urm:A, 5urm:B, 5xjc:D
27 4ct4:B 378 181 0.1038 0.1217 0.2541 1.06e-04 5anr:B, 4ct4:D, 1vec:A, 2wax:C, 2way:A
28 2vso:A 366 90 0.0429 0.0519 0.2111 2.90e-04 1fuk:A, 2vso:B, 2vsx:A, 2vsx:B
29 5sup:B 383 123 0.0609 0.0705 0.2195 2.96e-04 5sup:A, 5sup:C, 5suq:A, 5suq:C
30 7liu:A 442 127 0.0655 0.0656 0.2283 3.08e-04 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
31 7liu:A 442 37 0.0316 0.0317 0.3784 0.41 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
32 4d26:A 430 108 0.0655 0.0674 0.2685 3.28e-04 4d25:A
33 4d26:A 430 37 0.0271 0.0279 0.3243 3.9 4d25:A
34 4kbf:A 365 114 0.0835 0.1014 0.3246 3.70e-04 2gxq:A, 2gxs:A, 2gxs:B, 2gxu:A, 3mwk:B, 3mwl:B, 3nbf:A, 3nbf:B, 3nbf:C, 3nbf:D
35 6zns:A 635 160 0.1016 0.0709 0.2812 7.24e-04
36 8enk:B 381 106 0.0609 0.0709 0.2547 8.10e-04 8enk:A, 1xtj:A, 7znk:P, 7znk:p
37 6s8r:A 167 92 0.0519 0.1377 0.2500 0.001
38 6b4i:F 426 100 0.0632 0.0657 0.2800 0.001 6b4i:E, 6b4j:E, 6b4j:F, 6b4k:A, 6b4k:B, 3ews:A, 3ews:B, 3fht:A, 3fht:B, 3fmo:B, 3fmp:B, 3fmp:D, 3g0h:A
39 6o5f:A 417 344 0.1603 0.1703 0.2064 0.002 6o5f:B
40 4b6f:A 645 72 0.0519 0.0357 0.3194 0.003 1a1v:A, 4a1t:A, 4a1t:B, 4a1v:A, 4a1v:B, 4a1x:A, 4a1x:B, 4a92:A, 4a92:B, 4b6e:B, 4b6f:B, 4b71:A, 4b71:B, 4b73:A, 4b73:B, 4b74:A, 4b74:B, 4b75:A, 4b75:B, 4b76:A, 4b76:B, 1bt7:A, 1cu1:A, 1cu1:B, 1dxp:A, 1dxp:B, 1dxw:A, 1dy8:A, 1dy8:B, 1dy9:A, 1dy9:B, 5e4f:A, 5e4f:B, 2f55:A, 2f55:B, 2f55:C, 6fe6:A, 5fps:A, 5fps:B, 5fpt:A, 5fpt:B, 5fpy:A, 5fpy:B, 1hei:A, 4i31:A, 4i31:B, 4i32:A, 4i32:B, 4i33:A, 4i33:B, 4jmy:A, 4jmy:B, 1jxp:A, 1jxp:B, 2k1q:A, 4k8b:A, 4k8b:B, 3kee:A, 3kee:B, 3kee:C, 3kee:D, 3kqh:B, 3kqh:A, 3kqk:B, 3kqk:A, 3kql:A, 3kql:B, 3kqn:A, 3kqu:A, 3kqu:B, 3kqu:C, 3kqu:D, 3kqu:E, 3kqu:F, 4ktc:A, 4ktc:C, 1ns3:A, 1ns3:B, 3o8b:A, 3o8b:B, 3o8c:A, 3o8c:B, 3o8d:A, 3o8d:B, 3o8r:A, 3o8r:B, 4ojq:A, 4ok3:A, 4ok5:A, 4ok6:A, 4oks:A, 4oks:B, 3oyp:A, 3oyp:B, 3p8n:A, 3p8n:B, 3p8o:A, 3p8o:B, 3rvb:A, 4tyd:A, 4tyd:D, 4tyd:B, 4tyd:E, 4tyd:C, 4tyd:F, 4tyd:G, 4tyd:M, 4tyd:H, 4tyd:J, 4tyd:L, 4tyd:K, 4u01:A, 4u01:B, 4u01:C, 4u01:D, 4u01:E, 4u01:F, 4u01:G, 4u01:H, 4u01:J, 1w3c:A, 1w3c:B, 4wxp:A, 4wxr:A, 4wxr:B, 2zjo:A
41 3ex7:C 392 106 0.0429 0.0485 0.1792 0.005 8c6j:7, 3ex7:H, 9fmd:7, 2hyi:C, 2hyi:I, 8i0w:u, 6icz:u, 2j0q:A, 2j0q:B, 2j0s:A, 2j0u:A, 6qdv:7, 2xb2:A, 2xb2:X, 5xjc:u, 5yzg:u, 7znj:A, 7znj:a, 7znj:F, 7znj:f, 7znj:K, 7znj:k
42 4w7s:B 448 349 0.1761 0.1741 0.2235 0.005
43 4ojq:B 420 52 0.0451 0.0476 0.3846 0.008 1hei:B, 4ok6:B
44 7pmq:C 458 346 0.1964 0.1900 0.2514 0.009 7pli:A, 7pli:B, 7pli:J, 7pli:E, 7pli:F, 7pli:I, 7pmm:A, 7pmm:B, 7pmq:D, 7pmq:A, 7pmq:B
45 7nac:x 539 45 0.0451 0.0371 0.4444 0.012 7nad:x, 7r72:x, 7r7a:x
46 6qv4:A 1666 392 0.2032 0.0540 0.2296 0.012 6qv3:A
47 7zpq:CA 1742 158 0.0903 0.0230 0.2532 0.026 7zrs:CA, 7zuw:CA
48 7zpq:CA 1742 74 0.0497 0.0126 0.2973 0.044 7zrs:CA, 7zuw:CA
49 7zpq:CA 1742 79 0.0497 0.0126 0.2785 7.0 7zrs:CA, 7zuw:CA
50 1gm5:A 729 101 0.0655 0.0398 0.2871 0.038
51 3i5x:A 509 93 0.0519 0.0452 0.2473 0.044 4db2:C, 4db2:A, 4db2:B, 4db2:D, 4db4:A, 3i5y:A, 3i61:A, 3i62:A, 3sqw:A, 3sqx:A, 4tyn:A, 4tyw:A, 4tyy:A, 4tz0:A, 4tz6:A
52 7oi6:x 374 98 0.0451 0.0535 0.2041 0.065
53 8ia0:CW 540 37 0.0361 0.0296 0.4324 0.087 8i9z:CW
54 1djo:A 330 106 0.0677 0.0909 0.2830 0.10 1djo:B, 1djp:A, 1djp:B, 4pga:A, 4pga:B, 6wyw:A, 6wyw:B, 6wyw:C, 6wyw:D, 6wyx:A, 6wyx:B, 6wyx:C, 6wyx:D, 6wyy:A, 6wyy:B, 6wyy:C, 6wyy:D, 6wyz:A, 6wyz:B, 6wyz:C, 6wyz:D, 6wz4:A, 6wz4:B, 6wz4:C, 6wz4:D, 6wz6:A, 6wz6:B, 6wz6:C, 6wz6:D
55 7ase:f 1523 166 0.0971 0.0282 0.2590 0.16 7ask:F
56 6yxy:EB 663 35 0.0361 0.0241 0.4571 0.20 7aoi:XB, 6yxx:EB
57 6yxy:EB 663 93 0.0474 0.0317 0.2258 2.4 7aoi:XB, 6yxx:EB
58 6xki:A 378 86 0.0339 0.0397 0.1744 0.21 5zbz:A, 5zc9:A
59 5wdx:A 642 34 0.0293 0.0202 0.3824 0.21
60 7am2:BW 447 104 0.0519 0.0515 0.2212 0.25
61 7am2:BW 447 38 0.0339 0.0336 0.3947 0.62
62 3dkp:A 240 61 0.0429 0.0792 0.3115 0.30
63 9bha:A 793 70 0.0474 0.0265 0.3000 0.31 5a9f:A, 5aga:A, 9bh8:A, 9bh8:B, 9bh9:A, 9bh9:B, 9bha:B, 9c5q:C, 9c5q:A
64 9asj:A 741 70 0.0474 0.0283 0.3000 0.33 9asj:B, 9bp9:A, 9bp9:C, 9bpa:A, 9bpa:C, 9bpa:E, 9bpa:G
65 8w0a:C 636 70 0.0474 0.0330 0.3000 0.36 8w0a:A
66 7r7j:B 574 170 0.0948 0.0732 0.2471 0.45 8h5y:B, 8h5y:A, 8h5z:B, 8h5z:A, 6jde:B, 6jde:A, 7r7j:A
67 2rb4:A 164 77 0.0384 0.1037 0.2208 0.57
68 2olp:A 151 43 0.0406 0.1192 0.4186 0.65 2olp:B, 6otw:A, 6otx:A, 6oty:A, 3pi1:A, 3pi1:B, 3pi2:A, 3pi2:B, 3pi3:A, 3pi3:B, 3pi4:A, 3pi4:B, 3pt7:A, 3pt8:A
69 8fkv:NI 647 348 0.1535 0.1051 0.1954 0.70 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
70 6ieg:A 872 80 0.0542 0.0275 0.3000 0.75
71 6s0k:h 838 64 0.0497 0.0263 0.3438 0.84 5k9t:A, 2vda:A
72 2fsi:B 748 64 0.0497 0.0294 0.3438 0.87 2fsg:B
73 2fsh:B 722 64 0.0497 0.0305 0.3438 0.90
74 2fsh:A 691 65 0.0497 0.0318 0.3385 0.91 3bxz:A, 3bxz:B, 2fsg:A, 2fsi:A
75 8vxy:B 1161 54 0.0497 0.0189 0.4074 1.2
76 8vxa:A 1139 54 0.0497 0.0193 0.4074 1.3 8vxc:A
77 8gzr:B 443 155 0.0813 0.0813 0.2323 1.3
78 8i9v:Cb 642 134 0.0609 0.0421 0.2015 1.4 8i9t:Cb, 8i9w:Cb, 8i9x:Cb
79 7jl0:A 662 162 0.0948 0.0634 0.2593 1.5 7jl2:A, 7jl2:C, 7jl2:E
80 8cnt:A 620 61 0.0406 0.0290 0.2951 1.8
81 8a9k:A 998 60 0.0451 0.0200 0.3333 1.8
82 7kzv:U 1198 60 0.0451 0.0167 0.3333 1.9 7kzt:U, 6vaa:A, 6vae:A, 6vaf:A
83 2xgj:B 777 73 0.0519 0.0296 0.3151 2.1
84 8c6j:V 934 69 0.0542 0.0257 0.3478 2.3 6hys:A, 6hys:B, 6hys:C, 6hys:D, 6hyt:A, 6hyt:B, 6hyt:C, 6hyt:D, 6hyu:A
85 3iuy:A 213 192 0.1106 0.2300 0.2552 2.3 3iuy:B
86 6c90:A 694 82 0.0564 0.0360 0.3049 2.6
87 6ro1:A 919 82 0.0564 0.0272 0.3049 2.8
88 6d6q:M 709 82 0.0564 0.0353 0.3049 2.8 6d6r:M, 7z52:B
89 6ieh:B 929 82 0.0564 0.0269 0.3049 3.1 6ieg:B, 7s7b:A, 7s7b:E, 7s7c:A
90 5ijd:C 137 39 0.0384 0.1241 0.4359 3.2 5ijc:D, 5ijc:C, 5ijd:D, 7mlm:C, 3vq1:C, 3vq1:D, 3vq2:C, 3vq2:D
91 7eld:A 1137 82 0.0497 0.0193 0.2683 4.3 7ele:A
92 7qdy:A 1169 86 0.0609 0.0231 0.3140 4.4 7qdz:A, 7qe0:A
93 6fsz:MM 978 81 0.0564 0.0256 0.3086 5.6 7ajt:EN, 7aju:EN, 6ft6:MM, 5ooq:A, 5ooq:B, 2xgj:A
94 2dfd:A 314 31 0.0316 0.0446 0.4516 6.4 2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
95 8q9t:A 1075 81 0.0542 0.0223 0.2963 7.2
96 6fwr:A 699 38 0.0339 0.0215 0.3947 8.4 6fws:A, 6fws:B
97 4zu9:A 582 120 0.0587 0.0447 0.2167 8.6
98 8izl:A 2067 64 0.0451 0.0097 0.3125 9.0 8izm:A, 8x01:A, 8yxm:A, 8yxp:A
99 7p01:A 572 43 0.0316 0.0245 0.3256 9.5 7p01:B, 7p07:A, 7p07:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218