BioLiP

>protein
DPAGKAAQYHKEYALFRSANMPSPDKLATGVGFHSFRIPAVVRTNTGRILAFAEGRRHNNRDYGDINLVYKRTKSPTNNG
ENPTDWESLREVVGTGPHTWGNPTPVVDGNTIYLFLSMNDGAYSQNGGNTLPDGTKTKKIDSTWVGRRHLYLTTSTDDGD
TWTKPVDMTKTLTPDGQAWDAVGPGNGIKLSTGELVIPAQGRNIIGRGPSGNRTWSMQILKGAGSEGTICQTPDGKLMRN
DRPGPMGHRSVARGTLAGLGPFATDNGLPDPACQGSILSYNSDEPARTIFMNSASTDRRTAMRVRISYDKDAAKFNFGRE
LKDAPLGNVGNEGGYSSMTKTSDYKIGALVESDWYEDKGGEKSHRCIIWRRFNLSWIINGP

The query sequence (length=381) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7p1v:A	384	381	1.0000	0.9922	1.0000	0.0	7p1q:A, 7p1r:A, 7p1r:B, 7p1r:C, 7p1r:D, 7p1s:A, 7p1s:B, 7p1s:C, 7p1s:D, 7p1u:A, 7p1u:B, 7p1v:B, 7p1v:C, 7p1v:D
2	2xzj:A	386	382	0.7612	0.7513	0.7592	0.0	4m4v:A, 2xzi:A, 2xzi:B, 2xzj:B, 2xzk:A, 2xzk:B
3	7p1o:X	386	382	0.7402	0.7306	0.7382	0.0	7p1d:A, 7p1e:A, 7p1f:B, 7p1f:A, 7p1o:A
4	6myv:C	526	351	0.2336	0.1692	0.2536	3.24e-15	6mrv:B, 6mrv:A, 6myv:A, 6myv:B, 6myv:D
5	7qxo:A	519	356	0.2336	0.1715	0.2500	5.41e-13	7qxo:B, 7qy8:A, 7qy8:B, 7qy9:A, 7qy9:B
6	2ber:A	601	376	0.2808	0.1780	0.2846	4.49e-11	2bzd:A, 2bzd:B, 2bzd:C, 1eus:A, 1euu:A, 1w8n:A, 1w8o:A, 1wcq:A, 1wcq:B, 1wcq:C
7	2f25:A	373	179	0.1417	0.1448	0.3017	1.69e-09	2f0z:A, 2f10:A, 2f11:A, 2f12:A, 2f13:A, 2f25:B, 2f27:A, 2f27:B, 2f29:A, 2f29:B, 4nc5:A, 4ncs:A, 1vcu:A, 1vcu:B
8	8u5o:A	449	417	0.2625	0.2227	0.2398	1.82e-08	2bf6:A, 5tsp:A, 5tsp:B, 8u2a:A, 2vk5:A, 2vk6:A, 2vk7:A, 2vk7:B
9	8t26:A	504	371	0.2362	0.1786	0.2426	1.37e-07	8t1y:A, 8t1z:A, 8t24:A, 8t27:A
10	9c20:A	451	310	0.1942	0.1641	0.2387	6.66e-07	8url:A, 8uvv:A
11	7lbv:A	380	346	0.2152	0.2158	0.2370	7.14e-05
12	6qzh:A	744	57	0.0604	0.0309	0.4035	7.97e-05	7a54:A, 7a54:B, 7a5x:A, 7a5x:B, 3h72:A, 3h72:B, 3h73:A, 3h73:B, 5kky:A, 5kky:B, 2vvz:A, 2vvz:B, 2ya5:A, 2ya5:B, 2ya6:A, 2ya6:B, 2ya7:A, 2ya7:B, 2ya7:C, 2ya7:D, 2ya8:A, 2ya8:B
13	6qzh:A	744	43	0.0472	0.0242	0.4186	2.63e-04	7a54:A, 7a54:B, 7a5x:A, 7a5x:B, 3h72:A, 3h72:B, 3h73:A, 3h73:B, 5kky:A, 5kky:B, 2vvz:A, 2vvz:B, 2ya5:A, 2ya5:B, 2ya6:A, 2ya6:B, 2ya7:A, 2ya7:B, 2ya7:C, 2ya7:D, 2ya8:A, 2ya8:B
14	8ul7:A	363	234	0.1444	0.1515	0.2350	0.001	8ule:A, 8um0:A
15	4x47:A	489	109	0.0814	0.0634	0.2844	0.003	4x49:A, 4x4a:A, 4x6k:A
16	1sli:A	679	108	0.0787	0.0442	0.2778	0.003	2sli:A, 3sli:A, 4sli:A
17	1dil:A	381	181	0.1339	0.1339	0.2818	0.003	7aey:AAA, 1dim:A, 2sim:A, 6tvi:AAA
18	3b69:A	626	230	0.1496	0.0911	0.2478	0.004	2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
19	2ags:A	634	257	0.1732	0.1041	0.2568	0.038	2a75:A, 2fhr:A, 1mz6:A, 1n1t:A, 1n1v:A, 1n1y:A
20	5dm6:3	65	17	0.0236	0.1385	0.5294	3.9	7a0r:3, 7a0s:3, 7a18:3, 3cf5:3, 3dll:3, 5dm7:3, 4ioa:3, 4ioc:3, 5jvg:3, 5jvh:3, 1nkw:3, 1nwx:3, 1nwy:3, 3pio:3, 3pip:3, 4u67:3, 4v4g:B5, 4v4g:D5, 4v4g:F5, 4v4g:H5, 4v4g:J5, 4v4p:A8, 4v4r:B8, 4v4s:B8, 4v4t:B8, 4wfn:3, 2zjp:3, 2zjq:3, 2zjr:3
21	7mq8:SQ	187	36	0.0394	0.0802	0.4167	4.9	7mq9:SQ
22	8jkk:D	383	99	0.0604	0.0601	0.2323	5.0	8jkk:A, 8jkk:G, 8jkk:J, 7w5p:A, 7w5p:H, 7w5p:D, 7w5p:G
23	7mqa:SQ	156	36	0.0394	0.0962	0.4167	5.1
24	7s0w:B	499	52	0.0446	0.0341	0.3269	6.2
25	2gbp:A	309	79	0.0551	0.0680	0.2658	9.3	2fvy:A, 2fw0:A, 8fxt:A, 3ga5:A, 3ga5:B, 3gbp:A, 1gca:A, 1gcg:A, 1glg:A, 2hph:A, 2ipl:A, 2ipm:A, 2ipn:A, 2qw1:A

[Back]