BioLiP

>protein
DKDVKYYTLEEIQKHKDSKSTWVILHHKVYDLTKFLEEHPGGEEVLREQAGGDATENFEDVGHSTDARELSKTYIIGELH
PDDRSKIAKPSETL

The query sequence (length=94) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1aw3:A	94	94	1.0000	1.0000	1.0000	2.38e-65	1axx:A, 2axx:A, 1b5a:A, 1b5b:A, 1bfx:A, 1blv:A, 1do9:A, 1mny:A
2	1hko:A	104	93	0.8936	0.8077	0.9032	1.19e-59	1aqa:A, 1cyo:A, 1ehb:A, 1es1:A, 1f03:A, 1f04:A, 1i5u:A, 1ib7:A, 1j0q:A, 1jex:A, 1lqx:A, 1lr6:A, 1m20:A, 1m2i:A, 1m2m:A, 1m59:A, 1nx7:A, 1sh4:A, 1u9m:A, 1u9m:B, 1u9m:C, 1u9m:D, 1u9m:E, 1u9m:F, 1u9u:A, 3x32:A, 3x33:A, 3x34:A, 3x35:A
3	2i96:A	108	94	0.8830	0.7685	0.8830	1.78e-58	4hin:A, 4hin:B, 4hin:C, 4hin:D, 2m33:A
4	3ozz:B	82	81	0.6915	0.7927	0.8025	2.11e-46
5	2i89:A	90	83	0.6277	0.6556	0.7108	2.36e-41	2i89:B, 2i89:C, 2i89:D, 1icc:A, 1icc:B, 1icc:D, 1lj0:A, 1lj0:B, 1lj0:C, 1lj0:D, 3mus:B
6	1awp:A	86	83	0.5319	0.5814	0.6024	3.93e-35	1awp:B, 1b5m:A, 1eue:A, 1eue:B, 4hil:A, 4hil:B, 1icc:C, 3mus:A
7	3ner:B	91	80	0.5319	0.5495	0.6250	4.02e-34	3ner:A
8	2ibj:A	86	84	0.5426	0.5930	0.6071	1.82e-33
9	4b8n:B	90	74	0.3298	0.3444	0.4189	8.19e-13	4b8n:A, 4b8n:C, 4b8n:D
10	1cxy:A	81	80	0.2872	0.3333	0.3375	6.46e-12
11	8tgb:A	108	76	0.2553	0.2222	0.3158	2.05e-11	8tgb:B
12	3lf5:A	87	72	0.2553	0.2759	0.3333	2.33e-11	3lf5:B
13	7bwh:A	88	79	0.2979	0.3182	0.3544	3.09e-11
14	1kbi:A	504	51	0.2447	0.0456	0.4510	4.49e-11	1fcb:A, 1fcb:B, 1kbi:B, 1kbj:A, 1kbj:B, 3ks0:A, 3ks0:B, 1lco:A, 1lco:B, 1ldc:A, 1ltd:A, 1ltd:B, 2oz0:A, 2oz0:B, 1qcw:A, 1qcw:B, 1sze:A, 1sze:B, 1szf:A, 1szf:B, 1szg:A, 1szg:B
15	1x3x:A	82	66	0.2660	0.3049	0.3788	2.07e-09	1x3x:B
16	1sox:A	463	81	0.3298	0.0670	0.3827	9.97e-08	2a9a:A, 2a9a:B, 2a9b:A, 2a9c:A, 2a9c:B, 2a9d:A, 2a9d:B, 3hbp:A, 3hbq:A, 1sox:B
17	1mj4:A	79	73	0.2766	0.3291	0.3562	7.28e-07
18	3e23:A	198	64	0.2128	0.1010	0.3125	0.81
19	8dyu:A	2562	29	0.1170	0.0043	0.3793	3.3	8dyv:A
20	1u8x:X	436	63	0.2021	0.0436	0.3016	3.6
21	8fcy:A	2864	29	0.1170	0.0038	0.3793	3.7	8fd6:A, 8fdt:A
22	8pqw:A	2892	29	0.1170	0.0038	0.3793	3.8	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
23	5nug:A	2920	29	0.1170	0.0038	0.3793	4.0	5nug:B
24	7z8g:A	3047	29	0.1170	0.0036	0.3793	4.2	8fdu:A, 7z8l:f
25	1kwm:A	402	57	0.2234	0.0522	0.3684	4.3	1kwm:B, 1zli:A
26	8ptk:f	4502	29	0.1170	0.0024	0.3793	5.3	8ptk:e
27	7z8f:e	4579	29	0.1170	0.0024	0.3793	5.7	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
28	2d2c:D	168	24	0.1170	0.0655	0.4583	6.5	2d2c:Q, 2e74:D, 2e75:D, 2e76:D, 4h0l:D, 4h13:D, 4i7z:D, 4pv1:D, 1vf5:D, 1vf5:Q
29	3ats:A	352	27	0.1170	0.0312	0.4074	6.7	3att:A

[Back]