BioLiP

>protein
DPAVTYYRLEEVAKRNTSEETWMVIHGRVYDLTRFLSEHPGGEEVLREQAGADATESFEDVGHSPDAREMLKQYYIGDVH
PNDLKPK

The query sequence (length=87) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2i89:A	90	87	0.9540	0.9222	0.9540	3.82e-59	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
2	1awp:A	86	86	0.9310	0.9419	0.9419	1.85e-58	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
3	3ner:B	91	86	0.8046	0.7692	0.8140	1.12e-50	3ner:A
4	3ozz:B	82	81	0.7011	0.7439	0.7531	2.82e-43
5	2i96:A	108	87	0.6782	0.5463	0.6782	2.78e-40	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
6	1hko:A	104	81	0.6322	0.5288	0.6790	1.98e-39	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
7	1aw3:A	94	83	0.6322	0.5851	0.6627	3.54e-38	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
8	2ibj:A	86	76	0.5747	0.5814	0.6579	4.31e-34
9	4b8n:B	90	71	0.3908	0.3778	0.4789	1.76e-16	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1kbi:A	504	57	0.3448	0.0595	0.5263	9.88e-15	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
11	1cxy:A	81	77	0.3218	0.3457	0.3636	5.12e-14
12	1x3x:A	82	77	0.3678	0.3902	0.4156	4.85e-13	1x3x:B
13	3lf5:A	87	78	0.3333	0.3333	0.3718	8.36e-13	3lf5:B
14	7bwh:A	88	79	0.2989	0.2955	0.3291	1.14e-11
15	8tgb:A	108	75	0.2874	0.2315	0.3333	1.16e-11	8tgb:B
16	1sox:A	463	81	0.3448	0.0648	0.3704	4.89e-07	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	79	0.3103	0.3418	0.3418	7.96e-06
18	6nzx:A	76	67	0.2529	0.2895	0.3284	0.013
19	5jyx:B	109	36	0.1379	0.1101	0.3333	0.52	5jyx:A, 5jyx:E, 5jyx:C, 5jyx:J, 5jyx:D, 5jyx:H, 5jyx:F, 5jyx:O, 5jyx:G, 5jyx:L, 5jyx:I, 5jyx:K, 5jyx:M, 5jyx:N
20	4z71:B	163	66	0.2299	0.1227	0.3030	0.67	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
21	7sc6:A	349	18	0.1034	0.0258	0.5000	4.1	7scq:A, 7scq:B
22	4jz6:A	484	55	0.1954	0.0351	0.3091	6.1
23	5c71:A	583	43	0.1494	0.0223	0.3023	7.3	5c71:C
24	6gxv:A	481	30	0.1379	0.0249	0.4000	9.1	6gxv:B, 6gya:A, 6gya:B, 6gya:C, 6gya:D
25	3e23:A	198	25	0.1264	0.0556	0.4400	9.6

[Back]