Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DLTLRDYQMEVAKPALNGENIIICLPTGSGKTRVAVYITKDHLDKKRKASEQGKVIVLVNKVPLVEQHLRKEFNPFLKHW
YQVIGLSGDSELKISFPEVVKRYDVIICTAQILENSLLNESVRLSDFSLIIIDQCHHTQKEGVYNNIMRRYLKEKIKNRK
QAKELIPQPQILGLTASPGVGGARSNSKAEEHILKICANLDACRIMTVKEHASQLKNQVKEPFKKTVIADDKRRDPFRER
IIEIMQDIQKYCQLYPKSEFGSQPYEQWVIREERRAAKEEKRKERVCAEHLKKYNDALQINDTIRMVDAYNHLNNFYKEL
KRRKTAESDDSKQDETDEFLMRLFHAKKKQLKELARKPEYDNEKLMKLRNTLMEEFTKTEEPRGIIFTKTRQSALALYHW
IMDNPKFEEVGIKAHFLIGAGHNSETKPMTQNEQREVIDKFRGGSINLLIATTVAEEGLDIKECNIVIRYGLVTNEIAMV
QARGRARADESTYALVASSGSGAVEREDVNIFRENMMYKAIRRVQEMPPEEYLNKIQDFQLQSIVEKQMKAKRDQRKKNP
SLITFLCKNCHKLICSGEDIQVIENMHHVSVKKDFQHLYHKRENQTNVEIICKDCGQVWGNMMVYRGLDLPCLKIRNFVV
AFEDTKEIFKKWGELPIIFPD

The query sequence (length=661) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5jc3:A 668 667 1.0000 0.9895 0.9910 0.0 5jc3:B, 5jc7:B, 5jcf:A, 5jcf:B, 5jch:A, 5jch:B
2 5jc7:A 641 661 0.9682 0.9984 0.9682 0.0
3 7bkp:A 689 682 0.7247 0.6952 0.7023 0.0 6g19:A, 6gjz:A, 6gkh:A, 6gkm:A, 6h66:A, 7nic:A, 7niq:B
4 7jl0:A 662 667 0.7231 0.7221 0.7166 0.0 7jl2:A, 7jl2:C, 7jl2:E
5 6h61:A 660 670 0.6989 0.7000 0.6896 0.0 6g1s:A, 6g1x:A, 7nga:A
6 4gl2:A 617 663 0.6884 0.7374 0.6863 0.0 4gl2:B
7 7bkq:A 640 674 0.6732 0.6953 0.6602 0.0
8 5jb2:A 670 677 0.4644 0.4582 0.4535 0.0 5jaj:A, 5jbg:A
9 5jbj:A 627 677 0.4493 0.4737 0.4387 0.0
10 8dvs:A 682 690 0.3646 0.3534 0.3493 8.93e-122 7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
11 5f9h:G 653 678 0.3525 0.3568 0.3437 1.49e-118 5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
12 3zd7:A 623 673 0.3313 0.3515 0.3254 8.73e-106 8g7t:C
13 8g7t:A 647 689 0.3464 0.3539 0.3324 3.81e-104 4ay2:A, 4bpb:A, 8dvr:A, 8g7u:A, 8g7u:C, 8g7v:A, 8g7v:C, 8scz:A, 8sd0:A, 7tnx:A, 7to1:A, 2ykg:A, 3zd6:A
14 4a36:A 523 543 0.2935 0.3709 0.3573 7.50e-99 4a36:B
15 3tbk:A 524 557 0.2995 0.3779 0.3555 2.57e-95
16 8t5s:A 693 689 0.2874 0.2742 0.2758 7.59e-67
17 2rqb:A 135 117 0.1120 0.5481 0.6325 6.56e-41 3ga3:A
18 7eld:A 1137 512 0.2073 0.1205 0.2676 5.39e-31 7ele:A
19 8hf0:A 1561 527 0.1906 0.0807 0.2391 2.27e-20 8hf0:D, 8hf1:A, 8hf1:D, 8hf1:G, 7w0a:A, 7w0a:E, 7w0c:A, 7w0d:A, 7w0e:A, 7w0f:A
20 7w0b:A 1586 527 0.1906 0.0794 0.2391 2.69e-20 7w0d:F
21 7v6c:A 1540 513 0.1800 0.0773 0.2320 7.26e-20
22 5zal:A 1314 197 0.0968 0.0487 0.3249 1.95e-17 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
23 5zal:A 1314 180 0.0877 0.0441 0.3222 6.47e-11 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
24 7yym:A 1281 190 0.0953 0.0492 0.3316 1.12e-15 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
25 7yym:A 1281 178 0.0817 0.0422 0.3034 4.71e-10 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
26 3eqt:B 142 110 0.0499 0.2324 0.3000 3.63e-15 3eqt:A, 2rqa:A
27 8dg5:A 1635 80 0.0454 0.0183 0.3750 2.85e-09 8dg7:A
28 8dg5:A 1635 280 0.0968 0.0391 0.2286 0.068 8dg7:A
29 8dfv:A 1664 80 0.0454 0.0180 0.3750 2.95e-09
30 8dfv:A 1664 279 0.0908 0.0361 0.2151 0.090
31 6p4f:C 436 175 0.0817 0.1239 0.3086 5.34e-09 6p4f:A, 6p4w:A
32 6p4f:C 436 55 0.0257 0.0390 0.3091 0.005 6p4f:A, 6p4w:A
33 8dga:A 1629 68 0.0393 0.0160 0.3824 7.38e-08
34 8dga:A 1629 279 0.0908 0.0368 0.2151 0.072
35 2zja:A 700 166 0.0681 0.0643 0.2711 8.15e-07 2zj5:A
36 7r7j:B 574 188 0.0802 0.0923 0.2819 8.48e-07 8h5y:B, 8h5y:A, 8h5z:B, 8h5z:A, 6jde:B, 6jde:A, 7r7j:A
37 4a2v:A 122 102 0.0454 0.2459 0.2941 1.42e-06 4a2x:A, 4a2x:C, 4a2x:B, 4a2x:D
38 8vxa:A 1139 139 0.0575 0.0334 0.2734 2.01e-05 8vxc:A
39 8vxy:B 1161 139 0.0560 0.0319 0.2662 2.23e-05
40 4kbf:A 365 92 0.0424 0.0767 0.3043 3.16e-05 2gxq:A, 2gxs:A, 2gxs:B, 2gxu:A, 3mwk:B, 3mwl:B, 3nbf:A, 3nbf:B, 3nbf:C, 3nbf:D
41 3ex7:C 392 160 0.0575 0.0969 0.2375 3.76e-05 8c6j:7, 3ex7:H, 9fmd:7, 2hyi:C, 2hyi:I, 8i0w:u, 6icz:u, 2j0q:A, 2j0q:B, 2j0s:A, 2j0u:A, 6qdv:7, 2xb2:A, 2xb2:X, 5xjc:u, 5yzg:u, 7znj:A, 7znj:a, 7znj:F, 7znj:f, 7znj:K, 7znj:k
42 6uv1:A 438 145 0.0620 0.0936 0.2828 1.51e-04 6uv1:B, 6uv2:A, 6uv3:A, 6uv4:A
43 5gan:B 1781 196 0.0862 0.0320 0.2908 1.94e-04 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
44 1gm5:A 729 143 0.0605 0.0549 0.2797 1.96e-04
45 1gm5:A 729 114 0.0514 0.0466 0.2982 0.86
46 4w7s:B 448 148 0.0635 0.0938 0.2838 2.50e-04
47 2p6r:A 683 177 0.0696 0.0673 0.2599 2.53e-04
48 6qv4:A 1666 178 0.0802 0.0318 0.2978 2.77e-04 6qv3:A
49 6xki:A 378 109 0.0454 0.0794 0.2752 5.46e-04 5zbz:A, 5zc9:A
50 8arp:C 445 103 0.0454 0.0674 0.2913 0.001 8arp:A, 8arp:B, 8arp:D, 8arp:E, 8arp:F
51 7am2:BW 447 148 0.0575 0.0850 0.2568 0.001
52 6m6a:M 459 83 0.0439 0.0632 0.3494 0.001 6m6b:M
53 8y6o:I 597 101 0.0454 0.0503 0.2970 0.002 8qp8:G, 6qw6:5X, 6qx9:5X, 8r08:G
54 4d26:A 430 42 0.0287 0.0442 0.4524 0.003 4d25:A
55 9bha:A 793 173 0.0681 0.0567 0.2601 0.003 5a9f:A, 5aga:A, 9bh8:A, 9bh8:B, 9bh9:A, 9bh9:B, 9bha:B, 9c5q:C, 9c5q:A
56 2d7d:A 621 85 0.0408 0.0435 0.3176 0.003 2nmv:A, 3v4r:B, 3v4r:A
57 9asj:A 741 173 0.0681 0.0607 0.2601 0.004 9asj:B, 9bp9:A, 9bp9:C, 9bpa:A, 9bpa:C, 9bpa:E, 9bpa:G
58 7pmq:C 458 126 0.0530 0.0764 0.2778 0.004 7pli:A, 7pli:B, 7pli:J, 7pli:E, 7pli:F, 7pli:I, 7pmm:A, 7pmm:B, 7pmq:D, 7pmq:A, 7pmq:B
59 5elx:A 391 109 0.0484 0.0818 0.2936 0.004 3peu:A, 3pev:A, 3pew:A, 3pey:A, 3rrm:A, 3rrn:A
60 8v87:3 656 145 0.0575 0.0579 0.2621 0.004 8v84:3
61 6l5n:A 377 38 0.0303 0.0531 0.5263 0.005 6l5m:A, 6l5m:B, 6l5m:C, 6l5m:D, 6l5m:E, 6l5n:B, 6l5o:A
62 6o8e:A 592 109 0.0484 0.0541 0.2936 0.005 1d9z:A, 2fdc:B, 6o8e:B, 6o8f:A, 6o8f:B, 6o8g:A
63 2vso:A 366 57 0.0272 0.0492 0.3158 0.006 1fuk:A, 2vso:B, 2vsx:A, 2vsx:B
64 2rb4:A 164 96 0.0393 0.1585 0.2708 0.007
65 2db3:A 420 42 0.0272 0.0429 0.4286 0.007 2db3:B, 2db3:C, 2db3:D
66 8w0a:C 636 127 0.0514 0.0535 0.2677 0.009 8w0a:A
67 6o8h:A 571 109 0.0484 0.0560 0.2936 0.010 6o8g:B, 6o8g:C
68 6yxy:EB 663 103 0.0424 0.0422 0.2718 0.010 7aoi:XB, 6yxx:EB
69 8i9v:Cb 642 74 0.0408 0.0421 0.3649 0.015 8i9t:Cb, 8i9w:Cb, 8i9x:Cb
70 7liu:A 442 57 0.0303 0.0452 0.3509 0.033 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
71 5yzg:D 1908 185 0.0681 0.0236 0.2432 0.038 6ahd:D, 8bc8:B, 8bc9:B, 8bca:B, 8bcb:B, 8bcc:B, 8bcd:B, 8bce:B, 8bcf:B, 8bcg:B, 8bch:B, 7bdi:B, 7bdj:B, 7bdk:B, 7bdl:B, 4f92:B, 4f93:B, 6ff7:r, 8h6k:5D, 8h6l:5D, 4kit:B, 5o9z:C, 7os1:B, 8qo9:B, 8qzs:B, 5urj:A, 5urk:A, 5urm:A, 5urm:B, 5xjc:D
72 2fdc:A 505 109 0.0439 0.0574 0.2661 0.043
73 6acx:A 1175 118 0.0605 0.0340 0.3390 0.062 6acx:B
74 7zpq:CA 1742 172 0.0605 0.0230 0.2326 0.062 7zrs:CA, 7zuw:CA
75 7zpq:CA 1742 123 0.0545 0.0207 0.2927 0.17 7zrs:CA, 7zuw:CA
76 5dtu:A 404 76 0.0348 0.0569 0.3026 0.070
77 6b4i:F 426 90 0.0348 0.0540 0.2556 0.10 6b4i:E, 6b4j:E, 6b4j:F, 6b4k:A, 6b4k:B, 3ews:A, 3ews:B, 3fht:A, 3fht:B, 3fmo:B, 3fmp:B, 3fmp:D, 3g0h:A
78 6x2f:A 1144 83 0.0393 0.0227 0.3133 0.10 7ssg:A, 6x26:A, 6x2n:A, 6x43:A, 6x4w:A, 6x4y:A, 6x50:A
79 5lst:A 617 61 0.0318 0.0340 0.3443 0.10
80 6xeo:A 1118 87 0.0393 0.0233 0.2989 0.11
81 6znq:B 711 132 0.0560 0.0520 0.2803 0.23 6znp:B
82 6znp:A 748 132 0.0560 0.0495 0.2803 0.23 6znq:A
83 4bru:A 375 42 0.0212 0.0373 0.3333 0.23
84 5v9x:A 772 136 0.0575 0.0492 0.2794 0.24
85 5v9x:A 772 80 0.0378 0.0324 0.3125 0.33
86 8tbx:A 458 153 0.0499 0.0721 0.2157 0.34
87 8tbx:A 458 70 0.0318 0.0459 0.3000 1.9
88 8enk:B 381 127 0.0484 0.0840 0.2520 0.40 8enk:A, 1xtj:A, 7znk:P, 7znk:p
89 3iuy:A 213 119 0.0439 0.1362 0.2437 0.64 3iuy:B
90 8i9z:CE 465 151 0.0484 0.0688 0.2119 0.92 8i9p:CE, 8i9r:CE, 8i9t:CE, 8i9v:CE, 8i9w:CE, 8i9x:CE, 8i9y:CE, 8ia0:CE
91 6dgd:A 704 212 0.0787 0.0739 0.2453 0.99 6dgd:B, 4nl4:H
92 8fkv:NI 647 63 0.0363 0.0371 0.3810 1.1 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
93 8fkv:NI 647 122 0.0469 0.0479 0.2541 1.5 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
94 2xgj:B 777 138 0.0439 0.0373 0.2101 1.2
95 6fsz:MM 978 138 0.0439 0.0297 0.2101 1.3 7ajt:EN, 7aju:EN, 6ft6:MM, 5ooq:A, 5ooq:B, 2xgj:A
96 4nl8:A 549 212 0.0787 0.0947 0.2453 1.4
97 8eti:D 391 153 0.0469 0.0793 0.2026 1.4
98 8esq:D 427 153 0.0469 0.0726 0.2026 1.7 8esr:D, 8eth:D, 8eup:D, 8euy:D, 8ev3:D
99 6s8r:A 167 101 0.0378 0.1497 0.2475 2.3
100 4ljy:A 451 60 0.0287 0.0421 0.3167 2.7 7oqb:p, 7oqe:p
101 4cgz:A 629 29 0.0197 0.0207 0.4483 2.9 4cdg:A, 4cdg:B, 4o3m:A
102 4nl8:E 571 214 0.0817 0.0946 0.2523 3.0 4nl8:B
103 7aud:A 522 29 0.0197 0.0249 0.4483 3.3 7aud:E, 7aud:B, 7aud:C, 7aud:D, 7aud:F
104 7auc:A 493 29 0.0197 0.0264 0.4483 3.4
105 8cad:A 636 66 0.0303 0.0314 0.3030 4.0 8cad:B, 8cad:C, 8cad:D, 8cad:E, 8cad:F
106 6yxx:ES 152 45 0.0257 0.1118 0.3778 4.9 6yxy:ES
107 4ct4:B 378 42 0.0212 0.0370 0.3333 5.3 5anr:B, 4ct4:D, 1vec:A, 2wax:C, 2way:A
108 8rd8:F7 177 51 0.0272 0.1017 0.3529 6.0 8rdv:F7, 8rdw:F7
109 6h4f:B 318 36 0.0197 0.0409 0.3611 6.6 6h1j:B, 6h21:A, 6h21:B, 6h21:C, 6h2n:A, 6h2n:B, 6h2n:C, 6h4f:C, 6h4f:F, 6h4f:O, 6h4f:P, 6h4f:E, 6h4f:G, 6h4f:Q, 6h4f:A, 6h4f:D, 6h4f:H, 6h4f:I, 6h4m:B, 6h4m:C, 6h4m:F, 6h4m:O, 6h4m:P, 6h4m:E, 6h4m:G, 6h4m:Q, 6h4m:A, 6h4m:D, 6h4m:H, 6h4m:I, 6hnq:B, 6hnq:C, 6hnq:F, 6hnq:O, 6hnq:P, 6hnq:E, 6hnq:G, 6hnq:Q, 6hnq:A, 6hnq:D, 6hnq:H, 6hnq:I
110 7a8r:A 531 110 0.0378 0.0471 0.2273 6.9 7a8r:B, 6jtz:A, 6jtz:B, 4u7d:A, 4u7d:B, 4u7d:D, 4u7d:C, 2v1x:A, 2v1x:B, 2wwy:B, 2wwy:A, 8yrs:B, 8yrs:A
111 8z0f:A 549 34 0.0197 0.0237 0.3824 8.2 8z0f:B
112 8z9x:B 567 34 0.0197 0.0229 0.3824 8.8 8z9x:A
113 3i5x:A 509 50 0.0212 0.0275 0.2800 9.7 4db2:C, 4db2:A, 4db2:B, 4db2:D, 4db4:A, 3i5y:A, 3i61:A, 3i62:A, 3sqw:A, 3sqx:A, 4tyn:A, 4tyw:A, 4tyy:A, 4tz0:A, 4tz6:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218