BioLiP

>protein
DPAVTYYRLEEVAKRNTAEETWMVIHGRVYDITRFLSEHPGGEELLLEQAGADATESFEDLGHSPDAREMLKQYYIGDVH
PNDLKP

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1awp:A	86	86	1.0000	1.0000	1.0000	5.45e-61	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
2	2i89:A	90	86	0.8953	0.8556	0.8953	1.26e-55	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
3	3ner:B	91	86	0.8023	0.7582	0.8023	3.47e-51	3ner:A
4	3ozz:B	82	81	0.7209	0.7561	0.7654	5.96e-44
5	2i96:A	108	83	0.6047	0.4815	0.6265	5.61e-37	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
6	1hko:A	104	81	0.5814	0.4808	0.6173	2.55e-36	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
7	1aw3:A	94	83	0.5814	0.5319	0.6024	3.60e-35	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
8	2ibj:A	86	76	0.5581	0.5581	0.6316	2.56e-34
9	4b8n:B	90	71	0.3837	0.3667	0.4648	1.83e-16	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1cxy:A	81	77	0.3256	0.3457	0.3636	1.55e-14
11	1kbi:A	504	57	0.3372	0.0575	0.5088	1.08e-13	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
12	1x3x:A	82	77	0.3837	0.4024	0.4286	1.17e-13	1x3x:B
13	3lf5:A	87	68	0.2907	0.2874	0.3676	5.39e-13	3lf5:B
14	7bwh:A	88	79	0.3140	0.3068	0.3418	5.77e-13
15	8tgb:A	108	75	0.3023	0.2407	0.3467	1.15e-12	8tgb:B
16	1sox:A	463	81	0.3605	0.0670	0.3827	4.27e-08	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	79	0.3023	0.3291	0.3291	5.96e-06
18	6nzx:A	76	67	0.2558	0.2895	0.3284	0.002
19	6hyp:A	2272	45	0.2093	0.0079	0.4000	0.19
20	4z71:B	163	65	0.1977	0.1043	0.2615	1.4	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
21	2is4:B	632	23	0.1279	0.0174	0.4783	2.1
22	2is6:A	654	23	0.1279	0.0168	0.4783	2.1	2is1:A, 2is1:B, 2is2:A, 2is2:B, 2is4:A, 2is6:B
23	5jyx:B	109	36	0.1395	0.1101	0.3333	2.2	5jyx:A, 5jyx:E, 5jyx:C, 5jyx:J, 5jyx:D, 5jyx:H, 5jyx:F, 5jyx:O, 5jyx:G, 5jyx:L, 5jyx:I, 5jyx:K, 5jyx:M, 5jyx:N
24	5t0w:A	229	28	0.1279	0.0480	0.3929	2.9	5t0w:B, 5t0w:C, 5t0w:D
25	7sc6:A	349	18	0.1047	0.0258	0.5000	3.4	7scq:A, 7scq:B
26	8ova:AC	208	50	0.1628	0.0673	0.2800	6.1	7ase:F, 5opt:f, 8ove:AC, 4v8m:AC
27	8b7s:A	458	28	0.1395	0.0262	0.4286	6.1

[Back]