BioLiP

>protein
DKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTTKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATYFPEHQLLAEEKSNMITNEINHL
WIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVM
NLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISN
KACHETVLKILNANGGYQKYR

The query sequence (length=261) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5eyg:B	265	263	0.9962	0.9811	0.9886	0.0	5eyg:A, 5eyh:A, 5eyh:B, 5f24:A, 5f24:B, 4g61:A, 4g61:B, 4i3e:A, 4i3e:B, 4i3y:A, 4i3y:B, 4i40:A, 4i40:B, 4ptk:A, 4ptk:B, 3ryd:A, 3ryd:C
2	5dw8:A	260	216	0.2605	0.2615	0.3148	7.03e-29	5dw8:B, 5j16:A, 5j16:B, 5j16:C, 5j16:D
3	6ib8:B	270	182	0.1992	0.1926	0.2857	3.89e-24	6ib7:A, 6ib8:A, 2qfl:A, 6tqn:T, 6tqn:S, 6tqo:T, 6tqo:S
4	2p3n:A	256	246	0.2567	0.2617	0.2724	1.34e-23	2p3n:B, 2p3n:C, 2p3n:D
5	8wdq:A	273	226	0.2261	0.2161	0.2611	8.15e-20	8wdq:B
6	2czi:A	259	186	0.1954	0.1969	0.2742	2.15e-17	2czh:B
7	6giu:A	275	244	0.2414	0.2291	0.2582	7.43e-17	4as4:A, 4as4:B, 1awb:A, 1awb:B, 6giu:B, 6gj0:A, 6gj0:B, 2hhm:A, 2hhm:B, 1ima:A, 1ima:B, 1imb:A, 1imb:B, 1imc:A, 1imc:B, 1imd:A, 1imd:B, 1ime:A, 1ime:B, 6zk0:AAA, 6zk0:BBB
8	2bji:A	274	229	0.2222	0.2117	0.2533	3.67e-15	2bji:B
9	3luz:B	234	193	0.2069	0.2308	0.2798	2.38e-14
10	3lv0:A	258	179	0.1801	0.1822	0.2626	5.76e-14	3luz:A, 3lv0:B
11	5zon:A	256	224	0.2184	0.2227	0.2545	7.06e-14	5yht:A, 5yht:B, 5zon:B, 5zon:C, 5zon:D
12	4as5:A	274	216	0.1954	0.1861	0.2361	1.84e-12	4as5:B, 4as5:C, 4as5:D
13	1dk4:A	252	171	0.1686	0.1746	0.2573	5.73e-10	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
14	5eq9:B	260	108	0.1073	0.1077	0.2593	5.79e-08	5eq8:A, 5eq9:A, 5eq9:C, 5eq9:D, 5t3j:A
15	6b5z:A	252	187	0.1839	0.1905	0.2567	4.65e-06	6b5z:B, 6b60:A, 6b60:B, 6b61:A, 6b61:B, 6b62:A, 6b62:B, 6b63:A, 6b63:B, 6b64:A, 6b64:B, 6b65:A, 6b65:B, 6b66:A, 6b66:B, 1lbx:A, 1lbx:B, 1lby:A, 1lby:B, 1lbz:A, 1lbz:B
16	4hxv:A	317	271	0.2184	0.1798	0.2103	2.86e-04	4o7i:A
17	5djj:A	257	211	0.1609	0.1634	0.1991	0.032	5djg:A, 5djh:A, 5dji:A, 5djk:A
18	8f9y:A	352	36	0.0498	0.0369	0.3611	0.11
19	4qxd:B	289	99	0.0958	0.0865	0.2525	0.15	4qxd:A
20	1k9y:A	354	73	0.0766	0.0565	0.2740	0.52	1k9z:A, 1ka0:A, 1ka1:A, 1qgx:A
21	7pt6:8	402	93	0.0843	0.0547	0.2366	0.96	7pt6:H, 7pt7:8, 7v3v:H
22	3u24:A	546	135	0.1264	0.0604	0.2444	3.0
23	5g26:A	241	35	0.0575	0.0622	0.4286	7.8
24	3cx5:P	185	74	0.0805	0.1135	0.2838	8.1	3cx5:E, 3cxh:P, 3cxh:E, 8e7s:C, 8e7s:c, 8ec0:C, 8ec0:c, 1ezv:E, 6giq:E, 6giq:P, 6hu9:E, 6hu9:P, 2ibz:E, 1kb9:E, 1kyo:E, 1kyo:P, 1p84:E, 4pd4:E, 6t0b:E, 6t0b:P, 6t15:E, 6t15:P, 6ymx:E, 6ymx:P
25	3e65:B	421	88	0.0728	0.0451	0.2159	8.3	2bhj:A, 1df1:A, 1df1:B, 1dwv:A, 1dwv:B, 1dww:A, 1dww:B, 1dwx:A, 1dwx:B, 3dwj:A, 3dwj:B, 3e65:A, 3e67:A, 3e67:B, 3e68:A, 3e68:B, 3e6l:A, 3e6l:B, 3e6n:A, 3e6n:B, 3e6o:A, 3e6o:B, 3e6t:A, 3e6t:B, 3e7i:A, 3e7i:B, 3e7m:A, 3e7m:B, 3e7t:A, 3e7t:B, 3eai:A, 3eai:B, 3ebd:A, 3ebd:B, 3ebf:A, 3ebf:B, 4js9:A, 4js9:B, 1jwj:A, 1jwj:B, 1jwk:A, 1jwk:B, 1m8d:A, 1m8d:B, 1m8e:A, 1m8e:B, 1m8h:A, 1m8h:B, 1m8i:A, 1m8i:B, 1m9t:A, 1m9t:B, 1n2n:A, 1n2n:B, 1noc:A, 1nod:A, 1nod:B, 2nod:A, 2nod:B, 3nod:A, 3nod:B, 3nqs:A, 3nqs:B, 3nw2:A, 3nw2:B, 1qom:A, 1qom:B, 1qw4:A, 1qw4:B, 1qw5:A, 1qw5:B, 1r35:A, 1r35:B, 4ux6:B, 1vaf:A, 1vaf:B, 2y37:A, 2y37:B
26	3qvq:A	251	116	0.1111	0.1155	0.2500	9.3	3qvq:B, 3qvq:C, 3qvq:D
27	3zok:A	365	45	0.0498	0.0356	0.2889	9.6	3zok:B, 3zok:C, 3zok:D

[Back]