BioLiP

>protein
DIEERGKILVSLMYSTQQGGLIVGIIRCVHLAAMDANGYSDPFVKLWLKPDMGKKAKHKTQIKKKTLNPEFNEEFFYDIK
HSDLAKKSLDISVWDYDIGKSNDYIGGCQLGISAKGERLKHWYECLKNKDKKIERWHQLQ

The query sequence (length=140) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2cm6:A	149	139	0.9714	0.9128	0.9784	1.57e-97	2cm5:A, 2cm6:B, 5lo8:A, 5lo8:B, 5lob:A, 5lob:B, 5lob:C, 5low:A, 5low:B, 5low:C, 5low:H, 5low:I, 5low:J
2	4ldc:A	149	137	0.7500	0.7047	0.7664	4.87e-80
3	3hn8:A	279	135	0.4000	0.2007	0.4148	3.27e-28	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
4	3hn8:A	279	105	0.3071	0.1541	0.4095	2.74e-21	1dqv:A, 3hn8:B, 3hn8:C
5	5h4z:A	129	127	0.3286	0.3566	0.3622	5.75e-25	5h4y:A, 5h4z:B
6	6ank:B	263	136	0.3786	0.2015	0.3897	5.21e-24	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
7	6ank:B	263	109	0.2929	0.1559	0.3761	1.40e-17	6anj:A, 6ank:A, 6lcy:A, 3n5a:A
8	5cch:E	280	109	0.3286	0.1643	0.4220	2.21e-23	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
9	5cch:E	280	139	0.4071	0.2036	0.4101	2.34e-22	1byn:A, 8c5h:S, 5ccg:E, 5ccg:F, 5ccg:K, 5cch:F, 5cci:E, 5cci:F, 3f05:A, 1k5w:A, 5kj7:E, 5kj7:F, 5kj7:K, 5kj8:E, 5kj8:F, 5kj8:K, 2lha:A, 6mti:1, 6mti:2, 6mti:3, 6mti:4, 6mti:5, 6mti:6, 1tjx:A, 7tx9:A, 7u4q:A, 1uov:A, 1uow:A, 4v11:A, 5vfe:A, 5vfe:B, 5vff:A, 5vfg:A, 5w5c:F, 2yoa:A, 2yoa:B
10	2uzp:A	142	132	0.3429	0.3380	0.3636	2.37e-21	2uzp:B, 2uzp:C
11	1w15:A	132	135	0.3500	0.3712	0.3630	3.43e-21
12	3pfq:A	523	111	0.3214	0.0860	0.4054	5.28e-20	1a25:A, 1a25:B, 2i0e:A, 2i0e:B
13	6uwa:A	187	110	0.2929	0.2193	0.3727	6.81e-19	1dsy:A, 3gpe:A, 2nce:A, 3twy:A, 5w4s:A
14	4lt7:A	128	124	0.3143	0.3438	0.3548	5.53e-18	2k3h:A, 4np9:A, 4ns0:A
15	4lcv:C	129	124	0.3143	0.3411	0.3548	1.19e-17
16	6bty:B	128	131	0.2929	0.3203	0.3130	8.05e-12	2b3r:A, 2b3r:B, 6btz:A, 6btz:D, 6btz:B, 6btz:C, 6bu0:A, 6bu0:B, 6bu0:C
17	7atp:A	129	94	0.2429	0.2636	0.3617	4.71e-10
18	5a50:A	165	110	0.2571	0.2182	0.3273	4.79e-08	5a4x:A, 5a4x:B, 5a50:B, 5a51:A, 5a51:B, 4v29:A, 4v29:B
19	7a1r:A	121	77	0.2000	0.2314	0.3636	2.14e-06	7a1r:B
20	5a52:A	154	106	0.2143	0.1948	0.2830	6.51e-06
21	6nyt:A	135	112	0.2071	0.2148	0.2589	6.06e-04
22	3b7y:A	144	102	0.1929	0.1875	0.2647	0.004
23	1djg:B	561	76	0.1429	0.0357	0.2632	0.024	1djg:A, 1djh:A, 1djh:B, 1dji:A, 1dji:B, 1djw:A, 1djw:B, 1djx:A, 1djx:B, 1djy:A, 1djy:B, 1djz:A, 1djz:B
24	5ue8:A	847	86	0.1571	0.0260	0.2558	0.044	5ue8:B, 1y8f:A
25	4ihb:E	126	57	0.1214	0.1349	0.2982	0.23	7jof:A, 7jof:B, 7jof:C, 7jof:D
26	5ek8:A	668	37	0.0786	0.0165	0.2973	0.57
27	6kxk:D	553	90	0.1571	0.0398	0.2444	0.65	6kxk:F, 6kxu:A, 6kxu:B, 6kxu:C, 6kxu:D, 6kxu:E, 6kxu:F, 6kxu:G, 6kxu:H
28	3d46:A	405	73	0.1429	0.0494	0.2740	0.72	3box:A, 3box:B, 3cxo:A, 3cxo:B, 3d46:B, 3d46:C, 3d46:D, 3d46:E, 3d46:F, 3d46:G, 3d46:H, 3d47:A, 3d47:B, 3d47:C, 3d47:D, 3d47:E, 3d47:F, 3d47:G, 3d47:H, 2gsh:A, 2gsh:B
29	3m34:A	632	60	0.1286	0.0285	0.3000	1.0	3m6l:A, 3m7i:A
30	1ekj:G	220	88	0.1571	0.1000	0.2500	1.6	1ekj:A, 1ekj:B, 1ekj:C, 1ekj:D, 1ekj:E, 1ekj:F, 1ekj:H
31	6pmp:C	617	23	0.0714	0.0162	0.4348	2.2	6pmp:A, 6pmp:B, 6pmp:D
32	7x6v:A	1381	91	0.1714	0.0174	0.2637	2.3
33	7x6s:A	1453	91	0.1714	0.0165	0.2637	2.3	5ltf:A, 5ltn:A, 5ltn:B, 5t2t:A
34	1wuf:A	371	33	0.0786	0.0296	0.3333	2.9	1wuf:B
35	7c9k:B	233	37	0.0929	0.0558	0.3514	3.5	7c9k:A
36	4h1g:A	670	32	0.0929	0.0194	0.4062	4.3
37	7lxt:H	220	45	0.0929	0.0591	0.2889	5.6	7lxt:V
38	3nsj:A	530	89	0.1571	0.0415	0.2472	7.2	7pag:A, 5ug7:A, 4y1s:A, 4y1t:A

[Back]