Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
DLDELKKEVSMDDHKLSLDELHNKYGTDLTRGLTNARAKEILARDGPNSLTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSILLWIGAIL
CFLAYGIQAATEDEPANDNLYLGVVLSTVVIVTGCFSYYQEAKSSRIMDSFKNMVPQQALVIRDGEKSTINAEFVVAGDL
VEVKGGDRIPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFSSENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGVVVYTGDRTVMGRI
ATLASGLEVGRTPIAIEIEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKR
MARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGAAFDKTSATWSALSRIAALCNR
AVFQAGQDNVPILKRSVAGDASESALLKCIELCCGSVQGMRDRNPKIVEIPFNSTNKYQLSIHENEKSSESRYLLVMKGA
PERILDRCSTILLNGAEEPLKEDMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHFALPEDKYNEGYPFDADEPNFPTTDLCFVGLMA
MIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETIEDIAARLNIPIGQVNPRDAKACVVHGSDL
KDLSTEVLDDILHYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGISGSDVSKQAADMIL
LDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLVFIIGNVPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESD
IMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPMDLIGKRVRWDDRWISDVEDSFGQQWTYEQ
RKIVEFTCHTSFFISIVVVQWADLIICKTRRNSIFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCPGTDVALRMYPLKPSWWFC
AFPYSLIIFLYDEMRRFIIRRSPGGWVEQETYY

The query sequence (length=993) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7wyu:A 993 993 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
2 3b8e:A 998 993 0.8862 0.8818 0.8862 0.0 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
3 8d3x:A 989 989 0.8530 0.8564 0.8564 0.0 8d3u:A, 8d3w:A
4 8k1l:A 979 983 0.6808 0.6905 0.6877 0.0
5 7x20:A 986 986 0.6455 0.6501 0.6501 0.0 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
6 7efl:A 987 986 0.6324 0.6363 0.6369 0.0 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
7 6zhh:A 883 800 0.2759 0.3103 0.3425 5.09e-117 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
8 8iwp:A 896 861 0.2679 0.2969 0.3089 1.65e-110 8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
9 7w7t:A 1021 861 0.2729 0.2654 0.3148 4.38e-106 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
10 5zmw:A 1000 862 0.2759 0.2740 0.3179 1.75e-104 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
11 5ztf:A 972 852 0.2709 0.2767 0.3157 2.69e-104
12 1q3i:A 192 208 0.1410 0.7292 0.6731 1.14e-86
13 7vh6:A 768 762 0.2105 0.2721 0.2743 8.16e-55 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
14 5ksd:A 833 680 0.1682 0.2005 0.2456 7.34e-49 5ksd:B
15 7nxf:A 829 703 0.1823 0.2183 0.2575 4.70e-48 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
16 7m5x:A 1000 881 0.2034 0.2020 0.2293 6.15e-27 7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A
17 7vpk:A 1055 902 0.2175 0.2047 0.2395 6.21e-27 8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
18 8ieo:P 1031 887 0.2145 0.2066 0.2401 6.74e-27 8iem:P
19 7op8:A 1118 830 0.1964 0.1744 0.2349 2.22e-21 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
20 7rd6:A 929 620 0.1521 0.1625 0.2435 1.36e-18 7rd7:A, 7rd8:A
21 6xmt:A 1092 473 0.1158 0.1053 0.2431 5.81e-15 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
22 8q74:A 783 232 0.0634 0.0805 0.2716 3.05e-14 8q75:A, 8q76:A
23 8q74:A 783 310 0.0705 0.0894 0.2258 3.50e-08 8q75:A, 8q76:A
24 4bbj:A 664 322 0.0826 0.1235 0.2547 3.43e-14 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
25 4bbj:A 664 288 0.0715 0.1069 0.2465 8.94e-12 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
26 8ox8:A 1125 740 0.1672 0.1476 0.2243 3.69e-14 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
27 6roh:A 1112 788 0.1793 0.1601 0.2259 2.03e-13 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
28 8ioy:A 816 224 0.0604 0.0735 0.2679 3.80e-13
29 8ioy:A 816 267 0.0564 0.0686 0.2097 0.001
30 7qbz:A 638 245 0.0665 0.1034 0.2694 3.90e-13 7qc0:A
31 7qbz:A 638 175 0.0433 0.0674 0.2457 1.01e-09 7qc0:A
32 7si6:A 873 203 0.0554 0.0630 0.2709 4.02e-13 7si3:A, 7si7:A
33 7si6:A 873 267 0.0675 0.0767 0.2509 7.50e-04 7si3:A, 7si7:A
34 7r0h:A 654 281 0.0715 0.1086 0.2527 8.06e-13 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
35 7r0h:A 654 218 0.0614 0.0933 0.2798 9.74e-13 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
36 6k7l:A 992 678 0.1591 0.1593 0.2330 2.29e-12 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
37 8ox4:A 870 439 0.1118 0.1276 0.2528 6.57e-12
38 7nnl:B 682 181 0.0524 0.0762 0.2873 1.38e-11 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
39 7nnl:B 682 296 0.0775 0.1129 0.2601 9.60e-07 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
40 3sky:A 261 183 0.0514 0.1954 0.2787 8.17e-11
41 8oxa:A 1035 177 0.0534 0.0512 0.2994 5.69e-10 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
42 8oxa:A 1035 313 0.0735 0.0705 0.2332 1.44e-05 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
43 4umv:A 605 245 0.0634 0.1041 0.2571 2.47e-09 4umw:A
44 4umv:A 605 195 0.0524 0.0860 0.2667 1.18e-08 4umw:A
45 7vgh:B 1183 774 0.1662 0.1395 0.2132 7.46e-08 7vgi:B
46 2yj4:B 252 167 0.0473 0.1865 0.2814 1.14e-06 2iye:A, 2iye:C, 2yj3:A, 2yj4:A, 2yj5:A, 2yj5:B, 2yj6:A, 2yj6:B
47 7bsp:A 1028 548 0.1158 0.1119 0.2099 1.09e-04 7bsq:A, 7vsh:A
48 7bsp:A 1028 143 0.0342 0.0331 0.2378 0.078 7bsq:A, 7vsh:A
49 7kyc:A 1178 383 0.0906 0.0764 0.2350 4.86e-04 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
50 7kyc:A 1178 109 0.0302 0.0255 0.2752 0.37 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
51 7kyc:A 1178 31 0.0161 0.0136 0.5161 2.4 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
52 7kya:A 1174 405 0.0926 0.0784 0.2272 0.001 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
53 7kya:A 1174 277 0.0645 0.0545 0.2310 0.50 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
54 6lcp:A 1140 197 0.0473 0.0412 0.2386 0.001 6lcr:A
55 6lcp:A 1140 303 0.0705 0.0614 0.2310 0.009 6lcr:A
56 8ox6:A 575 150 0.0413 0.0713 0.2733 0.002
57 8ox6:A 575 20 0.0141 0.0243 0.7000 5.0
58 6lkn:A 1064 572 0.1178 0.1100 0.2045 0.004 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
59 6lkn:A 1064 143 0.0342 0.0320 0.2378 0.079 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
60 7bss:A 816 143 0.0342 0.0417 0.2378 0.095 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
61 4dwo:A 268 52 0.0201 0.0746 0.3846 0.34 3niw:A
62 2rar:A 261 34 0.0191 0.0728 0.5588 0.53 2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
63 3r4c:A 268 34 0.0181 0.0672 0.5294 0.73
64 4ex6:A 219 79 0.0252 0.1142 0.3165 1.2 4ex7:A
65 4ap9:A 200 37 0.0161 0.0800 0.4324 3.1 4ap9:B, 4ap9:C, 4ap9:D
66 4eei:B 423 170 0.0393 0.0922 0.2294 3.3 4eei:A, 5hw2:A, 5hw2:C
67 1nrw:A 285 43 0.0171 0.0596 0.3953 4.5
68 2ckj:A 1264 77 0.0262 0.0206 0.3377 5.1
69 5ld5:C 342 103 0.0292 0.0848 0.2816 7.1 5ld5:A, 5ld5:B, 5ld5:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218