BioLiP

>protein
DLVTLAGQLNAGTILPETILIVTLLVVLLADLIQGRQADRWTPYFAIVGLGGAIATMIPLWTQPATISFFGSFISDHLSL
FFRGLIALSALGTILMSIRYVEQTGSSLGEFMTILLTATVGGMFIAGAQELVFIFVALETLSIASYLLTGYTKRDSRSNE
AALKYLLIGAASSAIFLYGSSLLYGLSGGHTQLPAIAQALSSESLGLVVALVFVIAGISFKISAVPFHQWTPDVYEGAPT
PVVAFLSVGSKAAGFALAIRFLTLAFPSVTDQWQLIFTVLAILSMILGNVVALAQTSMKRMLAYSSIGQAGFVMIGFVVG
TEAGYASMLFYLLVYLFMNLGAFTCVILFSLRTGTDQISEYAGLYQKDPLLTLGLSLCLLSLGGIPPLAGFFGKIYLFWA
GWQAGAYGLVLLGLLTSVISIYYYIRVVKMMVVKEPQEMSEAVRNYPEVSWSSFGLRPLQVGLVMTVIATSLAGILANPL
FNLVNTAVWDVP

The query sequence (length=492) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6l7o:B	493	492	1.0000	0.9980	1.0000	0.0	6l7p:B
2	7aqq:N	488	372	0.3069	0.3094	0.4059	1.41e-82	7a23:I, 7a24:I, 7ar7:N, 7ar8:N, 8bef:N, 8bpx:N
3	8qby:N	479	436	0.3272	0.3361	0.3693	1.87e-76
4	7zmb:2	558	401	0.2622	0.2312	0.3217	1.86e-42	7zme:2, 7zmg:2, 7zmh:2
5	7o6y:2	469	372	0.1972	0.2068	0.2608	2.69e-27	7o71:2, 6rfq:2, 6rfr:2, 6y79:2, 7zkp:2
6	7zkq:2	448	372	0.1951	0.2143	0.2581	5.11e-25
7	8e9i:M	518	290	0.1687	0.1602	0.2862	4.43e-18	8e9g:M, 8e9h:M
8	6l7o:F	647	383	0.2073	0.1577	0.2663	1.02e-17	6l7p:F
9	7qso:N	347	304	0.1545	0.2190	0.2500	1.34e-16	7r41:N, 7r42:N, 7r44:N, 7r45:N, 7r47:N, 7r48:N, 7r4c:N, 7r4d:N, 7r4f:N, 7r4g:N, 6zkm:N, 6zkn:N, 6zku:N, 6zkv:N
10	8qby:M	503	356	0.1931	0.1889	0.2669	1.44e-16	8qc1:M
11	5gup:i	347	321	0.1667	0.2363	0.2555	2.25e-16	7v2c:i, 7v2d:i, 7v2e:i, 7v2f:i, 7v2h:i, 7v2k:i, 7v2r:i, 7v30:i, 7v31:i, 7v32:i, 7v33:i, 7v3m:i, 7vbl:i, 7vbp:i, 7vc0:i, 7vwl:i, 7vxs:i, 7vy1:i, 7vy9:i, 7vye:i, 7vyg:i, 7vyi:i, 7vys:i, 7vz8:i, 7vzv:i, 7vzw:i, 7w00:i, 7w0h:i, 7w0r:i, 7w0y:i, 7w1o:i, 7w1p:i, 7w1t:i, 7w1u:i, 7w1v:i, 7w1z:i, 7w20:i, 7w2k:i, 7w2r:i, 7w2u:i, 7w2y:i, 7w31:i, 7w32:i, 7w35:i, 7w4c:i, 7w4d:i, 7w4e:i, 7w4f:i, 7w4g:i, 7w4j:i, 7w4k:i, 7w4l:i, 7w4m:i, 7w4n:i, 7w4q:i
12	6l7o:D	504	300	0.1728	0.1687	0.2833	3.17e-16	6l7p:D
13	7v2h:l	606	340	0.1850	0.1502	0.2676	1.14e-15	7vc0:l, 7vy1:l, 7vys:l, 7w0h:l, 7w2l:l, 7w2r:l, 7w2y:l, 7w32:l, 7w4q:l
14	5lnk:L	599	384	0.1972	0.1619	0.2526	5.95e-15
15	3rko:L	612	325	0.1626	0.1307	0.2462	4.03e-14	3rko:B
16	8e9g:L	625	369	0.1972	0.1552	0.2629	6.54e-14	8e9h:L, 8e9i:L
17	3rko:M	504	341	0.1789	0.1746	0.2581	2.03e-13	3rko:C
18	8iaq:N	344	309	0.1626	0.2326	0.2589	1.04e-12	8ib6:N, 8ibb:N, 8ibf:N, 8ic4:N
19	8qby:L	659	376	0.1911	0.1426	0.2500	7.77e-12	8qc1:L
20	6rfq:5	654	412	0.1890	0.1422	0.2257	5.52e-11	7o6y:5, 6rfr:5
21	8bpx:M	494	306	0.1504	0.1498	0.2418	1.54e-10	7a23:M, 7aqq:M, 7ar7:M, 7ar8:M, 7arb:M, 8bef:M
22	5xtc:i	347	234	0.1240	0.1758	0.2607	2.53e-10	5xtd:i, 5xth:i, 5xti:i, 5xti:Bi
23	7a23:a	600	310	0.1606	0.1317	0.2548	3.36e-10
24	8gym:n5	709	173	0.0976	0.0677	0.2775	5.54e-09	8gym:N5, 7tgh:5
25	8bpx:L	665	416	0.1890	0.1398	0.2236	7.04e-09	8bef:L
26	6tjv:F	600	278	0.1443	0.1183	0.2554	7.05e-08
27	7zme:5	670	341	0.1565	0.1149	0.2258	1.13e-05	7zmg:5
28	5xtc:r	459	311	0.1545	0.1656	0.2444	2.42e-05	5xtd:r, 5xth:r, 5xti:r, 5xti:Br
29	5lnk:M	459	332	0.1382	0.1481	0.2048	2.83e-05	8q0a:M, 8q0f:M, 8q0m:M, 8q0o:M, 8q1y:M, 8q25:M, 8q45:M, 8q48:M, 8q49:M, 8q4a:M, 7qso:M, 7r4f:M, 7r4g:M, 6zkm:M, 6zkn:M, 6zku:M, 6zkv:M
30	7v2c:r	459	358	0.1402	0.1503	0.1927	1.02e-04	7v2d:r, 7v2e:r, 7v2f:r, 7v2h:r, 7v2k:r, 7v2r:r, 7v30:r, 7v31:r, 7v32:r, 7v33:r, 7v3m:r, 7vbl:r, 7vbp:r, 7vc0:r, 7vwl:r, 7vxs:r, 7vy1:r, 7vy9:r, 7vye:r, 7vyg:r, 7vyi:r, 7vys:r, 7vz8:r, 7vzv:r, 7vzw:r, 7w00:r, 7w0h:r, 7w0r:r, 7w0y:r, 7w1o:r, 7w1p:r, 7w1t:r, 7w1u:r, 7w1v:r, 7w1z:r, 7w20:r, 7w2k:r, 7w2l:r, 7w2r:r, 7w2u:r, 7w2y:r, 7w31:r, 7w32:r, 7w35:r, 7w4c:r, 7w4d:r, 7w4e:r, 7w4f:r, 7w4g:r, 7w4j:r, 7w4k:r, 7w4l:r, 7w4m:r, 7w4n:r, 7w4q:r
31	7zmb:4	494	125	0.0752	0.0749	0.2960	0.001	7zme:4, 7zmg:4, 7zmh:4
32	6rfq:4	486	175	0.0894	0.0905	0.2514	0.005	6rfr:4, 6y79:4
33	8iaq:M	459	356	0.1707	0.1830	0.2360	0.052	8ib6:M, 8ibb:M, 8ibf:M, 8ic4:M
34	7q0n:A	386	45	0.0305	0.0389	0.3333	2.2	7q0n:B, 6s7l:A, 6s7l:B
35	8iuf:N4	478	93	0.0549	0.0565	0.2903	3.1	8j9h:N4, 8j9i:N4, 8j9j:N4
36	4wz7:5	619	151	0.0793	0.0630	0.2583	5.1	6h8k:5

[Back]