BioLiP

>protein
DKVYENVTGLVKAVIEMSSKIQPAPPEEYVPMVKEVGLALRTLLATVDETIPALPASTHREIEMAQKLLNSDLGELISKM
KLAQQYVMTSLQQEYKKQMLTAAHALAVDAKNLLDVIDQARLKML

The query sequence (length=125) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1ow8:C	142	125	0.9840	0.8662	0.9840	2.79e-85	3b71:A, 3b71:B, 3b71:C, 6bz3:A, 6bz3:C, 1ow6:A, 1ow6:C, 1ow7:A, 1ow7:B, 1ow7:C, 1ow8:A, 6pw8:A, 7w9u:A, 7w9u:C, 7w9u:D
2	4xev:A	148	122	0.5760	0.4865	0.5902	1.49e-46	3gm1:A, 3gm1:B, 4r32:A, 3u3f:A, 3u3f:B, 3u3f:C, 3u3f:D, 4xef:A, 4xef:D, 4xek:A, 4xev:D
3	7dhw:A	726	46	0.1200	0.0207	0.3261	1.5
4	7ok6:AAA	170	86	0.1840	0.1353	0.2674	2.0	7ok6:HHH
5	4hjf:A	263	35	0.0880	0.0418	0.3143	2.1	3u2e:A, 3u2e:B
6	6s18:A	143	93	0.2240	0.1958	0.3011	2.3	6s18:B, 6s38:A, 6s38:B
7	7oik:A	4426	70	0.1600	0.0045	0.2857	3.1	7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
8	6hn0:A	583	55	0.1600	0.0343	0.3636	3.3	6hn1:A, 4jk4:A, 4jk4:B, 8kfo:B, 4luf:A, 4luh:A, 4or0:A, 4or0:B, 5orf:A, 5orf:B, 5orf:C, 5orf:D, 5osw:A, 5otb:A, 5otb:B, 5otb:C, 5otb:D, 6qs9:A, 6qs9:B, 6rjv:A, 6rjv:B, 3v03:A, 3v03:B, 8wdd:A, 8wdd:B
9	1iun:B	276	74	0.1840	0.0833	0.3108	4.0	2d0d:A, 1iuo:A, 1iup:A, 1uk7:A, 1uk8:A, 1uk9:A, 1uka:A
10	4bd0:A	261	39	0.1120	0.0536	0.3590	5.4	5a92:A, 5a93:A, 4bd1:A, 4c3q:A, 6c79:A, 5g18:A, 1iyo:A, 1iyp:A, 1iyq:A, 1iys:A, 5kmw:A, 5ksc:A, 4x69:A, 4x69:B, 2zq8:A, 2zq9:A, 2zqa:A, 2zqc:A, 2zqd:A
11	6gwi:B	450	27	0.1120	0.0311	0.5185	6.0	6gwi:A
12	6yxx:AN	193	47	0.1040	0.0674	0.2766	6.9	7aoi:AN, 6hiv:AN, 6hix:AN, 6yxy:AN
13	4rnh:A	423	14	0.0560	0.0165	0.5000	7.0
14	5ui5:V	323	52	0.1200	0.0464	0.2885	8.1	2o8k:A, 2o9l:A, 5ui5:I
15	3pfd:C	369	40	0.1040	0.0352	0.3250	9.7	3pfd:A, 3pfd:B, 3pfd:D

[Back]